Heatmap: Cluster_34 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
30.43 19.16 19.15 19.64 26.47 26.65 28.8 28.92 27.57 40.45 29.96 30.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.15 0.06
0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.09 0.0 0.09 0.0 0.04 0.15 0.06
26.85 23.12 24.28 23.4 25.69 24.67 28.45 27.66 27.38 36.63 33.49 27.84
9.91 8.23 8.54 7.7 9.15 9.81 7.88 10.08 10.45 10.07 8.75 7.84
87.87 89.36 118.28 93.92 99.1 95.22 99.47 88.24 100.6 116.0 108.81 101.25
18.95 18.38 18.84 18.49 17.06 18.57 17.97 20.1 19.29 20.57 18.98 20.07
59.93 61.4 57.25 53.3 55.56 59.38 52.23 62.29 65.24 63.0 59.91 58.32
3.54 3.39 2.55 2.78 1.72 2.49 2.35 2.92 2.69 4.07 2.64 3.19
0.14 0.25 0.04 0.17 0.2 0.26 0.41 0.42 0.28 0.67 0.44 0.21
203.25 182.62 162.73 166.11 165.31 182.53 189.38 199.67 207.65 211.15 207.85 208.25
0.07 0.02 0.15 0.04 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.18 0.05 0.0
64.32 71.88 100.61 84.63 84.83 91.46 91.82 84.65 96.53 98.63 92.16 83.96
42.82 35.36 32.6 32.58 36.45 36.06 31.87 39.8 42.56 45.25 37.05 42.86
0.6 0.64 0.18 0.72 0.26 0.29 0.35 0.47 0.18 0.96 1.09 0.43
0.07 0.0 0.22 0.0 0.14 0.0 0.05 0.3 0.07 0.33 0.05 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.32 0.0 0.35 0.05 0.0
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.02 0.13 0.08 0.04 0.14 0.04 0.09
1.18 1.13 1.1 1.11 1.05 0.87 1.05 1.16 1.09 1.5 1.37 1.05
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.05 0.0 0.0
5.38 3.93 3.7 3.49 4.99 5.86 6.28 6.92 6.7 8.74 7.0 6.17
2.61 2.3 2.37 1.89 1.12 2.81 1.6 2.39 1.67 2.53 2.15 2.92
0.28 0.17 0.37 0.15 0.0 0.34 0.1 0.19 0.0 0.3 0.07 0.19
0.5 0.32 0.5 0.12 0.2 0.27 0.27 0.53 0.33 0.83 0.48 0.36
0.29 0.23 0.2 0.36 0.05 0.34 0.43 0.51 0.47 0.42 0.69 0.34
0.04 0.02 0.0 0.07 0.05 0.04 0.08 0.32 0.12 0.22 0.1 0.06
0.43 0.39 0.38 0.4 0.5 0.36 0.61 0.68 0.37 0.64 0.56 0.38
0.11 0.1 0.0 0.08 0.13 0.0 0.13 0.28 0.04 0.06 0.22 0.06
4.12 3.25 3.46 3.9 4.31 3.38 5.91 4.2 5.76 7.88 7.1 5.91
0.32 0.28 0.05 0.49 0.54 0.49 0.59 0.77 0.26 1.3 0.0 0.51
2.5 0.79 0.75 1.15 0.57 0.86 0.9 1.66 1.16 2.01 2.35 2.02
9.76 7.99 9.48 8.19 8.62 9.2 9.5 9.73 9.33 11.77 10.7 10.63
0.32 0.22 0.45 0.43 0.37 0.46 0.33 0.9 0.79 0.91 0.61 0.15
0.61 0.43 0.68 0.45 0.22 0.26 0.51 0.47 0.44 1.17 0.72 0.54
2.12 1.0 2.46 1.53 1.22 2.26 1.46 3.03 1.53 4.97 2.57 2.27
4.93 3.97 4.85 3.65 4.8 5.09 5.3 5.09 4.97 4.37 4.61 4.42
0.0 0.07 0.0 0.02 0.07 0.05 0.02 0.1 0.03 0.21 0.05 0.0
0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.0 0.06 0.18 0.0 0.27 0.22 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.19 0.09 0.0
