Heatmap: Cluster_9 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.99 0.13 0.17 0.43 0.1 0.74 0.09 0.22 0.51 0.09 0.26 0.26
4.0 3.04 2.54 3.64 3.69 6.22 5.75 5.64 7.54 4.11 5.17 4.62
5.06 3.03 2.55 2.75 2.4 4.36 2.34 3.43 6.44 6.2 6.37 6.01
20.42 20.65 20.97 20.18 19.15 19.97 21.12 21.33 24.48 21.33 20.45 22.38
3.02 1.77 1.62 1.89 1.68 2.14 1.31 1.75 2.32 2.6 2.51 1.72
1.6 0.28 0.47 0.51 0.23 1.05 0.95 2.25 2.63 0.89 1.16 1.13
1.98 0.99 0.82 1.09 0.46 1.19 0.88 0.71 1.59 1.02 0.91 1.01
0.36 0.55 0.94 0.65 0.43 0.54 0.42 0.51 1.81 1.38 1.24 0.86
1.59 0.02 0.69 0.03 0.22 0.24 0.02 0.42 1.5 0.12 0.83 0.79
1.11 0.56 0.63 0.34 0.45 0.52 0.56 0.87 1.29 1.95 0.64 0.56
1.86 0.54 1.51 0.81 0.4 0.79 1.36 0.84 3.12 0.64 0.75 1.28
6.83 8.67 10.53 9.5 6.5 9.61 7.61 8.84 14.19 6.31 8.16 8.08
23.83 26.64 32.95 32.99 28.21 28.69 28.23 36.5 41.85 41.46 33.05 26.85
0.92 0.83 0.45 0.76 1.28 2.12 2.52 2.81 3.5 1.92 2.4 1.51
2.25 2.48 3.66 3.88 2.62 2.89 3.68 3.82 5.67 4.22 3.32 3.05
0.18 0.09 0.03 0.18 0.05 0.04 0.16 0.07 0.21 0.0 0.1 0.06
0.32 0.38 0.15 0.19 0.07 0.63 1.13 1.07 1.84 0.64 0.98 0.32
1.81 0.99 0.97 0.99 1.0 1.68 1.32 1.79 3.1 2.62 2.07 2.19
0.25 0.19 0.18 0.17 0.08 0.11 0.36 0.25 0.74 0.5 0.84 0.55
5.47 4.99 4.77 5.83 3.94 5.13 5.16 5.7 7.23 7.67 6.44 5.85
2.06 1.02 1.02 1.13 1.19 1.24 1.33 1.73 2.58 1.2 1.75 1.76
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.05 0.26 0.07 0.18 0.11
6.61 7.83 7.39 7.98 8.37 7.06 7.0 6.63 9.27 9.89 8.21 8.59
4.5 3.54 5.0 3.43 4.82 4.6 5.05 4.08 9.36 7.09 8.88 5.04
51.93 54.26 57.98 65.05 58.46 59.93 59.04 67.0 65.54 66.3 65.09 63.98
6.0 9.3 6.36 13.6 11.69 13.14 18.43 20.07 27.52 16.82 17.91 13.74
14.74 14.46 14.36 16.63 17.16 17.81 18.27 20.21 19.74 17.45 18.54 15.75
0.47 0.95 1.03 0.78 1.03 1.69 1.85 2.52 2.42 1.06 1.44 0.97
7.56 6.04 4.82 6.46 8.69 13.03 13.09 15.34 18.04 14.34 11.33 13.53
1.14 0.92 0.41 1.46 1.98 3.12 4.7 5.4 6.67 5.25 3.82 3.12
1.48 3.04 0.71 2.3 0.92 1.62 3.21 1.61 4.33 3.86 4.02 2.32
1.74 2.39 2.63 1.91 1.8 1.79 1.66 0.81 5.4 2.81 0.65 2.24
0.14 0.17 0.46 0.1 0.13 0.18 0.41 0.41 1.0 0.8 0.37 0.53
0.0 0.04 0.12 0.22 0.41 0.5 0.25 0.56 0.12 0.04 0.14 0.04
0.21 0.35 0.34 0.4 0.36 0.18 0.14 0.11 0.46 0.53 0.14 0.42
30.59 33.31 30.84 34.83 27.93 33.98 35.62 32.68 39.61 39.87 39.23 38.05
0.6 0.07 0.14 0.0 0.0 0.24 0.42 0.38 0.82 0.27 0.13 0.51
2.63 1.49 0.82 2.01 1.12 1.79 1.53 1.72 3.05 2.34 3.45 2.66
4.56 2.55 2.85 2.15 2.66 2.71 2.55 4.36 4.96 3.15 3.61 3.2
43.75 33.96 38.16 35.4 35.45 38.31 31.93 25.73 46.62 49.35 47.01 43.48
0.0 0.02 0.12 0.02 0.0 0.07 0.02 0.25 0.0 0.02 0.0 0.04
0.07 0.24 0.26 0.36 0.02 0.34 0.17 0.22 1.23 1.03 0.22 0.64
