Heatmap: Cluster_59 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.88 -0.2 -0.15 0.12 0.04 -0.01 0.25 0.15 0.24 0.2 0.08 -0.17
-0.45 -0.26 -0.05 -0.04 -0.08 0.04 0.11 0.24 0.23 0.01 0.13 -0.03
-0.55 -0.28 -0.24 0.05 -0.23 -0.03 0.05 0.09 0.42 0.35 0.2 -0.13
-0.12 0.06 -0.63 -0.11 -0.84 0.18 -0.11 -0.07 0.12 0.36 0.49 0.16
-0.5 -0.29 -0.38 0.04 -0.01 -0.04 -0.1 0.08 0.28 0.4 0.33 -0.1
-0.82 -0.35 -0.83 -0.16 -0.32 0.15 0.08 0.11 0.34 0.39 0.55 0.14
-0.63 -0.29 -0.44 -0.07 -0.07 -0.16 -0.1 0.14 0.29 0.25 0.44 0.25
-0.44 -0.28 0.03 0.12 -0.16 -0.34 -0.04 0.02 0.3 0.3 0.27 -0.04
-0.53 -0.1 -0.1 -0.03 -0.09 -0.51 -0.1 0.0 0.44 0.41 0.32 -0.05
-0.52 -0.28 -0.13 0.09 0.09 0.01 0.19 0.26 0.21 0.05 -0.04 -0.12
0.18 -0.07 -0.22 -0.19 -0.37 -0.4 -0.23 -0.07 0.2 0.28 0.42 0.18
-0.12 -0.26 -0.63 -0.35 -0.7 -0.14 0.17 0.14 0.11 0.45 0.47 0.3
-0.67 -0.82 -0.2 -0.44 -0.24 -0.03 -0.12 -0.09 0.27 0.63 0.69 0.19
-0.3 -0.39 -0.2 -0.04 -0.34 -0.01 0.13 -0.1 0.25 0.36 0.42 -0.06
-0.49 -0.25 -0.15 -0.07 -0.04 -0.16 -0.07 0.05 0.29 0.19 0.35 0.13
-0.25 -0.18 -0.7 0.01 -0.11 0.0 -0.12 0.09 0.3 0.34 0.29 0.03
-1.15 -0.34 -0.33 0.19 -0.03 -0.12 0.1 0.22 0.38 0.39 0.22 -0.14
-0.25 -0.08 -0.35 -0.11 -0.58 -0.22 -0.18 -0.15 0.34 0.27 0.47 0.42
-0.81 -0.56 -0.53 -0.21 -0.04 0.08 0.09 0.05 0.34 0.4 0.39 0.22
-0.33 -0.25 -0.18 -0.04 -0.06 -0.08 -0.1 -0.02 0.33 0.13 0.29 0.17
-0.12 -0.17 -0.26 -0.85 -2.33 -0.83 -0.21 0.25 0.7 0.76 0.44 0.41
-0.3 -0.15 -0.26 -0.04 -0.05 0.07 -0.08 -0.04 0.08 0.21 0.29 0.15
-1.47 -0.97 -0.2 -0.05 -0.2 0.08 0.44 0.42 0.31 0.18 0.35 0.02
-0.23 0.16 -0.31 0.04 -0.36 -0.31 -0.11 -0.14 0.26 0.3 0.34 0.1
-0.18 -0.15 -0.36 -0.17 -0.05 -0.04 -0.1 0.18 0.12 0.29 0.24 0.06
-0.25 -0.29 0.03 -0.12 -0.3 0.0 0.04 0.05 0.2 0.25 0.14 0.11
0.03 -0.08 -0.06 0.05 -0.01 -0.08 -0.05 0.08 -0.03 0.17 0.0 -0.03
-0.43 -0.42 0.0 -0.03 -0.09 0.1 0.19 0.22 0.17 0.03 0.15 -0.06
-0.11 0.07 -0.61 -0.2 -0.65 -0.09 -0.02 -0.09 0.17 0.31 0.54 0.23
-0.7 -0.3 -0.86 -0.18 -0.11 0.02 0.09 -0.1 0.57 0.41 0.34 0.16
-0.61 -0.42 -0.37 -0.0 0.01 -0.17 0.1 0.1 0.27 0.26 0.41 0.08
