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Heatmap: Cluster_85 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.47 -0.35 -0.4 -0.02 0.17 0.17 0.18 0.27 0.24 -0.08 0.05 -0.01
-0.1 -0.3 -0.77 -0.28 0.66 -0.13 -0.13 0.34 0.17 -0.07 0.24 -0.15
-0.19 -0.14 -0.19 0.03 0.07 0.03 -0.05 0.08 0.14 0.1 0.08 -0.01
-0.18 -0.24 -0.12 -0.03 0.26 -0.02 -0.02 0.09 0.22 -0.04 0.06 -0.06
-0.3 -0.48 -0.31 -0.2 0.22 0.15 0.05 0.11 0.32 0.09 0.08 0.04
-0.28 -0.3 -0.42 -0.04 0.17 -0.03 -0.01 0.09 0.3 0.06 0.15 0.15
-0.31 -0.17 -0.25 -0.04 0.21 -0.02 0.39 0.38 -0.0 0.02 -0.27 -0.18
-0.37 -0.28 -0.34 -0.13 0.07 0.24 0.25 0.31 0.25 0.07 -0.04 -0.28
-0.55 -0.46 -0.44 0.07 0.31 0.01 0.06 0.48 0.3 0.09 -0.23 -0.05
-0.83 -1.25 -0.96 -0.05 1.24 -0.49 -0.67 0.55 0.54 0.23 -0.05 -0.39
-0.11 -0.24 -0.12 -0.06 0.23 -0.13 0.12 0.39 0.2 -0.15 -0.13 -0.16
-0.5 -0.72 -0.28 -0.32 0.07 0.29 0.3 0.23 0.46 0.18 0.02 -0.23
-0.34 -0.54 -0.39 -0.22 0.05 -0.02 0.06 0.25 0.36 0.08 0.28 0.12
-0.53 -0.84 -0.7 -0.44 0.3 0.59 0.45 0.51 0.21 0.12 -0.09 -0.53
-0.15 -0.14 -0.34 0.01 0.14 -0.04 -0.07 0.05 0.36 0.06 0.09 -0.07
-0.13 -0.08 -0.21 -0.06 0.07 0.05 0.07 0.2 0.04 -0.04 -0.04 0.07
-0.28 -0.25 -0.23 -0.07 0.3 0.03 -0.06 0.27 0.25 0.06 -0.05 -0.14
-0.06 -0.18 -0.17 -0.01 0.04 0.04 -0.03 0.08 0.11 0.04 0.15 -0.05
-0.24 -0.11 -0.32 -0.03 0.14 0.06 0.01 0.21 0.13 0.02 0.05 -0.0
-0.25 -0.19 -0.38 -0.04 0.16 0.07 0.1 0.23 0.16 0.05 0.01 -0.04
-0.18 -0.18 -0.16 0.01 0.04 -0.0 0.07 0.16 0.07 0.02 0.09 -0.01
-0.06 -0.13 -0.21 -0.01 0.1 0.05 -0.01 0.15 0.08 0.02 0.02 -0.04
-0.26 -0.12 -0.12 -0.12 0.18 0.01 0.27 0.19 0.07 0.08 -0.2 -0.09
-0.02 -0.21 -0.2 -0.08 0.15 -0.0 -0.09 0.08 0.16 0.01 0.17 -0.03
-0.27 -0.15 -0.2 -0.05 0.01 0.02 0.03 0.04 0.23 0.13 0.12 0.02
-0.08 -0.14 -0.14 0.02 0.09 -0.06 0.03 0.06 0.08 -0.01 0.02 0.11
-0.09 -0.12 -0.38 0.06 0.07 0.14 -0.03 0.06 0.2 -0.05 0.09 -0.02
-0.91 -0.94 -1.23 -0.9 1.12 -0.54 -1.15 1.22 0.59 -0.47 -0.14 0.28
0.04 -0.71 -0.43 -0.16 0.59 -0.14 -0.13 0.71 0.06 -0.1 0.17 -0.62
-0.31 -0.84 -0.75 -0.79 0.44 -0.12 0.28 0.85 0.41 0.03 0.01 -0.29