0.0 0.0 0.03 0.03 0.05 0.11 0.04 0.19 0.07 0.0 0.0 0.0
0.11 0.11 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.96 0.33 0.05 0.13
0.14 0.59 0.05 0.2 0.07 0.57 1.2 1.05 0.75 0.43 0.37 0.77
0.04 0.02 0.22 0.05 0.07 0.07 0.04 0.04 0.42 0.19 0.02 0.11
1.0 0.93 1.19 1.3 1.55 1.8 2.29 2.37 2.77 1.93 1.68 1.62
0.5 0.18 0.3 0.56 0.51 1.19 1.61 2.16 2.26 1.94 1.17 0.71
0.0 0.04 0.0 0.07 0.02 0.2 0.04 0.0 0.26 0.02 0.0 0.1
6.14 3.73 3.02 3.71 3.63 3.41 5.1 5.13 6.51 5.96 5.58 5.19
2.02 1.14 1.53 1.31 1.24 1.24 1.23 1.87 2.09 1.95 1.39 1.41
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.13 0.02 0.15 0.0 0.04 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.02
1.0 0.7 0.36 0.74 0.58 0.9 0.94 0.91 1.59 1.58 1.56 1.11
5.42 4.46 4.89 6.7 7.51 5.82 6.1 9.43 8.1 7.1 8.16 7.57
0.0 0.07 0.62 0.11 0.07 0.04 0.05 0.04 0.35 0.06 0.06 0.02
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.06 0.0 0.26 0.14 0.05 0.06
2.97 2.99 2.64 4.03 4.39 5.7 7.02 6.73 8.56 5.97 6.52 5.34
0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.17 0.02 0.0 0.02
0.25 0.37 0.16 0.29 0.12 0.07 0.5 0.2 0.46 0.8 0.18 0.17
47.34 45.83 45.8 46.88 40.96 58.44 45.79 51.75 69.09 57.22 57.84 56.3
0.18 0.11 0.04 0.13 0.17 0.45 0.51 1.16 1.05 0.68 0.49 0.47
4.41 3.43 3.95 3.51 3.54 5.31 5.71 5.32 5.05 4.51 4.71 4.86
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.19 0.02 0.09 0.04
0.46 0.0 0.0 0.02 0.05 0.13 0.02 0.04 0.28 0.02 0.04 0.11
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.11 0.02 0.0
0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0
1.09 1.59 0.43 1.94 1.52 1.56 1.27 2.65 2.86 3.18 2.66 2.04
0.6 0.34 0.0 0.18 0.06 0.3 0.32 0.02 0.56 0.12 0.17 1.0
0.04 0.02 0.0 0.0 0.05 0.09 0.11 0.21 0.4 0.21 0.16 0.17
0.67 0.33 0.33 0.46 0.2 0.97 0.51 0.21 1.28 0.41 0.58 0.78
0.11 0.12 0.02 0.04 0.09 0.0 0.1 0.02 0.56 0.61 0.31 0.06
2.54 1.85 2.09 1.83 1.89 2.11 1.65 1.63 2.12 2.27 2.17 1.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0
0.36 0.42 0.24 0.35 0.18 0.4 0.09 0.5 0.68 0.66 0.89 0.51
0.74 0.25 0.16 0.3 0.0 0.1 0.34 0.47 0.8 0.32 0.53 0.6
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.02 0.0 0.31 0.02 0.0 0.04
0.49 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.16 0.26 0.52 0.3 0.19 0.32
1.52 0.93 0.45 0.68 1.0 0.51 1.16 1.21 1.3 0.85 0.87 0.87
1.15 1.67 1.53 1.35 1.95 1.32 0.59 1.45 1.61 3.08 2.34 1.92
0.64 0.12 0.03 0.15 0.09 0.59 1.14 1.35 1.37 1.12 0.71 0.34
0.43 0.21 0.59 0.24 0.3 0.27 0.25 0.3 0.86 0.46 0.5 0.34
0.74 1.13 1.14 1.05 0.96 1.45 1.26 0.86 3.2 2.03 2.44 2.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.14 0.0 0.0 0.04
0.07 0.11 0.13 0.2 0.09 0.18 0.21 0.25 0.67 0.59 0.1 0.04
1.29 0.89 0.96 0.89 0.78 0.85 0.79 0.64 1.91 1.88 1.74 1.45
