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Heatmap: Cluster_3 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.43 0.67 -0.37 -0.54 -0.42 -0.21
0.33 0.06 -0.38 -0.33 0.04 0.14
0.14 0.09 -0.12 0.02 -0.0 -0.15
0.2 0.21 -0.1 -0.12 -0.1 -0.13
0.17 0.05 -0.06 -0.06 -0.02 -0.09
0.26 -0.07 -0.4 -0.22 0.15 0.17
0.13 0.15 -0.24 -0.07 -0.02 0.02
0.51 0.42 -0.7 -0.58 -0.17 0.09
0.01 0.05 -0.2 -0.04 0.08 0.09
1.85 -0.39 -1.84 -2.19 -1.81 -0.26
0.08 0.08 -0.41 -0.1 0.05 0.22
1.0 -0.15 -0.96 -0.41 -0.41 0.1
0.41 0.19 -0.4 -0.17 -0.13 -0.03
0.18 0.01 -0.32 -0.22 0.03 0.23
0.88 -0.06 -0.72 -0.72 -0.5 0.35
0.13 0.32 -0.17 -0.1 -0.16 -0.1
0.2 0.31 0.06 -0.17 -0.26 -0.25
0.18 0.29 -0.45 0.07 0.07 -0.3
0.13 0.03 -0.1 -0.01 0.01 -0.06
0.32 0.13 -0.3 -0.21 -0.05 0.01
0.33 0.03 -0.72 0.07 0.01 0.07
0.48 0.58 -0.04 -0.25 -0.76 -0.48
1.18 0.23 -0.24 -1.06 -0.98 -0.45
0.29 0.12 -0.34 -0.18 -0.08 0.11
0.18 0.17 -0.16 -0.1 -0.06 -0.05
1.1 0.48 -1.06 -1.24 -0.73 -0.06
0.45 0.24 -0.49 -0.09 -0.33 0.02
0.58 0.11 -0.46 -0.38 -0.1 -0.01
0.56 0.18 -0.23 -0.23 -0.12 -0.38
-0.05 0.09 -0.1 -0.0 0.04 0.02
0.27 0.04 -0.26 -0.03 -0.28 0.17
-0.13 0.9 -0.2 -0.44 -0.27 -0.34
1.11 0.55 -0.83 -1.39 -0.98 -0.1
0.77 0.32 -0.48 -0.65 -0.51 -0.0
0.35 0.29 -0.39 -0.17 -0.18 -0.06
0.48 0.36 -0.76 -0.37 -0.21 0.13
0.15 0.13 -0.18 0.01 -0.08 -0.06
0.55 -0.06 -0.83 -0.11 -0.06 0.17
0.1 0.06 -0.41 -0.01 -0.01 0.19
0.53 0.18 -0.82 0.06 -0.38 0.07
0.76 0.42 -0.76 -0.67 -0.51 0.08
0.68 0.41 -0.75 -0.57 -0.44 0.08
0.45 0.05 -0.41 -0.04 -0.19 -0.01
-0.12 0.04 -0.35 0.02 0.21 0.13
-0.15 0.12 -0.4 -0.21 0.16 0.36
0.43 0.16 -0.51 -0.34 -0.12 0.17
0.13 0.5 -0.19 -0.13 -0.19 -0.27
0.58 0.1 -0.4 -0.15 -0.31 -0.05
1.01 1.62 -1.46 -2.29 -2.95 -2.26
0.95 1.73 -1.4 -2.87 -3.16 -3.1
-0.04 -0.04 -0.1 -0.06 0.06 0.16
0.23 0.43 -0.51 -0.25 -0.2 0.09
0.4 0.35 -0.59 -0.28 -0.17 0.04
0.34 0.2 -0.37 -0.21 -0.03 -0.04
0.14 -0.0 -0.03 -0.1 -0.04 0.02
0.36 0.26 -0.05 -0.23 -0.23 -0.24
0.11 0.15 0.02 -0.08 -0.13 -0.11
0.5 0.44 -0.33 -0.2 -0.36 -0.35
0.14 0.15 -0.11 -0.05 -0.07 -0.09
0.86 0.73 -0.73 -1.09 -0.57 -0.38
0.89 -0.1 -0.31 -0.96 -0.08 -0.08
