Heatmap: Cluster_182 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.32 0.15 0.14 -0.07 -0.23 -0.37 -0.69 -0.09 -0.13 0.23 0.31 0.1
0.29 -0.03 -0.13 -0.22 -0.33 -0.08 -0.34 -0.14 0.08 0.23 0.33 0.14
0.02 0.02 -0.18 -0.07 -0.1 -0.18 -0.11 0.15 0.05 0.13 0.13 0.08
0.33 0.2 -0.12 -0.01 -0.08 -0.07 -0.18 -0.07 -0.21 0.01 -0.03 0.13
0.19 0.09 -0.08 0.02 -0.06 0.16 0.06 -0.12 -0.12 0.02 0.01 -0.23
0.02 -0.19 -0.08 -0.27 -0.31 -0.41 -0.13 0.09 0.15 0.4 0.2 0.29
0.27 0.13 0.05 0.02 -0.32 -0.04 -0.31 -0.09 -0.14 0.15 0.06 0.1
0.19 0.08 -0.13 -0.0 -0.16 -0.18 -0.09 0.06 0.0 0.12 0.05 0.0
0.32 0.03 -0.03 -0.13 -0.23 -0.15 -0.34 -0.11 0.08 0.18 0.14 0.09
-0.42 -0.62 -1.03 -0.2 -0.46 -0.67 0.48 0.73 0.19 0.53 0.25 0.08
0.24 0.14 -0.04 -0.04 -0.31 0.04 -0.19 -0.2 -0.01 0.17 0.07 0.03
0.16 0.09 0.04 -0.08 -0.37 -0.29 -0.16 -0.17 0.03 0.27 0.18 0.15
0.23 0.22 0.13 -0.01 -0.04 -0.6 -0.27 -0.15 -0.16 0.33 0.04 0.04
0.49 0.47 -0.89 -0.06 -0.58 -1.35 -0.01 -0.12 -0.03 0.46 0.49 -0.06
0.17 0.02 0.01 0.01 -0.16 -0.18 -0.29 -0.11 0.01 0.28 0.03 0.12
0.02 -0.03 0.09 -0.08 -0.07 -0.2 -0.28 -0.03 -0.05 0.29 0.15 0.1
-0.23 -0.21 -0.16 0.07 0.06 -0.12 -0.07 0.14 0.03 0.04 0.19 0.17
0.23 0.12 -0.19 -0.02 -0.12 -0.03 -0.16 0.01 -0.06 0.08 0.06 0.01
0.08 -0.0 -0.19 -0.25 -0.3 -0.2 0.14 0.26 0.05 0.09 0.03 0.17
0.2 0.15 0.07 -0.04 -0.21 -0.13 -0.22 -0.16 -0.03 0.13 0.08 0.08
-0.41 -1.0 -2.16 -0.56 -0.55 -0.57 0.48 0.78 0.62 0.74 0.31 -0.1
0.37 0.13 -0.38 -0.08 -0.36 -0.56 -0.24 0.29 0.13 0.22 0.03 0.12
0.46 0.24 -0.17 -0.03 -0.39 0.06 -0.12 -0.32 -0.12 -0.01 0.13 0.05
0.33 0.27 -0.31 -0.17 -0.53 -0.06 -0.1 -0.07 -0.08 0.25 0.11 0.12
-0.07 0.12 -0.51 0.26 -0.44 -0.22 0.04 -0.28 0.05 0.36 0.46 -0.12
0.15 0.0 -0.0 -0.1 -0.1 -0.28 -0.1 0.02 -0.11 0.12 0.08 0.23
-0.36 0.07 -0.2 0.09 -0.23 0.05 0.17 -0.1 0.07 0.31 0.21 -0.24
-0.15 0.04 -0.7 0.29 -0.35 -0.01 0.07 0.12 0.26 0.06 0.32 -0.27
0.29 0.08 -0.21 -0.06 -0.31 0.04 -0.17 -0.3 -0.06 0.21 0.11 0.22
0.23 -0.02 -0.1 -0.17 -0.12 -0.35 -0.08 -0.02 -0.05 0.27 0.09 0.2
0.11 0.08 -0.11 0.01 -0.11 0.08 -0.02 -0.13 -0.01 0.07 -0.0 -0.01
0.23 0.16 -0.33 -0.18 -0.28 -0.13 -0.18 -0.19 0.11 0.24 0.16 0.22
0.18 0.01 -0.08 -0.24 -0.28 -0.21 0.01 0.03 0.09 0.19 -0.03 0.23
-0.15 0.11 -0.27 -0.14 -0.26 -0.52 -0.13 0.04 0.18 0.19 0.34 0.35
-0.83 -0.6 -0.39 0.05 -0.71 -0.87 0.38 0.45 0.32 0.44 0.66 -0.05
0.03 0.09 -0.07 -0.24 -0.18 -0.66 0.05 -0.52 0.03 0.19 0.46 0.41
