Heatmap: Cluster_37 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
101524	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
102594	-	-	-	-	-	-	-	-	1.85	3.07	-	-
107748	-	1.38	-	-	-	-	-	-	1.16	1.45	2.15	-
109762	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
110494	-	-	-	-	-	-	-	2.28	-	-1.05	2.74	-
111688	-0.76	-2.31	-	-1.47	-2.72	0.92	0.59	1.59	0.53	0.19	0.68	-3.16
112102	-	-	-	-	-	-	-	1.36	-0.42	1.5	2.0	0.9
122109	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
124489	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
128621	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
131670	-	2.39	-	-	-	-	-	2.76	-	-	-	-
134452	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
135313	-	-	-	-	-	-	1.98	3.01	-	-	-	-
19708	-	-	-	-	-	-	1.6	1.63	2.06	0.76	-	-
2318	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
33390	-	-	-	-	-	-	1.27	1.3	2.14	1.43	-	-
36878	-	2.35	-	-	-	0.84	-	2.35	-	-	-	-
39075	-	-	-	-	-	-	0.86	-	-	2.13	1.94	1.0
402021	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
402086	0.21	1.32	-	0.63	-	-	-0.39	-0.66	1.47	1.06	-0.83	-
402094	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
402166	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.7	2.46	-
402330	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
402334	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.73	2.43	-
402416	-	-	-	-	-	-	-	-	2.43	2.72	-	-
402870	-	-0.79	-	-0.35	-	-	-	2.08	1.29	-0.54	1.36	-0.46
403536	-	-	-	-	-	-	-	1.21	-	3.28	-	-
403605	-	0.32	1.12	-	0.52	-	-	-	-	1.4	1.68	0.37
403641	1.56	-	-	-0.29	-	0.43	-1.03	1.7	0.83	0.42	-	-
404003	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
404157	-	-	-	-	-	-	-	2.95	-	2.09	-	-
404740	0.09	-	-	-	-0.28	-	-	0.88	1.39	1.68	-0.95	0.95
404926	-	2.55	-	-	-	-	-	-	-	2.62	-	-
405302	-	1.65	-	1.36	-	-	-	2.65	-	-	-	-
406685	-	-	-	1.8	-	-	-	3.09	-	-	-	-
406694	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
406967	-	-	-	-	-	-	-	-	1.83	2.14	0.84	1.15
407913	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
408728	-	-	-	-	-	-	-	2.01	-	2.14	1.84	-
408940	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
409846	-	0.68	-	-	-	-	0.16	2.36	0.46	-0.83	-	1.15
409884	-2.25	-3.14	-1.71	-0.96	0.77	-1.66	-0.26	1.18	0.88	0.26	0.12	0.7
410039	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
410324	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
410944	0.72	-0.16	-	-	-	0.17	-	1.84	1.23	-	1.26	-
411055	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
411077	-	0.03	-	-1.84	-	0.36	-1.57	1.78	0.28	1.75	-1.65	-0.44
412153	-	1.14	0.94	0.85	-	-	-	-	-	2.6	-	-
412707	-	-	-	-	-	-	-	2.37	0.18	2.51	-	-
412965	-	1.83	-	-	-	-	-	-	-	2.22	1.92	-
413034	-0.52	-2.69	0.59	-1.2	-	-0.16	1.09	1.4	0.11	0.06	0.51	-
413771	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
414015	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
414302	0.34	0.26	-	-	-	-	1.11	2.54	-	0.65	-	-
415344	-	1.78	-	-	-	-	-	3.1	-	-	-	-
4154	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
415442	0.8	-	-	-	-	-1.25	1.84	1.61	0.23	1.03	-	-
415988	-0.49	-1.09	-2.12	-0.73	0.22	-2.77	0.35	-0.29	-0.52	1.33	0.58	0.9
416078	-	-	-	-	-	-	-	3.06	-	1.87	-	-
416310	-	-	1.25	-	-	-	-	3.27	-	-	-	-
416909	-	-	-	-	-	-	-	2.52	-	2.65	-	-
417042	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
