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Heatmap: Cluster_70 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.87 -0.38 0.29 0.37 0.48 -0.21 0.42 0.06 0.28 -0.25 -0.37 -0.5
-0.49 -0.62 0.06 0.09 0.47 0.04 0.15 0.33 0.07 -0.08 -0.25 -0.14
-0.65 -0.23 0.1 0.19 0.13 0.17 0.15 0.15 0.1 -0.02 -0.05 -0.27
-0.36 -0.71 -0.32 -0.11 0.07 -0.35 0.31 0.51 0.3 0.21 0.13 -0.15
-1.48 -1.2 -0.47 -0.24 -0.2 -0.57 0.68 0.7 0.54 0.36 0.25 -0.09
-0.62 -0.55 -0.34 0.25 0.26 0.39 0.69 0.31 -0.01 -0.34 -0.28 -0.48
-0.43 -0.03 0.05 0.19 0.09 0.19 0.14 0.22 0.01 -0.14 -0.19 -0.28
-0.26 -0.19 -0.15 -0.16 -0.22 -0.32 0.16 0.25 0.16 0.21 0.2 0.14
-1.08 -1.22 0.27 0.79 0.96 -0.12 -0.22 0.95 0.12 -0.88 -0.96 -1.47
-0.15 -0.37 -0.05 -0.1 -0.01 -0.33 0.04 0.37 0.12 0.06 0.25 0.0
-0.13 -0.14 -0.02 0.07 0.16 -0.0 0.14 0.15 0.05 -0.11 -0.02 -0.21
-0.88 -0.58 -0.08 0.28 0.5 0.05 0.44 0.31 0.26 -0.12 -0.23 -0.71
-0.06 -0.17 -0.04 0.01 0.1 -0.12 0.13 0.06 0.02 0.09 0.03 -0.08
-0.53 -0.36 0.12 0.12 0.19 0.25 0.26 0.14 0.23 -0.12 -0.16 -0.43
-0.58 -0.49 0.04 0.07 0.24 -0.01 0.03 0.31 0.15 0.11 0.06 -0.19
-0.88 -0.62 -0.05 0.2 0.21 -0.1 0.24 0.61 0.25 0.09 -0.21 -0.38
-0.66 -0.44 -0.09 0.11 0.08 -0.24 -0.0 0.27 0.26 0.18 0.18 0.05
-0.58 -0.34 0.09 0.16 0.39 0.17 0.19 0.19 0.04 -0.16 -0.17 -0.28
-0.59 -0.12 0.16 0.21 0.29 0.07 0.08 0.13 0.04 -0.02 -0.11 -0.37
-0.21 -0.14 -0.09 0.07 0.27 -0.21 0.11 0.11 0.05 0.07 0.04 -0.15
-0.45 -0.51 -0.1 0.42 0.26 -0.19 0.5 0.53 0.15 -0.03 -0.44 -0.92
-0.51 -0.53 -0.32 0.31 -0.04 -0.42 0.53 0.62 0.25 0.09 -0.17 -0.48
-0.43 -0.07 -0.1 0.14 0.09 0.05 0.02 0.18 0.13 0.01 0.04 -0.14
-1.53 -0.79 0.24 0.44 0.52 0.18 0.28 0.45 0.05 -0.21 -0.33 -0.51
-0.57 -0.49 -0.04 0.17 0.28 -0.1 0.14 0.36 0.18 0.04 -0.12 -0.16
-1.67 -0.93 0.5 0.53 0.22 -0.16 0.18 0.25 0.18 -0.01 0.03 -0.38
-1.3 -0.79 0.16 0.43 0.25 -0.21 0.18 0.36 0.19 0.17 -0.04 -0.25
-2.0 -1.41 -0.29 0.13 -0.17 -0.05 0.6 0.83 0.54 0.39 -0.56 -0.19
-1.93 -1.05 -0.31 0.3 0.33 -0.01 0.83 0.52 0.08 0.08 -0.15 -0.44
-0.88 -0.34 0.24 0.22 -0.01 -0.37 0.07 0.46 0.11 0.16 -0.08 -0.02
-0.32 -0.2 -0.09 0.11 0.2 0.14 0.25 0.15 0.04 -0.11 -0.05 -0.24
-0.73 -0.25 0.16 0.24 0.28 0.1 0.26 0.16 0.03 0.02 -0.25 -0.36
-1.39 -0.42 0.1 0.19 0.34 -0.04 0.25 0.32 0.24 0.09 0.01 -0.44
-0.37 -0.2 -0.1 0.06 0.24 -0.09 0.18 0.16 0.1 0.07 -0.02 -0.16
-0.33 -0.21 0.04 0.04 0.09 -0.29 0.04 0.3 0.19 0.09 -0.02 -0.07
-0.31 -0.7 -0.46 0.06 -0.21 -0.68 0.08 0.53 0.5 0.5 0.21 -0.27
-1.53 -0.64 -0.35 0.48 0.36 0.22 0.36 0.71 0.28 -0.35 -0.12 -0.86
-0.21 -0.57 -0.54 -0.27 -0.12 -0.17 0.35 0.34 0.3 0.22 0.19 0.07
-0.53 -0.33 -0.02 0.18 0.33 0.06 0.33 0.24 -0.03 -0.04 -0.22 -0.24
