Heatmap: Cluster_6 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.4 0.02 0.27 -0.02 0.18 -0.0 0.16 0.02 -0.08 -0.01 0.01 -0.27
-0.1 0.02 0.45 0.25 -0.16 0.08 -0.29 -0.16 0.03 -0.05 -0.0 -0.25
0.02 -0.14 -0.06 -0.17 0.17 0.3 -0.2 -0.02 0.02 0.03 0.05 -0.07
-0.47 0.12 0.51 0.16 -0.2 -0.0 0.05 0.02 0.1 -0.16 -0.15 -0.2
-0.56 -0.01 0.25 0.1 -0.39 0.26 0.26 -0.08 0.27 -0.33 0.22 -0.32
-0.36 0.09 0.39 0.33 0.06 0.25 -0.17 -0.35 -0.1 -0.03 -0.02 -0.35
0.2 -0.09 0.03 -0.1 0.07 0.11 -0.16 -0.02 0.01 -0.05 0.02 -0.06
-0.1 -0.12 -0.08 -0.03 -0.01 -0.06 -0.02 0.13 0.08 0.16 0.07 -0.06
-0.11 0.04 0.95 -0.47 -0.31 -0.1 0.14 -0.41 -0.48 0.09 -0.02 0.04
-0.39 0.04 0.75 -0.1 -0.76 0.35 0.28 0.02 -0.38 -0.44 0.3 -0.39
0.09 0.06 0.75 -0.53 0.4 0.03 0.12 -0.51 -0.61 -0.28 0.01 -0.15
0.1 -0.08 0.46 -1.05 0.52 0.25 -0.0 -0.32 -0.3 0.33 -0.48 -0.12
-0.18 -0.31 1.12 -0.59 -0.17 0.53 0.04 -0.44 -0.49 0.15 -0.68 -0.13
0.09 0.32 0.71 -0.33 -0.03 0.18 0.22 -0.52 -0.49 -0.04 -0.24 -0.42
-0.22 -0.15 0.55 -0.65 0.5 0.45 -0.01 -0.44 -0.79 0.06 0.01 0.0
-1.2 -1.02 1.5 -0.94 0.29 0.59 -0.3 -0.63 0.17 -0.32 -0.51 -0.14
-0.41 -0.29 1.17 -0.64 0.17 0.27 0.25 -0.46 -0.77 0.12 -0.23 -0.37
0.04 -0.03 0.8 -0.17 -0.55 0.04 0.03 -0.59 0.02 0.06 -0.11 -0.02
-0.92 -0.22 1.65 -0.8 -0.67 -0.36 0.02 -1.33 -0.37 -0.46 0.41 0.33
-0.54 -0.01 0.75 -0.34 -0.02 0.7 0.32 -0.32 -0.92 0.17 -0.45 -0.32
-0.97 -0.22 1.32 -0.57 -0.96 0.19 0.12 -0.19 -1.19 -0.08 0.36 0.23
-0.09 -0.17 0.91 -1.99 -0.5 0.04 0.21 -0.2 -0.24 0.3 0.14 0.13
-0.27 -0.24 0.52 -0.65 0.21 0.46 0.8 -0.79 -0.3 -0.62 -0.09 0.0
-0.15 0.19 0.85 -0.31 -0.73 0.06 0.27 -0.39 -0.53 0.3 -0.27 -0.01
-0.22 -0.13 0.36 -0.06 -0.73 0.61 0.7 -0.28 -0.46 0.08 -0.12 -0.51
-0.38 -0.16 0.95 -0.62 -0.31 0.47 0.31 -0.42 -1.17 -0.09 0.27 -0.02
0.21 0.04 0.94 -0.24 -0.56 -0.11 0.39 -1.05 -0.45 -0.27 0.36 -0.31
-0.51 0.02 1.17 -0.52 -0.09 -0.1 0.43 -0.52 -0.29 -0.11 -0.11 -0.4
-0.35 0.14 0.7 0.03 -0.57 0.44 0.64 -0.53 -1.2 0.18 -0.61 -0.06
