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Heatmap: Cluster_29 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.23 -0.03 0.14 -0.12 -0.01 0.05 -0.07 0.06 -0.05 -0.12 -0.04 -0.09
0.18 0.03 0.04 -0.02 -0.12 0.5 -0.03 -0.35 -0.2 -0.15 0.09 -0.18
-0.11 -0.15 -0.03 0.07 -0.26 0.43 0.29 -0.13 0.16 0.13 -0.26 -0.36
-0.32 -0.5 -0.13 -0.09 -0.3 0.52 -0.02 0.18 0.08 0.35 0.09 -0.17
0.03 -0.06 0.15 0.09 -0.06 0.17 0.14 -0.22 -0.02 -0.03 0.02 -0.28
0.24 -0.08 0.14 -0.17 0.12 0.1 -0.09 0.07 0.13 -0.11 -0.2 -0.25
0.16 0.08 -0.05 0.35 -0.61 0.34 -0.31 0.53 -0.02 -0.47 -0.51 0.0
0.95 -0.47 0.03 -0.46 0.31 0.34 -0.72 -0.03 0.2 -0.51 0.07 -0.71
-0.08 0.24 0.36 -0.09 -0.03 0.07 0.17 -0.31 -0.29 0.07 -0.09 -0.18
0.13 -0.12 0.03 -0.04 -0.1 0.1 0.05 0.06 0.01 -0.0 -0.0 -0.15
0.06 -0.03 0.24 -0.02 -0.09 0.15 -0.11 -0.09 -0.0 0.0 -0.01 -0.14
0.18 -0.1 -0.21 -0.02 -0.08 0.17 -0.01 0.05 0.14 0.02 -0.07 -0.14
-0.08 -0.24 -0.09 -0.06 0.08 0.13 0.01 0.17 0.16 -0.03 -0.02 -0.09
0.29 -0.16 0.01 0.04 -0.07 0.1 0.04 -0.05 -0.03 -0.02 -0.03 -0.18
0.15 -0.16 -0.15 -0.06 -0.02 0.12 -0.09 0.1 0.09 0.01 -0.05 0.02
0.12 -0.34 0.16 0.06 0.06 0.23 -0.14 -0.15 0.07 -0.08 0.01 -0.1
0.15 -0.64 -0.11 -0.39 0.01 0.23 0.06 0.29 0.26 -0.06 -0.03 -0.04
0.13 -0.19 -0.05 -0.08 -0.08 0.17 0.17 0.04 0.0 -0.08 0.02 -0.09
-0.1 -0.51 0.02 -0.31 -0.73 0.69 0.41 0.4 0.24 -0.03 -0.47 -0.32
0.05 -0.04 0.14 0.05 -0.15 0.21 -0.15 -0.18 -0.01 0.07 0.05 -0.1
0.97 0.42 0.72 0.14 -1.14 0.28 -0.4 -0.72 0.17 -1.89 -0.33 -0.45
0.84 -0.25 -0.32 -0.12 -1.03 0.13 -0.09 -0.27 0.03 0.04 0.34 -0.03
0.25 -0.35 -0.21 0.17 -0.07 0.74 0.08 -0.29 -0.09 -0.09 -0.02 -0.54
0.27 0.01 -0.24 -0.24 -0.26 0.26 0.08 0.12 0.21 -0.23 -0.03 -0.12
0.53 -2.88 -0.21 -0.16 -0.6 0.69 -1.11 -0.1 0.47 0.31 0.58 -0.18
-0.18 0.38 - - 0.82 1.78 -1.03 1.35 0.12 -1.02 - -
- - 1.81 - - 0.19 1.34 -0.04 0.78 0.02 -0.75 -0.94
0.16 -0.93 -0.87 0.56 0.34 0.91 0.01 0.79 0.16 - 0.42 -
-0.24 -0.32 -0.23 -0.07 0.12 0.38 0.08 0.08 0.3 -0.09 -0.11 -0.07
-0.13 -0.44 0.15 -0.16 0.16 0.4 -0.12 0.14 0.23 -0.38 0.0 -0.07
0.0 -0.21 0.02 -0.14 -0.1 -0.01 0.12 0.05 0.17 0.01 0.09 -0.04
-0.03 -0.72 -0.22 -0.03 -0.26 0.55 0.62 0.24 -0.16 -0.22 0.14 -0.51
0.06 -0.33 0.19 0.1 0.15 0.18 0.0 -0.04 0.16 -0.02 -0.3 -0.3
0.33 0.43 0.7 -1.18 0.18 1.36 0.42 -1.61 0.16 -2.22 -0.66 -
-0.28 -0.19 0.44 -0.16 0.09 -0.36 0.42 0.12 -0.52 0.13 0.02 -0.03
0.06 -0.09 0.61 -0.42 0.38 0.42 -0.8 -0.58 0.13 -0.2 -0.39 0.17
