Heatmap: Cluster_17 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
102871	11.37	6.44	7.74	6.15	5.37	8.14	7.12	9.42	4.33	7.05	11.24	16.11
111434	0.0	0.09	0.02	0.0	0.07	0.07	0.02	0.0	0.09	0.08	0.02	0.21
113781	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06
126836	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
136248	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
15599	0.11	0.06	0.02	0.04	0.0	0.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.0	0.02
16110	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.13
18006	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
18337	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
19741	0.14	0.24	0.0	0.09	0.21	0.7	0.53	0.08	0.0	0.2	0.4	0.96
230863	1.28	0.21	0.04	0.28	0.0	0.15	0.0	0.12	0.12	0.19	0.07	0.58
235152	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.13	0.16	0.04	0.0	0.12	0.0	0.04
28345	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.13	0.12	0.0	0.0	0.12	0.0	0.2
29169	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09
38123	0.14	0.11	0.09	0.08	0.12	0.23	0.32	0.0	0.23	0.04	0.12	0.22
402661	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
403245	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.13
403250	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.09
403560	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.04
403691	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
403771	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
404136	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
404460	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
404580	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
404965	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02
404990	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
406690	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04
407019	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
407240	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
407844	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
409908	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.09
411336	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
411576	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
412234	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
412712	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
413007	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.09
413187	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02
413189	0.35	0.18	0.02	0.12	0.05	0.04	0.0	0.08	0.02	0.06	0.08	0.17
413427	0.07	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
413516	0.36	0.05	0.0	0.03	0.0	0.09	0.02	0.0	0.07	0.0	0.0	0.09
414540	0.07	0.03	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11
415134	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
416201	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
416338	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
416402	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
416430	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.1	0.0	0.11
416777	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
417595	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.06
417638	0.0	0.02	0.03	0.02	0.02	0.0	0.07	0.02	0.04	0.02	0.07	0.17
417909	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
417938	0.0	0.1	0.03	0.17	0.0	0.18	0.27	0.0	0.04	0.16	0.09	0.31
418356	0.11	0.12	0.0	0.05	0.0	0.07	0.0	0.06	0.37	0.06	0.2	0.51
418360	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
418718	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
418840	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06
419220	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
419239	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.06
419750	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
420608	0.14	0.0	0.03	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.09
421411	0.04	0.02	0.0	0.03	0.0	0.0	0.04	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02
421912	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
422367	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.04
422480	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.02
424595	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
425282	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
425362	0.04	0.0	0.0	0.05	0.07	0.0	0.02	0.02	0.05	0.0	0.0	0.13
426190	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09
426724	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
427207	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.05	0.04
427481	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.04
427846	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
428016	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06
428882	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09
429772	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
429813	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
430319	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
430642	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
431545	0.04	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.06
431562	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
432424	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
442029	0.25	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.09	0.0	0.04	0.15
48861	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
72266	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
75347	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
82899	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
88541	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
92689	0.0	0.0	0.03	0.0	0.08	0.0	0.06	0.0	0.0	0.02	0.0	0.07
92732	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17
99656	0.07	0.0	0.0	0.03	0.0	0.15	0.1	0.0	0.03	0.14	0.0	0.25

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)