Heatmap: Cluster_82 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.11 1.09 0.55 1.54 1.99 3.1 1.34 1.57 1.65 0.59 1.0 1.27
1.26 2.07 1.35 2.5 2.07 3.81 2.64 1.92 1.49 0.96 2.05 1.69
4.55 5.02 3.87 5.26 6.19 9.02 6.68 5.76 5.19 7.46 5.18 5.31
2.44 2.42 2.27 2.69 3.06 4.08 2.97 2.85 2.74 3.27 3.25 3.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.71 0.83 0.43 1.18 1.43 7.03 2.79 4.3 3.59 1.38 1.93 2.81
3.03 3.36 4.04 3.7 3.12 5.24 4.5 3.84 4.11 4.21 3.94 2.94
37.69 51.45 42.1 54.54 49.74 56.86 45.55 47.51 45.48 44.45 46.38 47.08
0.14 0.44 0.35 0.18 0.87 0.72 0.02 0.08 0.64 0.02 0.22 0.13
0.43 0.46 0.11 0.36 0.3 1.34 0.18 0.39 0.9 0.32 0.35 0.48
1.22 1.36 1.67 1.56 1.46 2.15 1.4 1.08 2.3 1.3 1.81 1.24
0.32 0.59 0.34 0.49 0.74 0.92 0.32 0.52 0.61 0.85 0.61 0.68
0.0 0.21 0.12 0.3 0.66 1.07 0.68 0.62 0.33 0.25 0.14 0.19
41.25 38.11 46.67 46.79 50.63 56.55 53.07 56.0 54.19 47.44 41.89 38.63
0.29 0.45 1.24 0.81 1.01 1.06 0.65 0.35 0.76 0.58 0.51 0.15
13.25 13.32 15.8 18.49 15.6 19.45 19.77 16.91 18.77 15.42 12.34 9.42
15.3 23.19 23.71 34.64 29.08 37.6 28.28 27.7 29.86 26.25 25.26 19.42
0.14 0.07 0.11 0.14 0.14 0.79 0.4 0.46 0.16 0.18 0.14 0.41
2.8 2.93 3.6 2.1 3.0 5.39 3.69 1.46 3.28 2.95 3.16 3.29
0.14 0.12 0.1 0.23 0.08 0.36 0.06 0.16 0.14 0.12 0.02 0.15
0.0 0.31 0.1 0.0 0.11 0.71 0.28 0.08 0.18 0.02 0.02 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.08 0.0 0.04 0.02 0.02 0.1
0.07 0.04 0.09 0.04 0.1 0.17 0.02 0.04 0.14 0.0 0.02 0.02
2.23 1.86 2.06 2.03 2.56 1.83 1.31 1.1 2.84 2.0 1.58 2.0
0.04 0.04 0.05 0.25 0.13 0.31 0.23 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0
1.36 1.67 1.86 2.43 1.81 2.95 3.02 2.52 2.46 2.36 1.55 1.88
0.14 0.09 0.02 0.04 0.1 0.43 0.14 0.02 0.05 0.0 0.07 0.21
1.76 3.3 4.1 2.71 3.66 2.82 2.71 2.45 2.91 3.05 2.85 2.58
0.96 1.07 0.44 0.99 0.41 3.53 0.9 1.63 1.32 1.04 1.13 0.69
0.61 0.78 0.43 1.38 0.75 1.06 1.19 0.98 1.33 1.52 1.25 0.94
0.28 0.78 0.29 0.68 0.9 1.03 0.68 0.94 0.93 1.34 0.51 0.72
0.07 0.08 0.05 0.11 0.03 0.26 0.13 0.11 0.05 0.14 0.04 0.04
2.72 4.25 4.77 4.18 5.17 4.41 4.52 3.51 4.07 4.33 4.01 3.84
0.04 0.04 0.0 0.1 0.08 0.44 0.25 0.21 0.16 0.04 0.0 0.04
0.0 0.02 0.04 0.02 0.22 0.52 0.02 0.02 0.35 0.0 0.19 0.02
3.23 4.68 4.13 5.79 5.75 6.68 5.58 5.14 6.44 5.08 4.77 4.5
0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.75 0.48 0.63 0.83 1.41 2.93 2.11 1.75 0.72 0.95 1.12 0.64
0.0 0.04 0.0 0.0 0.05 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.04 0.02 0.12 0.05 0.37 0.08 0.02 0.05 0.02 0.04 0.02
1.39 2.73 3.17 3.19 3.8 3.5 3.07 2.38 4.02 2.47 3.24 1.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.06 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0
13.07 14.94 15.84 17.68 16.93 20.91 19.26 23.46 15.48 13.41 10.35 13.01
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.5 0.63 0.03 0.66 0.2 1.03 0.35 0.41 0.18 0.08 0.2 0.31
0.43 0.46 1.34 1.07 0.87 1.47 0.48 0.49 0.88 0.13 0.57 0.77
0.86 1.2 1.39 1.72 1.95 1.48 1.58 1.23 1.72 1.71 1.76 1.09
1.29 1.87 2.32 2.3 2.38 2.33 2.5 1.65 2.18 2.51 2.88 2.13
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.32 0.04 0.04 0.1 0.04 0.08 0.08
0.25 0.17 0.13 0.32 0.42 0.99 0.32 0.23 0.18 0.44 0.37 0.23
8.7 9.55 9.56 11.44 11.34 11.83 11.48 10.21 12.09 10.79 11.65 10.04
1.68 2.06 2.17 1.45 2.0 2.49 1.71 1.37 2.04 1.94 1.67 1.85
5.46 4.06 4.33 5.52 5.25 8.74 4.71 5.01 6.95 4.54 4.36 5.48
0.75 0.82 0.94 1.34 1.0 2.86 1.82 0.95 0.72 0.47 0.57 0.75
2.87 2.36 1.89 3.24 4.66 6.69 5.39 5.64 4.93 2.45 2.24 1.89
10.38 11.02 7.51 10.68 11.12 17.08 10.54 9.09 8.91 9.0 9.77 6.6
0.21 0.04 0.0 0.08 0.0 0.46 0.06 0.0 0.05 0.11 0.07 0.02
23.07 20.37 27.41 25.96 22.61 35.66 26.71 26.3 20.23 18.67 22.82 19.13
2.29 2.41 1.65 2.81 3.08 4.16 3.39 2.42 3.51 2.81 2.78 1.83
0.04 0.0 0.04 0.16 0.04 0.41 0.14 0.08 0.04 0.04 0.0 0.04
1.21 2.33 2.26 2.01 2.7 3.7 3.14 2.44 3.14 3.22 1.95 3.13
0.11 0.08 0.05 0.11 0.16 0.12 0.07 0.04 0.09 0.02 0.02 0.09
42.55 50.95 46.43 51.21 54.7 59.63 46.05 58.3 44.29 42.04 42.81 45.92

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)