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Heatmap: Cluster_164 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
2.44 - - - - - - 1.94 - - 1.45 -
-0.18 0.12 -0.05 0.07 -0.06 -0.03 -0.1 0.08 0.05 -0.02 0.12 -0.03
1.38 -1.88 -2.29 -0.08 - 0.03 -0.62 0.67 -0.8 0.89 0.06 0.3
0.14 0.15 -0.42 0.22 -0.29 -0.18 0.11 0.03 -0.06 -0.23 0.43 -0.12
0.17 0.8 -1.38 0.58 -0.24 0.12 -0.49 -0.02 -0.08 -0.68 -0.21 0.26
0.36 1.79 - - - - - 1.66 1.14 - 0.93 -
-0.02 -0.2 0.45 -0.28 0.07 0.05 0.16 -0.08 0.04 -0.34 -0.15 0.12
-0.65 -0.42 -0.16 0.08 -0.12 -0.75 -0.0 0.41 -0.01 -0.26 0.89 0.18
-0.36 -0.29 0.02 -0.01 0.23 -0.43 0.17 0.24 -0.1 -0.09 0.4 -0.01
0.31 0.14 -0.1 0.03 -0.2 0.03 -0.06 -0.12 -0.51 0.11 0.22 -0.02
-0.71 0.01 -0.82 0.19 0.4 0.07 0.08 -0.05 0.65 -0.29 0.28 -0.56
1.06 - - -0.06 -0.83 - -1.08 1.67 -1.28 -0.02 1.07 0.3
-0.22 -0.17 -0.1 0.08 0.02 0.33 -0.28 0.09 0.1 -0.03 0.11 -0.04
0.36 -0.15 0.18 -0.57 0.03 -0.05 -0.33 0.23 -0.02 -0.36 0.37 0.01
-0.05 0.06 -0.21 -0.39 -0.36 0.36 0.13 0.12 0.12 0.0 0.08 -0.05
-0.04 0.16 -0.19 0.5 -0.78 -0.23 -0.2 0.04 -0.3 -0.06 0.19 0.45
-0.08 -0.01 -0.79 -0.15 -0.13 0.25 -0.04 -0.09 0.21 0.13 0.39 0.01
0.07 -0.02 -0.19 -0.03 -0.08 0.18 -0.01 -0.06 0.02 -0.0 0.13 -0.03
0.26 -0.11 -0.15 -0.07 -0.04 -0.14 -0.23 -0.21 -0.15 0.03 0.32 0.33
0.45 -0.47 -0.22 -0.38 0.14 -0.07 -0.2 -0.01 0.17 0.21 -0.09 0.2
-0.16 0.27 -2.9 0.91 0.82 - -1.55 -0.49 -0.18 -0.93 1.48 -0.2
-1.4 -1.4 -1.48 -0.52 0.28 -0.18 -0.01 1.49 0.72 -0.61 0.42 -0.61
- - - - -1.47 1.91 - -0.93 0.77 0.77 0.89 1.06
- 1.86 - - - 0.68 -0.19 0.64 0.26 - -0.34 1.23
-0.21 0.01 -0.22 -0.07 0.04 -0.15 -0.14 0.43 0.03 0.14 0.39 -0.51
-0.16 0.27 -0.21 0.12 0.01 -0.1 0.03 -0.26 0.22 -0.22 0.21 -0.04
-0.28 -0.79 -0.09 -0.02 0.37 -0.07 -0.55 0.12 0.21 -0.17 0.54 0.23
0.78 - - - 0.15 0.36 0.27 0.2 0.73 -0.12 1.24 -0.76
-0.21 -0.08 -0.37 -0.27 -0.06 0.22 0.03 0.31 0.0 0.17 0.41 -0.41
-0.08 - -0.45 -1.78 -0.45 -0.22 0.78 1.55 0.07 -1.81 1.12 -1.84
