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Heatmap: Cluster_63 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.23 0.43 -0.01 0.39 0.05 0.12 0.18 -0.08 -0.29 -0.08 -0.39 -0.38
0.15 0.39 0.09 0.12 0.08 0.0 -0.17 -0.41 -0.19 -0.07 0.04 -0.19
0.19 0.05 -0.2 -0.27 -0.16 0.1 -0.72 -0.78 0.1 0.27 0.64 0.17
-0.47 0.27 0.27 0.38 0.11 0.18 -0.0 -0.58 0.24 -0.25 0.0 -0.57
0.72 0.83 0.47 -0.17 -0.44 0.12 -0.69 -1.11 -0.28 -0.21 -0.1 -0.37
-0.18 0.44 0.36 0.19 0.1 0.07 0.09 -0.55 -0.27 -0.26 0.06 -0.4
-0.04 0.53 0.2 0.21 -0.12 -0.14 -0.14 -0.49 -0.13 -0.04 -0.03 -0.06
0.27 0.39 0.44 -0.09 0.05 0.41 -0.57 -0.65 -0.24 -0.21 -0.06 -0.26
0.14 0.36 0.48 0.12 0.14 0.19 -0.44 -0.56 0.03 -0.24 -0.21 -0.44
-0.14 0.44 0.03 0.26 -0.02 0.07 0.15 -0.42 -0.15 -0.04 0.03 -0.45
0.1 0.1 0.09 0.15 -0.1 0.14 -0.13 -0.16 -0.02 -0.12 0.04 -0.14
-0.34 0.3 0.1 0.18 0.23 -0.02 -0.01 -0.35 -0.19 -0.16 0.25 -0.19
-0.15 0.44 -0.22 0.19 0.19 0.3 0.55 -0.49 -0.26 -0.27 -0.26 -0.51
-0.15 0.28 0.09 0.25 -0.01 0.04 0.08 -0.22 -0.15 -0.05 -0.02 -0.25
0.26 0.26 -0.04 0.12 0.06 0.05 -0.08 -0.02 -0.34 -0.03 -0.17 -0.17
-0.02 0.48 -0.09 0.28 0.01 0.23 0.08 -0.38 -0.08 -0.07 -0.27 -0.46
-0.04 0.37 0.02 0.17 0.18 0.09 -0.17 -0.38 0.01 -0.24 0.02 -0.2
-0.24 0.47 0.22 0.27 -0.1 0.12 0.19 -0.43 -0.19 -0.28 0.06 -0.4
-0.03 0.5 0.05 0.35 -0.17 0.01 0.12 -0.39 -0.17 -0.16 0.08 -0.5
0.48 0.47 0.13 0.1 -0.03 -0.14 -0.7 -0.96 -0.14 -0.16 0.26 0.06
0.17 0.36 0.03 0.15 -0.16 -0.07 -0.14 -0.25 -0.02 -0.2 0.09 -0.07
0.02 0.18 0.13 0.14 -0.04 0.06 -0.19 -0.31 0.04 -0.07 0.11 -0.16
0.68 0.35 0.12 -0.08 -0.5 -0.12 -0.22 -0.36 0.05 -0.01 -0.24 -0.07
0.32 0.49 0.05 -0.0 -0.25 0.03 -0.2 -0.31 -0.25 -0.02 0.01 -0.09
0.01 0.23 -0.07 0.13 -0.03 0.14 0.14 -0.27 -0.08 -0.11 0.06 -0.24
-0.22 0.2 0.13 0.16 0.02 -0.06 -0.13 -0.12 -0.08 -0.02 0.08 -0.02
-0.09 0.18 0.06 0.23 0.03 -0.01 -0.06 -0.2 -0.07 -0.07 0.0 -0.05
0.12 0.19 0.06 0.11 0.13 0.06 -0.12 -0.11 -0.16 -0.16 -0.06 -0.13
0.19 0.34 0.05 0.11 -0.25 0.11 -0.11 -0.2 -0.1 -0.05 0.03 -0.24
-0.01 0.16 0.04 0.22 0.17 0.15 -0.04 -0.08 -0.24 -0.11 -0.07 -0.29
-0.04 0.27 0.17 0.27 0.08 -0.04 -0.05 -0.38 -0.29 -0.12 0.11 -0.14
-0.76 -0.08 -0.34 0.43 0.31 0.64 -0.32 -0.59 -0.1 0.02 0.38 -0.3
