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Heatmap: Cluster_217 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.31 -0.11 -0.18 0.03 0.26 0.02 0.17 0.22 0.15 0.04 -0.21 -0.22
-0.01 -0.23 -0.34 -0.17 0.09 0.03 -0.07 0.26 0.22 0.01 0.03 0.05
0.12 -0.17 -0.01 -0.07 0.09 0.04 -0.13 0.13 0.25 -0.09 -0.04 -0.19
-0.36 -0.3 -0.16 -0.09 0.15 0.01 -0.04 0.1 0.19 0.14 0.17 0.07
-0.21 -0.49 -0.22 -0.18 0.27 0.18 -0.09 0.16 0.18 0.17 0.09 -0.06
-0.39 -0.6 -0.21 -0.29 0.16 0.39 -0.08 0.3 0.27 0.04 0.05 0.02
-0.07 -0.06 -0.12 0.0 0.06 -0.02 -0.07 0.06 0.07 0.0 0.09 0.05
-0.12 -0.15 0.04 0.07 0.15 0.1 0.1 0.04 0.08 -0.06 -0.07 -0.23
-0.41 -0.43 -0.7 -0.26 0.1 0.05 0.29 0.3 0.33 0.2 0.33 -0.24
-0.41 -0.63 -0.42 -0.36 0.6 -0.09 0.17 0.33 0.2 0.1 0.06 -0.02
-0.32 -0.57 -0.25 -0.28 0.27 0.71 0.16 0.38 0.33 -0.51 -0.25 -0.34
-0.98 -0.74 -0.22 -0.06 0.3 0.21 0.39 0.47 0.47 -0.04 -0.33 -0.25
-0.31 -0.22 -0.11 0.03 0.39 0.21 0.02 0.18 -0.02 -0.11 -0.07 -0.15
-0.71 -1.23 -0.83 -0.77 0.08 0.45 0.61 0.47 0.53 -0.12 0.29 -0.18
-0.45 -0.56 -0.13 -0.24 -0.01 0.43 0.38 0.33 0.39 -0.21 -0.17 -0.21
-0.4 -0.04 0.23 0.28 0.86 -0.09 0.44 -0.93 0.04 -0.36 -0.57 -0.39
-0.21 -0.32 -0.09 -0.0 0.26 0.13 0.02 0.28 0.11 -0.11 -0.1 -0.07
-0.02 -0.11 -0.17 -0.13 0.2 0.01 0.03 0.21 0.11 -0.05 -0.05 -0.08
-0.15 -0.26 -0.19 -0.17 0.0 0.2 -0.06 0.2 0.11 0.09 0.07 0.07
-0.21 -0.23 -0.03 -0.09 0.28 -0.02 -0.11 0.25 0.09 -0.02 -0.02 0.03
-0.08 -0.19 -0.13 -0.05 0.26 0.14 0.02 0.12 -0.01 0.01 -0.01 -0.14
-0.1 -0.24 -0.04 -0.07 0.15 0.09 -0.03 0.14 0.16 0.0 -0.05 -0.08
-0.3 -0.24 0.02 0.02 0.14 0.19 0.1 0.14 0.02 0.05 -0.1 -0.13
-0.29 -0.34 0.18 0.05 0.27 0.32 0.04 0.24 -0.09 -0.03 -0.29 -0.27
-0.1 -0.09 -0.06 0.06 0.06 0.03 0.0 0.05 0.13 -0.0 0.01 -0.1
-0.25 -0.38 -0.09 -0.09 0.3 0.1 0.07 0.2 0.27 -0.16 -0.09 -0.04
-0.04 -0.1 0.04 -0.0 0.13 0.05 -0.05 0.01 0.14 -0.07 -0.04 -0.09
-1.45 -1.22 -0.79 -1.05 0.32 0.6 0.58 0.57 0.47 -0.1 -0.18 0.26
-0.11 -0.82 0.08 -0.15 0.35 0.2 0.16 0.23 0.26 -0.31 0.04 -0.31
-0.49 -0.68 -0.04 -0.07 0.4 0.17 0.06 0.29 0.22 -0.09 -0.05 -0.06
-0.2 -0.37 -0.15 -0.04 0.3 0.06 0.03 0.07 0.24 0.04 -0.01 -0.1
-0.36 -0.2 -0.11 0.02 0.22 0.12 0.25 0.27 0.09 0.06 -0.32 -0.22
-4.95 -2.02 -1.83 -0.08 0.32 1.58 0.86 1.25 0.18 -1.18 -1.72 -2.42
-0.49 -1.19 -0.45 0.12 0.39 0.28 -0.42 0.41 0.55 0.18 0.08 -0.36
0.06 -0.28 -0.21 -0.07 0.2 0.02 0.01 0.17 0.26 -0.1 -0.05 -0.13
0.01 -0.52 -0.19 -0.24 0.29 0.12 -0.09 0.29 0.09 0.04 -0.05 0.06
-0.74 -0.41 -0.06 0.09 0.26 -0.16 0.17 0.55 0.63 -0.1 -0.71 -0.23
-0.01 -0.15 -0.08 0.02 0.18 0.15 -0.05 0.08 0.21 -0.01 -0.13 -0.31
0.02 -0.28 -0.11 -0.16 -0.03 0.11 0.14 0.13 0.14 0.04 -0.01 -0.05
-0.55 -0.2 -0.11 0.01 0.29 0.09 0.11 0.22 0.18 -0.07 0.03 -0.18
