Heatmap: Cluster_28 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
100988	-0.2	-0.59	-0.16	-0.26	-0.03	-0.0	-0.35	0.28	0.37	0.25	0.27	0.12
101352	0.14	-0.85	-0.34	-0.52	-0.02	-0.46	-0.8	0.02	0.23	0.31	0.75	0.55
110438	0.1	-0.34	-0.36	-0.29	-0.17	-0.13	-0.16	0.1	0.22	0.14	0.35	0.3
110768	0.1	-0.3	-0.22	-0.24	-0.12	-0.2	-0.26	-0.01	0.23	0.21	0.34	0.27
140930	-0.07	-0.06	-0.09	-0.14	0.03	-0.3	-0.16	-0.11	0.26	0.08	0.32	0.13
148911	-0.16	-0.77	-0.11	-0.39	-0.03	-0.24	-0.46	0.21	0.38	0.34	0.37	0.33
150151	0.07	-0.31	0.01	-0.38	-0.17	-0.29	-0.4	0.16	0.28	0.34	0.21	0.21
153690	0.14	-0.17	-0.29	-0.12	-0.04	0.0	-0.3	-0.04	0.2	0.12	0.15	0.22
154282	0.09	-0.3	-0.36	-0.35	-0.06	-0.04	-0.15	0.04	0.26	0.09	0.26	0.31
166581	-0.13	-0.49	0.01	-0.14	0.11	-0.46	-0.26	-0.08	0.34	0.16	0.42	0.2
169212	0.1	-0.23	-0.18	-0.23	-0.04	-0.09	-0.16	0.0	0.3	-0.01	0.22	0.2
170139	0.08	-0.25	-0.08	-0.19	-0.03	-0.17	-0.12	0.1	0.14	0.11	0.2	0.12
172555	0.19	-0.27	-0.13	-0.29	-0.02	-0.0	-0.3	-0.01	0.16	0.17	0.21	0.13
172716	0.08	-0.52	-0.03	-0.34	0.15	-0.16	-0.42	0.07	0.12	0.09	0.42	0.24
172808	0.03	-0.41	-0.39	-0.09	0.06	0.01	-0.04	0.01	0.05	0.22	0.17	0.22
227322	-0.08	-0.27	-0.24	-0.28	-0.2	-0.11	-0.16	-0.13	0.3	0.38	0.32	0.22
227886	0.26	-0.2	-0.3	-0.43	-0.23	-0.36	-0.23	0.19	0.17	0.25	0.32	0.25
228194	0.09	-0.29	-0.13	-0.28	-0.06	-0.09	-0.46	0.04	0.24	0.14	0.24	0.33
228916	-0.01	-0.37	-0.17	-0.35	-0.1	-0.08	-0.2	0.02	0.36	0.1	0.33	0.24
229898	-0.31	-0.39	-0.13	-0.07	-0.01	-0.07	-0.18	0.09	0.45	0.29	0.14	-0.03
231938	0.15	-0.49	-0.1	-0.42	-0.1	0.02	-0.21	0.01	0.32	0.09	0.2	0.27
232056	-0.07	-0.63	-0.45	-0.47	-0.26	-0.11	-0.03	-0.01	0.38	0.41	0.47	0.27
232989	0.1	-0.2	0.01	-0.17	0.08	-0.19	-0.19	-0.01	0.03	0.1	0.14	0.21
234158	0.31	-0.26	-0.18	-0.38	-0.1	-0.15	-0.31	-0.16	0.12	0.23	0.34	0.28
268099	0.09	-0.81	-0.25	-0.63	-0.14	-0.7	-0.64	0.35	0.4	0.54	0.44	0.39
269005	-0.19	-0.8	-0.43	-0.55	-0.2	-0.43	-0.38	0.3	0.51	0.51	0.48	0.34
271847	0.08	-0.11	-0.2	-0.16	-0.09	-0.22	-0.3	0.01	0.14	0.18	0.27	0.25
