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Heatmap: Cluster_1 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.04 -0.05 -0.01 0.1 0.28 0.16 -0.12 -0.09 -0.01 -0.06 -0.11 -0.2
0.1 -0.08 -0.0 -0.02 0.41 0.13 0.04 0.2 -0.13 -0.25 -0.27 -0.3
-0.03 0.06 0.04 0.02 0.14 0.2 -0.05 0.04 -0.02 -0.12 -0.12 -0.22
0.06 0.05 0.29 0.29 0.37 0.29 -0.19 -0.16 -0.02 -0.26 -0.57 -0.51
-0.04 0.02 0.01 0.2 0.13 0.34 0.09 -0.02 -0.17 -0.23 -0.2 -0.25
0.06 0.15 0.22 0.2 0.25 0.1 -0.12 -0.23 -0.13 -0.33 -0.12 -0.2
0.03 -0.12 0.03 0.08 0.21 -0.02 0.02 0.08 -0.09 -0.06 -0.09 -0.1
0.27 -0.58 0.1 0.31 1.02 0.78 0.04 -0.25 -0.52 -0.86 -0.97 -1.19
0.01 -0.01 0.35 0.22 0.38 0.27 -0.06 -0.16 -0.24 -0.38 -0.25 -0.45
0.03 -0.08 0.2 0.07 0.18 0.24 0.12 -0.08 -0.06 -0.19 -0.11 -0.46
0.11 -0.19 0.39 -0.1 0.35 0.46 -0.05 -0.08 -0.33 -0.29 -0.32 -0.29
0.03 -0.07 0.09 0.07 0.17 0.18 0.05 -0.03 -0.07 -0.14 -0.07 -0.28
0.1 0.13 0.34 0.06 0.14 0.14 0.07 -0.17 -0.2 -0.16 -0.17 -0.44
0.0 0.04 0.05 0.1 0.15 0.02 -0.1 -0.06 -0.04 -0.06 -0.01 -0.14
0.02 -0.3 0.17 0.05 0.4 0.3 0.13 0.05 0.06 -0.3 -0.35 -0.52
0.03 0.07 0.18 0.09 0.19 0.01 -0.07 -0.11 -0.05 -0.16 -0.0 -0.24
0.06 -0.1 0.11 0.07 0.28 0.25 -0.01 -0.07 0.02 -0.24 -0.13 -0.37
-0.16 -0.06 0.19 0.1 0.36 0.23 0.05 0.01 -0.0 -0.25 -0.26 -0.41
0.32 0.03 0.95 -0.29 0.49 0.1 -0.61 -0.43 -0.51 -0.31 -0.43 -0.23
0.05 -0.04 0.0 0.05 0.26 0.13 -0.0 0.02 -0.02 -0.18 -0.16 -0.17
0.99 -0.11 1.35 -0.27 0.73 -0.91 -1.71 -0.47 -1.37 -1.19 -0.75 0.09
0.59 -0.3 0.29 0.61 0.83 0.56 0.09 -0.64 -0.87 -1.08 -0.98 -1.18
0.09 -0.01 0.15 0.1 0.23 0.16 0.02 -0.09 -0.07 -0.21 -0.15 -0.33
-2.51 -2.25 -0.11 0.22 1.53 1.04 0.32 0.66 -0.15 -1.31 -1.97 -2.36
-0.06 -0.14 0.09 0.05 0.27 0.04 0.06 0.01 -0.08 -0.02 -0.1 -0.17
0.61 0.32 0.53 0.04 0.16 -0.27 -0.72 -0.35 -0.14 -0.31 -0.37 -0.1
-0.01 -0.02 0.26 0.16 0.19 0.11 0.01 -0.2 -0.03 -0.14 -0.1 -0.35
-0.01 0.03 0.05 0.16 0.1 0.11 0.05 0.04 -0.01 -0.21 -0.12 -0.23
0.19 -0.14 0.3 0.16 0.46 0.37 -0.25 -0.19 -0.04 -0.05 -0.48 -0.82
0.12 -0.09 0.02 0.14 0.23 0.14 -0.02 0.05 -0.11 -0.14 -0.24 -0.2
0.51 -0.99 -0.18 -0.45 1.55 0.71 -0.32 -0.29 -0.65 -1.14 -0.96 -0.62
0.05 -0.09 0.17 0.03 0.22 0.23 -0.14 -0.02 0.03 -0.18 -0.13 -0.27
0.61 0.41 1.09 -0.07 0.19 -0.16 -0.71 -0.8 -0.81 -1.11 -0.46 0.12
0.08 0.15 0.1 0.13 0.18 -0.03 -0.04 -0.04 -0.08 -0.19 -0.13 -0.19
0.06 -0.18 0.05 -0.08 0.33 0.31 0.09 -0.24 0.1 -0.21 -0.15 -0.22
0.13 -0.05 0.25 0.11 0.25 0.09 -0.03 -0.04 -0.15 -0.22 -0.21 -0.25
-0.08 0.02 0.11 0.14 0.11 0.22 0.07 0.06 -0.17 -0.16 -0.18 -0.24
0.14 -0.2 0.2 0.17 0.48 0.2 0.0 -0.18 -0.09 -0.35 -0.27 -0.38
-0.01 0.08 0.15 0.11 0.15 0.03 -0.11 -0.04 -0.06 -0.04 -0.19 -0.11
-0.22 -0.51 0.59 0.3 0.5 0.25 -0.2 -0.08 -0.07 -0.28 -0.28 -0.57
