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Heatmap: Cluster_198 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.09 0.27 0.1 0.18 0.34 0.48 0.08 -0.47 -0.43 -0.29 -0.09 -0.49
-0.22 -0.05 -0.12 0.02 0.03 0.16 0.08 0.1 0.01 -0.05 -0.06 0.05
-0.21 -0.08 0.05 0.1 0.1 0.16 0.0 -0.08 0.08 -0.14 -0.02 0.0
-1.51 -1.86 -1.98 0.37 1.26 0.76 -0.2 0.96 -0.54 0.49 - -0.27
-0.12 0.03 -0.11 0.06 -0.02 0.08 0.07 0.17 0.09 0.08 -0.01 -0.41
0.12 -0.13 0.01 -0.06 -0.19 0.33 -0.05 0.06 0.18 -0.16 -0.14 -0.05
0.26 -0.04 0.09 -0.03 -0.12 -0.01 -0.11 0.03 0.05 0.03 -0.0 -0.2
-0.22 -0.58 -0.2 -0.17 0.53 0.2 -0.08 -0.12 -0.06 0.29 0.2 -0.1
0.17 -0.08 0.02 0.05 -0.11 0.12 -0.06 0.07 0.05 -0.04 -0.01 -0.22
0.01 0.0 -0.16 0.05 0.14 0.18 0.12 -0.12 -0.1 -0.01 0.02 -0.19
-0.81 -0.9 0.66 -0.15 0.18 1.11 -0.48 -0.19 -0.09 -0.3 -0.83 0.29
0.13 -0.02 0.01 -0.01 -0.04 0.01 -0.04 0.03 0.01 -0.0 0.02 -0.11
0.19 -0.31 0.05 0.23 -0.36 0.32 -0.35 -0.08 0.37 -0.37 -0.05 0.08
0.03 0.12 -0.04 0.11 -0.06 0.37 0.0 0.08 -0.17 -0.22 -0.0 -0.33
-0.34 -0.97 -0.68 0.24 -0.01 0.8 -0.76 0.34 -0.18 0.14 0.21 0.24
-0.46 -0.07 0.32 -0.04 -0.66 0.53 -0.05 0.2 0.08 0.1 0.01 -0.37
-0.16 -0.36 0.94 0.38 -2.94 1.45 0.65 -0.56 -0.59 -1.24 -3.24 -0.31
-0.93 -0.14 0.13 -0.02 -0.72 -0.47 -0.58 0.9 0.16 -0.12 0.4 0.32
0.12 -0.0 -0.06 -0.07 -0.13 0.19 -0.11 0.03 0.1 -0.01 -0.03 -0.06
-0.06 -0.28 -0.15 0.05 0.09 0.17 -0.1 -0.04 0.14 0.33 0.1 -0.41
-0.22 -0.64 -0.11 -0.1 -0.46 -0.09 0.16 0.22 0.46 0.3 0.29 -0.23
-0.07 -0.39 -0.05 -0.13 -0.05 0.15 0.21 0.06 -0.0 0.13 0.04 0.01
0.03 -0.06 -0.26 0.04 0.25 0.18 0.22 -0.09 -0.36 0.07 0.01 -0.16
-0.17 -0.22 0.19 -0.16 -0.02 0.06 -0.08 0.33 0.25 -0.28 0.05 -0.1
1.07 -0.92 -3.15 -1.18 -0.45 1.62 -1.18 -1.95 1.05 - 1.08 -2.88
-0.96 -0.03 -0.45 0.14 0.25 0.47 0.19 0.1 0.54 -0.2 -0.76 -0.03
-0.57 -0.44 -0.12 -0.15 0.37 0.2 0.17 0.48 0.3 0.1 -0.54 -0.28
-0.6 -0.92 -0.69 -0.47 0.07 0.6 0.88 0.72 -0.36 -0.27 -0.17 -0.13
-0.39 -0.31 -0.13 0.09 -0.01 0.25 0.13 0.08 0.15 -0.28 0.18 0.08
