Heatmap: Cluster_177 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.68 -0.28 0.1 -0.07 -0.08 0.05 0.12 0.06 0.22 0.17 0.19 -0.02
-0.01 -0.17 -0.06 -0.05 0.17 0.09 0.11 -0.2 0.14 -0.02 0.09 -0.14
-0.72 -0.52 -0.03 -0.16 0.08 0.11 0.21 0.03 0.31 0.01 0.31 0.04
-0.29 -0.25 -0.09 0.1 0.15 0.08 -0.02 -0.0 0.21 0.08 0.04 -0.1
-0.71 -0.9 -0.08 -0.31 0.22 0.17 0.01 0.21 0.56 0.19 0.15 -0.09
-0.24 -0.37 -0.37 -0.18 0.18 0.13 0.14 -0.03 0.21 0.16 0.29 -0.13
-0.42 0.02 -0.34 0.3 -0.08 0.44 0.13 0.04 0.24 -0.01 -0.09 -0.56
-0.05 -0.2 -0.03 -0.08 -0.01 -0.05 0.05 0.06 0.32 0.1 0.02 -0.21
0.02 0.38 -0.57 0.01 -0.45 0.26 0.08 -0.04 0.04 0.19 0.07 -0.26
-0.28 -0.14 -0.18 0.25 0.39 0.48 -0.09 -0.29 -0.16 0.09 -0.16 -0.17
-0.48 -0.36 0.07 0.02 -0.0 -0.18 -0.11 -0.04 0.2 0.34 0.25 0.07
-0.14 -0.28 -0.28 -0.0 0.25 0.0 0.11 -0.05 0.19 -0.02 0.11 -0.01
-0.2 -0.21 -0.24 -0.04 0.17 0.02 -0.06 -0.01 0.23 0.08 0.21 -0.03
-0.3 -0.24 -0.0 -0.09 -0.05 0.16 -0.06 0.01 0.18 0.16 0.11 0.06
-0.57 -0.01 -0.09 0.24 -0.16 0.1 0.56 -0.25 0.31 0.12 -0.05 -0.66
-0.25 -0.13 0.0 0.09 0.11 0.02 -0.05 -0.0 0.11 0.11 0.06 -0.11
-0.69 -0.38 -0.08 0.12 0.16 0.18 0.14 0.0 0.22 0.15 -0.01 -0.06
-0.32 -0.1 -0.25 0.07 -0.16 0.05 0.22 -0.16 0.29 0.37 0.15 -0.4
-0.51 -0.55 -0.21 -0.38 -0.04 -0.39 0.11 0.08 0.67 0.22 0.46 -0.02
-0.11 -0.23 -0.25 -0.04 0.59 -0.06 -0.05 -0.63 0.23 0.03 0.35 -0.22
- -1.47 - 0.23 - - 1.03 -1.53 2.54 - 1.17 -
-0.46 -0.46 0.03 -0.05 -0.06 -0.04 -0.08 0.13 0.21 0.12 0.18 0.27
-0.81 0.25 -0.67 0.31 -0.16 0.24 0.2 0.06 0.45 0.19 -0.21 -0.47
-0.87 -0.24 -3.42 0.39 0.1 0.19 0.26 -1.19 1.7 -0.54 0.15 -1.68
-0.29 -0.28 0.06 0.06 0.21 -0.24 -0.13 -0.13 0.43 0.06 0.22 -0.17
-0.24 -0.29 0.12 -0.02 -2.58 0.35 0.05 -0.59 1.11 -0.51 0.52 -0.3
-0.1 0.4 -0.04 0.06 -0.91 0.37 -0.5 0.08 0.45 0.12 -0.23 -0.26
-0.56 -0.46 -0.3 -0.07 0.34 0.27 0.07 -0.03 0.29 0.1 0.15 -0.09
-0.4 -0.57 0.07 -0.25 0.06 -0.06 0.09 -0.11 0.38 0.19 0.34 -0.03
0.36 -0.0 0.14 -0.09 0.45 0.03 -0.08 -0.56 -0.13 -0.21 0.04 -0.23
-0.23 -0.02 -0.14 0.06 -0.06 0.07 0.1 -0.08 0.1 0.11 0.11 -0.08
-0.41 0.34 -0.78 0.29 -0.71 -0.02 0.12 0.22 0.53 0.37 -0.34 -0.32
