Heatmap: Cluster_169 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.07 0.09 0.05 0.06 -0.1 -0.18
0.13 0.03 -0.13 -0.15 -0.02 0.12
0.13 -0.08 0.02 -0.06 0.05 -0.06
0.06 -0.37 -0.12 0.12 0.16 0.09
0.11 -0.13 -0.13 -0.13 0.23 0.01
0.13 -0.15 -0.08 0.13 0.05 -0.11
0.02 -0.12 -0.09 0.11 0.11 -0.05
-0.02 -0.07 -0.03 -0.01 0.06 0.06
0.17 0.2 -0.26 0.16 -0.19 -0.16
0.05 -0.06 0.03 0.04 0.03 -0.09
-0.13 -0.09 0.12 0.13 -0.01 -0.03
0.06 -0.05 -0.05 0.04 -0.03 0.02
0.13 0.0 0.04 0.04 -0.06 -0.15
0.1 -0.11 -0.03 0.07 -0.01 -0.03
-0.02 -0.09 0.02 0.08 0.08 -0.07
-0.02 -0.03 0.03 0.06 -0.04 0.01
0.08 0.24 -0.36 -0.23 0.21 -0.04
0.11 -0.11 -0.33 -0.13 0.14 0.25
0.03 -0.01 0.04 -0.04 -0.02 -0.01
0.06 -0.02 -0.01 0.01 -0.03 -0.01
0.09 -0.2 -0.07 -0.01 0.19 -0.03
0.05 -0.06 0.01 0.06 0.04 -0.11
-0.06 -0.21 -0.06 -0.15 0.09 0.32
-0.12 -0.22 0.07 0.17 -0.23 0.24
0.15 -0.06 -0.37 -0.15 0.22 0.13
0.15 0.12 -0.09 -0.09 -0.05 -0.07
0.17 -0.67 -0.34 0.44 0.53 -0.59
0.05 -0.06 -0.07 -0.05 0.02 0.09
0.13 -0.0 -0.11 0.01 -0.17 0.12
-0.01 -0.1 -0.03 -0.02 0.14 -0.0
-0.8 -0.56 -0.2 -0.13 0.6 0.53
0.06 0.07 -0.03 -0.03 -0.03 -0.05
0.09 0.03 -0.07 -0.12 -0.02 0.08
-0.19 -0.59 -0.48 0.17 0.36 0.42
0.12 0.13 -0.05 -0.15 -0.07 -0.0
-0.01 -0.0 0.06 -0.03 0.03 -0.05
0.07 0.04 -0.04 -0.17 -0.0 0.09
0.06 -0.05 -0.09 -0.08 0.05 0.11
-0.23 -0.61 0.15 0.53 0.01 -0.1
0.1 -0.3 -0.39 0.11 0.33 0.03
-0.06 -0.15 -0.02 0.16 0.09 -0.04
-0.09 -0.11 0.14 0.08 0.01 -0.05
0.04 0.05 -0.17 -0.01 0.09 -0.03
0.09 0.07 -0.02 -0.08 -0.01 -0.05
-0.2 -0.31 0.06 -0.14 0.14 0.33
0.09 -0.03 0.0 0.06 -0.05 -0.08
-0.21 0.02 -0.1 0.01 0.15 0.09
0.04 -0.1 -0.06 -0.17 0.06 0.19
0.1 -0.01 -0.19 -0.14 -0.02 0.21
0.04 -0.06 -0.02 -0.1 -0.0 0.13
0.1 0.1 -0.02 0.01 -0.13 -0.07
0.01 -0.0 0.12 0.08 -0.05 -0.18
0.07 -0.03 -0.03 -0.12 -0.0 0.09
-0.07 -0.01 0.05 0.04 0.08 -0.1
0.01 0.11 -0.19 -0.1 0.1 0.05
0.01 0.05 0.02 -0.12 -0.01 0.04
-0.01 -0.06 -0.06 0.16 0.03 -0.07
0.1 -0.02 -0.05 -0.11 0.04 0.03
0.11 -0.08 -0.05 -0.01 0.04 -0.02
0.02 -0.29 0.02 0.1 0.05 0.06
-0.19 -0.18 0.33 0.16 -0.09 -0.11
-0.05 -0.08 0.02 -0.02 0.1 0.03
-0.12 -0.49 0.48 0.24 -0.23 -0.1
0.03 -0.32 -0.0 -0.06 0.13 0.17
0.12 0.26 -0.0 -0.05 -0.26 -0.12
0.64 - - 0.82 0.71 0.05
-0.31 -0.26 -0.12 0.02 0.09 0.45
-0.08 -0.06 0.08 0.04 0.01 0.01
0.09 -0.1 -0.07 -0.0 0.04 0.03