-0.09 0.01 1.2 -0.46 -0.28 0.25 -0.11 -0.74 -0.43 0.17 -0.13 -0.51
-0.41 0.24 1.11 -0.49 0.02 -0.08 -0.05 -0.95 -0.44 0.09 0.07 -0.14
-0.02 -0.1 0.45 0.02 0.05 0.03 -0.1 -0.12 -0.09 -0.18 -0.01 -0.04
-0.47 -0.12 1.21 -0.64 -0.05 0.34 0.34 -0.72 -0.57 0.02 -0.24 -0.38
-0.32 0.14 0.64 -0.26 -0.1 0.2 0.13 -0.68 -0.5 0.25 -0.03 0.04
-0.43 0.33 1.21 -0.35 -0.78 -0.22 0.49 0.17 -1.38 -0.26 -0.32 -0.14
-0.45 -0.16 0.87 -0.27 0.29 0.51 -0.36 -0.38 -0.58 -0.14 0.26 -0.44
-0.11 -0.08 -0.03 0.01 0.08 -0.07 0.02 0.09 -0.02 0.06 0.05 -0.0
-0.05 -0.12 0.02 0.04 0.17 0.05 0.12 0.0 0.05 -0.07 -0.0 -0.26
0.05 -0.11 0.1 -0.13 0.1 -0.02 -0.08 0.06 -0.01 0.08 -0.01 -0.06
-0.15 -0.17 0.14 0.06 0.07 0.0 0.17 -0.07 0.05 0.15 -0.12 -0.2
0.05 -0.02 0.11 -0.01 -0.0 0.04 -0.03 -0.04 -0.06 0.01 0.06 -0.1
-0.18 -0.21 0.01 -0.17 0.13 0.04 -0.06 0.23 0.09 0.27 -0.2 -0.06
-0.21 0.34 0.33 0.08 -0.02 -0.33 -0.16 0.08 0.12 0.08 -0.19 -0.31
-0.05 -0.07 0.15 -0.1 -0.0 0.05 -0.13 0.07 0.09 -0.09 0.07 -0.01
-0.04 0.01 -0.03 -0.06 -0.01 -0.06 -0.04 0.09 0.1 0.1 0.02 -0.11
0.09 -0.21 0.27 0.03 0.05 -0.17 -0.07 0.12 -0.05 -0.13 -0.02 0.02
-0.2 0.12 0.23 -0.06 0.03 0.02 -0.03 -0.03 0.0 -0.03 0.04 -0.14
-0.09 -0.0 -0.02 0.13 0.05 0.02 -0.0 0.11 0.02 0.04 -0.11 -0.18
-0.29 -0.14 0.2 0.11 0.11 -0.27 -0.0 -0.08 0.13 0.11 0.1 -0.06
-0.02 -0.05 0.05 0.06 0.02 -0.02 -0.03 0.06 0.03 -0.03 -0.03 -0.06
-0.4 -0.14 1.23 -0.45 0.09 0.07 0.35 -0.59 -0.7 0.09 -0.39 -0.38
-0.28 -0.24 1.1 -0.53 -0.08 0.1 0.01 -0.19 -0.33 0.01 -0.08 -0.26
-0.39 0.04 1.05 -0.27 -0.13 0.51 0.12 -0.77 -0.83 0.17 -0.53 -0.1
-0.28 -0.44 1.2 -0.7 -0.72 0.5 0.21 -0.14 -0.6 -0.02 -0.45 0.08
-0.21 -0.19 -0.17 -0.01 0.15 -0.01 -0.05 0.19 0.07 0.14 0.07 -0.06
-0.36 -0.35 0.57 -0.02 0.29 0.1 -0.21 -0.16 -0.06 -0.17 -0.23 0.27
-0.2 0.2 0.17 0.02 0.05 0.05 0.09 -0.02 -0.04 -0.1 -0.08 -0.2
-0.17 0.15 0.23 0.23 0.2 -0.07 0.04 -0.16 -0.07 0.03 -0.09 -0.49
0.28 -0.07 0.01 -0.14 0.12 -0.19 -0.03 -0.04 0.09 -0.02 -0.04 -0.05
0.05 0.08 0.39 0.07 0.04 0.06 -0.04 -0.09 0.14 -0.25 -0.25 -0.36
