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Heatmap: Cluster_201 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.48 -1.18 0.29 -0.24 -1.74 1.06 0.74 0.6 0.24 -0.52 -0.94 -0.33
0.12 -0.21 0.19 -0.49 -0.25 0.24 -0.42 -0.2 0.54 0.16 0.06 -0.09
-0.68 -0.23 0.37 0.03 0.09 0.18 0.37 -0.0 0.28 -0.25 -0.23 -0.27
-1.57 -2.94 0.34 -1.54 -1.62 1.17 0.52 0.83 0.68 0.34 -0.59 -0.7
-0.72 0.08 -0.78 -0.7 -3.68 1.0 1.16 -0.78 0.83 -0.47 0.58 -2.01
-0.28 -0.17 0.31 -0.01 -0.12 0.12 0.5 -0.13 0.02 -0.05 -0.16 -0.25
0.01 -0.04 -0.01 -0.12 0.0 0.02 -0.09 -0.08 0.17 0.05 0.07 0.0
-1.17 -3.58 - 1.16 -1.74 1.34 1.08 0.36 1.38 -3.44 -2.16 -3.43
-0.04 -0.32 0.13 -0.29 -0.11 0.29 -0.15 -0.11 0.2 0.14 0.09 0.02
-0.64 -1.1 0.29 -0.27 0.29 0.48 0.93 -0.11 0.3 -0.62 -0.22 -0.63
-1.17 -0.7 0.65 0.37 -0.08 0.83 0.28 -0.05 0.06 -0.41 -0.63 -0.44
-0.06 -0.11 -0.1 -0.12 -0.1 0.59 0.11 0.06 0.19 -0.23 -0.12 -0.33
-2.22 -0.5 0.24 -1.52 -0.69 0.41 1.0 -0.03 0.91 -0.13 0.45 -1.09
0.04 -0.17 0.11 -0.17 0.1 -0.16 -0.07 -0.28 0.31 0.02 0.19 -0.04
-0.0 -0.28 -0.44 0.17 -0.25 0.53 0.24 -0.0 -0.28 -0.06 -0.11 0.19
-0.82 -0.25 -0.07 -0.15 -0.02 0.74 0.25 0.41 -0.25 0.04 -0.25 -0.23
-1.11 -0.47 -0.51 0.09 -1.06 0.93 0.79 -0.27 0.31 0.56 -0.12 -1.07
-0.03 -0.73 -0.25 -1.71 0.19 0.24 -0.63 -0.43 0.75 -0.21 1.01 -0.0
-0.69 -0.59 0.06 0.45 -0.19 0.85 0.54 -0.63 -0.3 -0.6 0.03 0.05
0.27 0.23 -0.4 -0.91 -0.96 0.15 0.59 -0.25 0.58 -0.92 0.52 -0.16
-0.06 0.0 -0.07 0.13 0.12 0.07 0.18 -0.02 -0.0 -0.1 0.02 -0.33
-0.45 0.67 -0.42 0.81 -0.22 -0.16 0.93 -1.21 -0.32 -0.43 0.53 -3.49
-0.53 -0.81 -0.08 -0.03 -0.16 0.55 0.51 0.42 0.07 0.18 -0.16 -0.71
-0.78 -0.66 0.02 0.34 0.39 0.5 0.66 0.08 -0.86 -0.67 0.22 -0.31
-0.31 -0.87 -0.78 -2.0 -3.63 1.54 0.61 -1.09 -0.19 0.93 0.22 -0.2
-0.56 -0.14 -0.14 -0.3 -2.86 0.25 1.16 0.78 0.25 -0.21 -0.2 -1.0
0.19 -0.37 0.46 -0.14 -0.01 0.47 -0.6 -0.18 0.23 -0.41 -0.05 -0.02
-1.3 -0.15 0.21 0.02 -0.42 -0.15 0.74 0.46 0.04 0.24 -0.61 -0.05
-0.91 -1.43 0.46 -0.61 -0.44 0.65 1.0 0.62 -0.0 -0.81 0.03 -0.67
-0.33 -0.23 -0.39 0.23 0.22 0.98 -0.3 -0.13 0.26 -0.61 0.08 -0.62
-0.18 -0.46 -0.31 0.03 -0.48 0.86 0.51 -0.84 0.09 -0.27 0.2 0.01
-2.08 0.25 0.14 0.17 -0.44 -0.37 0.8 0.55 0.08 0.37 -0.24 -1.25
0.07 -1.62 0.33 -0.19 - 1.4 1.38 -0.32 -0.53 -0.69 -0.49 -1.27
0.04 -0.22 -0.58 -0.04 -0.32 0.47 -0.07 0.15 -0.07 0.33 0.18 -0.18
0.02 -0.2 0.07 0.05 0.14 0.26 -0.18 -0.04 0.14 -0.13 -0.13 -0.08
-0.05 -0.04 -0.03 0.04 -0.18 0.05 -0.04 0.09 0.09 0.05 0.03 -0.03
-0.0 -0.23 -0.12 -0.13 -0.06 0.36 0.12 -0.02 0.03 -0.1 -0.0 0.07
0.02 -0.68 0.05 -1.19 -1.42 0.44 0.05 -1.28 1.24 0.36 -0.46 0.42
-0.33 0.09 0.09 0.09 -0.05 0.41 -0.06 -0.05 0.17 -0.17 -0.07 -0.29
-0.47 -0.18 0.16 -0.16 0.03 0.47 0.26 0.17 -0.08 -0.17 -0.12 -0.15
0.07 -0.42 -0.01 -0.25 0.05 0.03 0.49 0.12 0.33 -0.09 -0.21 -0.38
-0.34 -0.25 -0.11 0.05 0.26 0.08 0.08 0.1 0.16 -0.06 0.08 -0.16
-0.08 -0.07 -0.09 0.12 0.19 0.2 -0.11 -0.06 0.07 -0.11 0.03 -0.14
-0.13 0.16 0.11 -0.1 0.22 0.41 -0.08 -0.01 0.18 -0.37 -0.33 -0.28
0.12 -0.02 -0.0 -0.21 -0.03 -0.11 -0.12 -0.03 0.14 0.05 0.11 0.07
-0.63 -0.21 -0.01 0.03 0.03 0.41 0.07 -0.13 0.28 -0.12 0.03 0.0
-0.65 -0.57 -0.36 0.1 0.03 0.28 -0.06 0.36 0.26 -0.27 0.45 -0.05
-0.58 -0.17 -0.05 0.09 0.21 0.32 0.03 0.1 0.09 -0.27 0.06 -0.03
-0.1 -0.04 0.15 0.02 0.03 0.31 0.19 -0.09 0.03 -0.19 -0.18 -0.26
-0.09 -0.19 0.02 -0.01 0.05 0.29 -0.01 -0.1 0.14 -0.03 -0.08 -0.05
0.07 -0.34 0.07 0.04 -0.14 0.63 0.31 -0.1 0.01 -0.28 -0.1 -0.56
-0.33 0.01 -0.08 0.0 0.04 0.15 0.51 0.19 0.03 -0.2 -0.11 -0.45
-0.36 -0.32 0.22 0.15 0.11 0.36 0.03 -0.04 0.16 -0.06 -0.09 -0.39
-0.22 -0.25 0.28 0.17 0.04 0.31 0.29 -0.06 0.02 -0.16 -0.24 -0.4
0.49 -0.13 -0.34 -0.18 -0.14 0.22 0.07 -0.39 0.43 -0.25 0.07 -0.17
0.08 -0.22 0.15 -0.01 0.13 0.15 -0.02 -0.11 0.0 -0.06 -0.09 -0.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.