-0.3 -0.12 0.29 0.33 0.08 -0.45
0.29 -0.35 -0.31 -0.04 0.01 0.26
0.05 -0.17 0.1 0.02 0.02 -0.03
0.06 0.01 -0.01 -0.08 -0.01 0.02
0.01 0.06 -0.04 0.0 0.06 -0.1
0.01 -0.21 0.0 0.1 0.13 -0.06
0.07 -0.04 0.0 -0.0 -0.01 -0.03
0.1 0.04 -0.08 -0.06 -0.04 0.04
-0.06 -0.17 0.08 -0.16 0.08 0.19
-0.37 0.51 0.13 0.22 -0.22 -0.55
0.13 0.08 -0.14 -0.05 0.01 -0.04
0.22 -0.34 -0.75 0.38 0.09 0.12
-0.01 -0.19 0.13 -0.01 -0.0 0.06
0.11 -0.13 -0.09 0.12 0.06 -0.09
0.01 0.02 -0.15 -0.04 0.05 0.1
-0.67 -0.63 -0.01 -0.53 1.18 -0.36
-0.03 0.05 0.15 0.05 -0.1 -0.15
0.04 -0.21 0.0 0.15 0.09 -0.1
0.06 0.09 0.0 0.03 -0.15 -0.04
0.1 -0.02 -0.04 0.09 -0.01 -0.13
0.07 -0.03 -0.01 0.02 -0.03 -0.01
0.09 0.08 -0.04 -0.02 -0.03 -0.09
-0.07 -0.05 0.16 0.12 -0.01 -0.18
-0.12 -0.07 0.12 0.08 0.0 -0.03
-0.02 -0.07 0.02 0.06 0.03 -0.03
0.1 -0.01 -0.16 -0.01 0.11 -0.05
-0.01 -0.03 0.07 0.05 0.0 -0.09
-0.11 0.1 -0.01 0.02 0.09 -0.11
0.02 -0.03 -0.14 0.1 0.12 -0.09
-0.04 - -0.59 0.24 1.03 0.2
-0.0 0.01 0.04 0.12 -0.07 -0.11
-0.23 -0.14 -0.3 -0.14 0.05 0.57
0.03 -0.13 -0.11 -0.08 0.09 0.18
0.03 -0.05 -0.08 -0.03 0.11 0.01
0.15 0.05 -0.11 -0.23 -0.06 0.17
0.19 0.07 -0.1 -0.11 -0.01 -0.07
-0.3 -0.06 0.26 0.48 -0.28 -0.3
0.09 -0.0 -0.07 -0.02 -0.0 0.0
0.06 -0.08 -0.02 -0.07 0.02 0.09
-0.39 -0.21 0.18 0.41 0.18 -0.35
0.02 0.09 -0.09 -0.16 0.03 0.1
0.17 0.09 -0.12 -0.19 -0.09 0.11
0.22 -0.12 -0.18 -0.28 0.03 0.25
-0.03 -0.17 -0.09 -0.11 -0.0 0.33
0.08 -0.16 -0.04 0.03 0.04 0.04
0.02 0.01 -0.03 -0.08 0.08 -0.01
0.02 0.01 0.06 0.1 -0.09 -0.11
-0.03 -0.11 0.05 0.1 0.03 -0.05
-0.12 0.04 0.25 -0.12 0.03 -0.13
0.06 -0.12 0.0 0.0 -0.01 0.05
0.0 -0.09 -0.02 0.02 0.12 -0.03
-0.28 -0.09 0.34 0.01 0.07 -0.14
-0.17 0.23 0.08 0.1 -0.25 -0.03
0.01 -0.08 0.01 -0.03 0.13 -0.05
-0.23 -0.22 -0.05 -0.07 0.13 0.34
-0.21 -0.86 0.37 0.15 0.06 0.19
0.12 0.11 -0.11 -0.2 -0.02 0.07
0.15 -0.02 -0.08 0.03 -0.09 0.0
0.19 -0.06 -0.12 -0.07 0.07 -0.03
-0.03 -0.18 0.03 -0.01 0.06 0.1
0.02 0.06 -0.06 -0.18 0.05 0.09
0.01 -0.02 0.01 0.02 -0.04 0.01
-0.05 -0.3 -0.1 -0.07 0.22 0.23
-0.17 -0.46 0.25 0.27 0.02 -0.03
-0.1 0.04 0.08 -0.06 0.09 -0.07
0.03 0.02 0.04 -0.09 -0.02 0.0
-0.16 -0.13 0.08 -0.02 0.21 -0.01
0.16 -0.05 -0.1 -0.14 0.06 0.05
0.05 0.05 -0.05 -0.1 -0.0 0.05
-0.29 0.1 -0.04 0.08 0.1 0.02
0.03 -0.17 -0.05 0.05 0.1 0.02
-0.05 0.02 -0.12 0.2 0.0 -0.08
0.1 0.01 -0.02 -0.02 0.02 -0.1