-0.31 -0.21 0.02 0.1 0.42 0.14 -0.11 -0.31 0.13 0.04 0.05 -0.11
0.75 1.06 0.05 -0.93 1.29 0.25 -2.45 -2.09 -1.95 0.11 -2.24 0.09
-1.07 -0.91 0.17 0.05 -0.14 -0.18 -0.08 0.18 0.51 0.4 0.11 0.19
-0.21 0.29 -0.47 -0.21 -0.14 0.12 -0.05 0.0 0.45 0.21 0.02 -0.29
0.11 0.02 -0.56 -0.48 0.4 0.14 -0.35 -0.52 0.26 0.15 0.48 -0.14
0.3 0.22 -0.59 -0.57 1.09 0.75 -0.85 -1.52 0.04 -1.35 0.6 -0.7
-0.55 -0.21 0.14 -0.02 0.23 -0.06 -0.06 -0.02 0.36 0.11 0.07 -0.2
-0.52 -0.32 0.1 -0.08 0.15 -0.09 0.09 -0.07 0.19 0.25 0.13 0.01
-0.54 -0.25 0.04 -0.18 -0.09 0.14 0.1 0.04 0.34 0.1 0.15 -0.04
-0.15 -0.22 -0.1 0.06 0.12 0.12 0.05 0.01 0.06 0.03 0.01 -0.04
-0.13 -0.24 -0.0 0.01 0.11 0.16 0.0 -0.05 0.09 -0.03 0.1 -0.05
-0.67 -0.54 -0.07 -0.14 -0.19 -0.14 0.23 0.4 0.33 0.02 0.19 0.19
0.24 -0.37 0.03 -0.07 0.59 -0.5 0.06 -0.68 0.26 -0.19 0.24 -0.11
-0.21 -0.07 0.01 0.09 0.12 0.19 0.14 0.01 -0.14 0.03 -0.08 -0.15
-0.42 -0.36 0.1 -0.03 -0.14 -0.07 0.1 0.16 0.27 0.15 -0.04 0.12
-0.25 -0.43 0.12 -0.14 -0.04 0.14 -0.05 0.02 0.33 0.15 0.04 -0.05
-0.38 -0.2 -0.25 -0.02 0.18 -0.05 0.26 0.18 0.16 -0.08 -0.05 0.11
-0.07 -0.23 -0.01 -0.06 0.06 0.13 0.05 0.01 0.13 0.01 -0.01 -0.04
-0.15 -0.13 -0.13 0.04 0.15 0.01 -0.01 0.09 0.07 -0.0 -0.01 0.02
-0.3 -0.2 -0.11 0.16 0.06 0.17 0.28 -0.06 0.08 0.07 0.01 -0.3
-1.0 -0.64 -0.64 -0.09 0.64 -0.15 -0.21 0.17 0.53 0.05 0.4 0.03
-0.18 -0.18 -0.07 0.02 0.25 0.06 0.21 -0.12 0.19 -0.04 0.07 -0.31
-0.28 -0.11 -0.02 0.01 0.19 0.0 -0.0 -0.01 0.13 -0.02 0.1 -0.04
-0.36 -0.23 -0.36 0.05 0.25 0.16 0.16 -0.0 0.41 0.09 0.12 -0.62
-0.31 -0.41 0.04 0.09 0.2 0.13 -0.06 -0.02 0.26 0.1 0.0 -0.18
-0.57 -0.26 0.02 0.09 0.21 0.03 0.09 -0.02 0.23 0.12 0.06 -0.16
-0.21 -0.46 -0.13 -0.03 -0.06 0.09 0.11 0.08 0.2 0.2 0.18 -0.11
-0.36 -0.32 0.04 -0.12 -0.02 0.05 0.05 -0.02 0.38 0.02 0.18 -0.03
-0.27 -0.17 0.09 0.07 0.15 0.02 -0.14 0.0 0.13 0.04 0.06 -0.06
-0.26 -0.25 -0.2 -0.21 -0.09 0.17 0.18 -0.04 0.25 0.13 0.25 -0.09
-0.29 -0.38 -0.07 -0.12 -0.21 0.03 0.14 0.07 0.29 0.17 0.11 0.12
0.14 0.0 -0.05 -0.16 0.36 0.08 0.0 -0.29 -0.06 -0.02 0.03 -0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.