-0.61 -0.38 0.21 0.41 0.52 0.53 0.29 0.14 -0.29 -0.27 -0.63 -0.76
0.16 -0.25 0.21 0.03 0.67 0.21 -0.02 0.07 -0.11 -0.56 -0.4 -0.47
0.08 -0.04 0.41 0.21 0.29 0.07 -0.34 -0.12 0.03 -0.05 -0.3 -0.53
0.44 0.24 0.88 -0.46 0.09 -0.42 -0.43 -0.44 -0.28 -0.07 -0.15 -0.12
-1.55 0.05 0.34 1.06 1.24 0.08 0.27 0.3 -0.69 -2.21 -1.87 -1.76
0.28 0.08 0.59 0.11 0.25 -0.02 -0.13 -0.22 -0.42 -0.41 -0.45 -0.05
-0.09 -0.18 0.3 0.07 0.47 0.04 0.23 -0.01 -0.02 -0.17 -0.29 -0.67
-0.0 -0.03 0.05 0.27 0.32 0.06 -0.04 -0.08 -0.12 -0.25 -0.16 -0.13
-0.49 -0.96 -0.05 0.09 0.89 0.54 0.26 0.2 0.01 -0.61 -0.38 -0.59
-0.86 -0.34 0.26 0.23 0.89 0.72 -0.04 -0.24 -0.37 -0.02 -0.51 -0.99
-0.12 0.12 0.11 0.14 0.1 0.15 -0.09 -0.0 0.01 -0.2 -0.1 -0.18
0.05 0.06 0.09 0.08 0.22 0.13 0.01 -0.09 -0.06 -0.2 -0.12 -0.23
0.08 -0.06 0.08 0.04 0.17 0.1 -0.01 -0.04 -0.01 -0.09 -0.13 -0.17
-2.09 -2.77 0.1 0.15 1.22 1.16 0.1 0.52 -0.42 -0.49 -0.7 -1.76
-0.07 -0.03 0.24 0.19 0.33 0.13 0.08 -0.22 -0.06 -0.4 -0.15 -0.22
0.19 -0.05 0.15 0.04 0.21 0.08 0.02 -0.05 -0.11 -0.16 -0.12 -0.29
-0.0 -0.12 0.05 0.06 0.33 0.04 0.05 0.07 0.04 -0.16 -0.15 -0.3
0.0 0.03 0.11 0.1 0.21 0.07 -0.13 -0.1 -0.03 -0.17 -0.02 -0.13
0.06 -0.18 0.15 0.02 0.21 0.09 -0.04 0.06 -0.02 -0.12 -0.08 -0.2
0.45 -0.08 0.72 0.1 0.61 0.19 -0.51 -0.52 -0.38 -0.59 -0.34 -0.54
0.2 -0.08 0.21 0.17 0.33 0.16 -0.05 -0.1 -0.18 -0.28 -0.24 -0.32
-0.05 -0.18 0.12 0.1 0.3 0.22 -0.12 0.04 -0.13 -0.24 0.0 -0.17
0.06 -0.09 0.08 0.04 0.26 0.13 -0.14 -0.02 -0.08 -0.09 0.0 -0.21
0.03 -0.04 0.09 0.13 0.21 0.04 0.02 0.05 -0.02 -0.13 -0.13 -0.32
-0.05 -0.22 0.18 0.04 0.31 0.31 0.15 0.06 -0.06 -0.27 -0.3 -0.37
0.2 -0.05 0.04 0.2 0.28 0.29 -0.23 -0.15 -0.11 -0.07 -0.38 -0.22
0.37 -3.87 0.52 0.13 1.59 1.08 0.07 0.31 -1.15 -2.88 -4.95 -3.39
-0.36 -0.75 -0.26 0.32 1.33 0.8 0.45 0.18 -0.96 -1.15 -1.2 -1.33
0.14 0.21 0.36 0.27 0.27 0.05 -0.31 -0.17 -0.09 -0.24 -0.34 -0.41
0.21 0.26 0.21 0.13 0.2 -0.06 -0.03 -0.27 -0.05 -0.27 -0.14 -0.34
0.06 -0.1 -0.01 0.09 0.25 0.3 -0.04 -0.06 0.06 -0.19 -0.18 -0.32
-0.13 -0.17 0.15 0.27 0.56 0.19 0.16 -0.14 -0.03 -0.37 -0.4 -0.47
0.27 -0.51 0.48 0.11 0.33 0.47 -0.08 -0.25 0.3 -0.41 -0.48 -1.02
-0.03 -0.07 0.09 0.12 0.18 0.24 -0.03 -0.01 -0.05 -0.14 -0.2 -0.17
0.14 -0.04 0.11 0.08 0.13 0.13 0.0 -0.03 -0.07 -0.16 -0.08 -0.26
0.1 0.03 0.17 0.09 0.18 0.17 -0.08 -0.1 -0.11 -0.18 -0.1 -0.27
0.14 0.11 -0.02 0.13 0.26 0.2 -0.15 0.12 -0.26 -0.2 -0.27 -0.21
0.08 -0.0 0.07 0.11 0.44 0.22 0.06 -0.14 -0.1 -0.31 -0.31 -0.34
0.26 -0.14 0.53 0.92 0.69 0.53 -0.4 -0.9 -0.68 -1.08 -0.54 -1.26
-0.23 -0.06 0.25 0.32 0.43 0.27 -0.18 -0.26 0.04 -0.32 -0.21 -0.34
0.01 0.01 0.19 0.18 0.34 0.22 0.01 -0.26 -0.11 -0.15 -0.13 -0.5

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.