Heatmap: Cluster_171 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
-0.19 -0.39 -0.17 0.32 0.14 0.17
-0.23 -0.27 0.23 0.12 0.01 0.07
-0.19 -0.33 0.18 0.17 0.02 0.08
-0.29 -0.48 -0.01 0.41 0.14 0.05
-0.27 -0.38 0.01 0.33 0.06 0.14
-0.18 -0.32 0.01 0.18 0.16 0.08
0.02 0.09 0.04 -0.03 -0.08 -0.05
-0.11 -0.12 -0.03 0.19 0.04 0.0
-0.4 -0.39 0.11 0.11 0.06 0.35
-0.12 -0.25 -0.04 0.24 0.1 0.03
0.3 -0.11 -0.07 0.45 -0.19 -0.62
-0.21 0.23 0.01 0.03 0.03 -0.12
-0.07 -0.21 -0.24 0.14 0.26 0.05
-0.16 0.16 0.37 0.18 -0.59 -0.16
-0.03 -0.18 0.14 0.17 -0.03 -0.11
0.02 -0.26 0.03 0.1 0.09 -0.0
0.03 -0.14 -0.01 0.07 0.09 -0.06
-0.26 -0.85 -0.13 0.58 0.29 -0.04
-0.14 -0.01 0.19 0.1 -0.1 -0.06
-0.28 -0.52 -0.1 0.6 0.04 -0.01
-0.16 -0.1 0.17 -0.0 -0.1 0.16
0.01 -0.21 0.06 0.18 -0.0 -0.07
0.15 -0.06 -0.14 -0.04 0.06 0.01
-0.53 -0.08 0.18 0.61 0.1 -0.66
0.05 -0.13 -0.07 0.09 0.01 0.03
-0.52 -0.57 0.45 0.45 -0.04 -0.11
-1.22 1.0 0.53 -0.89 -0.19 -0.49
0.03 -0.08 0.08 0.14 -0.03 -0.16
0.01 -0.06 0.01 0.14 -0.05 -0.06
0.05 -0.03 0.05 0.12 -0.12 -0.08
-0.02 -0.03 0.07 -0.01 0.03 -0.05
0.02 -0.14 0.02 -0.08 0.1 0.07
-0.45 -0.06 0.39 0.47 -0.26 -0.36
0.03 -0.11 0.04 0.1 0.0 -0.08
-0.12 0.21 0.17 0.01 -0.0 -0.34
-0.74 -0.47 0.25 0.6 0.08 -0.13
-0.06 -0.29 0.06 0.12 0.1 0.03
-0.19 -0.11 0.02 0.13 0.05 0.08
-0.22 -0.24 0.11 0.17 0.09 0.04
-0.23 -0.39 -0.03 0.49 0.01 -0.0
0.01 -0.14 -0.2 0.12 0.1 0.09
0.15 -0.24 0.01 0.12 0.04 -0.11
-0.24 -0.48 -0.05 0.1 0.18 0.34
-0.28 -0.35 -0.07 0.34 0.11 0.14
-0.22 0.03 -0.05 0.05 0.15 0.01
-0.23 0.01 0.16 0.21 -0.03 -0.18
-0.09 -0.1 0.18 0.06 0.0 -0.07
0.32 -0.23 -0.33 -0.33 0.37 0.03
-0.14 -0.3 -0.02 0.32 0.03 0.03
0.01 -0.17 0.07 0.11 -0.03 -0.0
-0.21 -0.05 -0.13 0.4 0.01 -0.1
-0.44 0.1 -0.34 0.23 0.25 0.06
-0.23 -0.28 -0.17 0.07 0.19 0.32
-0.49 -0.29 0.34 0.24 0.01 0.03
-0.07 -0.48 0.07 0.44 0.04 -0.17
-0.31 -0.15 0.21 0.23 -0.09 0.03
-0.03 -0.16 -0.0 0.03 0.04 0.12
0.09 -0.46 -0.15 0.33 0.02 0.06