-0.33 -0.49 -0.35 -0.44 0.18 0.09 0.15 0.2 0.42 -0.14 0.27 0.09
-0.23 -0.26 0.15 0.16 0.35 0.08 0.16 0.08 0.13 -0.19 -0.21 -0.43
-0.27 -0.42 -0.54 -0.08 0.32 0.13 0.03 0.2 0.22 0.04 0.15 -0.02
0.02 -0.1 -0.18 -0.03 0.1 0.03 -0.0 0.13 0.03 -0.02 0.05 -0.04
-0.27 -0.31 -0.26 -0.11 0.22 0.18 0.1 0.19 0.13 -0.07 0.03 0.03
-0.41 -0.33 -0.14 -0.04 0.15 0.11 -0.07 0.14 0.23 0.1 0.08 0.05
-0.22 -0.69 -0.38 0.0 0.31 0.02 -0.2 0.35 0.29 0.21 0.18 -0.24
-0.25 -0.33 0.02 0.02 0.26 0.15 0.11 0.1 0.12 -0.05 -0.03 -0.24
-0.36 -0.34 -0.03 0.14 0.47 0.08 0.3 0.22 0.13 -0.21 -0.33 -0.41
-0.13 -0.33 -0.07 -0.06 0.29 0.13 0.02 0.24 0.12 -0.04 -0.09 -0.21
0.07 -0.33 -0.2 -0.31 0.09 0.14 0.1 0.26 0.2 0.0 -0.01 -0.18
-0.13 -0.28 -0.08 -0.12 0.22 0.17 -0.18 0.14 0.26 -0.11 0.02 -0.02
-0.23 -0.32 -0.14 -0.14 0.11 0.0 0.04 0.21 0.18 0.08 0.01 0.09
-0.18 -0.44 -0.21 -0.16 0.22 0.19 -0.05 0.1 0.18 -0.05 0.21 0.03
-0.4 -0.24 -0.27 -0.01 0.2 0.01 0.12 0.29 0.1 0.08 -0.01 -0.01
-0.7 -0.54 -0.28 0.08 0.57 0.2 -0.01 0.2 0.19 -0.01 -0.18 0.04
-0.32 -0.53 -0.16 -0.17 0.16 0.06 -0.06 0.16 0.29 0.24 0.13 -0.0
-0.08 -0.2 0.05 -0.01 0.16 -0.06 -0.05 0.12 0.15 -0.03 -0.05 -0.06
-0.33 -0.2 0.05 0.04 0.24 -0.01 0.07 0.18 0.06 0.02 -0.04 -0.18
-0.05 -0.21 -0.14 -0.06 0.18 -0.0 -0.11 0.11 0.19 0.03 -0.03 0.03
-0.32 -0.25 0.07 -0.03 0.18 0.15 0.11 0.18 0.05 0.04 -0.12 -0.18
-0.53 -0.47 -0.02 0.1 0.5 0.31 -0.04 0.28 0.07 -0.23 -0.28 -0.06
-0.55 -1.39 -0.03 -0.08 0.25 0.21 -0.19 0.39 0.39 0.24 -0.19 0.15
-0.46 -0.49 0.13 -0.1 0.31 0.12 0.23 0.22 0.13 -0.1 -0.07 -0.18
0.0 -0.28 -0.01 -0.26 0.03 0.22 0.14 0.17 0.16 -0.02 -0.13 -0.12
-0.07 -0.06 0.0 0.06 0.17 0.04 0.04 -0.01 0.07 -0.07 -0.06 -0.12
-0.26 -0.2 -0.1 0.01 0.1 0.12 0.1 0.09 0.16 -0.09 0.04 -0.02
0.06 -0.95 -0.93 -0.49 0.86 -0.88 -0.2 0.3 0.76 0.25 -0.2 -0.0
-0.18 -0.75 -1.15 -0.63 0.34 -0.37 0.41 0.47 0.54 -0.09 0.33 0.02
-0.2 -0.16 -0.19 -0.19 0.07 0.15 0.19 0.21 0.15 -0.04 0.05 -0.14
-0.38 -0.42 -0.17 -0.01 0.3 0.26 -0.01 0.1 0.15 0.03 0.08 -0.11
-0.18 -0.33 -0.22 -0.23 0.15 -0.03 -0.36 0.31 0.41 0.07 0.04 0.14
-0.14 -0.22 -0.21 -0.04 0.12 0.08 -0.01 0.17 0.09 0.02 0.06 0.01
-0.2 -0.26 -0.16 -0.07 0.21 -0.02 0.02 0.12 0.11 0.04 0.15 -0.02
-0.08 -0.16 -0.06 -0.07 -0.02 0.05 -0.0 0.09 0.07 -0.02 0.05 0.11
0.02 -0.15 0.0 -0.14 0.06 0.2 -0.12 0.06 0.21 -0.03 0.03 -0.23
-0.17 -0.27 -0.22 0.01 0.27 0.09 0.07 0.14 0.16 -0.0 -0.07 -0.09
-0.18 -0.22 -0.05 -0.06 0.19 0.2 0.1 -0.02 0.12 -0.12 0.01 -0.05
-0.68 -1.03 -0.84 -0.92 0.21 -0.62 1.11 0.32 0.96 -0.42 0.01 -0.16
-0.42 -0.42 -0.15 0.03 0.27 0.28 0.13 0.08 0.24 -0.12 0.07 -0.19
-0.4 -0.56 -0.69 -0.34 0.06 0.09 0.16 0.24 0.52 0.02 0.24 0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.