0.09 -0.05 -0.02 0.02 -0.11 0.07
0.09 -0.06 -0.12 -0.06 0.08 0.05
-1.75 -0.22 -0.37 0.1 0.5 0.66
0.01 -0.06 -0.08 -0.02 0.09 0.06
-0.12 0.51 -0.26 -0.66 -0.37 0.5
-0.14 0.09 0.04 0.03 0.07 -0.12
0.25 -0.21 -0.27 -0.17 0.14 0.18
-0.14 0.14 0.11 0.01 -0.06 -0.08
0.23 0.15 -0.24 -0.15 -0.16 0.1
-0.01 0.29 0.24 -0.07 -0.3 -0.26
0.04 0.02 0.02 0.0 -0.04 -0.05
0.03 0.03 0.03 -0.1 -0.0 -0.0
0.06 -0.03 -0.05 0.13 0.02 -0.15
0.03 -0.04 0.07 0.11 -0.04 -0.14
0.03 -0.02 0.01 0.06 0.02 -0.11
0.02 -0.28 0.03 0.02 0.11 0.07
-0.36 -0.24 -0.03 0.33 0.18 0.01
-0.12 -0.14 0.01 0.09 0.11 0.03
0.01 0.09 -0.01 0.06 -0.05 -0.1
-0.06 -0.21 -0.27 0.2 0.5 -0.35
0.09 -0.23 0.05 0.09 -0.09 0.07
0.11 -0.0 -0.02 -0.08 0.05 -0.08
0.05 0.56 -0.01 0.17 -0.76 -0.34
0.07 -0.01 0.0 -0.11 0.04 -0.01
0.02 -0.07 0.05 0.04 -0.02 -0.02
0.14 0.0 -0.16 -0.03 0.04 -0.02
0.08 0.04 0.02 0.03 -0.1 -0.08
0.2 -0.12 0.04 -0.15 -0.08 0.09
-0.24 -0.1 0.46 0.77 -0.55 -1.15
0.08 -0.03 0.01 -0.04 0.02 -0.03
0.24 -0.1 -0.16 -0.02 0.02 -0.0
-0.04 0.11 -0.01 -0.03 -0.07 0.04
-0.2 -0.06 0.13 0.24 0.04 -0.22
0.09 -0.12 -0.02 0.11 -0.03 -0.03
-0.35 -0.43 0.34 0.29 -0.13 0.09
0.05 0.03 0.03 -0.04 -0.05 -0.02
-0.0 -0.42 -0.09 0.19 0.13 0.12
-0.13 -0.42 -0.02 0.07 0.16 0.24
0.06 -0.02 0.1 0.08 -0.07 -0.17
0.04 -0.04 0.02 -0.02 -0.0 -0.0
0.14 0.18 -0.11 -0.16 -0.14 0.05
0.01 -0.02 0.08 0.02 -0.04 -0.05
-0.06 0.07 0.04 -0.11 -0.04 0.08
-0.08 0.21 0.08 -0.11 -0.13 -0.0
0.07 0.16 -0.02 -0.08 -0.13 -0.02
0.1 -0.15 -0.58 -0.28 -0.01 0.62
0.05 0.04 -0.18 -0.25 0.04 0.25
0.06 -0.09 -0.04 -0.12 0.06 0.12
0.01 0.11 -0.01 -0.13 -0.0 0.02
0.05 0.1 -0.09 -0.13 0.01 0.05
1.42 - - - 1.73 -
0.01 -0.0 0.0 -0.01 0.0 -0.01
0.28 0.37 0.03 -0.13 -0.42 -0.31
0.08 0.1 -0.27 -0.19 0.01 0.21
0.22 -0.07 0.32 -0.01 -0.31 -0.26
0.06 -0.15 -0.23 0.09 0.07 0.13
-0.01 0.02 0.12 0.02 -0.03 -0.13
-0.17 0.08 -0.13 -0.1 0.02 0.26
-0.01 0.05 0.01 0.04 0.04 -0.14
-2.23 -0.85 -0.38 0.26 0.41 0.96
0.07 -0.07 -0.19 -0.12 0.08 0.19
-0.01 -0.42 -0.03 0.22 0.19 -0.03
-0.04 -0.25 -0.23 0.06 0.14 0.25
0.11 0.13 -0.07 -0.32 -0.09 0.18
0.07 0.01 -0.03 -0.08 -0.05 0.08
0.05 0.08 0.06 0.03 -0.06 -0.19
0.05 0.01 -0.02 -0.04 0.03 -0.03
-0.35 -0.74 -0.67 0.24 0.67 0.28
-0.02 -0.22 0.09 0.28 -0.06 -0.11
0.1 -0.08 -0.02 -0.09 0.03 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.