Heatmap: Cluster_80 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.45 0.01 0.88 -0.05 0.09 0.56 0.03 0.1 -0.87 -0.26 -0.23 -0.76
-0.21 -0.03 -0.11 0.11 -0.22 -0.05 0.04 0.23 0.09 0.25 -0.04 -0.16
0.08 0.08 0.67 -0.0 0.06 -0.36 -0.46 -0.3 0.17 -0.77 -0.13 0.4
-0.49 0.05 0.77 0.36 0.23 0.3 -0.05 0.15 -0.72 -0.15 -0.44 -0.91
0.23 0.41 0.43 -0.15 -0.07 0.11 -0.35 0.16 -0.09 -0.91 -0.36 0.1
-0.35 0.14 0.6 0.06 0.27 -0.15 -0.27 0.18 -0.08 -0.5 -0.2 -0.06
-0.65 0.07 1.38 0.15 -0.46 0.46 -0.59 0.21 -0.55 -0.74 -0.14 -1.01
-0.1 0.01 0.04 0.12 -0.33 0.49 0.03 -0.12 0.01 -0.05 0.07 -0.35
-0.7 -0.16 0.85 -0.65 -0.21 0.47 0.36 -0.15 -0.4 0.14 -0.14 -0.23
0.04 -0.28 0.76 0.22 -0.08 -0.38 -0.12 -0.32 -0.45 0.2 -0.17 0.12
0.97 0.26 1.1 -0.54 -0.41 -1.12 -0.77 -0.23 -0.13 -1.15 -0.13 0.13
0.18 0.06 0.12 0.04 -0.06 -0.04 -0.09 -0.11 0.02 -0.03 -0.02 -0.09
-1.08 -0.66 0.95 -0.12 0.12 0.15 -0.03 0.37 -0.25 -0.27 0.07 -0.23
0.66 0.26 0.84 -0.18 0.31 -0.42 -0.37 -0.79 -0.45 -0.51 -0.3 -0.07
0.14 -0.02 0.09 0.11 0.08 0.35 -0.34 -0.36 -0.05 -0.31 0.19 -0.08
0.15 -0.07 0.36 -0.05 0.16 0.02 -0.03 -0.12 -0.07 -0.38 -0.24 0.13
0.1 0.21 0.38 0.05 0.1 -0.01 0.02 -0.19 0.01 -0.4 -0.17 -0.27
-0.47 -0.27 0.37 -0.56 0.14 0.49 0.71 0.06 -0.15 -0.41 -0.09 -0.53
0.0 0.12 0.05 -0.51 -0.18 0.28 -0.11 0.14 0.02 -0.09 -0.0 0.14
0.05 0.34 0.45 0.15 0.2 0.19 -0.33 -0.18 -0.48 -0.36 -0.01 -0.37
0.09 -0.23 -0.27 -0.74 -1.33 0.46 0.6 0.52 -0.15 0.74 -1.26 -0.09
-0.37 -0.37 0.56 -0.22 0.15 0.24 0.12 0.11 0.1 -0.06 -0.03 -0.61
- -2.08 1.82 0.34 0.6 0.27 1.22 - -2.02 -0.84 -0.96 -0.72
0.06 0.06 -0.29 0.25 -0.47 0.78 -0.01 -0.42 -0.15 -0.19 0.14 -0.25
-0.15 0.15 0.59 0.36 -0.14 0.12 0.1 -0.41 0.16 -0.69 -0.2 -0.38
-1.27 0.13 0.52 0.32 -2.44 1.48 0.61 0.2 -0.93 -0.29 -2.48 -0.63
-0.23 -0.24 0.9 0.46 0.03 0.24 0.47 -0.27 -0.53 -0.09 -0.92 -1.08
-0.11 -0.76 0.64 -0.11 0.1 1.55 -0.92 -0.03 -1.93 -0.7 0.53 -2.63
-1.9 -0.17 1.22 -0.21 -0.26 0.64 0.67 -0.58 0.19 -1.08 -1.06 -0.16
-1.76 -1.57 2.25 - 1.45 1.37 -1.07 -2.56 -2.82 - -2.73 -1.52