-1.81 0.25 -1.82 0.95 -0.75 0.79 0.33 -0.09 -0.54 - 1.17 -0.23
-0.07 -0.71 -0.34 -0.02 -0.19 -0.28 -0.17 0.8 0.16 -0.4 0.6 -0.09
0.05 -0.07 -1.76 -0.06 -1.91 0.11 0.88 -0.43 0.51 0.21 0.67 -0.63
-0.26 -0.66 -0.64 -0.82 -0.35 -0.11 -0.52 0.62 0.12 0.76 0.86 -0.35
0.06 0.17 -0.59 0.18 -1.12 0.07 -0.33 0.66 -0.49 0.46 0.26 -0.22
-0.4 0.26 -1.28 0.15 0.26 -0.98 -0.07 0.26 -0.23 0.07 0.75 0.12
-0.08 0.43 -1.13 0.65 -0.99 0.32 -0.11 -0.89 -0.26 -0.85 0.78 0.43
-0.4 0.29 -0.37 -0.17 -0.75 0.35 -0.55 0.98 -0.93 -0.49 0.86 -0.36
0.84 -0.13 -2.12 -1.31 -0.45 0.03 -0.14 0.73 0.62 -0.45 0.11 -0.01
0.08 -0.05 -0.44 0.01 -0.19 0.06 -0.14 -0.04 0.11 0.07 0.24 0.17
-0.37 -0.05 -0.02 0.71 -0.61 0.35 -0.47 0.34 -1.89 0.1 0.98 -1.34
- 0.06 -2.23 -0.67 0.9 1.2 -0.59 -0.67 0.51 0.74 0.25 -1.37
-1.9 -0.34 0.9 -0.29 -1.75 -0.91 0.54 0.65 0.36 -0.75 1.29 -3.61
- - - - 1.17 - - 2.08 -0.24 - 2.22 -
1.07 0.65 -1.68 0.18 0.28 -0.57 -0.8 -1.46 -2.63 0.22 0.73 0.11
-0.1 -0.32 -0.63 0.34 0.24 0.13 -0.07 0.45 -0.95 0.39 0.22 -0.38
0.58 0.72 -0.39 -1.42 -0.25 -1.5 -0.92 -1.24 1.1 -0.63 0.56 0.4
-0.06 -0.26 -0.02 0.04 0.02 -0.51 0.15 0.1 -0.13 -0.11 0.53 0.01
-0.09 0.1 -0.1 -0.1 -0.24 -0.07 -0.19 0.08 0.11 0.2 0.25 -0.03
-0.12 0.05 -0.55 -0.06 -0.37 0.23 -0.45 0.14 0.1 0.08 0.62 -0.06
0.11 -0.06 -0.15 0.01 -0.01 -0.1 -0.06 0.01 0.08 -0.05 0.19 -0.0
- - - - 1.13 - 1.64 - 0.46 -0.39 2.19 -
-0.59 -0.71 -0.4 0.08 -0.51 0.44 0.11 -0.15 -0.02 -0.07 0.93 0.04
0.05 -0.43 -1.67 -0.17 -0.18 0.33 0.26 0.28 0.49 -0.17 0.29 -0.07
1.96 1.19 - - - - - 1.45 - - 1.33 -0.76
0.2 -0.07 -0.03 0.0 -0.03 -0.16 -0.6 0.02 -0.17 -0.12 0.38 0.34
-0.03 -0.43 -0.39 -0.25 -0.24 0.15 0.19 0.22 0.29 -0.31 0.64 -0.26
-0.76 -0.01 -0.17 -0.34 -1.58 0.03 0.66 0.68 0.5 -0.87 0.18 0.14
0.3 -0.22 -0.25 0.08 0.11 -0.12 -0.22 -0.1 0.15 0.06 0.14 -0.05
- - 0.07 -0.48 -0.81 - 0.74 1.24 0.53 0.25 1.36 -1.2
-1.99 0.43 -1.39 0.31 0.24 -1.41 0.31 0.58 -0.19 -0.25 0.77 0.1
0.75 0.34 0.3 -0.05 - -1.05 0.08 -1.5 0.53 -0.26 0.97 -0.46