0.13 -0.03 0.98 -0.22 0.08 0.27 -0.08 -0.54 0.1 -0.56 -0.34 -0.63
-0.57 -0.08 0.13 0.16 -0.0 -0.04 -0.2 0.13 0.22 0.26 0.06 -0.25
0.5 -0.44 0.73 0.03 -1.86 -0.18 -0.61 -2.85 0.22 -0.13 0.64 0.65
0.32 -0.08 0.45 -0.16 -0.6 -0.3 0.32 0.0 0.19 0.31 -0.04 -1.06
-0.64 -0.22 0.58 0.32 0.36 0.11 0.25 -0.73 0.55 -0.27 -0.28 -1.02
-0.68 -0.48 1.13 0.62 -0.56 -1.07 0.22 -0.06 -0.62 -0.34 0.08 0.21
0.2 -0.39 0.03 -0.01 0.05 -0.28 -0.25 0.01 0.22 -0.06 0.23 0.1
-0.09 -0.15 0.17 -0.15 0.05 0.27 -0.22 0.05 0.09 -0.03 0.06 -0.13
-0.52 -0.75 1.06 0.21 -1.42 0.17 0.14 -0.06 0.73 -0.39 -0.2 -0.7
0.13 -0.01 0.15 -0.12 0.04 -0.2 -0.21 -0.04 0.04 0.08 0.06 0.02
-0.77 0.02 0.37 0.16 0.22 -0.03 0.16 0.02 0.24 -0.19 -0.18 -0.37
-1.88 -0.4 1.45 0.27 1.07 -0.78 -0.13 0.13 -1.25 -0.81 -1.37 -0.04
-0.5 -0.21 0.26 0.07 0.02 0.07 0.33 -0.26 0.21 0.11 -0.03 -0.28
-0.06 -1.73 1.41 -1.07 -1.33 -0.58 -0.38 0.21 1.05 -2.17 -0.05 0.44
0.23 -0.0 0.12 -0.13 -0.06 -0.12 -0.12 0.01 0.02 0.02 0.03 -0.03
-1.06 -0.16 0.53 0.09 0.01 0.31 0.14 -0.12 0.23 -0.16 -0.14 -0.21
-0.54 -0.44 0.37 -0.07 -0.23 0.31 0.59 -1.05 0.56 0.22 -0.46 -0.18
-1.26 1.22 0.75 -0.75 0.91 - 0.84 1.08 - -0.42 -2.26 -2.02
-0.03 0.12 0.29 0.09 0.16 -0.1 -0.01 -0.15 -0.03 -0.11 -0.1 -0.21
-0.09 -0.13 0.06 0.01 0.06 0.09 -0.1 0.1 0.02 -0.04 -0.04 0.04
-0.1 0.33 0.31 0.05 -0.04 -0.37 -0.26 -0.01 -0.01 0.12 0.03 -0.23
-0.31 -0.1 0.35 0.18 -0.06 -0.04 -0.0 -0.19 0.02 0.14 0.0 -0.11
0.07 -0.02 0.18 0.11 0.04 -0.14 -0.0 -0.09 -0.13 0.06 0.0 -0.12
-0.31 -0.01 0.15 0.13 0.08 0.04 -0.05 0.02 0.01 -0.01 0.01 -0.12
-0.08 -0.19 0.16 0.06 0.06 -0.43 -0.07 0.11 0.15 -0.06 0.14 0.04
-0.02 0.06 0.21 0.05 -0.05 -0.18 -0.1 0.07 0.04 0.05 -0.03 -0.15
0.08 0.14 0.1 0.14 0.01 -0.04 -0.04 -0.23 -0.16 0.06 0.02 -0.13
-0.17 -0.14 -0.05 0.11 0.21 0.0 -0.17 0.14 0.12 -0.07 -0.02 -0.04
-0.35 -0.09 0.26 0.12 0.17 0.02 -0.19 -0.03 0.06 -0.04 0.01 -0.04
-0.43 0.29 0.2 0.16 -0.01 -0.64 0.33 0.11 0.06 -0.11 -0.14 -0.12