0.01 0.34 0.25 0.01 0.01 -0.02 -0.35 -0.38 -0.04 0.02 0.02 -0.02
0.15 -0.13 -0.16 -0.09 -0.21 0.09 -0.34 -0.33 0.19 0.24 0.37 0.03
0.36 0.56 0.41 0.34 0.39 0.33 -0.6 -1.11 -0.89 -0.53 -0.08 -0.33
0.06 0.41 0.22 0.07 -0.22 0.18 -0.16 -0.47 -0.06 -0.03 0.01 -0.23
0.42 0.17 0.13 -0.08 0.14 -0.28 -0.14 -0.21 -0.29 0.01 0.13 -0.18
-0.03 0.07 0.03 0.14 -0.06 0.24 0.08 -0.14 0.01 -0.06 -0.07 -0.27
0.22 -0.02 -0.38 -0.18 0.03 0.33 -0.38 -0.74 -0.21 0.09 0.67 0.05
-0.05 0.31 0.1 0.29 -0.06 0.47 0.14 -0.46 -0.14 -0.45 -0.08 -0.44
-0.39 0.5 0.29 0.46 -0.17 0.14 0.32 -0.15 -0.44 -0.31 -0.36 -0.41
-1.32 -0.24 0.56 0.97 0.89 0.17 -0.5 -0.62 -0.01 -0.66 -0.28 -0.88
-0.09 0.42 0.05 0.35 -0.03 0.09 -0.05 -0.52 -0.1 -0.25 0.15 -0.28
0.25 0.25 0.19 0.01 0.05 0.07 -0.23 -0.36 -0.11 -0.17 -0.03 -0.06
-0.0 0.35 0.38 0.09 0.14 0.08 -0.86 -1.6 -0.24 0.11 0.43 0.07
0.19 0.42 0.13 0.13 -0.09 0.05 -0.25 -0.47 -0.19 -0.22 0.11 -0.02
-0.28 0.24 0.11 0.21 0.03 0.16 0.23 -0.31 -0.13 -0.2 0.03 -0.26
-0.36 0.32 0.09 0.3 0.3 0.25 0.1 -0.44 -0.05 -0.23 -0.14 -0.45
-0.49 0.05 0.25 0.27 0.17 0.24 -0.01 -0.46 -0.18 0.02 0.03 -0.12
-0.05 0.36 0.19 0.11 -0.08 -0.01 0.11 -0.36 -0.2 -0.04 0.08 -0.24
-0.0 0.48 0.05 0.13 -0.04 0.34 0.09 -0.49 -0.3 -0.38 0.11 -0.31
0.29 0.82 0.31 0.15 -0.04 -0.2 -0.37 -0.66 -0.26 -0.44 -0.06 -0.18
0.19 0.36 0.21 0.11 -0.17 0.22 -0.51 -0.5 -0.13 -0.13 -0.02 0.1
-0.1 0.15 0.09 0.03 0.03 0.01 -0.08 -0.26 -0.09 0.02 0.15 0.01
-0.12 0.44 0.12 0.27 -0.07 0.21 0.06 -0.25 -0.28 -0.15 -0.11 -0.34
0.41 0.36 0.1 -0.03 -0.12 -0.13 -0.17 -0.18 -0.05 -0.02 -0.09 -0.25
0.49 0.37 0.07 0.08 0.09 -0.09 -0.18 -0.53 -0.05 -0.3 -0.08 -0.17
0.01 0.28 0.11 0.23 0.04 0.15 -0.09 -0.24 -0.29 -0.02 -0.08 -0.24
0.49 0.04 0.18 -0.18 -0.01 -0.25 -0.53 -0.51 -0.12 -0.06 0.31 0.25
0.17 0.7 0.26 0.35 -0.06 -0.31 -0.36 -0.62 -0.36 -0.16 -0.09 -0.05
-0.08 0.21 0.04 0.18 0.13 0.09 0.14 -0.28 -0.05 -0.27 0.04 -0.27
0.32 0.61 0.2 0.38 -0.31 -0.3 -0.47 -0.85 -0.18 -0.09 0.14 -0.08
0.14 0.17 0.12 0.28 0.17 -0.04 0.01 -0.36 -0.35 -0.23 0.04 -0.11
0.35 0.35 0.26 0.36 0.14 -0.13 -0.36 -0.26 -0.48 -0.06 -0.34 -0.19
-0.15 0.59 0.43 0.33 0.03 0.05 -0.1 -0.69 -0.17 -0.35 -0.07 -0.41
0.36 0.11 0.09 -0.18 -0.13 -0.06 -0.28 -0.31 -0.12 0.06 0.14 0.16
-0.33 0.27 0.12 0.21 0.04 -0.14 -0.09 -0.03 -0.03 -0.14 0.13 -0.12