-0.45 0.05 0.42 0.35 -0.2 -0.41
-0.2 -0.28 -0.12 0.22 0.2 0.1
-0.02 -0.04 0.08 -0.24 -0.02 0.2
-0.91 -0.8 0.02 0.63 0.44 -0.04
0.07 -0.05 -0.05 -0.02 0.07 -0.03
-0.56 0.0 0.44 0.12 0.01 -0.2
-0.36 -0.25 0.17 0.53 -0.13 -0.16
-0.1 -0.25 -0.39 0.11 0.27 0.24
-0.45 -0.67 -0.18 0.43 0.38 0.15
-0.09 -0.1 0.09 0.1 -0.0 -0.01
-0.33 -0.51 0.04 0.42 0.17 0.02
-0.29 -0.62 0.22 0.19 0.15 0.15
0.19 0.24 -0.11 -0.05 -0.17 -0.15
-0.18 -0.31 -0.01 0.22 0.1 0.11
-0.12 -0.07 0.11 0.25 -0.05 -0.16
-0.21 -0.46 0.16 0.4 -0.1 0.06
-0.14 -0.13 0.11 0.11 -0.05 0.08
-0.01 -0.13 0.05 0.1 0.02 -0.04
-0.58 0.38 0.0 0.01 0.16 -0.15
-0.62 -0.65 0.05 0.39 0.22 0.26
0.25 -0.04 -0.05 -0.22 0.39 -0.5
-1.63 -0.43 0.51 -0.18 0.45 0.34
-0.08 -0.12 0.08 0.12 -0.02 0.01
-0.31 0.12 0.32 0.24 -0.25 -0.25
-0.24 -0.08 0.02 0.2 0.02 0.04
0.69 -0.49 - 0.8 0.36 -0.61
-0.05 -0.23 0.04 0.15 0.05 0.01
0.25 -0.12 -0.37 -0.16 0.27 0.02
0.19 0.28 -1.03 0.51 -0.49 0.04
-0.04 -0.41 -0.07 0.22 0.16 0.05
-0.08 -0.4 -0.14 0.16 0.19 0.17
-0.16 0.04 -0.79 0.18 0.31 0.18
-0.07 -0.34 0.02 -0.06 0.27 0.1
-0.77 -0.71 0.05 0.53 0.42 -0.02
-0.38 0.11 0.35 0.07 0.09 -0.4
0.06 -0.15 0.02 0.18 -0.03 -0.11
-0.06 -0.09 0.04 -0.07 0.02 0.15
0.02 0.05 -0.08 0.06 -0.08 0.03
0.0 -0.05 0.04 0.06 -0.01 -0.04
- -0.04 0.58 0.87 -0.27 -0.2
-0.21 -0.18 0.08 0.3 0.05 -0.11
0.06 -0.04 0.01 0.14 -0.11 -0.08
-0.36 -0.41 -0.01 0.88 -0.21 -0.36
0.06 -0.16 -0.07 0.1 0.04 0.01
-0.05 -0.08 0.11 0.11 -0.01 -0.09
-0.33 -0.28 0.17 0.59 -0.2 -0.19
-0.18 -0.1 0.19 0.24 -0.04 -0.16
-0.83 -0.83 0.05 0.56 0.43 0.02
0.22 -0.36 - -0.91 0.76 0.87
-1.16 -0.01 0.02 0.36 0.16 0.2
-0.11 -0.05 -0.05 0.24 -0.0 -0.05
-1.0 -0.99 -0.11 1.13 0.18 -0.43
-0.14 -0.73 -0.18 0.31 0.26 0.23
-0.16 -0.27 0.15 0.17 0.1 -0.04
0.0 -0.07 -0.02 -0.02 0.15 -0.05
0.09 -0.26 -0.26 -0.07 0.1 0.31
-0.29 -0.35 0.09 0.72 -0.27 -0.24
-0.9 -0.93 0.01 0.63 0.42 0.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.