-0.1 -0.14 -0.02 0.04 0.06 0.01 0.04 0.05 0.07 0.03 0.04 -0.09
0.14 0.18 0.45 0.13 0.15 -0.28 -0.13 -0.41 -0.26 0.02 0.11 -0.38
-0.12 -0.3 0.41 -0.06 0.07 0.06 -0.07 -0.16 0.04 0.03 -0.06 0.04
0.19 -0.5 0.32 -0.31 0.07 -0.13 -0.26 -0.2 0.25 0.17 -0.0 0.16
-0.17 -0.12 0.14 0.04 0.08 0.07 0.13 -0.01 0.07 -0.03 -0.06 -0.19
-0.07 0.03 0.21 0.08 0.18 -0.27 0.15 -0.11 0.04 0.04 -0.13 -0.25
-0.12 -0.03 0.18 -0.01 -0.06 -0.08 0.05 0.01 0.01 0.03 0.03 -0.04
-0.94 -0.01 -0.28 0.18 -0.32 -0.1 0.86 -0.57 0.38 0.01 0.32 -0.43
-0.07 -0.17 0.2 -0.02 0.03 -0.08 0.0 -0.03 0.04 0.0 0.1 -0.04
- -2.32 1.19 0.44 - 0.68 0.77 -2.31 -0.77 -0.32 -0.01 1.18
-0.27 -0.04 0.13 0.06 0.08 0.0 0.08 0.0 0.08 -0.06 0.03 -0.14
-0.36 0.17 0.21 0.3 0.11 -0.01 0.06 -0.08 -0.01 -0.03 -0.13 -0.37
-0.27 -0.26 0.58 -0.2 0.25 0.11 -0.04 0.06 -0.43 -0.13 0.03 0.01
0.08 -0.19 0.67 1.0 -2.37 -1.14 -0.38 -0.35 0.4 -1.37 -0.18 0.75
0.23 -0.08 0.06 -0.19 -0.02 -0.16 -0.17 -0.15 0.25 -0.01 0.06 0.08
0.12 -0.1 -0.01 -0.0 -0.01 0.09 -0.04 -0.01 -0.09 -0.0 0.08 -0.05
0.24 -0.01 0.14 -0.25 -0.1 -0.05 -0.21 -0.23 0.23 -0.05 0.1 0.07
-0.29 -0.56 0.51 -0.08 -0.0 -0.04 -0.26 0.1 0.03 -0.12 0.26 0.16
-0.66 0.04 0.1 -0.05 0.09 -0.28 -0.04 0.11 0.22 0.24 0.19 -0.18
-0.29 -0.14 0.24 0.0 0.06 -0.06 -0.29 0.22 0.17 0.1 -0.08 -0.05
-0.07 -0.15 0.65 -0.13 -0.26 0.18 -0.21 -0.1 -0.03 0.01 0.06 -0.19
-0.06 -0.04 0.54 -0.05 -0.29 -0.31 0.21 -0.3 -0.03 0.07 0.07 -0.03
0.1 -0.05 0.06 -0.05 -0.34 -0.01 0.04 -0.04 0.05 -0.15 0.17 0.14
-0.81 0.14 1.77 0.38 -1.43 - 0.91 0.22 - -0.62 -0.82 -0.03
-0.01 0.24 0.34 -0.28 -0.07 -0.17 -0.12 -0.17 -0.2 0.13 -0.03 0.19
-0.15 -0.04 0.33 0.05 -0.25 0.0 0.13 -0.04 -0.07 -0.06 -0.06 0.07
-0.27 -0.55 0.38 -0.09 -0.52 -0.27 0.57 0.05 0.19 0.12 0.01 -0.06
0.05 0.07 0.11 0.05 0.15 -0.24 0.01 0.05 -0.14 0.03 -0.04 -0.15
-0.2 -0.09 -0.02 0.02 0.13 -0.05 -0.03 0.21 0.15 0.1 -0.18 -0.11
0.31 -0.05 0.19 -0.21 -0.09 -0.09 -0.24 -0.04 -0.02 0.04 0.07 0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.