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Heatmap: Cluster_109 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.48 0.24 -0.07 -0.12 -0.34 -0.26 -0.63 -0.37 -0.21 0.1 0.25 0.47
0.81 0.47 -0.21 -0.38 -0.72 -0.78 -0.87 -0.55 -0.16 0.06 0.28 0.73
1.63 0.36 -0.45 -0.82 -1.3 -0.95 -1.38 -1.4 -1.08 -0.36 0.22 1.14
0.61 0.11 -0.0 -0.23 -0.46 -0.7 -0.22 -0.3 -0.03 0.22 0.25 0.27
0.69 0.25 -0.26 -0.52 -0.66 -1.79 -1.84 -0.83 -0.62 0.15 0.71 1.32
1.04 0.83 0.5 -0.33 -0.61 -2.23 -1.58 -0.43 -1.39 -0.01 0.06 0.67
0.55 0.38 0.15 -0.32 -0.4 -0.67 -0.68 -0.43 -0.14 -0.04 0.24 0.58
0.49 0.25 -0.04 -0.06 -0.27 -0.58 -0.33 -0.35 -0.26 -0.01 0.19 0.51
1.4 0.86 -0.48 -1.1 -1.82 -2.34 -2.07 -1.2 -0.83 -0.09 0.26 1.32
1.18 0.65 -0.53 -0.76 -0.99 -0.77 -1.36 -0.26 -0.59 -0.18 0.12 0.95
0.15 0.17 0.06 0.08 -0.28 -0.27 -0.27 -0.33 -0.03 0.09 0.18 0.28
0.68 0.38 -0.25 -0.16 -0.31 -0.69 -0.58 -0.43 -0.11 0.02 0.26 0.45
0.69 0.26 -0.13 -0.39 -0.67 -0.57 -0.53 -0.0 -0.11 0.08 0.13 0.53
0.57 0.37 0.03 -0.18 -0.28 -0.39 -0.36 -0.14 -0.19 -0.02 0.01 0.24
1.79 1.06 -0.27 -1.3 -1.58 -2.81 -3.45 -2.51 -1.54 -0.88 0.03 1.36
0.46 0.38 0.09 -0.23 -0.37 -0.59 -0.33 0.02 -0.08 0.05 -0.09 0.3
1.05 0.5 -0.1 -0.4 -0.7 -0.69 -0.91 -0.93 -0.5 -0.29 0.35 0.79
0.36 0.22 -0.0 -0.09 -0.18 -0.47 -0.34 0.02 -0.01 0.01 -0.02 0.28
0.84 0.27 -0.19 -0.46 -0.52 -0.76 -0.84 -0.34 -0.31 -0.03 0.21 0.87
0.75 0.19 -0.09 -0.48 -0.6 -0.52 -0.24 -0.15 0.02 -0.08 0.29 0.3
0.32 0.19 -0.12 -0.3 -0.43 -0.51 -0.3 0.05 0.04 0.14 0.08 0.5
0.61 0.2 -0.14 -0.35 -0.37 -0.26 -0.51 -0.33 0.1 -0.13 0.18 0.49
0.34 0.2 0.11 -0.04 -0.13 -0.34 -0.31 -0.22 -0.13 0.01 0.04 0.28
1.26 0.52 -0.23 -0.35 -0.53 -0.88 -0.69 -0.64 -0.37 -0.23 0.07 0.45
0.72 0.32 -0.31 -0.69 -0.69 -1.13 -0.89 -0.32 -0.15 0.12 0.38 0.98
1.15 0.47 -0.32 -0.44 -0.42 -0.76 -0.95 -0.7 -0.39 -0.16 0.2 0.66
1.84 0.55 -1.0 -1.07 -1.36 -1.51 -1.38 -1.21 -1.26 -0.71 0.01 1.26
0.8 0.25 -0.49 -0.54 -0.51 -0.42 -0.4 -0.12 -0.14 -0.01 0.15 0.62
0.9 0.56 0.03 -0.35 -0.58 -1.11 -0.98 -0.44 -0.3 0.08 0.19 0.55
0.36 0.24 0.1 -0.09 -0.18 -0.31 -0.24 -0.11 -0.09 -0.05 -0.06 0.25
1.48 0.61 -0.04 -0.23 -1.18 -2.65 -1.97 -1.22 -1.04 0.01 0.39 0.82
0.54 0.23 -0.07 -0.37 -0.41 -0.92 -0.79 -0.2 -0.18 0.14 0.2 0.83