-0.84 -0.51 -0.08 -0.26 0.36 0.64 -1.43 0.41 0.24 0.28 0.24 -0.25
-1.46 0.65 - -0.01 -0.45 -0.01 0.08 0.26 0.53 -1.15 0.75 0.61
-0.55 -0.05 -0.53 -0.9 0.52 -1.13 -0.53 -0.51 0.42 0.23 1.06 0.31
1.3 0.1 0.32 0.36 -1.03 - 0.46 -0.1 -1.04 -0.73 0.18 -0.15
-0.24 0.23 -0.81 0.71 -0.13 -1.02 0.04 -0.0 0.4 0.12 0.21 -0.37
-0.45 -0.31 -0.32 0.91 -0.55 0.02 0.1 0.03 -1.86 0.94 -0.53 0.14
-0.13 -0.98 0.14 -0.03 0.15 1.0 -0.36 0.46 0.0 -0.87 0.03 -0.6
-2.02 -0.79 -0.24 -0.61 - -1.01 0.83 1.47 -0.44 -0.01 1.09 -0.41
-0.34 -0.32 -1.37 -0.17 -0.43 0.07 -1.23 0.87 1.0 -0.66 0.66 -0.19
-1.52 1.07 - -0.29 -1.84 - -2.07 0.48 0.49 -0.44 0.96 1.46
0.31 0.6 -2.47 0.35 -1.65 -0.09 -0.09 0.66 0.01 0.92 -1.42 -0.45
- 0.01 -0.25 0.75 -0.55 - -0.07 0.7 0.37 1.05 0.41 -0.94
-0.29 -0.04 1.12 -0.89 0.3 0.67 -0.58 0.15 0.06 -0.83 -0.72 -0.55
0.26 -0.26 -0.08 -0.35 0.23 -0.46 -0.68 -0.07 0.25 -0.36 0.41 0.55
0.14 -0.95 - 1.05 - - 0.32 1.14 0.74 -0.55 -0.85 0.96
-0.38 0.17 -1.42 0.27 -0.17 -0.06 0.03 -0.41 0.01 0.56 0.07 0.46
-0.59 -1.27 0.34 0.0 -0.02 0.82 0.06 0.39 -0.32 -0.17 0.21 -0.51
0.38 -0.29 -1.54 1.2 -0.05 -3.15 -0.3 1.16 -0.02 -0.65 -0.46 -0.39
0.52 0.38 -1.86 0.08 -0.2 0.73 -0.17 0.04 -0.33 -0.23 -0.12 -0.13
0.21 -0.19 -0.24 -0.15 0.01 0.12 -0.29 0.1 0.23 -0.3 0.23 0.1
-1.4 0.38 0.13 0.84 0.51 -3.12 -0.12 0.79 0.27 -1.65 -0.51 0.03
-0.46 0.59 -0.67 0.01 -1.04 0.06 -0.67 0.54 0.33 -1.2 0.48 0.52
1.51 -0.22 -0.29 -0.55 -1.41 -0.47 -0.85 0.55 -1.08 0.06 0.16 0.04
1.06 -0.35 - -0.06 - 0.5 0.33 1.17 0.8 -0.37 -0.45 -
- -1.34 - -0.69 - 1.18 -0.13 1.38 -1.59 0.27 0.67 1.05
-0.22 0.06 -0.71 -0.03 -0.06 -0.17 -0.68 0.22 -0.09 0.39 0.59 0.15
0.01 -0.1 -1.34 -0.1 -0.23 -0.17 -0.62 0.88 0.06 -0.16 0.56 0.13
-0.29 0.07 -1.28 -0.45 -0.25 0.35 -0.6 0.4 0.2 0.09 0.63 0.18
-0.02 -0.43 -0.09 -0.24 -0.26 -0.33 -0.83 0.46 0.55 -0.65 0.78 0.14
-0.44 -0.12 -0.79 -0.1 0.46 0.23 0.14 0.58 0.14 -0.52 0.27 -0.57
- - - 1.2 - - - 1.42 1.74 -0.28 1.05 -0.35
-0.81 -0.79 -0.67 0.38 -0.1 0.33 0.27 0.54 0.04 0.2 0.21 -0.42