0.94 -0.0 0.44 -0.03 -0.67 0.11 -0.26 -0.02 0.07 -0.56 -0.02 -0.99
-0.07 -0.47 0.21 -0.42 -0.03 0.1 0.26 0.4 0.25 -0.34 -0.12 -0.07
0.2 -1.94 -1.2 -0.53 -0.31 0.36 -0.43 0.62 0.29 0.73 -0.17 0.4
0.7 0.29 0.79 0.09 -1.09 0.43 -0.8 -0.59 -0.79 0.38 -0.32 -0.65
-0.21 -0.14 -0.19 -0.36 0.45 -0.17 0.05 0.2 0.38 0.03 0.02 -0.35
1.09 - 1.35 - - 0.99 0.41 - 0.66 -0.29 0.7 -
0.01 -0.12 -0.58 -0.03 0.3 -1.64 0.35 -0.28 0.62 -0.0 0.19 0.14
0.03 -0.26 0.05 -0.11 -0.38 0.36 0.0 0.06 0.15 0.15 0.05 -0.27
-0.71 -0.03 0.86 -0.12 0.03 0.6 -0.54 0.07 0.34 -0.35 -0.59 -0.55
-2.38 -1.53 -2.29 0.46 0.53 1.44 0.37 0.22 -0.57 -0.22 -0.31 -0.1
0.2 -0.19 0.21 -0.01 0.0 0.16 -0.0 -0.13 0.13 -0.08 -0.13 -0.25
0.49 -0.46 0.08 -0.13 -0.03 -0.19 -0.49 -0.76 0.27 0.23 0.13 0.33
0.13 0.06 0.27 -0.17 0.03 0.27 -0.33 -0.12 -0.22 -0.13 0.23 -0.18
0.6 -0.52 -2.14 -0.13 0.54 -0.02 0.04 0.43 0.18 -0.35 -0.22 0.08
0.47 -0.02 0.02 -0.14 -0.12 0.25 -0.49 -0.52 -0.07 0.09 0.12 0.11
-0.07 -0.12 0.11 -0.15 0.02 0.23 0.06 0.09 0.06 0.01 -0.15 -0.15
0.16 0.1 0.21 0.08 -0.51 0.21 -0.03 -0.29 0.08 -0.0 0.02 -0.2
0.18 -0.41 0.07 -0.03 -0.21 0.18 -0.03 0.1 0.13 0.13 -0.03 -0.19
0.15 0.05 -0.05 -0.01 0.19 0.63 0.25 -0.15 -0.08 -0.24 -0.82 -0.4
0.01 -0.27 -0.26 -0.26 0.11 0.27 0.04 0.22 0.15 0.07 -0.12 -0.09
-1.65 -1.72 0.49 -1.68 -3.23 1.01 0.99 -0.37 1.15 -0.15 -0.35 -0.22
0.05 0.21 0.06 0.17 -0.54 0.08 0.08 -0.14 -0.01 0.11 0.06 -0.29
-0.02 -0.82 0.35 -0.42 0.09 1.37 -0.09 0.19 -0.46 -0.76 -0.6 -0.47
0.3 0.14 0.06 0.1 -0.32 0.02 0.01 -0.19 -0.06 0.05 -0.04 -0.16
-0.24 -0.26 -0.3 -0.08 0.29 0.38 0.14 0.22 0.08 0.06 -0.13 -0.4
-0.28 -0.62 -0.64 -0.17 0.18 0.43 0.3 0.32 0.23 -0.09 -0.05 -0.07
-0.32 -0.35 0.28 -0.18 -0.15 0.31 0.07 0.04 0.26 0.41 -0.08 -0.69
0.56 -0.43 -0.7 -0.26 -0.78 -0.0 0.18 0.48 0.16 0.43 -0.13 -0.26
0.17 -0.53 0.1 0.13 -0.79 0.72 -0.39 -0.43 0.41 0.13 0.04 -0.26
0.3 0.18 0.06 0.06 -0.5 0.04 0.2 -0.09 -0.0 -0.11 -0.03 -0.3
0.26 0.1 0.12 -0.08 -0.23 0.08 0.05 -0.21 -0.11 0.07 -0.04 -0.1
0.35 -1.25 0.09 -0.43 -0.29 -0.04 -0.0 0.41 0.89 -0.14 -0.12 -0.55
0.32 -0.21 -0.16 -0.06 -0.09 0.33 -0.0 0.07 0.16 -0.1 -0.28 -0.12
-1.57 -1.15 1.53 -0.97 -0.56 1.04 1.06 -0.44 -0.41 -0.48 -0.77 -2.31
-0.07 -0.36 -0.24 -0.11 0.15 0.12 0.05 0.17 0.14 0.02 0.1 -0.08
-0.01 0.05 0.37 -0.13 0.09 -0.07 0.12 -0.03 0.02 -0.12 -0.04 -0.36
-0.14 -0.25 -0.18 -0.01 -0.15 0.14 0.17 -0.13 0.39 0.21 -0.03 -0.18