0.43 0.46 0.34 0.25 -0.29 -0.94 -0.8 -0.28 -0.56 0.07 -0.05 0.46
1.32 0.54 0.09 -0.36 -0.83 -1.11 -1.45 -1.18 -0.84 -0.22 0.22 0.84
0.37 0.27 0.17 -0.06 -0.17 -0.63 -0.54 -0.05 -0.09 0.04 -0.06 0.38
0.67 0.33 0.16 -0.27 -0.18 -0.61 -0.49 -0.11 -0.23 -0.11 0.02 0.31
0.95 0.36 -0.14 -0.63 -0.64 -1.19 -0.97 -0.48 -0.3 0.07 0.27 0.9
1.29 0.55 -0.29 -0.37 -0.39 -0.85 -0.86 -0.59 -0.42 -0.51 0.06 0.56
0.59 0.35 0.11 -0.24 -0.26 -0.42 -0.45 -0.09 -0.08 -0.08 0.06 0.16
1.08 0.72 -0.33 -0.83 -1.03 -1.11 -0.99 -0.51 -0.19 -0.06 0.19 0.81
0.53 0.25 -0.21 -0.21 -0.25 -0.45 -0.42 -0.18 -0.21 -0.04 0.04 0.64
1.31 0.6 -0.55 -1.25 -1.56 -2.68 -2.43 -1.59 -1.19 -0.18 0.58 1.62
0.54 0.3 -0.18 -0.4 -0.37 -0.82 -0.65 -0.27 -0.2 0.09 0.27 0.78
1.09 0.71 -0.35 -0.73 -1.01 -1.27 -1.34 -0.74 -0.47 -0.26 0.23 1.15
0.74 0.45 0.1 -0.28 0.03 -0.6 -0.47 -0.41 -0.26 -0.23 -0.13 0.39
0.45 0.32 0.41 0.09 -0.15 -0.56 -0.83 -0.66 -0.33 -0.12 0.14 0.48
1.23 0.68 -0.48 -0.51 -0.48 -1.09 -1.61 -1.63 -2.06 -1.13 0.35 1.49
0.55 0.23 -0.05 -0.41 -0.65 -1.69 -1.05 -0.84 -0.35 0.03 0.5 1.29
1.21 0.5 -0.17 -0.64 -0.78 -0.92 -0.84 -0.58 -0.48 -0.25 0.11 0.82
0.71 0.34 -0.35 -0.46 -0.87 -1.36 -0.73 -0.48 -0.37 0.41 0.21 1.05
0.5 0.31 -0.17 -0.49 -0.52 -1.38 -0.83 -0.54 -0.12 0.17 0.48 0.98
1.59 0.74 -0.15 -0.96 -0.95 -1.24 -1.71 -1.35 -0.6 -0.52 0.23 0.8
1.26 0.71 0.29 -0.08 -1.25 -1.39 -1.18 -1.08 -1.07 -0.02 0.24 0.53
1.31 0.8 0.02 -0.98 - - -2.12 -3.09 -0.71 0.22 0.13 1.6
0.66 0.41 0.1 -0.31 -0.15 -0.68 -0.68 -0.26 -0.08 -0.07 0.06 0.37
1.3 0.52 -0.33 -0.64 -0.93 -1.36 -1.08 -0.68 -0.36 -0.04 0.15 0.84
1.88 1.35 -0.32 -1.35 -1.37 -2.26 -2.51 -2.34 -1.53 -1.98 -1.4 1.39
0.8 0.82 0.12 -0.64 -1.23 -2.04 -1.71 -1.12 -0.95 -0.41 0.29 1.5
0.73 0.19 -0.17 -0.37 -0.32 -0.53 -0.32 -0.2 -0.16 0.08 0.11 0.43
1.13 0.41 -0.2 -0.47 -0.59 -0.79 -0.96 -0.7 -0.24 -0.13 0.25 0.65
0.92 0.39 -0.25 -0.39 -0.61 -0.99 -0.37 -0.43 -0.3 0.02 0.26 0.58
0.42 0.39 -0.03 -0.29 -0.4 -0.59 -0.73 -0.5 -0.15 0.17 0.33 0.62
1.11 0.4 -0.01 -0.26 -0.53 -0.58 -0.57 -0.6 -0.7 -0.52 0.06 0.72
0.38 0.28 0.15 -0.07 -0.16 -0.51 -0.35 -0.12 -0.1 0.03 0.0 0.22
0.66 0.15 -0.07 -0.26 -0.33 -0.25 -0.36 -0.21 -0.13 -0.04 0.05 0.41
1.38 0.62 -0.44 -0.4 -0.63 -0.4 -0.94 -0.9 -1.02 -0.33 0.16 0.59