417155	-0.06	-0.06	-	-0.17	-0.68	-	0.04	1.88	1.04	-0.95	0.36	-
417220	-1.29	0.38	-2.37	0.76	-	-	-1.17	-0.11	-0.33	0.3	2.1	-0.47
417975	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
418239	-0.41	0.72	-0.99	-1.25	0.06	-2.5	-3.59	0.25	-0.18	0.31	0.28	1.51
418243	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
418836	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
419130	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
419167	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
419706	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
419710	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
419732	-	-	0.98	-	0.91	-	-	-	-	1.79	1.56	0.8
419927	-	-	-	0.64	-	-	0.79	-	1.66	1.87	-	0.92
420267	-	-	-	0.91	-	-	0.71	0.74	0.58	2.41	-	-
420422	0.22	-0.12	-0.48	0.01	-0.11	-0.89	-0.34	0.15	0.08	0.31	0.14	0.5
420697	-	-0.54	-	-1.75	-	-	-1.18	0.14	1.19	1.22	2.02	-0.31
420955	-0.18	0.18	-	-0.55	-2.22	-1.73	-0.46	0.35	-2.21	1.22	0.95	1.21
422833	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
424173	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
424457	-	-	-	-	-	-	1.59	3.17	-	-	-	-
424623	-	0.27	-	-	-	-	-	0.28	-	3.09	0.11	-
424634	-	-	-	1.4	-	-	-	2.23	-	1.36	1.06	-
425287	1.52	-	-	0.35	-	-	-	-	1.45	1.78	-	0.76
425850	-	-	-	0.03	-	-	-	1.91	0.13	0.46	1.74	0.47
426280	-	-	-	-	-1.43	-1.36	-1.71	0.7	2.04	1.76	0.85	-
426380	-	-	-	-	-	-	-	-	1.0	2.91	-	1.3
426485	1.91	-	-	-	-	-	-	2.67	0.89	-	-	-
426851	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
427890	-	-	-1.32	-	-1.62	-0.39	-	0.58	0.88	1.31	1.32	1.14
428366	-	-	0.62	-	-	-	-	-	2.21	2.54	-	-
428580	-	-	-	-	-	-	-	2.8	1.65	-	-	0.91
429114	0.82	-	-	-0.22	-	-	-0.07	1.54	1.76	1.08	-	-
429179	0.89	-1.23	-	-1.26	-0.46	-	-	1.04	-1.12	1.17	1.45	0.1
429697	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
429990	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
430339	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
430727	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
431351	0.77	-	0.69	-0.27	-	-	-0.13	-0.03	-	2.35	-0.21	-
431514	-	-	-	-	-	-	0.16	2.79	1.99	-	-	-
431746	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
431924	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
432290	-	-	-	-	-	-	1.69	-	-	3.13	-	-
432450	-	0.54	-	-	-	-	1.07	-	0.64	2.42	0.63	-
49592	1.61	-	-	-	-	-	-	-	0.59	2.04	1.74	-
49788	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
57239	-	-	-	1.86	-	-	-	2.16	1.96	-	-	-
6228	-	0.68	-	0.39	-	-	-	0.68	1.49	0.82	1.55	-
65351	0.05	-0.14	-0.25	-0.14	0.04	-0.09	-0.05	0.25	0.13	0.15	-0.03	0.0
72694	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
73386	-	1.95	-	-	-	-	-	-	-	3.02	-	-
75677	0.19	-	-	-0.86	-	1.55	-0.68	1.31	0.16	0.45	0.15	-0.54
7961	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
80440	-0.09	-0.27	-0.16	-0.07	0.16	0.05	-0.15	0.23	0.16	0.04	-0.05	0.06
82182	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-
8355	1.85	-	-	0.68	-	-	0.95	-	-	2.28	-	-
8469	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-
85109	-	0.0	-	-	0.44	0.09	-	1.53	1.33	1.66	-	-
8619	0.42	-	-	-	-0.16	0.71	0.72	-	0.39	2.12	-	-0.27
91439	-	1.04	-	-	-	0.3	1.54	2.3	-0.21	-	-	-
97195	-	-	-	1.59	-	0.22	0.1	-	0.93	2.28	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.