36854	0.05	-0.4	-0.2	-0.13	-0.04	0.01	-0.26	-0.05	0.25	0.3	0.17	0.13
38956	-0.1	-0.56	-0.23	-0.39	-0.17	-0.32	-0.26	0.11	0.47	0.27	0.39	0.34
39553	-0.33	-0.99	-0.05	-0.42	-0.27	-0.64	-0.65	0.28	0.51	0.63	0.31	0.54
402221	0.12	-0.66	-0.87	-1.25	-0.81	-0.68	-0.36	0.28	0.67	0.5	0.44	0.82
403662	0.25	-0.28	-0.38	-0.55	-0.04	-0.28	-0.26	-0.13	0.34	0.24	0.42	0.27
405044	0.07	-0.2	-0.17	-0.23	-0.09	-0.16	-0.17	0.12	0.17	0.18	0.19	0.18
405072	0.15	-0.3	-0.67	-0.58	-0.32	-0.41	-0.21	0.19	0.36	0.32	0.37	0.48
406192	0.07	-1.16	-0.55	-0.56	0.02	-0.57	-0.64	0.36	0.5	0.37	0.63	0.35
407256	-0.28	-1.72	-0.49	-0.54	-0.27	-0.41	-0.06	0.3	0.59	0.62	0.54	0.28
408776	-0.35	-0.59	-0.39	-0.59	-0.24	-0.39	-0.7	-0.22	0.35	0.63	0.55	0.81
410207	0.37	-0.64	-1.41	-0.6	-0.46	-0.26	-0.98	0.12	0.4	0.38	0.66	0.75
410248	0.1	-0.32	-0.1	-0.2	-0.04	-0.2	-0.09	0.09	0.22	0.13	0.18	0.11
412878	0.11	-1.13	-1.64	-1.71	-1.33	-0.45	-0.04	0.57	0.81	0.5	0.39	0.83
414216	-0.05	-0.37	-0.13	-0.25	0.03	-0.22	-0.23	0.13	0.24	0.24	0.23	0.2
422857	0.12	-0.37	-0.6	-0.57	-0.36	-0.49	-0.27	0.35	0.37	0.3	0.35	0.5
423101	0.06	-0.53	-0.52	-0.42	0.04	-0.08	-0.73	0.28	0.31	0.17	0.52	0.3
423536	-0.51	-0.45	-0.61	-0.55	0.07	-0.7	-0.61	0.11	0.62	0.5	0.61	0.44
428898	-0.01	-0.31	-0.45	-0.47	-0.28	-0.21	-0.16	0.06	0.35	0.16	0.51	0.39
430927	0.03	-0.18	-0.11	-0.14	0.01	-0.23	-0.19	0.01	0.19	0.11	0.27	0.12
437299	-0.14	-0.57	-0.96	-1.18	-0.3	-0.45	-0.22	0.32	0.37	0.56	0.46	0.74
438024	0.07	-0.5	-0.4	-0.27	-0.21	-0.13	-0.25	0.17	0.33	0.34	0.36	0.16
438262	0.04	-0.98	-0.56	-0.36	0.02	-0.38	-0.44	0.21	0.37	0.49	0.45	0.35
438472	-0.09	-0.51	-0.11	-0.25	-0.04	-0.21	-0.22	0.02	0.39	0.22	0.33	0.2
439356	0.29	-0.41	-0.27	-0.5	-0.21	-0.37	-0.29	0.23	0.26	0.23	0.3	0.33
440209	0.02	-0.38	-0.26	-0.23	0.09	-0.21	-0.19	0.18	0.14	0.18	0.23	0.24
441012	-0.15	-0.34	-0.0	-0.15	-0.04	-0.04	-0.18	0.02	0.24	0.22	0.23	0.06
442733	-0.04	-0.46	-0.08	-0.4	0.04	-0.43	-0.21	0.24	0.25	0.25	0.18	0.35
443146	0.28	-0.23	-0.11	-0.29	-0.1	-0.06	-0.24	-0.1	0.2	0.17	0.19	0.15