0.21 0.13 0.09 0.41 0.12 0.12 0.27 0.76 0.35 0.57 0.33 0.34
0.0 0.03 0.31 0.03 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.42 0.07 0.23
0.07 0.1 0.0 0.0 0.08 0.0 0.12 0.26 0.0 0.02 0.11 0.09
0.25 0.45 0.76 0.24 0.05 0.32 0.23 0.54 0.32 0.92 0.18 0.15
0.25 0.4 0.3 0.28 0.08 0.17 0.17 0.44 0.16 0.63 0.49 0.19
0.0 0.3 0.24 0.17 0.2 0.0 0.07 0.53 0.26 0.64 0.27 0.13
1.22 0.79 0.64 1.0 1.71 0.78 1.59 2.12 1.88 4.15 4.02 3.02
0.71 0.31 0.62 0.37 0.61 0.63 0.65 0.48 0.54 0.5 0.34 0.22
0.47 0.59 1.13 0.75 0.52 0.79 0.62 0.39 1.09 1.37 0.92 0.47
2.18 2.26 2.79 2.78 2.01 2.43 2.64 4.37 3.08 3.77 4.01 3.0
1.49 1.36 1.54 1.43 1.29 1.22 1.66 1.77 1.45 1.59 1.63 1.35
2.22 2.31 2.88 2.28 2.65 2.45 2.59 2.54 2.21 2.98 2.59 2.38
0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.05 0.02 0.0
0.04 0.0 0.0 0.05 0.03 0.04 0.05 0.02 0.0 0.04 0.11 0.06
0.54 0.49 0.47 0.55 0.54 0.63 0.58 0.94 0.74 0.85 0.72 0.7
0.64 0.21 0.65 0.65 0.3 0.46 0.74 1.0 0.83 1.97 0.78 0.86
2.76 1.76 1.39 1.92 2.09 2.3 3.73 4.53 2.99 4.95 4.77 3.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.08 0.0 0.02
14.5 11.65 12.89 12.23 12.35 12.86 13.35 12.26 14.79 16.17 15.16 14.02
16.32 16.63 15.15 17.56 16.56 13.13 17.12 17.91 18.34 23.34 19.91 19.2
1.22 1.5 1.68 1.29 1.21 0.83 0.74 1.09 0.63 2.37 1.61 1.33
2.04 1.47 1.15 1.54 1.01 1.98 1.31 1.91 2.15 2.05 2.37 1.65
10.2 6.73 6.69 6.7 6.77 8.66 9.75 6.28 10.65 15.59 10.89 8.02
0.0 0.0 0.02 0.15 0.06 0.02 0.06 0.65 0.4 0.36 0.25 0.21
3.32 2.67 2.08 2.66 2.28 2.33 2.18 2.73 3.09 3.01 3.31 2.64
26.55 18.22 19.9 17.84 22.38 21.36 20.29 17.55 26.92 33.08 30.9 22.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0
14.81 15.69 17.71 20.43 18.92 17.67 19.88 18.95 21.23 25.68 20.65 20.73
94.82 82.35 97.61 86.26 93.78 93.74 105.22 109.52 101.45 119.03 107.96 103.22
2.89 2.64 2.64 1.93 1.71 2.49 2.42 3.04 2.83 3.14 3.6 3.01
17.31 12.36 13.95 13.63 9.07 9.15 10.8 10.12 10.25 15.13 13.91 14.67
40.05 37.69 39.33 41.12 37.43 43.24 41.87 51.98 44.76 47.82 47.49 38.31
1.86 2.2 1.95 2.13 2.72 2.07 2.94 3.53 3.21 3.71 3.81 2.62
0.47 0.08 0.45 0.43 0.11 0.6 0.16 0.35 0.92 1.89 1.0 0.83
139.62 118.11 115.93 108.6 114.45 128.05 134.8 129.66 149.72 151.16 147.61 146.19
0.43 0.19 0.26 0.03 0.06 0.0 0.09 0.66 0.18 0.87 0.18 0.3
0.36 0.21 0.26 0.66 0.45 0.32 0.72 1.73 1.46 2.41 1.19 0.49
17.5 14.98 20.81 14.22 15.7 21.57 17.94 21.26 19.76 19.69 19.26 14.94
8.32 7.48 6.35 7.29 9.31 9.79 9.92 9.98 9.72 11.27 11.61 10.09
0.43 1.32 1.47 1.0 0.57 0.49 0.61 0.76 0.63 1.49 1.03 0.9
223.12 187.65 195.42 179.77 189.51 197.99 208.23 184.56 220.85 238.94 223.41 211.29

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)