Heatmap: Cluster_47 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.44 0.35 0.06 -0.17 -0.25 -0.22 -0.17 -0.28 0.05 -0.18 0.07 0.08
-0.23 1.24 0.31 0.4 -0.29 -1.04 -0.5 -0.67 -0.7 -0.53 -0.23 0.49
0.05 0.45 0.12 -0.03 -0.21 -0.52 -0.34 -0.26 -0.37 -0.06 0.18 0.56
0.58 0.38 0.1 -0.01 -0.14 -0.23 -0.35 -0.28 0.01 0.13 -0.27 -0.26
1.43 1.19 -0.36 -0.25 -2.1 -1.82 -1.51 -1.38 -1.41 -0.4 -0.25 1.13
0.19 0.3 0.06 0.12 -0.1 -0.38 -0.32 -0.38 -0.27 0.04 0.17 0.3
0.32 0.55 0.01 -0.1 -0.53 -0.42 -0.14 -0.28 -0.1 -0.01 0.04 0.27
0.56 0.6 0.08 -0.22 -0.1 -0.25 -0.26 -0.54 -0.01 -0.11 -0.21 0.02
0.29 0.41 0.16 0.04 -0.16 -0.16 -0.39 -0.38 -0.17 -0.09 0.03 0.18
0.44 0.24 0.03 -0.09 -0.13 -0.17 -0.3 -0.32 -0.03 0.02 0.15 -0.01
0.35 0.27 0.0 -0.05 -0.14 -0.13 -0.05 -0.12 -0.08 -0.04 -0.06 -0.06
0.36 0.5 -0.07 -0.02 -0.25 -0.36 -0.3 -0.18 -0.24 -0.07 0.02 0.3
0.7 1.09 0.13 0.21 -0.4 -1.05 -1.04 -1.06 -0.88 -0.36 -0.04 0.58
0.16 0.22 0.18 0.11 0.06 -0.45 -0.25 -0.06 -0.29 -0.15 -0.05 0.31
0.61 0.38 0.13 -0.01 -0.41 -0.32 -0.28 -0.34 -0.48 -0.11 0.17 0.2
0.52 0.38 0.1 -0.05 -0.13 -0.17 -0.34 -0.36 -0.06 -0.09 0.05 -0.12
0.23 0.22 0.29 -0.19 -0.19 -0.18 -0.41 -0.41 0.0 0.09 0.22 0.08
0.33 0.25 0.06 0.04 -0.18 -0.14 -0.21 -0.35 -0.22 -0.1 0.09 0.25
0.04 1.02 0.58 0.31 -0.92 -0.41 -0.47 -0.92 -0.72 0.08 -0.2 0.19
0.36 0.23 0.09 0.12 -0.17 -0.29 -0.3 -0.34 0.06 0.07 0.08 -0.1
0.65 0.68 -0.37 -0.13 -1.19 -0.65 -0.72 -1.05 -0.51 0.18 0.51 0.77
0.41 0.41 -0.16 0.06 -0.15 -0.37 -0.26 -0.31 -0.11 0.07 0.06 0.09
0.27 0.41 -0.15 -0.09 -0.4 -0.13 -0.19 -0.27 -0.13 0.05 0.17 0.24
0.65 0.51 -0.06 -0.03 -0.3 -0.18 -0.38 -0.47 -0.2 -0.06 0.09 -0.02
0.5 0.12 0.22 0.17 -0.05 -0.72 -0.53 -0.41 -0.24 -0.08 0.23 0.28
0.59 0.28 -0.08 -0.02 -0.19 -0.11 -0.2 -0.3 -0.24 0.01 0.01 -0.0
1.07 0.61 -0.35 0.31 -0.41 -1.38 -0.74 -1.41 -0.69 0.36 0.2 0.25
0.09 0.37 0.18 0.26 -0.03 -0.32 -0.42 -0.44 -0.52 -0.21 0.14 0.48
1.23 1.43 0.35 0.27 -0.99 -3.41 -3.53 -3.11 -2.43 -0.29 0.14 0.66
0.2 0.22 0.13 -0.01 -0.05 -0.41 -0.2 -0.45 -0.08 -0.01 0.15 0.28
0.38 0.86 0.1 0.19 -0.67 -0.81 -1.35 -1.38 -0.41 0.09 0.6 0.45
0.44 0.49 0.15 0.08 -0.35 -0.37 -0.29 -0.46 -0.32 -0.06 0.04 0.24
0.93 0.74 -0.76 -0.29 -0.67 -0.51 -0.4 -0.42 -0.16 -0.24 -0.06 0.56
0.31 0.32 0.02 -0.07 -0.1 -0.29 -0.16 -0.1 -0.1 0.02 0.0 0.03