-0.16 0.02 -0.25 0.09 -0.29 -0.16 0.01 -0.31 0.17 0.28 0.43 -0.01
-0.54 -0.34 0.07 0.04 -0.09 -0.15 -0.15 0.21 0.22 0.25 0.17 0.1
-0.19 0.02 -0.1 -0.05 -0.08 -0.09 -0.11 -0.03 0.17 0.24 0.16 0.0
-0.26 -0.28 -0.12 -0.12 -0.1 0.01 -0.09 0.05 0.23 0.22 0.32 -0.01
-0.31 -0.33 -0.36 -0.06 -0.18 -0.21 -0.18 0.24 0.16 0.35 0.37 0.23
-0.45 0.03 -0.19 0.1 -0.15 -0.07 0.06 0.04 -0.09 0.22 0.27 0.09
-0.07 0.02 -0.11 -0.03 -0.12 -0.08 -0.0 -0.04 0.11 0.12 0.18 -0.01
-0.48 -0.33 -0.29 0.03 -0.21 0.03 0.09 0.18 0.22 0.29 0.23 0.0
-0.48 -0.22 -0.22 0.0 -0.34 -0.16 0.09 0.07 0.39 0.34 0.29 -0.03
0.09 -0.5 -0.74 -0.55 -0.29 0.02 0.16 0.26 0.43 0.26 0.42 -0.13
-0.85 -0.27 -0.21 0.1 -0.1 0.16 0.22 0.31 0.34 0.08 0.04 -0.19
-0.52 -0.47 -0.08 0.02 -0.02 -0.23 -0.38 0.07 0.4 0.4 0.4 0.02
-0.33 0.09 -0.06 0.08 -0.1 -0.22 -0.04 -0.07 0.2 0.2 0.21 -0.08
-0.31 -0.24 0.01 -0.09 -0.13 -0.02 -0.01 -0.1 0.2 0.38 0.3 -0.15
-0.64 -0.37 0.06 0.01 -0.18 -0.16 -0.06 0.14 0.29 0.37 0.21 0.04
-0.2 -0.25 -0.26 -0.13 0.07 -0.1 -0.06 -0.14 0.09 0.22 0.41 0.17
-1.12 -0.42 -0.23 0.12 -0.01 0.05 0.3 0.25 0.39 0.22 0.14 -0.26
0.01 0.03 -0.31 -0.08 -0.27 -0.06 0.04 -0.05 0.14 0.24 0.21 0.01
-0.74 -0.38 -0.31 -0.06 -0.32 -0.18 0.21 -0.02 0.25 0.43 0.49 0.14
-0.53 -0.37 -0.41 -0.06 -0.18 -0.1 0.05 0.17 0.21 0.23 0.46 0.19
-0.21 -0.04 -0.41 -0.08 -0.39 0.03 -0.09 0.02 0.15 0.28 0.32 0.21
-0.31 -0.15 -0.41 0.04 -0.56 0.1 0.17 0.03 0.2 0.21 0.37 0.03
0.01 -0.16 -0.4 -0.45 -0.69 -0.1 -0.09 -0.2 0.32 0.38 0.52 0.34
-0.4 -0.24 -0.25 -0.07 -0.12 -0.11 0.07 0.07 0.25 0.25 0.33 0.03
-0.63 -0.72 -0.1 -0.19 -0.99 -0.04 0.3 -0.21 0.47 0.57 0.42 0.21
-0.21 0.0 -0.24 0.07 -0.19 -0.03 -0.04 -0.02 0.15 0.14 0.32 -0.06
-0.6 -0.43 -0.28 0.16 -0.06 0.2 0.08 0.01 0.17 0.3 0.26 -0.11
-0.55 -0.35 -0.77 -0.24 -0.37 -0.11 0.23 0.11 0.27 0.41 0.43 0.33
-0.38 -0.4 -0.26 -0.15 -0.09 -0.07 0.15 0.18 0.03 0.27 0.36 0.12
-0.17 -0.12 -0.03 0.02 -0.21 -0.16 0.01 0.14 0.29 0.09 0.03 0.03
-1.37 -0.64 -0.14 0.03 0.0 -0.41 0.2 0.23 0.43 0.43 0.32 0.04
-0.02 -0.18 -0.56 -0.32 -0.28 -0.21 -0.38 -0.34 0.47 0.23 0.6 0.41