0.72 0.01 -0.81 -0.46 -0.21 0.25
0.26 0.33 -0.38 -0.17 -0.07 -0.08
0.39 0.05 0.11 -0.05 -0.31 -0.31
0.12 0.32 -0.18 0.02 -0.29 -0.07
1.32 -0.15 -1.26 -1.06 -0.67 0.1
0.63 1.12 -0.03 -0.55 -1.42 -2.02
0.29 0.13 -0.22 -0.05 -0.04 -0.18
0.46 0.13 -0.31 -0.06 -0.3 -0.07
1.84 -2.25 -3.51 -2.64 -1.22 0.61
0.22 0.1 -0.14 -0.11 -0.04 -0.06
0.1 -0.01 -0.48 -0.28 0.17 0.35
0.16 0.02 -0.12 -0.01 0.0 -0.07
0.83 0.04 -0.88 -0.68 -0.31 0.29
0.99 -0.21 -0.73 -0.74 -0.48 0.31
0.39 0.03 -0.26 -0.13 -0.07 -0.05
0.21 0.42 -0.24 -0.14 -0.16 -0.22
0.09 0.11 -0.1 0.01 -0.08 -0.03
0.25 0.04 -0.13 -0.01 -0.22 0.03
0.08 0.18 0.06 -0.17 -0.22 0.03
0.3 0.26 -0.19 -0.25 -0.12 -0.1
0.98 0.42 -0.28 -0.7 -0.69 -0.65
0.17 0.27 -0.15 -0.15 -0.2 -0.0
0.19 0.24 -0.22 -0.19 -0.1 0.01
0.42 0.16 -0.41 -0.2 -0.11 0.0
0.27 0.15 -0.31 -0.14 -0.1 0.06
0.58 0.78 -0.19 -0.48 -0.8 -0.69
0.28 0.28 -0.36 -0.07 -0.1 -0.14
1.04 0.22 -0.85 -0.63 -0.71 -0.05
0.43 0.2 -0.32 -0.39 -0.22 0.12
0.91 0.46 -0.84 -1.37 -0.79 0.29
0.24 0.22 -0.35 0.21 -0.35 -0.11
0.13 0.2 0.11 -0.2 -0.16 -0.13
0.58 -0.1 -0.51 -0.5 -0.12 0.32
0.88 1.29 -0.53 -1.58 -1.79 -1.37
0.91 1.3 -0.59 -1.57 -1.78 -1.43
0.42 0.13 -0.48 -0.18 -0.11 0.06
-0.04 0.43 -0.01 0.02 -0.18 -0.34
1.13 0.85 -1.24 -1.18 -1.13 -0.52
-0.16 -0.02 0.15 0.07 0.08 -0.17
0.37 0.49 -0.39 -0.14 -0.12 -0.49
1.02 1.1 -1.9 -0.56 -1.91 -0.69
0.38 0.14 -0.36 -0.18 -0.11 0.02
1.76 -1.26 -2.83 -2.34 -1.63 0.62
1.12 0.3 -0.97 -1.02 -0.5 -0.18
0.74 0.81 -0.43 -0.52 -0.38 -1.44
0.43 0.15 -0.28 -0.27 -0.12 -0.04
0.0 0.22 -0.32 -0.04 0.03 0.05
0.36 0.11 -0.26 -0.27 -0.1 0.07
0.23 0.11 -0.43 -0.11 0.06 0.04
0.3 0.2 -0.43 -0.16 -0.18 0.14
0.05 0.35 -0.07 -0.04 -0.19 -0.18
0.18 0.18 -0.31 -0.3 0.0 0.15
0.21 -0.0 -0.11 -0.07 0.0 -0.05
0.2 -0.02 -0.05 0.16 -0.22 -0.11
0.45 0.34 -0.88 -0.4 -0.26 0.3
0.35 0.63 -0.5 -0.24 -0.1 -0.53
0.29 0.31 -0.29 -0.2 -0.17 -0.08
0.3 0.53 -0.84 0.47 -0.54 -0.54
1.19 -0.91 - -0.33 -0.93 0.9
1.34 -0.09 -1.15 -1.19 -0.81 0.1
-0.19 0.79 -0.62 -0.07 -0.36 0.03
1.38 0.6 -0.49 -1.18 -2.02 -1.06
1.12 0.63 -1.15 -1.68 -1.0 0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.