-0.28 -0.3 -0.2 0.01 0.22 0.03 0.07 0.21 0.24 -0.09 0.05 -0.09
- -1.17 -3.75 -1.71 1.41 0.67 -3.58 2.14 0.09 -0.66 - -0.48
-0.47 -0.93 -0.3 -0.55 0.3 0.21 0.14 0.37 0.46 0.27 0.14 -0.34
-0.06 -0.19 -0.22 -0.02 0.13 -0.08 -0.06 0.09 0.32 0.04 -0.19 0.14
-0.26 -0.12 -0.3 -0.07 0.05 0.1 0.39 0.31 0.12 0.08 -0.15 -0.37
-0.43 -0.34 -0.31 -0.19 0.27 0.46 0.02 0.29 0.31 0.01 -0.21 -0.23
-0.27 -0.25 -0.18 0.09 0.13 0.06 -0.27 0.19 0.13 -0.0 0.14 0.1
- - - -0.57 2.24 - - 2.72 - - - -
-0.36 -0.1 -0.18 0.19 0.26 -0.02 -0.29 0.47 -0.06 -0.3 0.19 -0.06
-0.26 -0.54 -0.84 -0.55 0.56 0.03 -0.15 0.35 0.43 -0.01 0.13 0.18
-0.1 -0.42 -0.23 -0.08 0.11 0.04 -0.0 0.11 0.28 0.03 0.08 0.06
-0.15 -0.25 -0.16 -0.06 0.2 0.04 0.02 0.14 0.18 -0.04 0.0 -0.01
- -3.47 -0.97 -1.92 0.97 -1.3 -0.77 1.66 1.2 -0.33 -0.35 0.21
-0.45 -0.4 -0.17 0.22 0.48 -0.07 -0.23 0.49 -0.06 -0.06 0.02 -0.11
-0.51 -1.65 - -1.68 1.98 0.52 - 1.11 0.43 -1.4 0.49 -
-0.35 -0.21 -0.21 0.05 0.13 -0.01 0.18 0.25 0.17 0.08 -0.07 -0.15
-0.37 -0.35 -0.37 -0.08 0.15 0.04 0.03 0.36 0.29 -0.1 0.05 0.13
-0.25 -0.14 -0.23 0.02 0.12 0.11 -0.06 0.14 0.12 -0.04 0.1 0.04
-0.48 -0.24 -0.21 -0.01 0.12 0.11 0.01 0.26 0.17 0.09 0.03 -0.02
-0.09 -0.34 -0.82 -0.06 -0.09 0.55 0.14 0.16 0.18 -0.35 0.12 0.17
-0.32 -0.21 -0.23 -0.19 0.17 0.14 0.08 0.29 0.16 0.06 -0.12 0.01
-1.38 -1.59 -2.08 -1.02 0.95 -0.1 0.19 0.91 1.08 -0.27 -0.59 0.1
-0.6 -2.28 -1.75 -1.85 0.75 0.28 0.67 0.76 0.94 -0.04 -0.69 -0.2
-0.37 -0.46 -1.53 -0.42 0.56 0.31 0.35 0.96 -0.02 -0.14 -0.33 -0.34
-0.33 -0.23 -0.64 0.37 0.52 -0.22 0.12 0.27 0.08 -0.39 0.15 -0.17
-0.37 -0.32 -0.25 0.17 0.22 -0.23 0.03 0.2 0.23 -0.04 0.21 -0.02
-0.23 -0.23 -0.56 0.02 0.2 0.01 -0.26 0.18 0.39 0.0 0.19 0.04
-0.32 -0.2 -0.17 -0.05 0.23 0.05 -0.09 0.13 0.16 0.09 0.06 0.01
-0.72 -2.22 -3.54 -1.96 0.26 0.62 0.99 1.22 0.27 0.13 -0.06 -0.92
-0.53 -0.58 -0.13 0.03 0.4 0.12 0.17 0.24 0.38 -0.19 -0.13 -0.15
-0.36 -0.35 -0.19 -0.15 0.12 0.3 0.02 0.08 0.3 -0.04 0.06 0.02

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.