1.7 -0.15 - -1.47 - -1.08 - -0.85 -1.37 1.81 -0.09 0.71
0.04 -0.02 -0.34 -0.2 -0.31 -0.11 -0.36 -0.03 0.16 0.23 0.25 0.44
-0.3 -0.06 -0.24 0.17 -0.5 0.03 -0.05 -0.14 0.31 0.27 0.34 -0.08
-0.27 -0.01 -0.64 0.17 -0.14 0.03 0.17 0.07 0.3 0.14 0.25 -0.33
0.34 0.14 -0.88 0.26 -0.71 -0.36 -0.62 -0.44 -0.57 0.59 0.55 0.56
0.3 0.22 -0.48 -1.24 -0.8 -2.24 -0.06 0.05 -0.37 0.63 0.67 0.82
0.09 0.16 -0.4 -0.09 -0.24 -0.4 -0.29 -0.01 0.01 0.23 0.24 0.44
0.05 0.17 -0.07 -0.01 -0.29 -0.1 -0.14 -0.08 -0.06 0.13 0.16 0.17
0.07 0.01 -0.47 -0.04 0.01 -0.09 0.01 0.14 0.08 0.09 0.11 -0.03
-0.29 -0.18 -0.22 -0.28 -0.52 -0.35 0.1 -0.31 -0.01 0.28 0.77 0.44
0.94 0.25 -0.68 0.73 -1.24 -1.05 -0.64 -1.51 -0.47 0.55 0.53 0.12
0.24 -0.01 -0.73 -0.04 -0.38 -0.83 -0.31 0.29 -0.0 0.43 0.26 0.43
-0.33 -0.19 -0.27 0.4 -0.34 0.33 0.06 -0.4 0.48 0.03 0.11 -0.27
0.07 0.07 0.07 0.09 -0.26 -0.09 -0.27 -0.36 -0.08 0.25 0.28 0.09
0.21 0.1 -0.08 -0.12 -0.11 -0.37 -0.06 -0.13 -0.05 0.2 0.13 0.17
-0.05 0.03 -0.56 -0.53 -0.83 -0.71 0.1 -0.35 0.22 0.56 0.43 0.71
0.15 -0.04 0.04 -0.13 -0.24 -0.33 -0.11 -0.14 0.0 0.37 0.17 0.11
-0.06 0.05 -0.17 -0.05 -0.08 -0.34 -0.32 0.1 0.07 0.15 0.13 0.39
0.28 0.22 -0.64 -0.29 -1.69 -0.88 -0.24 0.24 0.43 0.65 -0.01 0.45
-0.06 -0.05 -1.84 -0.14 -0.5 -0.97 0.03 0.74 0.28 0.43 0.53 -0.03
0.42 0.18 -0.28 -0.04 -0.84 -0.64 0.06 0.07 -0.02 0.34 0.44 -0.27
0.38 0.19 0.01 -0.15 -0.12 -0.2 -0.44 -0.33 -0.19 0.12 0.21 0.27
0.0 -0.27 -0.24 0.05 -0.14 -0.13 -0.26 0.23 0.11 0.11 0.21 0.18
-0.01 -0.06 -0.15 -0.11 -0.1 -0.13 0.09 0.16 0.05 0.12 0.02 0.05
0.02 -0.02 -0.22 -0.09 -0.18 -0.5 -0.03 0.1 0.19 0.25 0.14 0.19
0.07 -0.33 -0.45 -0.12 -0.39 -0.41 0.09 0.37 0.16 0.32 0.14 0.21
0.05 0.08 -0.15 -0.1 -0.21 -0.31 -0.15 -0.15 -0.05 0.33 0.22 0.28
-0.05 -0.01 -0.31 0.01 0.09 -0.37 -0.04 0.2 -0.06 0.21 0.08 0.12
0.45 0.32 -0.29 -0.25 -0.4 -0.14 -0.19 -0.09 -0.1 0.09 0.08 0.24
-0.07 -0.08 -0.16 0.06 0.08 -0.13 -0.04 0.1 0.05 0.03 0.08 0.05
0.1 -0.03 -0.24 -0.08 -0.25 -0.25 -0.15 0.22 0.12 0.17 0.12 0.15
0.26 0.27 -0.23 -0.08 -0.4 -0.15 -0.16 -0.13 -0.07 0.22 0.22 0.06
0.22 0.19 -0.03 -0.03 0.03 -0.14 -0.22 -0.06 -0.03 0.01 -0.1 0.11
0.11 0.08 -0.14 -0.06 -0.14 -0.04 -0.37 -0.23 0.04 0.29 0.09 0.23
-0.03 0.09 -0.0 0.05 -0.02 -0.11 -0.24 -0.16 0.01 0.14 0.17 0.07
-0.01 0.0 -0.29 -0.12 -0.19 -0.13 -0.22 0.06 0.15 0.24 0.09 0.3
0.97 0.32 0.44 -0.86 -1.72 -2.02 -0.49 -0.98 -0.22 0.9 -0.6 0.78

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.