Heatmap: Cluster_59 (HCCA clusters)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
106537	-0.88	-0.2	-0.15	0.12	0.04	-0.01	0.25	0.15	0.24	0.2	0.08	-0.17
107819	-0.45	-0.26	-0.05	-0.04	-0.08	0.04	0.11	0.24	0.23	0.01	0.13	-0.03
108317	-0.55	-0.28	-0.24	0.05	-0.23	-0.03	0.05	0.09	0.42	0.35	0.2	-0.13
108987	-0.12	0.06	-0.63	-0.11	-0.84	0.18	-0.11	-0.07	0.12	0.36	0.49	0.16
110362	-0.5	-0.29	-0.38	0.04	-0.01	-0.04	-0.1	0.08	0.28	0.4	0.33	-0.1
110855	-0.82	-0.35	-0.83	-0.16	-0.32	0.15	0.08	0.11	0.34	0.39	0.55	0.14
111632	-0.63	-0.29	-0.44	-0.07	-0.07	-0.16	-0.1	0.14	0.29	0.25	0.44	0.25
113732	-0.44	-0.28	0.03	0.12	-0.16	-0.34	-0.04	0.02	0.3	0.3	0.27	-0.04
114014	-0.53	-0.1	-0.1	-0.03	-0.09	-0.51	-0.1	0.0	0.44	0.41	0.32	-0.05
115305	-0.52	-0.28	-0.13	0.09	0.09	0.01	0.19	0.26	0.21	0.05	-0.04	-0.12
123976	0.18	-0.07	-0.22	-0.19	-0.37	-0.4	-0.23	-0.07	0.2	0.28	0.42	0.18
126716	-0.12	-0.26	-0.63	-0.35	-0.7	-0.14	0.17	0.14	0.11	0.45	0.47	0.3
126929	-0.67	-0.82	-0.2	-0.44	-0.24	-0.03	-0.12	-0.09	0.27	0.63	0.69	0.19
127051	-0.3	-0.39	-0.2	-0.04	-0.34	-0.01	0.13	-0.1	0.25	0.36	0.42	-0.06
130469	-0.49	-0.25	-0.15	-0.07	-0.04	-0.16	-0.07	0.05	0.29	0.19	0.35	0.13
131219	-0.25	-0.18	-0.7	0.01	-0.11	0.0	-0.12	0.09	0.3	0.34	0.29	0.03
133100	-1.15	-0.34	-0.33	0.19	-0.03	-0.12	0.1	0.22	0.38	0.39	0.22	-0.14
134275	-0.25	-0.08	-0.35	-0.11	-0.58	-0.22	-0.18	-0.15	0.34	0.27	0.47	0.42
140749	-0.81	-0.56	-0.53	-0.21	-0.04	0.08	0.09	0.05	0.34	0.4	0.39	0.22
142608	-0.33	-0.25	-0.18	-0.04	-0.06	-0.08	-0.1	-0.02	0.33	0.13	0.29	0.17
14687	-0.12	-0.17	-0.26	-0.85	-2.33	-0.83	-0.21	0.25	0.7	0.76	0.44	0.41
148262	-0.3	-0.15	-0.26	-0.04	-0.05	0.07	-0.08	-0.04	0.08	0.21	0.29	0.15
159358	-1.47	-0.97	-0.2	-0.05	-0.2	0.08	0.44	0.42	0.31	0.18	0.35	0.02
163627	-0.23	0.16	-0.31	0.04	-0.36	-0.31	-0.11	-0.14	0.26	0.3	0.34	0.1
167877	-0.18	-0.15	-0.36	-0.17	-0.05	-0.04	-0.1	0.18	0.12	0.29	0.24	0.06
170735	-0.25	-0.29	0.03	-0.12	-0.3	0.0	0.04	0.05	0.2	0.25	0.14	0.11