0.0 0.12 0.13 0.0 0.16 0.0 0.1 0.1 0.42 0.02 0.02 0.04
0.0 0.04 0.0 0.19 0.0 0.05 0.1 0.0 0.31 0.26 0.16 0.17
0.14 0.18 0.05 0.31 0.05 0.18 0.23 0.37 0.32 0.49 0.48 0.34
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.34 0.1 0.49 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.21 0.18 0.02 0.05 0.09
0.61 0.58 0.17 0.03 0.0 0.0 0.0 0.17 0.66 0.53 0.54 0.13
0.99 0.12 0.0 0.05 0.0 0.18 0.02 0.06 0.94 0.02 0.14 0.35
9.18 7.74 7.06 5.15 5.91 6.88 6.95 7.12 8.66 9.05 9.52 7.62
0.04 0.0 0.0 0.12 0.0 0.09 0.02 0.07 0.0 0.02 0.0 0.04
0.4 0.13 0.13 0.28 0.29 0.2 0.42 0.3 0.72 0.72 0.63 0.45
0.04 0.0 0.09 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.04
1.1 1.2 3.58 1.82 1.57 2.08 2.44 1.08 2.99 6.69 2.28 1.12
4.21 6.28 6.51 5.77 7.15 6.63 5.93 8.84 11.48 11.59 9.44 9.4
0.11 0.0 0.21 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.25 0.08 0.0 0.07
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.2 0.04 0.04 0.42 0.04 0.16 0.0
5.62 5.22 6.49 6.63 7.63 6.94 7.77 10.36 8.44 7.56 7.08 7.35
8.33 6.49 5.3 4.75 5.24 5.72 5.28 4.49 7.1 7.4 7.57 5.74
0.18 0.0 0.15 0.0 0.05 0.11 0.45 0.17 0.4 0.56 0.19 0.1
24.69 16.26 20.04 17.5 18.16 18.24 15.65 22.89 25.33 22.11 21.39 19.12
0.0 0.71 0.43 0.11 0.0 0.0 0.29 0.0 1.22 1.15 0.36 0.79
2.55 2.55 2.52 2.84 1.58 1.75 3.26 3.9 2.09 3.09 3.76 3.71
1.31 0.17 0.22 0.39 0.03 0.56 0.44 0.48 0.81 0.28 0.43 1.0
8.21 5.52 8.39 6.96 7.89 8.55 7.94 6.35 11.37 13.02 11.57 7.64
4.05 2.6 3.04 2.75 2.67 2.56 2.69 3.4 5.39 4.23 5.06 3.14
3.82 3.92 5.19 3.38 4.36 3.66 3.06 5.11 14.35 8.22 12.46 7.04
1.85 0.56 0.74 1.61 1.74 3.04 3.18 5.04 5.85 3.87 3.67 2.49
0.14 0.13 0.0 0.02 0.12 0.44 0.76 0.7 0.82 0.37 0.11 0.32
5.29 2.64 2.41 2.92 1.92 7.48 8.86 8.77 8.82 6.09 5.08 4.46
11.91 11.35 11.27 11.71 11.64 11.01 12.04 12.56 12.16 12.98 13.3 12.58
0.04 0.0 0.05 0.0 0.08 0.11 0.02 0.17 0.12 0.06 0.09 0.02
3.4 1.76 1.98 1.64 1.85 1.32 2.49 1.39 4.27 2.01 2.44 2.72
8.84 8.15 6.18 7.67 6.3 8.07 9.68 9.37 11.17 11.02 10.14 11.26
0.53 0.22 0.54 0.08 0.08 0.14 0.18 0.34 0.75 0.25 0.12 0.28
3.35 3.55 3.42 4.06 3.72 4.14 5.85 5.77 6.34 5.49 5.48 4.5
2.89 0.29 1.03 0.2 1.49 1.67 0.73 1.64 5.71 3.12 3.65 2.19
0.46 0.1 0.22 0.13 0.08 0.13 0.16 0.07 0.61 0.17 0.19 0.04
9.65 7.41 6.57 8.01 7.73 8.59 7.21 8.52 10.53 8.98 10.99 9.16
4.7 4.56 3.19 4.83 3.68 4.23 4.58 4.63 5.77 5.4 5.91 4.08
8.33 8.61 8.36 8.17 8.26 8.3 7.62 9.2 14.26 11.14 15.04 14.85
1.11 1.25 1.02 1.53 1.1 1.36 2.07 1.92 2.94 3.29 2.41 2.71
0.14 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.05 0.02
0.21 0.4 0.0 0.68 0.16 1.27 0.86 0.39 1.82 0.56 0.0 0.19

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)