0.07 0.45 0.06 0.19 -0.13 -0.02 0.05 -0.24 -0.21 -0.1 0.01 -0.28
0.07 0.14 0.13 0.03 -0.1 -0.02 -0.17 -0.54 -0.12 0.04 0.12 0.27
0.38 0.36 0.09 0.06 -0.1 0.03 -0.52 -1.16 -0.24 0.02 0.42 0.02
0.17 -0.01 0.1 -0.0 0.11 -0.07 -0.06 -0.07 -0.08 -0.04 0.02 -0.09
-0.14 0.33 -0.09 0.12 0.14 0.02 0.03 -0.03 -0.08 -0.14 -0.11 -0.13
0.08 0.32 0.2 0.16 0.13 0.1 -0.1 -0.55 -0.14 -0.25 0.04 -0.2
-0.1 0.45 0.19 0.23 -0.08 0.31 0.01 -0.39 -0.36 -0.11 -0.04 -0.39
0.24 0.21 0.15 0.07 -0.05 -0.02 -0.13 -0.26 -0.19 -0.02 0.03 -0.12
-0.06 0.52 0.23 0.43 -0.02 0.04 -0.05 -0.37 -0.25 -0.13 -0.24 -0.43
0.03 0.31 0.34 0.13 0.19 0.12 -0.13 -0.53 -0.05 -0.36 -0.05 -0.24
0.1 1.0 0.2 0.63 -0.26 -0.2 -0.38 -1.12 -0.52 -0.34 -0.2 -0.09
0.03 0.89 0.28 0.63 -0.14 -0.46 -0.35 -0.93 -0.55 -0.15 -0.17 -0.07
-0.3 0.43 0.23 0.4 0.02 0.44 -0.01 -0.53 -0.39 -0.26 -0.02 -0.49
-0.38 0.02 0.21 0.23 0.22 0.09 0.02 -0.51 0.09 -0.07 0.1 -0.23
0.07 0.21 0.2 0.16 -0.03 0.1 -0.19 -0.35 -0.01 -0.13 0.06 -0.21
0.24 0.34 0.26 0.24 0.04 -0.11 -0.25 -0.2 -0.14 -0.2 -0.23 -0.19
0.74 1.02 0.48 0.53 0.15 -0.86 -0.78 -1.7 -1.18 -1.15 -0.28 0.25
-0.36 0.39 0.31 0.36 0.16 0.19 -0.48 -0.84 -0.29 -0.23 0.32 -0.09
0.92 0.86 0.21 0.07 -0.49 0.25 -0.68 -1.32 -0.73 -0.23 -0.02 -0.45
0.12 0.34 0.14 0.18 -0.03 -0.15 -0.32 -0.51 -0.06 -0.13 0.23 -0.04
-0.27 0.34 0.26 0.36 0.23 0.35 -0.03 -0.42 -0.31 -0.31 -0.14 -0.48
-0.3 0.34 0.21 0.47 0.04 0.25 0.03 -0.46 -0.36 -0.11 -0.05 -0.43
-0.22 0.63 0.5 0.76 0.01 0.15 -0.24 -1.01 -0.5 -0.5 -0.35 -0.28
-0.34 0.36 0.27 0.34 0.14 0.26 0.21 -0.31 -0.16 -0.37 -0.29 -0.49
0.13 0.53 0.41 0.22 -0.17 -0.17 -0.33 -0.78 -0.07 -0.14 0.06 -0.13
-0.1 0.37 0.12 0.14 -0.17 0.17 0.09 -0.46 -0.09 -0.05 0.06 -0.27
-0.07 0.37 0.23 0.21 -0.01 0.08 0.05 -0.39 -0.17 -0.22 -0.09 -0.17
0.33 0.38 0.2 0.12 -0.06 -0.07 -0.12 -0.49 -0.28 -0.28 -0.09 0.09
0.08 0.42 -0.01 0.38 -0.03 0.23 0.01 -0.32 -0.25 -0.31 -0.14 -0.32
0.3 0.16 -0.02 0.03 -0.14 -0.08 -0.09 -0.1 -0.02 -0.03 0.02 -0.1
0.02 0.16 0.19 0.21 0.04 -0.07 -0.12 -0.24 -0.12 -0.03 -0.05 -0.06
0.08 0.78 0.45 0.2 -0.3 -0.09 0.15 -0.45 -0.44 -0.33 -0.28 -0.41
-0.15 0.36 0.05 0.3 -0.09 0.25 0.02 -0.19 -0.09 -0.2 -0.05 -0.41
-0.19 0.36 0.16 0.35 -0.16 0.06 0.06 -0.18 -0.28 -0.03 -0.07 -0.28