-1.31 -0.56 1.12 -0.04 -0.36 0.95 -0.09 -0.27 -0.24 0.32 -1.58 -0.2
0.66 0.12 1.56 0.03 -0.01 0.55 -1.08 -1.3 - -1.02 -1.09 0.07
0.81 -0.41 0.24 -0.16 -0.13 -0.49 0.36 -0.48 -0.23 0.03 -0.0 -0.12
0.44 0.72 1.33 -0.64 0.07 -0.84 -0.78 0.0 -0.98 -1.21 -1.46 0.42
-0.13 0.14 0.33 0.16 0.17 0.48 -0.15 -0.43 -0.42 -0.07 0.14 -0.62
-0.23 0.32 0.22 0.3 0.25 0.17 0.06 -0.47 -0.47 -0.26 -0.13 -0.06
0.01 -0.23 0.62 -0.22 0.26 0.27 -0.2 -0.51 -0.07 -0.46 -0.18 0.27
0.23 0.25 1.07 -0.13 -0.72 1.07 -0.39 -1.65 -1.42 -0.67 0.18 -0.5
0.72 0.27 1.34 -1.21 - 0.41 0.14 -1.01 0.57 -1.41 -0.11 -1.05
0.58 -0.7 0.91 0.18 -0.28 1.13 0.36 -2.98 -0.4 -0.88 -0.5 -1.13
-0.44 0.29 -0.26 -0.07 -2.07 0.45 -0.61 0.98 0.12 -0.01 0.38 -0.63
0.13 -0.17 -0.21 0.48 -0.57 1.08 -0.18 -0.77 -0.49 -1.77 0.77 -0.34
-0.72 0.12 1.07 0.16 0.43 0.05 -0.08 -0.25 -0.21 -0.8 -0.36 -0.52
0.38 -0.21 -0.1 0.09 -0.23 -0.0 -0.34 0.34 0.23 -0.89 0.51 -0.33
-0.92 -0.02 0.32 -0.43 -0.53 0.57 -0.12 0.27 0.2 0.15 0.14 -0.28
-0.85 -0.24 1.62 0.35 -2.2 -0.02 -0.34 -0.68 0.28 0.17 -2.87 0.21
-0.13 0.06 0.33 0.03 0.07 0.23 0.1 -0.06 -0.06 -0.12 -0.28 -0.31
0.65 -0.27 0.04 -0.01 -0.59 0.17 -0.44 -1.44 0.31 0.97 -0.15 -0.78
-0.1 -0.08 0.09 0.04 -0.1 0.31 -0.06 -0.01 -0.0 -0.01 -0.02 -0.13
- - 2.17 -0.91 - 2.52 -0.47 - -0.94 - - -
-0.35 -0.29 -0.2 -0.32 0.2 0.43 0.58 -0.11 -0.24 0.02 -0.1 0.02
-2.46 -0.42 0.87 0.61 0.62 0.38 0.79 0.35 -1.45 -1.19 -0.55 -1.33
-0.83 -0.23 0.34 -0.02 0.15 1.09 0.19 -0.36 -0.32 0.22 -0.71 -0.72
0.98 0.11 0.74 0.07 -0.82 -0.44 -0.17 0.2 -0.86 -0.14 -0.79 -0.22
-0.47 0.61 1.71 0.28 -1.77 0.47 -1.4 -1.5 -1.64 -0.57 -1.23 0.53
0.36 0.82 1.44 -0.53 -1.81 0.56 -0.19 -0.82 -0.88 -1.14 -1.0 -0.26
-0.99 -0.6 0.84 -0.33 0.14 0.74 -0.39 -0.21 0.1 -0.67 0.45 -0.35
-1.56 0.1 0.58 0.66 0.18 1.1 -0.03 -0.65 -0.79 -0.19 -0.58 -1.04
-0.42 -0.03 1.2 0.45 1.38 -0.77 0.24 -0.95 -0.62 -0.3 -2.22 -4.29
- - 1.28 -0.27 -0.79 0.63 -0.07 0.61 1.1 -0.91 -1.15 0.02
- - 2.54 - - 2.36 - - - - 0.05 -
-0.61 -0.37 0.57 0.24 0.25 0.7 0.12 0.11 -0.03 -0.94 -0.1 -1.01
