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Heatmap: Cluster_57 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.12 -0.1 -0.54 -0.18 0.25 0.07 -0.34 -0.08 0.16 0.31 0.21 0.11
-0.4 -0.53 0.03 -0.12 0.33 0.24 -0.32 -0.13 0.24 0.18 0.14 0.07
-0.28 -0.22 -0.25 -0.01 0.2 0.25 0.11 0.04 0.03 -0.05 0.02 0.04
-0.2 -0.29 -0.19 -0.09 0.07 0.33 -0.11 0.38 -0.02 0.05 -0.04 -0.04
-0.24 -0.27 -0.5 0.01 0.15 0.23 0.39 0.17 -0.06 -0.08 0.16 -0.21
-0.16 -0.27 -0.3 -0.17 0.09 0.24 0.05 0.09 0.12 0.01 0.24 -0.06
-0.64 -0.21 -2.29 -0.03 0.29 -0.16 0.11 -0.48 -0.22 0.58 0.8 0.38
-0.26 -1.09 -1.43 -0.88 -0.21 0.48 -0.2 0.67 0.43 -0.13 0.77 0.14
1.33 -0.51 -2.89 -0.05 0.79 0.15 -0.21 -1.62 0.58 -0.29 -1.61 0.02
-0.12 -0.16 -0.38 0.0 0.2 0.18 -0.04 -0.06 0.14 0.05 0.1 0.01
0.04 -0.1 -0.22 0.13 0.24 0.0 -0.03 -0.03 -0.19 0.05 0.1 -0.05
0.32 -0.28 -0.18 -0.22 0.36 -0.54 -0.12 -0.16 0.23 -0.0 0.23 0.09
-0.12 -0.09 -0.14 -0.02 0.11 -0.01 0.03 0.0 0.09 -0.02 0.13 0.02
-0.2 -0.04 -0.74 -0.05 0.2 0.22 -0.06 -0.04 0.05 0.18 0.17 0.09
0.68 -0.07 -2.95 -0.45 0.31 -0.57 -0.45 -0.21 0.32 0.92 -0.43 0.25
-0.33 -0.6 -0.46 -0.18 -0.34 -0.0 -0.52 0.51 0.24 0.17 0.7 0.13
-0.31 -0.35 -0.58 -0.16 0.23 0.44 0.02 0.08 0.11 -0.06 0.25 0.04
0.33 0.06 -0.57 0.05 -0.23 -0.08 -0.22 0.11 0.08 -0.09 0.21 0.14
-0.09 -0.12 -1.17 -0.1 0.18 0.0 0.05 0.05 0.24 0.21 0.33 -0.07
0.24 0.03 -0.62 0.06 0.37 0.22 0.23 -0.37 -0.24 -0.05 0.21 -0.45
0.36 0.19 -0.28 -0.15 -0.08 0.05 0.0 -0.02 -0.06 -0.05 -0.0 -0.06
0.02 -0.12 -0.47 -0.07 0.07 0.14 -0.13 -0.05 0.16 0.03 0.17 0.13
0.01 -0.28 -0.21 -0.22 0.1 0.33 -0.08 0.19 0.12 -0.18 0.06 0.02
0.2 -0.1 -0.58 -0.03 0.16 -0.39 -0.14 -0.05 0.16 0.07 0.34 0.1
-0.16 -0.12 -0.01 -0.04 0.06 -0.04 -0.02 -0.11 0.07 0.12 0.26 -0.06
-0.07 -0.13 -0.64 -0.1 0.1 0.29 -0.09 0.22 -0.04 0.02 0.2 0.04
-0.37 -0.35 -0.39 0.08 -0.06 0.19 -0.25 0.49 0.11 0.09 0.21 -0.03
-0.16 -0.41 -0.5 -0.2 0.18 0.0 0.01 -0.13 0.24 0.03 0.35 0.32
-0.34 -0.65 -0.25 -0.07 0.2 0.02 -0.05 0.03 0.15 0.27 0.47 -0.09
-0.07 -0.19 -0.24 0.03 -0.01 -0.16 -0.01 0.08 -0.16 0.11 0.29 0.23
- - -1.24 2.05 - 1.39 0.73 -0.96 0.36 -1.05 -0.2 -
0.1 -0.15 -0.17 -0.01 0.0 -0.06 -0.32 -0.06 0.18 0.0 0.22 0.18
-1.08 -0.49 -1.13 0.2 -1.21 0.34 0.55 0.51 -0.11 0.64 0.57 -0.6
-0.26 0.37 -2.7 -0.05 0.59 0.63 -0.04 0.16 -0.36 0.69 -0.28 -1.37
-0.25 -0.35 -0.34 0.05 0.01 0.11 -0.16 0.07 0.22 0.08 0.37 0.0
-0.04 -0.2 -0.09 -0.09 0.1 0.0 -0.14 -0.1 0.11 0.07 0.19 0.12