-0.09 0.21 0.1 0.18 -0.0 0.04 -0.15 -0.17 -0.07 -0.07 0.08 -0.12
-0.01 0.32 0.11 0.11 0.04 0.24 0.11 -0.41 -0.1 -0.2 -0.01 -0.38
-0.16 0.43 -0.12 0.28 -0.14 0.06 0.24 -0.41 -0.15 -0.1 0.12 -0.28
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-0.12 0.22 0.32 0.25 0.04 0.18 0.02 -0.28 -0.24 -0.09 -0.18 -0.31
0.45 0.61 0.06 0.19 -0.4 0.03 -0.37 -0.36 0.09 0.05 -0.19 -0.71
-0.19 0.07 0.07 0.11 0.2 0.38 0.06 -0.37 -0.08 -0.18 -0.02 -0.2
0.21 0.58 0.19 0.18 -0.06 -0.07 -0.01 -0.5 -0.07 0.02 -0.34 -0.49
-0.09 0.23 0.11 0.11 -0.04 0.04 -0.18 -0.22 -0.08 -0.07 0.1 0.02
0.18 0.22 0.18 0.18 0.0 0.1 -0.24 -0.45 -0.17 0.03 -0.03 -0.13
-0.27 0.55 0.08 0.44 0.03 0.27 0.14 -0.38 0.0 -0.72 -0.08 -0.64
-0.09 -0.16 -0.1 -0.02 -0.11 0.09 -0.26 -0.08 0.07 0.21 0.32 0.03
0.4 0.22 -0.09 0.08 -0.22 -0.12 -0.3 -0.45 -0.06 0.11 0.13 0.1
0.26 0.56 0.33 0.05 0.05 -0.02 -0.4 -0.62 -0.29 -0.14 0.08 -0.3
0.35 0.47 0.01 0.09 -0.23 -0.03 -0.34 -0.36 0.03 -0.02 -0.06 -0.17
-0.3 -0.08 0.05 0.15 0.18 0.06 0.07 -0.04 0.05 -0.05 -0.02 -0.13
0.2 0.4 -0.05 0.12 -0.08 0.06 -0.13 -0.71 0.07 -0.15 0.17 -0.19
-1.19 0.47 0.39 -0.23 0.93 0.24 -0.06 -0.8 -0.71 -0.39 0.38 -0.47
0.15 0.36 0.12 0.29 0.17 0.12 -0.17 -0.5 -0.21 -0.26 -0.1 -0.23
0.14 0.15 0.13 0.03 0.06 0.08 -0.05 -0.17 -0.13 -0.11 -0.0 -0.19
-0.4 0.16 0.21 0.39 0.34 0.1 -0.63 -0.71 -0.15 -0.0 0.3 -0.11
-0.15 0.39 0.08 0.19 -0.01 0.32 0.2 -0.32 -0.15 -0.27 -0.06 -0.5
0.34 0.59 0.38 0.32 -0.14 -0.18 -0.44 -0.58 -0.28 -0.22 -0.18 -0.13
0.36 0.43 0.05 0.27 0.04 0.14 -0.23 -0.57 -0.09 -0.26 -0.12 -0.39
0.01 0.08 -0.04 0.18 0.23 0.18 0.02 -0.12 -0.13 -0.14 -0.07 -0.31
-0.3 0.48 0.17 0.37 -0.2 0.29 0.13 -0.42 -0.16 -0.25 -0.05 -0.45
0.95 0.67 0.1 -0.05 -0.46 0.14 -0.58 -0.88 0.04 -0.41 -0.22 -0.38
0.25 0.3 0.17 -0.06 -0.19 -0.0 -0.02 -0.28 0.01 -0.05 -0.13 -0.11
0.23 0.16 0.09 0.04 -0.18 -0.1 -0.17 -0.4 -0.03 0.1 0.14 0.01
0.14 0.33 0.35 0.14 0.04 0.09 -0.89 -1.48 -0.32 0.03 0.42 0.16
0.23 0.22 0.21 0.08 -0.01 0.2 -0.12 -0.4 -0.28 -0.1 -0.05 -0.13
0.16 0.06 0.1 0.01 -0.04 -0.04 -0.17 -0.19 -0.08 0.11 0.06 -0.03
-0.43 0.34 0.18 0.17 -0.03 0.23 0.19 -0.46 -0.03 -0.2 0.09 -0.34
0.23 0.03 0.08 0.02 0.12 -0.06 -0.15 -0.21 -0.09 -0.05 0.09 -0.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.