0.83 0.47 0.29 0.02 0.13 -0.84 -0.66 -0.3 -0.22 -0.29 -0.11 -0.16
0.19 0.3 0.13 -0.02 -0.15 -0.29 -0.35 -0.44 0.0 0.03 0.11 0.27
0.46 0.02 0.02 0.0 -0.14 -0.35 -0.59 -0.43 -0.27 0.12 0.3 0.43
0.06 0.4 0.19 -0.05 -0.11 0.05 -0.04 -0.18 -0.19 0.0 -0.17 -0.08
0.12 1.02 0.23 -0.11 -0.51 -0.52 -0.27 -0.76 -0.72 -0.23 0.35 0.31
0.7 0.32 -0.14 -0.06 -0.39 -0.35 -0.47 -0.51 0.01 -0.34 0.38 0.26
0.45 0.41 -0.06 -0.08 0.05 -0.45 -0.2 -0.36 -0.14 -0.09 0.05 0.13
0.44 0.55 0.39 0.0 -0.52 -0.45 -0.87 -0.64 -0.04 0.01 0.03 0.32
0.46 0.34 0.06 0.06 -0.2 -0.26 -0.27 -0.43 -0.22 -0.1 0.21 0.05
0.79 0.69 -0.26 -0.15 -0.68 -0.46 -0.9 -1.03 -0.41 -0.37 0.42 0.76
0.43 0.07 0.13 -0.08 -0.01 -0.2 -0.23 -0.3 -0.07 -0.03 0.07 0.05
0.42 0.26 0.14 0.01 -0.12 -0.32 -0.23 -0.15 -0.1 0.05 -0.05 -0.06
0.25 0.41 0.22 -0.06 -0.31 -0.29 -0.55 -0.4 0.05 0.04 0.27 0.04
0.22 0.33 0.08 -0.08 -0.13 -0.16 -0.41 -0.44 -0.21 0.05 0.18 0.32
0.34 0.38 0.18 0.02 -0.2 -0.35 -0.61 -0.29 -0.05 -0.03 0.28 0.01
0.29 0.22 -0.04 -0.01 -0.04 -0.25 -0.42 -0.49 -0.09 -0.05 0.4 0.2
0.91 0.52 -0.06 -0.02 -0.32 -0.38 -0.47 -0.48 -0.32 -0.2 -0.01 0.1
0.55 0.3 -0.14 -0.1 -0.06 -0.15 -0.52 -0.48 -0.07 -0.04 0.18 0.17
0.32 0.22 0.12 -0.07 -0.04 -0.19 -0.17 -0.11 -0.03 -0.07 -0.03 -0.02
0.3 0.37 -0.37 0.12 -0.16 -0.35 -0.38 -0.23 -0.28 0.11 0.22 0.32
0.56 0.21 0.09 -0.1 -0.03 -0.2 -0.22 -0.27 -0.1 -0.11 -0.0 -0.03
0.4 0.45 -0.04 -0.08 -0.25 -0.31 -0.27 -0.16 -0.18 -0.06 -0.08 0.3
0.25 0.37 -0.06 -0.1 -0.39 -0.44 -0.38 -0.15 -0.39 -0.08 0.12 0.73
0.5 0.46 0.11 -0.07 -0.22 -0.28 -0.26 -0.32 -0.22 0.01 -0.1 0.09
0.64 0.47 0.1 -0.09 -0.3 -0.08 -0.31 -0.41 -0.27 0.03 -0.14 -0.05
0.98 0.67 0.12 -0.06 -0.27 -0.27 -0.81 -1.02 -0.47 -0.25 0.14 0.01
0.27 0.08 -0.06 -0.09 -0.23 -0.07 -0.17 -0.31 0.07 0.05 0.26 0.07
0.74 0.56 0.17 -0.21 -0.1 -0.85 -0.59 -0.29 -0.16 0.11 -0.33 0.19
0.7 0.79 0.21 0.06 -0.61 -0.68 -0.67 -0.59 -0.29 -0.23 0.07 0.2
0.14 0.29 0.03 0.03 0.07 -0.29 -0.27 -0.2 -0.18 -0.06 0.06 0.24
0.31 0.43 0.01 -0.11 -0.07 -0.14 0.05 -0.15 -0.08 -0.12 -0.19 -0.09
0.25 0.18 0.04 0.04 0.03 -0.19 -0.17 -0.26 -0.26 -0.1 -0.02 0.3
0.61 0.43 -0.01 0.03 -0.18 -0.15 -0.16 -0.4 -0.34 -0.11 0.03 -0.07
0.32 0.5 0.21 0.04 -0.33 -0.85 -0.64 -0.46 -0.3 0.05 0.18 0.55
0.43 0.11 -0.01 -0.12 0.0 -0.0 -0.35 -0.39 -0.23 -0.05 0.27 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.