-0.5 -0.17 -0.31 0.07 -0.24 -0.01 0.15 -0.46 0.28 0.44 0.48 -0.16
-0.44 -0.02 0.01 -0.12 -0.16 -0.2 -0.12 -0.1 0.27 0.31 0.27 0.11
-0.44 -0.21 -0.96 -0.33 -0.63 -0.18 -0.02 -0.33 0.42 0.56 0.82 0.27
-0.5 -0.23 -0.18 -0.08 -0.15 0.14 0.11 -0.12 0.31 0.17 0.42 -0.13
-0.24 -0.25 -0.54 -0.25 -0.25 -0.03 0.14 -0.01 0.37 0.22 0.44 0.06
-0.3 -0.33 -0.35 -0.03 -0.17 -0.01 0.09 -0.26 0.34 0.38 0.4 -0.07
-0.64 -1.13 -1.33 -0.7 -1.51 -0.05 0.14 0.69 0.61 0.58 0.82 0.09
-0.51 -0.33 -0.5 -0.55 -0.5 -0.12 0.2 0.02 0.53 0.49 0.52 0.05
-0.21 -1.48 - -1.37 -1.35 0.26 -0.8 1.1 -0.07 1.43 0.36 0.21
-0.45 -0.3 -0.13 -0.01 0.02 -0.06 0.02 0.08 0.27 0.11 0.2 0.12
-0.34 -0.46 -1.02 0.09 -0.46 0.04 0.09 -0.21 0.3 0.53 0.44 0.28
-0.74 -0.27 -0.31 -0.21 -0.3 -0.45 -0.16 -0.21 0.22 0.46 0.8 0.39
-0.1 -0.09 -0.17 -0.01 -0.27 -0.08 -0.23 -0.04 0.16 0.18 0.33 0.18
-0.29 -0.24 0.01 -0.14 -0.53 -0.22 -0.23 -0.06 0.31 0.42 0.43 0.19
-0.52 -0.48 -0.31 -0.22 0.01 0.01 0.09 0.09 0.32 0.18 0.33 0.19
-0.37 -0.23 -0.72 -0.49 -0.96 -0.2 0.18 -0.31 0.58 0.59 0.78 0.02
-0.64 -0.48 -0.1 0.11 0.04 -0.27 -0.2 0.13 0.42 0.46 0.18 -0.06
-2.7 -1.04 -0.09 0.51 -0.84 -1.87 -0.55 -0.18 0.89 0.98 0.56 0.38
-0.21 -0.09 -0.29 -0.04 -0.26 -0.26 -0.11 -0.1 0.29 0.23 0.44 0.17
-0.1 0.01 -0.06 -0.05 -0.16 0.04 0.03 -0.09 0.1 0.09 0.17 -0.02
-1.04 -0.64 -0.41 -0.12 -0.14 0.03 0.18 0.06 0.38 0.57 0.42 -0.04
-0.57 -0.46 -0.37 -0.09 -0.37 -0.38 -0.12 0.07 0.37 0.29 0.61 0.43
-0.26 -0.09 -0.19 -0.17 -0.2 -0.12 -0.05 -0.08 0.25 0.24 0.43 0.06
-0.47 -0.42 -0.13 0.11 -0.01 -0.09 0.06 0.05 0.23 0.22 0.32 -0.08
0.12 -0.15 -0.21 -0.16 -0.18 -0.44 -0.16 -0.1 0.25 0.33 0.27 0.22
-0.43 -0.25 -0.09 -0.09 -0.27 -0.11 0.03 -0.03 0.28 0.3 0.36 0.07
-0.32 -0.31 -0.04 -0.06 -0.07 0.07 -0.01 0.11 -0.03 0.26 0.21 0.08
-0.32 -0.18 -0.89 -0.08 -0.56 -0.33 0.01 -0.11 0.52 0.58 0.52 0.1
-0.56 -0.38 -0.7 -0.09 -0.4 -0.17 0.12 -0.04 0.59 0.48 0.51 -0.05
-0.27 -0.14 -0.16 0.07 -0.16 -0.2 0.09 0.01 0.21 0.25 0.22 -0.04
-0.23 -0.18 -0.11 -0.04 -0.03 -0.08 -0.05 0.03 0.17 0.13 0.27 0.05
-0.4 -0.22 -0.12 0.02 -0.08 0.17 0.01 0.01 0.1 0.15 0.19 0.06
