Heatmap: Cluster_139 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.18 -0.8 -1.27 -0.57 -0.13 0.09 0.67 0.48 0.43 0.43 -0.34 -0.41
-0.68 -0.3 0.01 0.07 -0.14 -0.27 0.19 0.11 0.18 0.24 0.21 0.11
-0.31 -0.22 -0.24 -0.17 -0.15 0.08 0.2 0.09 0.29 0.26 0.13 -0.12
-0.33 -0.27 -1.17 -0.4 0.36 -0.01 0.4 0.31 0.42 0.03 -0.01 -0.04
-0.51 -0.26 -0.48 -0.0 -0.01 -0.07 0.16 -0.04 0.44 0.27 0.2 -0.01
-0.35 -0.45 -0.12 -0.11 0.15 0.07 0.08 -0.01 0.24 0.23 0.07 0.04
-0.94 -0.56 -0.54 -0.29 0.08 0.75 0.14 0.3 0.61 -0.0 -0.05 -0.45
-0.08 -0.13 -0.07 -0.07 0.01 0.13 0.1 -0.08 0.18 0.06 0.02 -0.11
-0.13 -0.17 -0.06 -0.04 0.11 -0.18 0.01 0.06 0.18 0.06 0.13 -0.04
-0.5 -0.62 -0.37 0.04 -0.04 -0.12 0.14 0.01 0.64 0.32 0.11 -0.08
-0.34 -0.4 -0.14 0.1 0.09 0.18 0.15 0.16 0.3 0.0 0.03 -0.32
-0.89 -0.98 -0.9 -0.6 -0.58 0.41 0.42 0.42 0.67 0.49 0.03 0.09
-0.7 -1.52 -0.61 -0.47 -2.33 0.13 0.23 1.13 0.42 0.83 0.23 -0.51
-0.36 -0.24 -0.05 0.01 0.06 -0.23 -0.01 0.04 0.24 0.27 0.19 -0.08
-0.39 -0.33 -0.26 -0.07 -0.06 0.21 0.22 0.3 0.18 0.06 0.12 -0.18
-0.07 -0.17 -0.09 0.04 0.13 0.03 0.06 0.08 0.09 0.04 0.04 -0.21
-0.86 -0.59 -0.05 -0.37 -0.38 0.14 0.38 0.24 0.38 0.41 0.04 0.06
-0.19 -0.24 -0.04 -0.1 -0.06 0.2 0.17 0.02 0.15 0.14 0.04 -0.18
-0.28 -0.17 -0.12 0.07 0.1 -0.05 0.07 0.11 0.1 0.09 0.12 -0.11
-0.26 -0.31 0.09 -0.08 0.01 0.3 0.12 0.02 0.26 0.05 -0.13 -0.21
-0.26 -0.25 -0.18 -0.01 0.01 0.11 0.14 0.09 0.26 0.11 0.12 -0.27
-0.25 -0.22 -0.17 -0.1 -0.06 -0.12 0.05 0.07 0.42 0.16 0.25 -0.2
-0.29 -0.33 -0.25 -0.11 -0.1 0.13 0.04 0.09 0.33 0.13 0.14 0.06
0.12 -1.12 -4.25 -2.58 -0.33 -1.47 1.05 0.46 0.91 -0.05 0.34 0.6
-0.08 -0.1 -0.27 0.0 -0.09 0.09 0.07 0.05 0.21 0.06 0.07 -0.06
-0.23 0.02 -0.24 0.03 -0.15 0.03 0.24 0.17 0.25 0.24 -0.15 -0.38
-0.2 -0.14 -0.11 0.02 -0.09 -0.23 0.04 -0.01 0.32 0.28 0.09 -0.08
-0.26 -1.28 -1.74 -0.27 -0.53 0.67 0.34 0.63 0.36 0.34 0.35 -0.48
-1.03 -0.72 0.15 -0.19 -0.03 -0.03 0.26 0.04 0.24 0.42 0.26 0.03
-0.49 -0.37 -0.07 0.03 -0.08 0.12 0.09 -0.19 0.32 0.22 0.33 -0.16
-0.72 -0.27 0.12 0.15 -0.15 -0.3 0.23 0.06 0.21 0.35 0.02 -0.02
-0.57 -1.05 -2.42 0.04 -0.12 0.24 0.63 0.32 1.31 -0.37 -0.17 -0.77
-0.18 -0.31 -0.24 -0.11 0.1 0.06 0.05 0.02 0.29 0.12 0.06 0.02
-0.63 -2.01 -2.56 -0.95 0.21 -0.15 0.57 0.44 0.75 0.34 0.39 0.34
-1.31 -2.79 -2.15 -1.29 -2.37 -0.08 0.04 0.91 0.75 1.51 0.23 0.11
-0.36 -3.0 -3.14 -2.18 -0.69 0.85 0.76 0.26 1.13 1.18 -0.81 -1.28
-0.5 -0.22 -0.03 -0.04 -0.07 -0.09 0.29 -0.09 0.17 0.15 0.24 0.02
-0.2 0.04 -1.76 0.79 -0.63 0.36 0.66 0.22 0.3 -0.12 -0.5 -0.88