0.74 0.29 -0.22 -0.33 -0.57 -0.57 -0.35 -0.25 -0.07 0.06 0.09 0.51
0.47 0.32 0.37 -0.15 -0.59 -0.98 -1.22 -0.89 -0.51 0.03 0.24 1.09
1.48 0.55 -0.53 -0.88 -0.99 -1.01 -1.14 -0.97 -0.45 -0.32 0.3 0.84
0.78 0.53 0.01 -0.08 -0.45 -0.84 -0.89 -0.6 -0.28 -0.06 0.21 0.54
0.26 0.06 0.04 -0.05 -0.13 -0.17 -0.28 -0.16 -0.08 0.1 0.11 0.2
0.57 0.09 -0.44 -0.58 -0.41 -0.47 -0.66 -0.19 -0.18 0.19 0.25 0.89
1.76 0.91 -0.55 -1.45 -1.52 -2.01 -1.7 -1.73 -1.4 -0.99 -0.08 1.4
1.24 0.64 -0.12 -0.67 -0.89 -0.96 -0.77 -0.88 -0.21 -0.25 -0.03 0.73
0.51 0.33 -0.02 -0.06 -0.48 -0.53 -0.4 -0.29 -0.07 0.11 0.19 0.29
0.95 0.46 0.1 -0.17 -0.35 -0.9 -0.87 -0.44 -0.31 -0.04 0.1 0.36
0.61 0.34 -0.04 -0.11 -0.42 -0.45 -0.42 -0.14 -0.21 -0.04 0.11 0.33
1.02 0.67 -0.46 -0.76 -0.86 -0.51 -1.4 -1.6 -0.5 0.04 0.55 0.93
0.79 0.37 -0.08 -0.45 -0.87 -1.89 -1.59 -1.11 -0.6 0.1 0.65 1.26
1.08 0.46 -0.22 -1.25 -0.74 -1.37 -1.44 -1.35 -0.04 -0.02 0.4 1.14
0.32 0.22 0.01 -0.21 -0.33 -0.4 -0.41 0.01 -0.04 0.12 0.16 0.29
0.51 0.36 -0.03 -0.21 -0.33 -0.66 -0.5 -0.24 -0.12 0.07 0.06 0.54
0.55 0.22 0.01 -0.19 -0.25 -0.25 -0.36 -0.26 -0.08 -0.11 0.11 0.31
1.17 0.31 -0.46 -0.6 -0.73 -0.66 -0.57 -0.51 -0.6 0.03 0.32 0.66
0.42 0.33 -0.13 -0.21 -0.25 -0.31 -0.29 -0.27 -0.06 0.1 0.05 0.34
0.49 0.34 -0.29 -0.22 -0.3 -0.24 -0.44 -0.18 -0.08 -0.0 0.1 0.43
0.2 0.13 -0.18 -0.17 -0.36 -0.4 -0.62 -0.2 -0.13 0.17 0.33 0.71
0.55 0.26 -0.09 -0.21 -0.25 -0.67 -0.51 -0.19 -0.08 0.04 0.15 0.5
0.49 0.19 -0.11 -0.17 -0.25 -0.76 -0.51 -0.24 -0.12 0.02 0.24 0.64
0.59 0.32 0.12 -0.18 -0.59 -0.66 -0.82 -0.65 0.01 0.1 0.37 0.49
0.63 0.25 -0.06 -0.1 -0.32 -0.51 -0.44 -0.21 -0.34 -0.12 0.05 0.61
0.76 0.12 -0.07 -0.34 -0.24 -0.39 -0.15 -0.14 -0.29 -0.09 0.04 0.35
0.59 0.25 0.02 -0.43 -0.18 -0.58 -0.97 -0.58 -0.19 0.01 0.21 0.83
0.64 0.38 -0.01 -0.25 -0.38 -1.22 -0.9 -0.47 -0.18 0.07 0.24 0.79
0.68 0.32 -0.05 -0.13 -0.25 -0.68 -0.51 -0.38 -0.24 0.01 0.13 0.48
0.94 0.02 -0.41 -0.82 -0.87 -0.6 -0.19 -0.26 0.0 0.01 0.26 0.69
0.76 0.49 -0.22 -0.66 -0.69 -0.97 -0.84 -0.28 -0.13 0.14 0.22 0.78
0.41 0.32 0.17 -0.02 -0.3 -0.83 -0.72 -0.37 -0.13 0.1 0.29 0.45
1.82 0.98 -0.84 -2.35 -2.29 -2.65 -2.0 -0.71 -0.63 -0.3 0.09 0.99

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.