444197	0.07	-0.2	-0.49	-0.34	-0.04	-0.08	-0.28	0.01	0.33	0.24	0.22	0.3
444239	0.01	-0.52	-0.31	-0.51	-0.15	-0.39	-0.27	0.26	0.37	0.46	0.39	0.16
445783	0.06	-0.31	-0.12	-0.29	0.06	-0.34	-0.29	0.1	0.16	0.14	0.35	0.25
446086	0.0	-0.32	-0.26	-0.23	-0.05	-0.05	-0.19	0.12	0.19	0.24	0.29	0.1
447029	-0.01	-0.25	-0.41	-0.16	-0.22	-0.3	-0.01	0.26	0.33	0.14	0.12	0.27
447293	-0.06	-0.13	-0.16	-0.13	0.05	-0.2	-0.22	0.01	0.23	0.15	0.21	0.16
447568	0.21	-0.46	-0.4	-0.61	-0.2	-0.48	-0.3	0.08	0.28	0.31	0.54	0.42
448410	-0.06	-0.14	-0.26	-0.16	-0.04	-0.12	-0.25	-0.04	0.3	0.19	0.19	0.24
58751	0.16	-0.34	-0.32	-0.39	-0.11	-0.17	-0.12	0.07	0.25	0.17	0.29	0.27
70753	-0.2	-0.35	-0.11	-0.06	0.09	-0.04	-0.14	0.05	0.17	0.12	0.25	0.1
73360	0.1	-0.33	-0.02	-0.29	-0.04	-0.29	-0.35	0.17	0.21	0.19	0.15	0.28
73896	0.08	-0.59	-0.37	-0.4	-0.08	-0.36	-0.43	0.26	0.41	0.28	0.46	0.21
74166	-0.0	-0.29	-0.39	-0.2	-0.09	0.08	-0.13	-0.23	0.21	0.18	0.31	0.32
74630	0.05	-0.62	-0.49	-0.77	-0.21	-0.61	-0.45	-0.21	0.31	0.4	0.74	0.74
74832	-0.05	-0.18	-0.07	-0.12	-0.04	-0.03	-0.06	0.09	0.16	0.07	0.12	0.07
74962	0.03	-0.27	-0.25	-0.37	-0.16	0.11	-0.26	-0.1	0.25	0.22	0.25	0.32
77916	0.29	-0.19	-0.54	-0.36	-0.41	-0.16	-0.41	0.15	0.19	0.23	0.37	0.39
80493	-0.31	-0.27	-0.52	-0.18	-0.09	-0.18	-0.21	0.01	0.37	0.32	0.45	0.24
81136	-0.21	-1.17	-0.44	-0.44	-0.28	-0.78	-0.68	0.04	0.66	0.64	0.68	0.5
81650	0.03	-0.19	-0.1	-0.15	-0.06	-0.01	-0.23	-0.0	0.16	0.1	0.18	0.2
83551	-0.14	-0.57	0.08	-0.28	-0.11	-0.29	-0.34	0.08	0.25	0.37	0.35	0.25
84100	-0.92	-0.81	0.02	-0.35	-0.15	-0.22	-0.83	0.06	0.63	0.62	0.38	0.44
89852	-0.16	-0.35	0.09	-0.09	0.01	-0.13	-0.21	0.03	0.11	0.13	0.32	0.11
90187	0.22	-0.29	-0.06	-0.36	-0.28	-0.26	-0.34	-0.12	0.3	0.26	0.42	0.2
90708	-0.09	-0.37	-0.39	-0.24	-0.25	-0.03	-0.21	-0.31	0.28	0.37	0.49	0.33
91379	0.02	-0.2	-0.32	-0.21	-0.01	-0.17	-0.12	0.18	0.23	0.05	0.19	0.22
96490	-0.0	-0.21	-0.15	-0.21	-0.08	-0.17	-0.12	0.13	0.03	0.2	0.24	0.22
99190	-0.06	-0.25	-0.04	-0.23	-0.09	-0.05	-0.34	-0.01	0.16	0.19	0.37	0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.