171149	0.03	-0.08	-0.06	0.05	-0.01	-0.08	-0.05	0.08	-0.03	0.17	0.0	-0.03
171221	-0.43	-0.42	0.0	-0.03	-0.09	0.1	0.19	0.22	0.17	0.03	0.15	-0.06
171388	-0.11	0.07	-0.61	-0.2	-0.65	-0.09	-0.02	-0.09	0.17	0.31	0.54	0.23
176403	-0.7	-0.3	-0.86	-0.18	-0.11	0.02	0.09	-0.1	0.57	0.41	0.34	0.16
177485	-0.61	-0.42	-0.37	-0.0	0.01	-0.17	0.1	0.1	0.27	0.26	0.41	0.08
183423	-0.16	0.02	-0.25	0.09	-0.29	-0.16	0.01	-0.31	0.17	0.28	0.43	-0.01
183654	-0.54	-0.34	0.07	0.04	-0.09	-0.15	-0.15	0.21	0.22	0.25	0.17	0.1
227647	-0.19	0.02	-0.1	-0.05	-0.08	-0.09	-0.11	-0.03	0.17	0.24	0.16	0.0
228155	-0.26	-0.28	-0.12	-0.12	-0.1	0.01	-0.09	0.05	0.23	0.22	0.32	-0.01
228213	-0.31	-0.33	-0.36	-0.06	-0.18	-0.21	-0.18	0.24	0.16	0.35	0.37	0.23
230037	-0.45	0.03	-0.19	0.1	-0.15	-0.07	0.06	0.04	-0.09	0.22	0.27	0.09
230688	-0.07	0.02	-0.11	-0.03	-0.12	-0.08	-0.0	-0.04	0.11	0.12	0.18	-0.01
230913	-0.48	-0.33	-0.29	0.03	-0.21	0.03	0.09	0.18	0.22	0.29	0.23	0.0
233271	-0.48	-0.22	-0.22	0.0	-0.34	-0.16	0.09	0.07	0.39	0.34	0.29	-0.03
235392	0.09	-0.5	-0.74	-0.55	-0.29	0.02	0.16	0.26	0.43	0.26	0.42	-0.13
235871	-0.85	-0.27	-0.21	0.1	-0.1	0.16	0.22	0.31	0.34	0.08	0.04	-0.19
235879	-0.52	-0.47	-0.08	0.02	-0.02	-0.23	-0.38	0.07	0.4	0.4	0.4	0.02
24354	-0.33	0.09	-0.06	0.08	-0.1	-0.22	-0.04	-0.07	0.2	0.2	0.21	-0.08
26394	-0.31	-0.24	0.01	-0.09	-0.13	-0.02	-0.01	-0.1	0.2	0.38	0.3	-0.15
266715	-0.64	-0.37	0.06	0.01	-0.18	-0.16	-0.06	0.14	0.29	0.37	0.21	0.04
267594	-0.2	-0.25	-0.26	-0.13	0.07	-0.1	-0.06	-0.14	0.09	0.22	0.41	0.17
268124	-1.12	-0.42	-0.23	0.12	-0.01	0.05	0.3	0.25	0.39	0.22	0.14	-0.26
271785	0.01	0.03	-0.31	-0.08	-0.27	-0.06	0.04	-0.05	0.14	0.24	0.21	0.01
27199	-0.74	-0.38	-0.31	-0.06	-0.32	-0.18	0.21	-0.02	0.25	0.43	0.49	0.14
2817	-0.53	-0.37	-0.41	-0.06	-0.18	-0.1	0.05	0.17	0.21	0.23	0.46	0.19
29306	-0.21	-0.04	-0.41	-0.08	-0.39	0.03	-0.09	0.02	0.15	0.28	0.32	0.21
402400	-0.31	-0.15	-0.41	0.04	-0.56	0.1	0.17	0.03	0.2	0.21	0.37	0.03
402493	0.01	-0.16	-0.4	-0.45	-0.69	-0.1	-0.09	-0.2	0.32	0.38	0.52	0.34