-0.61 -0.84 -0.89 -0.57 0.19 0.27 0.45 0.4 0.62 0.13 -0.08 -0.06
-2.05 -1.33 -3.29 -1.22 -0.35 -0.21 0.05 0.85 0.75 0.8 1.05 -0.24
-1.06 -0.4 -2.08 0.27 -1.1 -1.7 0.76 0.7 0.2 -0.03 0.99 0.15
-0.27 -0.28 -1.29 -0.34 -0.67 0.1 0.53 0.25 0.45 0.52 0.24 -0.26
-0.78 -0.4 -0.27 -0.14 -0.16 0.19 0.5 0.19 0.36 0.2 0.08 -0.25
-0.3 -0.66 -0.31 -0.45 -0.4 -0.06 0.15 0.58 0.25 0.41 0.11 0.13
-1.33 -1.17 -3.06 -1.12 -1.35 0.22 0.63 0.47 0.92 0.91 0.27 0.14
-0.21 -0.09 -0.37 0.14 -0.05 0.11 0.31 0.06 0.08 0.08 0.1 -0.31
-0.36 -0.35 -0.19 -0.0 0.11 -0.11 0.07 0.05 0.45 0.09 0.11 -0.06
-0.26 -0.23 -0.31 -0.08 0.19 0.08 0.09 -0.07 0.17 0.07 0.22 0.01
-0.12 -0.46 -0.54 -0.22 -0.01 0.26 0.16 -0.03 0.72 0.11 -0.31 -0.04
-0.2 -0.37 -0.21 -0.07 -0.18 0.12 0.27 0.14 0.21 0.19 0.03 -0.09
-1.65 -0.46 -3.13 -0.92 - -0.33 0.82 0.8 0.98 1.27 0.43 -1.82
-0.99 -3.76 -0.99 -0.84 -2.38 0.94 1.07 0.71 0.84 0.09 -0.77 0.11
-0.58 -0.31 0.18 0.1 -0.23 -0.42 0.09 0.02 0.23 0.22 0.23 0.19
-0.33 -0.17 -0.09 0.0 -0.16 0.12 0.17 0.1 0.25 0.09 0.05 -0.14
-0.2 -0.58 -0.4 -0.18 -0.22 -0.02 -0.08 0.17 0.45 0.41 -0.04 0.3
-0.57 -0.21 -0.12 -0.09 0.2 0.11 0.08 -0.15 0.28 0.19 0.25 -0.2
-0.06 -0.54 -0.23 -0.17 -0.51 -0.33 0.02 0.45 0.16 0.39 0.24 0.16
-0.29 -0.41 -0.34 -0.23 -0.03 0.07 0.07 0.04 0.49 0.35 0.11 -0.11
-1.23 -0.44 -2.46 -0.34 -0.35 -2.11 0.36 0.26 1.25 0.03 0.99 -0.01
-0.36 -0.17 -0.1 -0.14 -0.04 -0.07 0.35 0.1 0.41 0.18 -0.04 -0.35
-0.71 -0.53 -0.91 0.03 0.47 -0.22 0.34 0.09 0.61 0.27 0.13 -0.42
-0.47 -0.26 -0.36 -0.07 -0.24 0.37 0.36 0.13 0.33 -0.02 0.12 -0.19
-0.57 -0.44 -0.27 -0.06 -0.04 0.01 0.17 -0.24 0.52 0.35 0.23 -0.06
-0.47 -1.01 -0.6 -0.53 -0.43 0.17 0.04 0.37 0.68 0.5 0.41 -0.16
-0.54 -0.35 -0.46 0.3 -0.22 0.18 0.51 0.34 0.38 -0.09 0.05 -0.68
-0.34 -0.31 -0.26 0.05 -0.07 0.2 0.32 -0.08 0.44 0.15 -0.07 -0.3
-0.34 -0.1 -0.09 -0.1 -0.16 0.06 0.16 -0.08 0.31 0.18 0.24 -0.22
-0.45 -0.56 -0.39 -0.16 -0.12 -0.04 0.08 0.11 0.42 0.5 0.07 0.14
-0.54 -0.32 -0.22 0.0 -0.3 -0.33 0.27 0.17 0.33 0.35 0.25 -0.02
-1.13 -1.07 -0.71 -0.37 -1.15 0.85 0.49 0.56 0.44 0.04 -0.02 0.24
-0.32 -0.27 0.01 -0.13 0.03 -0.24 0.07 -0.13 0.24 0.34 0.23 -0.0
-0.4 -0.37 -0.4 -0.11 -0.0 0.14 0.16 0.13 0.48 0.14 0.03 -0.08
-0.42 -0.59 -0.32 -0.04 -0.04 0.24 0.33 -0.0 0.52 0.15 0.11 -0.33
-0.34 -0.63 -1.3 -0.82 -1.1 0.25 0.18 0.24 0.93 0.68 0.31 -0.2
-0.94 -0.61 -0.83 -0.04 -0.14 0.24 0.21 0.31 0.69 0.48 -0.14 -0.17
-0.4 -0.33 -0.39 -0.41 -0.64 -0.48 0.12 0.42 0.61 0.39 0.19 0.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.