0.33 0.31 -1.44 -0.76 -0.1 -0.11 -1.23 -0.47 0.32 0.03 1.02 0.3
0.35 0.47 0.43 -0.56 - - -0.51 -1.45 1.3 -0.46 0.97 0.15
0.04 -0.8 -0.3 0.24 -1.96 -0.14 0.46 0.42 0.32 -0.67 0.75 -0.05
0.19 -0.13 0.05 -0.15 -0.04 0.03 -0.31 0.06 0.08 0.13 -0.06 0.07
-0.31 0.32 -1.38 -0.08 -0.3 -0.44 0.42 -0.26 0.0 0.18 0.93 -0.26
-0.04 0.05 0.02 -0.13 -0.07 -0.13 -0.19 0.01 0.12 -0.06 0.07 0.28
0.12 0.15 -0.39 0.04 -0.15 -0.18 0.19 -0.37 0.16 -0.01 0.28 -0.03
0.36 -0.44 -0.21 -0.26 -0.27 0.49 0.07 0.26 -0.06 -0.11 0.11 -0.26
0.35 -0.12 0.34 -1.51 0.36 -0.32 -0.1 -0.14 0.34 0.13 -0.26 0.1
0.15 0.12 -0.19 0.09 -0.1 0.27 0.09 -0.07 -0.25 0.02 0.12 -0.38
0.14 -0.12 -0.32 -0.08 -0.22 0.44 -0.03 0.22 -0.1 -0.2 0.13 -0.03
0.02 -0.22 -3.85 0.86 -0.41 0.49 -0.28 0.85 -0.64 -0.54 0.61 -0.72
-0.3 -0.1 -0.02 -0.1 0.03 0.35 -0.01 0.22 -0.02 -0.06 0.12 -0.25
-1.56 -0.3 -3.9 0.26 0.16 -0.68 0.08 1.18 0.19 -0.34 0.17 0.55
-0.1 -0.68 -0.08 0.2 0.15 -0.08 0.01 -0.36 0.17 0.05 0.44 -0.02
0.21 -0.19 -1.38 -0.44 -1.22 -0.37 -0.25 0.83 -0.42 0.8 0.76 -0.25
0.09 -1.32 -2.56 -0.81 0.38 1.08 - 0.0 0.48 -0.29 1.34 -0.65
- - - 1.15 1.32 0.46 - -0.69 0.16 0.37 1.53 -
0.32 -0.31 -0.95 -0.21 -0.6 0.28 -0.02 0.13 -0.77 0.09 0.96 0.03
-0.41 -0.02 -0.45 -0.13 0.0 -0.05 -0.99 0.95 -0.12 0.39 0.18 -0.22
- 0.68 - - 1.44 - - - 0.78 1.07 0.84 1.05
0.23 0.23 -0.19 -0.06 -0.25 -0.07 0.17 -0.32 -0.21 0.06 0.17 0.09
0.16 0.16 -0.98 0.25 0.04 -0.13 0.11 0.07 0.26 -0.35 0.17 -0.16
- 2.69 - 0.51 - - - 1.12 - - - 0.95
-0.54 0.05 -0.57 0.08 -0.37 -0.14 0.33 0.14 0.28 -0.2 0.4 0.16
-1.09 -0.45 -1.5 0.56 -0.99 0.84 -0.37 0.54 -1.1 0.08 1.33 -1.26
0.05 0.38 -1.43 0.62 -0.28 -0.64 -0.29 -0.28 0.62 -0.2 0.66 -0.59
-0.08 -0.06 -0.07 0.07 -0.02 0.06 -0.09 0.07 -0.0 0.04 0.09 -0.02
0.09 -0.0 -0.18 0.07 -0.09 0.15 -0.04 -0.11 -0.28 -0.03 0.19 0.14
0.22 0.02 -0.18 -0.12 -0.34 0.1 0.02 -0.03 0.17 0.06 0.14 -0.15
1.34 0.22 -0.76 -1.14 -2.69 -0.05 -0.79 0.39 -0.53 0.05 0.02 0.59

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.