-0.02 -0.11 -0.16 0.04 0.07 0.03 0.02 0.07 0.04 0.01 0.0 -0.0
-1.11 -0.03 0.19 0.78 -1.48 0.79 0.95 0.47 0.15 -2.0 -0.1 -
0.11 -0.15 -1.02 -0.27 -0.26 -0.46 0.28 0.19 0.24 0.04 0.47 0.27
0.01 -0.2 -0.15 -0.11 0.13 0.24 -0.05 0.02 0.1 -0.02 -0.0 -0.01
-0.19 -0.05 -1.74 0.66 -0.44 0.68 -0.11 0.42 -0.26 -0.41 -0.16 0.23
-1.31 -1.42 -1.16 -1.39 -0.12 1.11 -0.26 0.86 0.5 0.2 0.69 -1.06
0.01 -0.55 -1.6 -0.48 0.05 -1.87 -0.36 0.35 -1.51 0.97 1.17 0.42
-0.59 -0.63 -0.14 -0.18 0.13 -0.01 -0.08 -0.13 0.34 0.2 0.38 0.31
-0.53 0.01 -1.65 0.45 0.03 0.37 0.3 0.32 -0.52 0.35 -0.1 -0.1
-0.21 -0.15 -0.59 -0.06 0.09 0.17 0.08 0.03 0.2 0.23 0.01 0.02
-1.15 -0.43 -0.27 0.27 -0.09 0.19 0.63 -0.25 -0.13 0.6 0.27 -0.6
0.19 -0.21 -2.59 -0.77 -0.22 0.62 0.24 -0.32 -0.3 0.37 0.56 0.35
-0.33 0.47 - 1.31 -0.6 0.41 -0.08 -0.69 0.38 -0.41 0.34 -1.13
-0.26 -0.17 -0.47 -0.05 0.23 0.1 -0.14 0.01 0.24 0.1 0.2 0.03
0.31 0.09 -0.12 -0.03 0.4 0.29 -0.3 -0.16 0.06 -0.43 -0.15 -0.21
0.09 -0.08 -0.33 -0.16 0.24 0.33 0.0 -0.03 -0.01 -0.16 0.03 -0.05
-0.14 -0.1 -0.07 0.01 0.05 0.04 -0.1 0.05 0.07 0.03 0.12 0.01
-0.13 -0.03 -0.34 0.07 0.09 -0.3 -0.1 0.03 0.04 0.23 0.24 0.08
-0.81 -0.42 -0.09 0.34 0.1 0.31 0.03 0.25 0.19 0.11 -0.12 -0.32
- - - 1.65 - - 1.75 1.55 - - 1.37 -
-0.09 -0.36 -0.48 0.0 -0.1 0.17 -0.06 0.33 -0.05 0.04 0.28 0.1
0.02 -0.17 -0.1 -0.1 -0.03 0.21 -0.17 0.11 0.06 0.08 0.07 -0.03
-0.2 -0.2 -0.32 0.06 0.13 0.17 -0.12 -0.05 0.13 0.13 0.17 -0.0
-0.09 -0.13 -0.21 -0.02 0.05 0.09 -0.1 0.14 0.08 0.23 0.04 -0.14
-0.5 -0.28 -0.36 -0.16 -0.05 0.28 0.19 0.04 0.23 -0.03 0.26 0.13
-0.16 -0.1 -0.2 -0.11 -0.12 0.12 0.19 0.08 0.0 0.22 0.14 -0.15
-0.19 -0.18 -0.28 -0.02 0.17 0.2 0.09 0.18 0.07 0.02 -0.01 -0.15
0.39 0.04 -0.09 -0.38 0.67 0.45 0.07 -0.44 -0.49 -0.36 0.14 -0.7
-0.7 -0.43 -0.27 -0.02 0.37 0.02 0.11 0.06 0.29 0.03 0.25 -0.06
0.19 -0.25 -0.85 -0.13 0.11 -0.1 -0.32 -0.2 0.32 0.25 0.18 0.38
-0.28 -0.25 -0.19 -0.01 -0.07 0.23 0.06 0.44 0.17 -0.16 -0.05 -0.07
-0.07 -0.17 -0.13 -0.13 -0.12 0.39 0.08 0.14 0.01 0.07 0.04 -0.21
0.06 -0.03 -0.32 -0.16 -0.03 0.11 -0.18 0.22 -0.04 0.06 0.16 0.06
0.07 -0.1 -0.24 -0.13 0.14 0.09 -0.15 0.14 0.03 0.06 0.04 -0.0
-0.15 -0.2 -0.05 -0.07 0.17 -0.01 -0.07 0.05 0.06 0.06 0.12 0.05
0.03 -0.2 -0.17 -0.05 0.2 0.36 0.02 0.04 -0.11 -0.13 0.06 -0.14
-0.55 -0.12 -1.53 -0.01 -0.05 0.34 0.16 0.52 0.11 0.68 -0.13 -0.56
0.17 -0.71 -0.98 -0.39 0.77 0.73 -0.51 -1.09 0.23 0.78 -1.33 0.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.