403940	-0.4	-0.24	-0.25	-0.07	-0.12	-0.11	0.07	0.07	0.25	0.25	0.33	0.03
404573	-0.63	-0.72	-0.1	-0.19	-0.99	-0.04	0.3	-0.21	0.47	0.57	0.42	0.21
404776	-0.21	0.0	-0.24	0.07	-0.19	-0.03	-0.04	-0.02	0.15	0.14	0.32	-0.06
406330	-0.6	-0.43	-0.28	0.16	-0.06	0.2	0.08	0.01	0.17	0.3	0.26	-0.11
407588	-0.55	-0.35	-0.77	-0.24	-0.37	-0.11	0.23	0.11	0.27	0.41	0.43	0.33
407940	-0.38	-0.4	-0.26	-0.15	-0.09	-0.07	0.15	0.18	0.03	0.27	0.36	0.12
408336	-0.17	-0.12	-0.03	0.02	-0.21	-0.16	0.01	0.14	0.29	0.09	0.03	0.03
408674	-1.37	-0.64	-0.14	0.03	0.0	-0.41	0.2	0.23	0.43	0.43	0.32	0.04
409429	-0.02	-0.18	-0.56	-0.32	-0.28	-0.21	-0.38	-0.34	0.47	0.23	0.6	0.41
410074	-0.5	-0.17	-0.31	0.07	-0.24	-0.01	0.15	-0.46	0.28	0.44	0.48	-0.16
410681	-0.44	-0.02	0.01	-0.12	-0.16	-0.2	-0.12	-0.1	0.27	0.31	0.27	0.11
411022	-0.44	-0.21	-0.96	-0.33	-0.63	-0.18	-0.02	-0.33	0.42	0.56	0.82	0.27
412053	-0.5	-0.23	-0.18	-0.08	-0.15	0.14	0.11	-0.12	0.31	0.17	0.42	-0.13
412673	-0.24	-0.25	-0.54	-0.25	-0.25	-0.03	0.14	-0.01	0.37	0.22	0.44	0.06
412774	-0.3	-0.33	-0.35	-0.03	-0.17	-0.01	0.09	-0.26	0.34	0.38	0.4	-0.07
413817	-0.64	-1.13	-1.33	-0.7	-1.51	-0.05	0.14	0.69	0.61	0.58	0.82	0.09
414023	-0.51	-0.33	-0.5	-0.55	-0.5	-0.12	0.2	0.02	0.53	0.49	0.52	0.05
414822	-0.21	-1.48	-	-1.37	-1.35	0.26	-0.8	1.1	-0.07	1.43	0.36	0.21
416268	-0.45	-0.3	-0.13	-0.01	0.02	-0.06	0.02	0.08	0.27	0.11	0.2	0.12
417780	-0.34	-0.46	-1.02	0.09	-0.46	0.04	0.09	-0.21	0.3	0.53	0.44	0.28
419561	-0.74	-0.27	-0.31	-0.21	-0.3	-0.45	-0.16	-0.21	0.22	0.46	0.8	0.39
419720	-0.1	-0.09	-0.17	-0.01	-0.27	-0.08	-0.23	-0.04	0.16	0.18	0.33	0.18
419914	-0.29	-0.24	0.01	-0.14	-0.53	-0.22	-0.23	-0.06	0.31	0.42	0.43	0.19
422095	-0.52	-0.48	-0.31	-0.22	0.01	0.01	0.09	0.09	0.32	0.18	0.33	0.19
422182	-0.37	-0.23	-0.72	-0.49	-0.96	-0.2	0.18	-0.31	0.58	0.59	0.78	0.02
42373	-0.64	-0.48	-0.1	0.11	0.04	-0.27	-0.2	0.13	0.42	0.46	0.18	-0.06
426276	-2.7	-1.04	-0.09	0.51	-0.84	-1.87	-0.55	-0.18	0.89	0.98	0.56	0.38
426562	-0.21	-0.09	-0.29	-0.04	-0.26	-0.26	-0.11	-0.1	0.29	0.23	0.44	0.17