-0.48 -0.19 -0.1 0.01 -0.11 0.1 0.16 0.16 0.15 0.16 0.11 -0.1
-0.37 -0.35 -0.5 -0.11 -0.02 -0.02 -0.2 0.14 0.33 0.29 0.37 0.12
0.04 -0.31 -0.83 -0.5 -0.51 0.01 0.09 0.36 0.1 0.39 0.49 0.08
-0.42 -0.23 0.02 0.12 -0.01 -0.34 -0.09 0.07 0.42 0.21 0.12 -0.07
-0.49 -0.39 -0.17 -0.19 -0.18 -0.36 -0.2 0.1 0.39 0.24 0.55 0.26
-0.5 -0.28 -0.38 -0.09 -0.37 -0.18 -0.16 -0.2 0.25 0.51 0.61 0.28
-0.87 -0.33 -0.26 -0.26 -0.27 -0.42 -0.1 0.18 0.42 0.48 0.65 0.06
-0.35 -0.26 -0.26 -0.08 -0.13 0.04 0.09 -0.05 0.26 0.3 0.26 -0.0
-1.12 -0.41 -0.24 0.08 -0.23 -0.11 0.12 0.11 0.51 0.41 0.28 -0.04
-0.07 -0.16 -0.26 -0.22 -0.4 -0.15 -0.09 -0.09 0.29 0.28 0.44 0.18
-0.45 -0.16 -0.46 -0.04 -0.29 -0.12 -0.07 -0.08 0.39 0.4 0.43 0.08
-0.15 0.14 -0.22 -0.07 -0.42 -0.17 0.01 -0.18 0.26 0.19 0.39 0.0
-0.13 0.05 -0.28 -0.19 -0.44 -0.13 0.08 -0.08 0.22 0.32 0.33 0.02
-0.03 0.06 -0.33 -0.37 -0.85 -0.18 -0.15 -0.12 0.46 0.53 0.45 -0.04
-0.24 0.04 -0.09 -0.35 -0.36 -0.12 -0.17 -0.27 0.34 0.56 0.42 -0.14
-0.2 -0.05 -0.22 -0.02 -0.06 0.07 0.05 0.01 0.03 0.1 0.24 -0.01
-0.33 -0.36 -0.35 -0.22 -0.01 -0.16 0.05 0.12 0.3 0.3 0.38 0.01
-0.13 -0.18 -0.51 -0.08 -0.11 -0.06 -0.06 0.01 0.21 0.35 0.32 0.04
0.17 -0.12 -0.34 -0.3 -0.39 -0.17 -0.2 -0.16 0.2 0.22 0.45 0.32
-0.28 -0.05 -0.21 -0.14 -0.27 -0.01 0.02 -0.08 0.25 0.09 0.51 -0.04
-0.45 -0.72 -0.78 -0.32 -0.24 0.11 -0.0 0.06 0.58 0.61 0.37 -0.02
0.0 -0.26 -0.22 -0.29 0.04 -0.11 -0.09 -0.61 0.32 0.33 0.41 0.14
-0.36 -0.25 -0.43 -0.03 0.04 0.0 -0.06 0.16 0.18 0.3 0.18 0.07
-0.01 -0.13 -0.09 -0.14 -0.21 -0.02 -0.08 -0.18 0.13 0.18 0.29 0.16
-0.75 -0.33 -0.12 0.02 -0.23 -0.02 0.2 0.21 0.35 0.2 0.19 -0.04
-0.84 -0.54 -0.4 -0.09 -0.19 -0.17 0.28 0.18 0.42 0.49 0.38 -0.15
-0.65 -0.19 -0.7 0.03 -0.47 -0.09 0.24 -0.2 0.33 0.48 0.59 -0.03
-0.24 -0.45 -1.25 -0.35 0.02 0.01 -0.07 0.26 -0.04 0.65 0.52 0.1
-0.0 -0.11 -0.55 -0.27 -0.43 -0.2 0.06 -0.03 0.36 0.29 0.44 0.11
-0.31 -0.33 -0.32 -0.07 -0.11 0.06 -0.29 0.07 0.16 0.25 0.41 0.22
-0.23 -0.44 -0.67 -0.4 -0.53 -0.0 -0.04 0.02 0.4 0.51 0.53 0.2

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.