-0.22 -0.34 0.17 0.03 0.52 0.56 -0.28 0.6 -0.18 -0.52 -0.93 -0.27
-0.07 0.25 -2.97 0.59 0.26 1.0 -0.51 0.02 -0.06 -1.22 -0.9 0.46
- -0.44 1.14 - 0.32 1.73 0.96 -0.11 -0.34 - -0.28 -
- - -0.15 0.23 1.56 - - 1.06 1.46 0.04 - 0.17
0.05 -0.14 -0.02 0.02 -0.11 -0.01 -0.14 0.29 0.08 0.08 0.06 -0.24
-2.2 -0.46 0.31 -0.13 1.46 -1.24 0.53 -0.02 0.61 -0.63 -0.01 -2.92
0.69 - 0.77 -0.79 -0.96 1.35 -0.48 -1.13 -2.32 0.23 -0.28 0.74
- - - - 2.36 - - 1.86 1.7 - - -
-1.13 -0.32 - -2.25 1.09 1.3 -0.95 0.36 0.68 -0.83 0.23 -0.31
-0.25 -0.3 -0.14 -0.25 -0.36 0.3 0.66 -0.17 0.04 0.2 0.06 -0.15
- - 0.34 0.06 1.53 0.57 -1.89 1.57 -0.07 -0.77 -2.07 -1.76
-0.19 -0.88 -0.49 -0.66 -0.3 0.42 0.53 1.02 0.16 -0.34 -0.44 -0.04
- - - - - 2.15 0.89 - 1.76 - 1.21 -
-0.14 -0.01 -0.04 0.18 0.06 0.15 0.13 0.12 -0.14 -0.15 -0.08 -0.16
-0.11 -0.2 -0.27 -0.06 -0.02 0.31 0.1 0.4 0.06 -0.19 -0.27 0.08
0.14 -0.17 -0.04 -0.01 0.09 0.03 -0.0 0.0 0.08 -0.03 0.09 -0.2
-0.06 0.0 -0.21 0.13 0.06 0.05 -0.05 -0.0 0.06 -0.06 0.14 -0.09
-0.04 -0.29 0.3 0.13 -0.37 0.26 0.22 0.03 -0.26 0.18 -0.06 -0.3
-0.33 -0.08 0.08 0.05 -0.23 0.91 0.34 0.18 -0.77 -0.57 0.03 -0.43
-1.08 -0.3 0.64 0.09 -0.77 0.74 0.08 0.06 0.06 0.08 -0.3 -0.27
-0.32 -0.07 0.18 0.11 -0.33 0.83 0.34 0.25 -0.52 -0.29 -0.32 -0.5
-1.39 -0.92 -2.42 -0.1 0.26 0.68 -0.07 0.11 0.9 0.23 0.16 0.01
0.06 0.03 0.01 0.17 -0.12 0.21 -0.04 0.1 -0.07 -0.08 -0.07 -0.25
-0.02 -0.4 -0.7 -0.17 0.78 0.05 0.05 0.82 0.31 -1.24 -0.33 -0.45
-0.06 -0.07 -0.15 -0.04 0.05 0.08 -0.11 0.2 0.1 -0.05 -0.02 0.01
0.05 -0.04 -0.46 0.27 -0.38 -0.1 -0.58 0.36 -0.13 -0.08 0.35 0.35
-0.17 -0.3 0.44 -0.15 -0.31 0.51 -0.27 0.13 -0.37 0.37 -0.01 -0.29
-0.55 0.2 1.01 -0.81 0.93 -0.25 -0.75 -0.42 1.17 -1.72 -0.72 -1.62
0.09 -0.08 -0.01 -0.06 0.03 0.06 -0.13 -0.04 0.08 -0.11 0.11 0.03
-0.03 0.01 0.19 -0.02 -0.1 0.22 0.0 -0.02 -0.0 -0.05 -0.1 -0.14
-0.04 -0.01 0.04 0.0 -0.49 0.03 0.06 -0.01 0.0 0.17 0.1 0.06
-0.22 -0.21 -0.12 -0.26 0.33 0.1 0.1 0.1 0.08 -0.05 0.04 0.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.