Heatmap: Cluster_42 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
-0.2 0.01 0.35 0.18 -0.17 -0.28
-0.43 0.14 0.31 0.12 -0.02 -0.26
-0.34 -0.21 0.4 0.27 0.01 -0.3
-0.3 0.24 0.7 0.01 -0.4 -0.72
-0.43 0.08 0.49 0.12 -0.15 -0.29
-0.24 -0.02 0.2 0.08 -0.03 -0.03
-0.56 -0.06 0.63 0.32 -0.16 -0.58
-0.22 0.04 0.41 0.16 -0.11 -0.43
-1.07 0.18 0.87 0.11 -0.38 -0.5
-0.2 -0.23 0.16 0.19 0.08 -0.06
-0.65 0.28 0.34 0.27 -0.28 -0.22
-0.04 -0.16 0.12 0.21 -0.0 -0.16
-0.75 0.1 0.7 0.34 -0.2 -0.79
-0.27 -0.28 0.25 0.34 0.09 -0.27
-0.12 0.11 0.58 0.09 -0.35 -0.61
-0.57 0.24 0.58 0.13 -0.23 -0.5
-0.33 0.04 0.25 0.17 -0.06 -0.15
-0.32 0.0 0.41 0.25 -0.16 -0.36
-0.46 0.04 0.41 0.26 -0.07 -0.39
-0.14 0.19 0.51 0.09 -0.34 -0.58
-0.38 0.09 0.53 0.25 -0.24 -0.56
0.0 0.31 0.44 -0.1 -0.37 -0.53
-0.24 0.02 0.14 0.17 -0.03 -0.1
-0.18 -0.18 0.19 0.27 0.04 -0.2
-0.28 -0.23 0.33 0.31 -0.03 -0.23
-0.36 -0.0 0.21 0.21 0.07 -0.2
-0.27 0.07 0.39 -0.0 -0.1 -0.19
-0.32 0.22 0.34 0.17 -0.26 -0.31
-0.22 -0.06 0.19 0.17 -0.04 -0.08
-0.07 0.23 0.14 0.0 -0.19 -0.15
-0.28 -0.12 0.28 0.22 0.02 -0.21
-0.2 0.05 0.35 0.27 -0.14 -0.52
-0.4 -0.18 0.49 0.25 0.02 -0.41
-0.38 0.11 0.27 0.17 -0.02 -0.26
-0.01 -0.36 0.34 0.29 -0.09 -0.33
-0.48 -0.46 0.27 0.38 0.21 -0.16
-0.1 -0.1 0.19 0.21 -0.1 -0.14
-0.55 0.28 0.51 0.19 -0.25 -0.53
-0.18 -0.15 0.29 0.19 -0.14 -0.09
-0.26 0.17 0.2 0.15 -0.06 -0.27
-0.26 0.16 0.47 0.17 -0.19 -0.6
-0.24 -0.31 0.2 0.26 0.04 -0.03
-0.47 0.11 0.35 0.11 -0.05 -0.2
-0.32 -0.11 0.39 0.24 -0.05 -0.31
-0.35 0.24 0.51 0.16 -0.3 -0.55
-0.24 0.01 0.25 0.36 -0.14 -0.37
-0.43 -0.03 0.6 0.4 -0.18 -0.82
-0.51 0.09 0.55 0.2 -0.18 -0.45
-0.36 0.22 0.27 0.2 -0.13 -0.33
-0.36 0.13 0.55 0.29 -0.2 -0.83
-0.08 0.01 0.18 0.19 -0.06 -0.3
-0.65 0.04 0.67 0.21 -0.22 -0.45
-0.45 0.31 0.55 0.14 -0.26 -0.66
-0.27 0.11 0.37 0.16 -0.21 -0.29
-0.26 0.25 0.5 0.17 -0.37 -0.58
-0.77 0.03 0.46 0.36 -0.18 -0.23
-0.4 0.21 0.4 0.04 -0.25 -0.16
-0.26 0.05 0.38 0.25 -0.2 -0.37
-0.21 0.18 0.42 0.15 -0.32 -0.39
-0.25 0.32 0.32 0.09 -0.22 -0.43
-0.23 -0.21 0.08 0.3 0.08 -0.09
-0.23 -0.15 0.21 0.28 -0.02 -0.17