0.25 -0.18 0.11 0.08 0.06 0.58 0.03 -0.47 0.07 -0.3 -0.1 -0.45
-0.16 0.06 0.37 -0.01 -0.13 0.02 0.05 -0.17 -0.08 0.08 -0.06 -0.07
-0.11 0.1 0.4 -0.06 -0.18 -0.11 0.27 -0.31 -0.21 0.13 -0.09 0.03
0.2 -0.26 0.01 0.02 0.07 0.31 0.0 -0.23 -0.08 -0.01 0.03 -0.17
0.26 0.05 0.17 0.05 -0.04 0.05 -0.08 -0.19 -0.12 -0.19 0.01 -0.07
0.1 -0.35 0.25 -0.22 -0.84 0.36 -0.32 0.25 0.16 -0.11 0.29 -0.01
0.33 -0.12 0.58 -0.16 -0.04 0.3 -0.5 -0.38 -0.49 -0.04 0.02 0.08
0.13 -0.31 0.06 0.09 -0.34 -0.04 -0.19 -0.14 0.07 0.07 0.65 -0.37
-0.07 -0.37 0.12 -0.02 0.11 0.35 -0.03 0.21 -0.01 -0.17 -0.17 -0.09
0.2 -0.34 0.37 0.01 0.04 0.42 -0.46 -0.48 0.15 -0.19 0.1 -0.16
-0.89 -0.46 0.01 -0.38 -0.37 0.51 -0.11 0.21 0.58 0.22 0.22 -0.22
0.19 -0.36 -0.18 0.03 -0.6 0.21 0.23 0.08 0.21 0.14 0.02 -0.21
0.37 -0.01 0.13 0.36 -0.65 0.06 -0.39 0.3 -0.32 0.18 -0.52 0.03
-2.36 -1.62 -0.28 -0.63 0.09 1.09 0.57 1.58 -0.97 -0.75 -1.28 -0.26
0.13 -0.08 -0.02 -0.05 -0.04 0.11 0.05 0.03 -0.01 -0.03 0.05 -0.18
-0.29 -0.08 0.52 0.33 0.03 0.71 -0.11 0.27 -0.24 -1.19 -0.11 -0.89
1.14 -2.8 -0.74 -0.3 -0.09 -0.63 1.07 0.41 0.31 - 0.29 -0.4
-0.74 -0.27 0.28 -0.09 -0.3 0.47 0.25 0.29 0.04 0.49 -0.36 -0.73
-0.04 -0.15 0.02 -0.08 0.0 0.15 0.01 -0.03 0.11 -0.03 0.07 -0.06
0.22 -0.52 -0.51 -0.23 0.09 -0.06 -0.07 0.45 0.23 -0.06 0.21 -0.09
- - - - 2.06 2.04 -0.39 1.19 -0.59 - - -
0.5 0.1 0.26 0.26 -1.22 0.08 -0.02 -0.07 -0.03 0.13 -0.52 -0.11
-0.31 0.19 0.35 0.24 -0.08 0.1 0.06 -0.17 0.02 -0.06 -0.13 -0.41
0.09 -0.19 0.21 0.12 0.2 0.17 0.01 -0.18 0.02 -0.12 -0.14 -0.29
0.06 -0.04 0.03 -0.06 0.15 0.01 0.12 0.06 0.11 -0.14 -0.23 -0.11
-0.18 -0.36 0.23 0.04 -0.36 1.4 -0.18 -0.19 0.22 -1.08 -0.72 -0.47
0.26 0.1 0.01 -0.08 -0.19 0.07 -0.06 -0.27 0.04 0.01 0.08 -0.05
-0.06 -0.07 0.01 0.27 -0.01 0.41 0.13 -0.57 -0.09 0.2 -0.09 -0.39
-0.54 0.16 0.79 0.22 -0.57 0.16 0.26 -0.18 -0.21 0.05 -0.39 -0.38
0.23 -0.21 0.68 0.3 -0.09 0.32 -0.97 -0.12 -0.52 -0.63 0.37 -0.18
-1.02 -0.75 -0.48 -0.23 -1.78 0.64 0.62 0.97 0.12 0.08 0.16 -0.43
-0.15 0.04 1.35 -0.09 0.31 - -0.26 -0.92 0.59 0.33 -1.71 -0.14
0.08 0.13 -0.0 -0.06 -0.06 -0.08 0.07 -0.17 -0.03 0.13 0.03 -0.05
-0.27 -0.44 -0.37 -0.3 0.4 0.49 0.3 0.18 0.14 -0.13 -0.13 -0.25
0.1 -0.14 0.2 0.11 0.02 0.16 -0.31 -0.25 -0.0 0.02 0.23 -0.27
0.29 -0.01 -0.0 -0.04 0.02 0.12 -0.17 -0.12 -0.17 -0.05 0.09 -0.04
-0.18 -0.18 -0.21 0.01 0.12 0.33 0.15 0.09 0.09 -0.09 -0.16 -0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.