0.14 -0.42 1.0 0.26 0.04 0.04 -0.33 -0.27 -0.23 -0.94 -0.11 -0.05
0.11 0.06 0.25 0.03 -0.03 -0.14 0.1 -0.2 -0.15 -0.2 0.07 0.02
- 0.02 1.22 -1.1 0.36 1.22 -0.13 -0.03 -1.15 -1.51 0.92 -
0.5 0.08 1.48 0.29 -3.1 -0.19 0.22 -0.41 0.64 -0.95 -2.27 -1.67
-0.8 -0.89 0.08 -0.12 -0.02 0.36 -0.38 0.33 -0.5 -0.13 0.7 0.45
-0.94 -0.28 0.3 0.5 0.2 0.62 0.07 0.16 -0.24 -0.38 -0.34 -0.4
0.15 0.76 0.53 0.11 -0.09 0.74 -0.6 0.27 -0.9 -1.52 -0.95 -0.32
-0.3 -0.04 0.08 0.15 -0.32 0.22 0.0 0.09 0.14 -0.21 -0.03 0.09
-0.36 -0.35 0.19 -0.65 -0.1 0.64 0.48 -0.2 0.14 -0.15 0.0 -0.17
-0.35 -0.11 0.75 0.33 0.2 0.12 -0.01 -0.2 -0.22 -0.31 -0.33 -0.34
-0.36 -0.32 1.04 0.07 0.22 0.88 -0.22 -0.17 -0.76 -0.61 -0.5 -0.72
0.18 0.14 0.1 -0.15 -0.0 -0.1 -0.1 -0.04 -0.07 0.03 -0.07 0.05
-0.46 -0.37 0.08 -0.66 0.15 0.64 0.58 0.05 -0.09 -0.79 0.27 -0.16
0.54 0.21 0.35 0.03 0.06 -0.49 -0.32 -0.13 -0.17 -0.27 -0.14 -0.0
-0.02 0.13 0.17 0.1 0.16 -0.04 -0.1 -0.18 -0.19 -0.08 0.01 -0.03
0.01 0.28 0.79 -0.18 0.33 0.13 -0.69 -0.52 -0.2 -0.51 -0.34 0.18
-1.4 0.2 0.24 -1.48 - 0.79 0.22 0.93 0.57 0.48 -0.51 -0.83
-0.82 -1.05 1.11 -0.31 0.1 1.7 0.23 -0.28 -0.41 -2.11 -0.55 -
0.15 0.3 0.32 0.0 -0.22 0.08 0.01 -0.23 -0.06 -0.16 -0.07 -0.28
-1.55 -0.61 1.37 -1.07 -0.35 1.29 -0.24 -2.3 -0.46 0.77 -0.07 -1.79
-0.66 0.26 -0.1 0.36 -0.86 0.32 0.1 0.1 0.37 0.08 -0.27 -0.27
-0.29 0.24 0.92 0.19 0.31 0.04 -0.4 -0.0 -0.27 -0.41 -0.73 -0.38
0.12 -0.25 0.34 0.13 0.29 0.34 -0.36 0.18 -0.18 -0.42 -0.15 -0.35
- - 1.93 0.38 -0.55 1.29 - -0.32 - 0.67 0.44 -
-0.06 -0.26 0.01 0.26 0.21 0.22 -0.16 -0.0 0.34 -0.26 -0.21 -0.28
-0.31 0.02 0.46 0.28 -0.11 0.49 -0.13 -0.13 -0.37 0.07 -0.48 -0.16
-0.15 0.04 0.27 0.25 0.17 0.18 0.18 -0.28 -0.16 0.0 -0.26 -0.46
0.2 0.27 0.28 0.1 0.14 -0.14 -0.26 -0.24 -0.17 -0.2 -0.23 0.09
0.08 0.16 0.16 -0.03 0.1 0.1 -0.04 0.01 -0.1 -0.04 -0.24 -0.22
-0.29 0.14 -0.0 -0.13 -0.27 -0.11 -0.07 -0.07 0.05 0.18 0.23 0.2
-0.32 0.04 0.18 0.1 0.04 0.18 0.11 -0.07 -0.0 -0.02 -0.11 -0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.