-0.45 0.31 0.56 0.21 -0.38 -0.67
-0.48 0.24 0.52 0.26 -0.3 -0.6
-0.38 0.17 0.33 0.16 -0.14 -0.28
-0.16 -0.06 0.12 0.2 0.02 -0.17
-0.27 -0.01 0.36 0.17 -0.1 -0.26
-0.39 0.19 0.31 0.24 -0.12 -0.4
-0.17 -0.18 0.17 0.21 -0.04 -0.05
-0.38 -0.04 0.53 0.15 -0.16 -0.32
-0.68 0.26 0.35 0.25 -0.12 -0.32
-0.67 0.22 0.45 0.27 -0.22 -0.35
-0.27 0.03 0.24 0.12 -0.1 -0.09
-0.19 -0.07 0.29 0.34 -0.08 -0.44
-0.35 0.34 0.55 0.04 -0.33 -0.58
-0.43 0.16 0.52 0.3 -0.27 -0.64
-0.32 0.12 0.52 0.25 -0.14 -0.79
-0.39 0.07 0.57 0.07 -0.09 -0.48
-0.18 -0.05 0.24 0.12 -0.0 -0.16
-0.25 0.05 0.34 0.33 -0.22 -0.43
-0.27 0.17 0.21 0.14 -0.13 -0.19
-0.1 0.09 0.24 0.08 -0.12 -0.25
-0.32 0.18 0.49 0.16 -0.26 -0.48
-0.44 -0.12 0.66 0.41 -0.19 -0.87
-0.14 -0.24 0.12 0.19 0.11 -0.1
-0.59 0.11 0.48 0.12 0.03 -0.4
-0.36 0.22 0.61 0.22 -0.31 -0.83
-0.85 0.17 0.73 0.2 -0.09 -0.81
-0.16 -0.01 0.22 0.17 -0.07 -0.2
-0.21 -0.2 0.29 0.33 -0.01 -0.34
-0.44 0.1 0.5 0.25 -0.19 -0.51
-0.52 -0.47 0.33 0.38 0.1 -0.08
-0.07 -0.14 0.26 0.33 -0.07 -0.47
-0.77 -0.18 0.45 0.54 0.05 -0.58
-0.45 -0.01 0.29 0.37 -0.05 -0.34
-0.43 0.17 0.28 0.32 -0.17 -0.38
-0.06 -0.2 0.17 0.24 -0.0 -0.21
-0.35 0.02 0.41 0.25 -0.13 -0.39
-0.11 0.13 0.25 0.19 -0.23 -0.33
-0.58 0.09 0.61 0.31 -0.18 -0.71
-0.22 0.1 0.38 0.06 -0.16 -0.26
-0.27 -0.14 0.37 0.28 -0.0 -0.39
-0.24 -0.31 0.36 0.31 -0.02 -0.25
-0.5 -0.22 0.46 0.45 0.09 -0.66
-0.65 -0.05 0.5 0.37 -0.06 -0.44
-0.21 -0.05 0.31 0.21 -0.17 -0.17
-0.48 0.19 0.61 0.04 -0.28 -0.38
-0.4 -0.15 0.25 0.36 -0.07 -0.12
-0.25 -0.02 0.41 0.14 -0.04 -0.4
-0.37 -0.08 0.42 0.29 -0.1 -0.34
-0.16 0.18 0.32 0.05 -0.18 -0.3
-0.45 -0.12 0.5 0.2 -0.0 -0.35
-0.24 -0.16 0.34 0.29 -0.03 -0.33
-0.41 0.1 0.58 0.13 -0.24 -0.43
-0.32 0.14 0.53 0.17 -0.26 -0.54
-0.18 0.03 0.55 0.14 -0.21 -0.59
-0.4 -0.02 0.45 0.27 -0.12 -0.38
-0.29 0.19 0.65 0.16 -0.34 -0.81
-0.16 -0.05 0.37 0.06 -0.13 -0.17
-0.42 -0.27 0.35 0.42 0.11 -0.45
-0.33 0.03 0.34 0.09 0.02 -0.25
-0.3 0.16 0.54 0.23 -0.32 -0.63
-0.18 0.18 0.45 0.12 -0.28 -0.52
-0.36 0.07 0.47 0.31 -0.23 -0.53

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.