428339	-0.1	0.01	-0.06	-0.05	-0.16	0.04	0.03	-0.09	0.1	0.09	0.17	-0.02
429511	-1.04	-0.64	-0.41	-0.12	-0.14	0.03	0.18	0.06	0.38	0.57	0.42	-0.04
438124	-0.57	-0.46	-0.37	-0.09	-0.37	-0.38	-0.12	0.07	0.37	0.29	0.61	0.43
441110	-0.26	-0.09	-0.19	-0.17	-0.2	-0.12	-0.05	-0.08	0.25	0.24	0.43	0.06
442161	-0.47	-0.42	-0.13	0.11	-0.01	-0.09	0.06	0.05	0.23	0.22	0.32	-0.08
444776	0.12	-0.15	-0.21	-0.16	-0.18	-0.44	-0.16	-0.1	0.25	0.33	0.27	0.22
447161	-0.43	-0.25	-0.09	-0.09	-0.27	-0.11	0.03	-0.03	0.28	0.3	0.36	0.07
447786	-0.32	-0.31	-0.04	-0.06	-0.07	0.07	-0.01	0.11	-0.03	0.26	0.21	0.08
447834	-0.32	-0.18	-0.89	-0.08	-0.56	-0.33	0.01	-0.11	0.52	0.58	0.52	0.1
447837	-0.56	-0.38	-0.7	-0.09	-0.4	-0.17	0.12	-0.04	0.59	0.48	0.51	-0.05
448455	-0.27	-0.14	-0.16	0.07	-0.16	-0.2	0.09	0.01	0.21	0.25	0.22	-0.04
45144	-0.23	-0.18	-0.11	-0.04	-0.03	-0.08	-0.05	0.03	0.17	0.13	0.27	0.05
54652	-0.4	-0.22	-0.12	0.02	-0.08	0.17	0.01	0.01	0.1	0.15	0.19	0.06
57110	-0.48	-0.19	-0.1	0.01	-0.11	0.1	0.16	0.16	0.15	0.16	0.11	-0.1
59303	-0.37	-0.35	-0.5	-0.11	-0.02	-0.02	-0.2	0.14	0.33	0.29	0.37	0.12
72231	0.04	-0.31	-0.83	-0.5	-0.51	0.01	0.09	0.36	0.1	0.39	0.49	0.08
75561	-0.42	-0.23	0.02	0.12	-0.01	-0.34	-0.09	0.07	0.42	0.21	0.12	-0.07
76584	-0.49	-0.39	-0.17	-0.19	-0.18	-0.36	-0.2	0.1	0.39	0.24	0.55	0.26
76894	-0.5	-0.28	-0.38	-0.09	-0.37	-0.18	-0.16	-0.2	0.25	0.51	0.61	0.28
77198	-0.87	-0.33	-0.26	-0.26	-0.27	-0.42	-0.1	0.18	0.42	0.48	0.65	0.06
77393	-0.35	-0.26	-0.26	-0.08	-0.13	0.04	0.09	-0.05	0.26	0.3	0.26	-0.0
79158	-1.12	-0.41	-0.24	0.08	-0.23	-0.11	0.12	0.11	0.51	0.41	0.28	-0.04
80075	-0.07	-0.16	-0.26	-0.22	-0.4	-0.15	-0.09	-0.09	0.29	0.28	0.44	0.18
80102	-0.45	-0.16	-0.46	-0.04	-0.29	-0.12	-0.07	-0.08	0.39	0.4	0.43	0.08
81473	-0.15	0.14	-0.22	-0.07	-0.42	-0.17	0.01	-0.18	0.26	0.19	0.39	0.0
81611	-0.13	0.05	-0.28	-0.19	-0.44	-0.13	0.08	-0.08	0.22	0.32	0.33	0.02
81865	-0.03	0.06	-0.33	-0.37	-0.85	-0.18	-0.15	-0.12	0.46	0.53	0.45	-0.04
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.