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Heatmap: Cluster_239 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
-0.15 -0.12 0.02 0.1 0.07 0.06
0.18 -0.17 -0.42 -0.06 0.29 0.07
-0.06 -0.54 0.02 0.05 0.14 0.26
0.03 -0.27 0.01 0.0 0.11 0.09
-0.04 -0.13 -0.2 0.16 0.04 0.14
-0.07 -0.3 -0.09 0.03 0.14 0.23
-0.08 -0.37 -0.08 0.04 0.23 0.17
0.14 -0.33 -0.32 0.07 -0.0 0.33
-0.04 -0.2 -0.15 -0.05 0.26 0.13
-0.02 -0.21 0.03 -0.0 -0.02 0.2
0.14 -0.15 -0.2 0.04 0.09 0.06
0.04 -0.3 -0.28 0.14 0.13 0.19
0.04 -0.1 -0.15 0.05 0.07 0.08
0.07 -0.34 -0.14 0.01 0.14 0.2
0.05 -0.58 -0.74 0.29 0.22 0.39
0.07 -0.17 -0.18 -0.05 0.13 0.16
-0.09 -0.36 0.06 0.17 0.08 0.08
0.16 -0.61 -0.6 0.28 0.25 0.22
0.07 -0.27 -0.15 0.03 0.19 0.09
0.04 -0.26 -0.04 0.07 0.12 0.04
0.39 -0.45 -0.45 -0.09 0.13 0.26
-0.26 -0.37 -0.07 0.17 0.11 0.3
0.12 -0.55 -0.7 0.17 0.26 0.37
-0.06 -0.15 0.08 0.14 -0.07 0.04
0.06 -0.14 -0.02 0.03 0.03 0.03
0.17 -0.13 -0.12 0.02 0.02 0.02
-0.04 -0.14 -0.08 0.15 0.07 0.02
0.11 -0.25 -0.31 0.07 0.07 0.23
0.06 -0.18 -0.13 -0.04 0.11 0.15
0.18 -0.07 -0.1 -0.13 0.1 -0.01
0.1 -0.56 -0.27 0.2 0.15 0.22
0.24 -0.33 -0.18 0.11 0.06 0.03
-0.06 -0.43 -0.18 0.11 0.38 0.04
0.13 -0.42 -0.09 -0.01 0.2 0.11
-0.08 -0.02 -0.05 0.13 0.08 -0.07
0.36 -0.3 -0.21 -0.04 0.11 -0.02
0.06 -0.15 -0.12 -0.03 0.11 0.11
0.11 -0.03 -0.17 -0.02 -0.03 0.12
0.06 -0.34 -0.12 -0.03 0.17 0.2
0.27 -0.09 -0.55 0.29 -0.16 0.08
0.1 -0.09 -0.11 0.0 0.04 0.05
0.04 -0.44 -0.09 0.04 0.15 0.21
0.1 -0.17 -0.12 0.1 0.09 -0.03
-0.47 -0.21 0.29 0.44 -0.02 -0.25
0.08 -0.1 -0.08 -0.01 0.04 0.05
0.02 -0.18 -0.07 0.05 0.07 0.09
0.06 -0.21 -0.22 0.02 0.14 0.17
0.04 -0.38 -0.27 0.09 0.17 0.25
0.01 -0.32 0.02 0.07 0.06 0.12
-0.02 -0.09 -0.17 -0.0 0.07 0.18
-0.03 -0.38 -0.07 0.12 0.17 0.12
0.04 -0.2 -0.15 0.1 0.16 0.01
-0.05 -0.51 0.04 0.2 0.08 0.13
0.01 -0.1 -0.17 0.05 0.01 0.18
-0.04 -0.4 -0.01 0.27 0.07 0.04
0.17 -0.13 -0.06 -0.01 -0.05 0.05
0.16 -0.08 -0.1 -0.05 -0.03 0.08
-0.08 -0.36 -0.06 0.07 0.16 0.2
-0.45 -0.46 -0.17 0.26 0.36 0.23
0.22 -0.34 -0.04 0.15 -0.07 0.01
0.03 -0.22 0.04 0.12 0.02 -0.01
-0.04 -0.0 0.03 0.05 0.07 -0.12
-0.14 -0.22 -0.17 0.16 0.08 0.23
0.33 -0.57 -0.38 0.23 0.23 -0.06
-0.19 -0.43 -0.77 0.24 0.44 0.33
0.21 -0.17 -0.15 -0.01 0.11 -0.03
0.15 -0.52 -0.1 0.42 -0.11 -0.02
0.26 -0.75 -0.34 0.35 0.17 0.03
0.1 -0.15 -0.3 -0.02 0.18 0.13
-0.09 -0.04 -0.06 0.17 0.04 -0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.