-0.63 -0.94 -0.62 0.12 -0.24 -1.29 0.17 0.65 0.46 0.59 0.36 -0.02
-1.12 -1.65 0.16 0.58 0.71 -0.04 0.3 0.57 0.25 -0.19 -0.57 -0.87
-0.09 -0.11 -0.58 -0.03 0.08 -0.07 0.41 0.33 0.13 -0.06 -0.12 -0.15
-0.4 -0.25 0.01 0.08 0.26 0.15 0.19 0.18 0.1 -0.0 -0.19 -0.3
-1.25 -0.66 -0.13 0.13 0.15 -0.72 0.06 0.63 0.4 0.32 0.19 -0.11
-0.37 -0.29 -0.11 -0.04 0.22 0.02 0.03 0.12 0.12 0.1 0.14 -0.06
-0.7 -0.47 -0.04 0.01 -0.03 -0.41 0.18 0.55 0.11 0.1 0.17 0.11
-1.96 -2.12 -0.22 -0.06 0.45 -0.5 0.23 0.88 0.59 0.3 0.03 -0.23
-0.85 -0.37 -0.03 0.3 0.29 -0.0 0.25 0.48 0.08 0.05 -0.27 -0.44
-0.52 -0.35 -0.26 0.08 0.08 -0.06 0.25 0.28 0.31 0.15 0.06 -0.29
-0.68 -0.58 -0.19 0.14 0.12 0.01 0.31 0.4 0.14 0.12 0.06 -0.26
-0.22 -0.62 -0.26 -0.16 -0.15 -0.49 0.15 0.57 0.27 0.35 0.15 -0.05
-2.57 -1.86 -0.45 0.4 0.65 0.08 0.93 0.87 0.16 -0.17 -0.59 -1.09
-0.76 -0.56 -0.01 0.14 0.04 -0.11 0.24 0.39 0.31 0.21 -0.02 -0.3
-1.2 -0.33 0.31 0.58 0.56 -0.39 0.23 0.55 0.03 -0.24 -0.51 -0.78
-0.7 -0.39 0.09 0.03 0.08 -0.53 0.08 0.33 0.29 0.19 0.12 0.04
0.33 -0.22 0.07 0.01 -0.02 -0.5 0.34 0.47 0.1 0.06 -0.45 -0.65
-0.37 -0.64 -0.38 -0.13 -0.41 -0.31 0.31 0.7 0.55 0.35 -0.21 -0.19
-0.46 -0.34 0.0 0.06 0.23 -0.06 0.1 0.33 0.12 0.01 -0.04 -0.13
-0.44 -0.23 -0.04 0.13 0.21 0.08 0.2 0.25 -0.08 -0.06 -0.04 -0.14
-0.88 -0.33 0.05 0.51 0.51 -0.11 0.17 0.27 0.09 -0.15 -0.14 -0.61
-1.31 -0.83 -0.33 0.1 0.17 -0.13 0.25 0.54 0.52 0.3 0.01 -0.31
-1.84 -0.23 -0.1 0.0 -0.19 -0.97 0.47 0.81 0.38 0.22 0.04 -0.14
-0.43 -0.49 -0.2 0.02 -0.24 -0.12 0.17 0.51 0.43 0.18 -0.02 -0.18
-3.21 -1.89 -1.11 -0.43 -0.77 -1.47 1.13 1.33 0.42 0.49 0.17 -0.15
-0.47 -0.64 -0.36 0.01 0.25 -0.25 0.29 0.29 0.06 0.25 0.13 0.06
-0.59 -0.57 -0.4 0.06 0.0 0.06 0.09 0.49 0.37 0.19 -0.07 -0.04
-0.22 -0.1 0.13 0.11 0.12 0.11 0.12 0.16 -0.06 -0.06 -0.15 -0.22
-0.13 -0.3 -0.22 0.1 0.35 -0.03 0.21 0.34 -0.04 -0.07 -0.11 -0.3
-0.29 -0.16 -0.09 0.12 0.21 0.07 0.24 0.2 0.02 0.03 -0.23 -0.26
-0.26 -0.22 -0.09 0.05 0.21 0.02 0.38 0.23 -0.06 -0.14 -0.15 -0.14
-0.24 -0.21 0.07 0.09 0.22 0.07 0.15 0.08 0.07 0.01 -0.16 -0.27
-0.65 -0.53 0.13 0.17 0.28 0.05 0.5 0.22 0.03 -0.1 -0.25 -0.29
-2.36 -1.84 -0.53 0.21 0.4 0.03 0.53 0.93 0.65 0.1 -0.33 -0.86
-0.35 -0.26 -0.04 0.09 0.18 -0.05 0.1 0.3 -0.01 -0.01 0.06 -0.12
-1.07 -0.64 -0.12 0.18 0.03 -0.34 0.52 0.61 0.26 0.13 -0.12 -0.26
-1.69 -0.81 0.05 0.29 0.24 0.21 0.33 0.6 0.16 -0.03 -0.09 -0.49
-0.55 -0.44 -0.07 0.12 0.09 -0.41 0.06 0.22 0.33 0.16 0.14 0.05
-1.04 -0.83 -0.2 0.15 -0.23 -1.02 0.23 0.63 0.57 0.32 0.25 -0.02
-0.3 -0.29 0.1 -0.2 0.34 -0.13 0.18 0.11 0.04 0.37 -0.1 -0.34
-0.15 -0.53 -0.17 0.01 0.28 0.19 0.25 0.24 0.09 -0.11 -0.17 -0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.