Heatmap: Cluster_143 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02
0.03 0.02 0.04 0.02 0.02 0.01
0.02 0.05 0.32 0.13 0.21 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
13.67 26.72 20.78 21.02 18.73 15.22
0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.07 0.24 0.19 0.07 0.19
0.06 0.0 0.13 0.04 0.0 0.0
2.12 3.68 4.2 3.24 1.99 0.88
0.02 0.06 0.04 0.02 0.04 0.01
0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0
0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0
0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.16 0.11 0.09 0.05 0.09 0.09
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.02 0.04 0.08 0.06 0.03 0.05
0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01
0.97 1.49 1.63 1.47 1.03 1.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.05 0.07 0.12 0.06 0.17 0.18
0.02 0.02 0.04 0.01 0.01 0.02
0.02 0.01 0.01 0.04 0.06 0.04
0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0
0.04 0.02 0.06 0.06 0.04 0.08
0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04
0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.3 0.19 0.31 0.32 0.3 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.03 0.01 0.02 0.03 0.03 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0
0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.09 0.19 0.18 0.09 0.04 0.03
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05
0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01
0.04 0.03 0.0 0.04 0.08 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.09 0.09 0.07 0.05 0.05
0.01 0.01 0.07 0.02 0.0 0.05
0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01
0.07 0.13 0.18 0.16 0.04 0.07
0.04 0.02 0.03 0.0 0.02 0.08
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.22 0.2 0.21 0.19 0.16 0.18
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
1.06 0.54 1.06 0.65 0.64 1.07
0.04 0.04 0.02 0.04 0.29 0.06
0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0
0.12 0.14 0.16 0.16 0.1 0.09
0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0
0.05 0.01 0.02 0.05 0.02 0.0
0.01 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02
1.97 1.78 2.61 2.22 1.68 2.06
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.03 0.04 0.01 0.02 0.02 0.05
0.11 0.12 0.13 0.11 0.15 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
0.09 0.12 0.1 0.07 0.08 0.06
0.0 0.07 0.02 0.02 0.04 0.01
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
1.2 2.12 2.31 1.42 1.25 0.82
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.07 0.01 0.06 0.07 0.06 0.06
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.01 0.09 0.04 0.04 0.01 0.01
0.08 0.15 0.17 0.14 0.06 0.09
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.13 0.2 0.26 0.15 0.12 0.0
0.18 0.16 0.2 0.22 0.18 0.18
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.18 0.22 0.28 0.23 0.16
0.03 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03
0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05
0.62 1.06 1.21 1.13 0.84 0.95
0.09 0.05 0.1 0.08 0.03 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02
0.05 0.11 0.02 0.07 0.13 0.29
0.03 0.06 0.05 0.02 0.02 0.01
0.18 0.31 0.12 0.09 0.25 0.28
0.07 0.12 0.12 0.16 0.03 0.17
0.28 0.31 0.29 0.42 0.4 0.33
0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 0.0
0.03 0.08 0.04 0.14 0.14 0.0
0.07 0.08 0.09 0.11 0.11 0.08
0.04 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01
0.06 0.04 0.03 0.05 0.03 0.04
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01
54.91 62.28 67.79 57.97 54.84 54.49
0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01
0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08
0.11 0.14 0.19 0.13 0.13 0.12
0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0
0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.11 0.11 0.05 0.04 0.04
0.03 0.14 0.12 0.08 0.1 0.03
0.06 0.06 0.0 0.02 0.19 0.14
0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.08 0.07 0.15 0.1 0.13 0.05
0.01 0.04 0.03 0.04 0.02 0.0
0.0 0.06 0.02 0.02 0.05 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01
0.14 0.13 0.12 0.16 0.1 0.13
0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.03 0.0 0.0 0.01 0.04 0.06
0.01 0.08 0.03 0.02 0.0 0.0
0.06 0.04 0.03 0.0 0.03 0.0
0.79 0.68 0.91 0.92 0.86 0.74
0.12 0.0 0.0 0.07 0.04 0.03
0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.01
0.02 0.02 0.06 0.03 0.01 0.01
0.07 0.24 0.3 0.09 0.0 0.07
0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.1 0.09 0.08 0.06 0.1 0.05
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.04
0.85 0.97 0.99 1.11 0.91 0.95
0.0 0.05 0.08 0.04 0.0 0.02
0.04 0.03 0.09 0.05 0.1 0.06
0.01 0.01 0.02 0.06 0.02 0.07
0.0 0.02 0.03 0.02 0.0 0.0
0.09 0.12 0.12 0.07 0.06 0.01
0.15 0.19 0.15 0.19 0.18 0.15
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.06 0.03 0.02 0.02
0.04 0.07 0.08 0.05 0.04 0.05
0.05 0.03 0.07 0.09 0.02 0.05
0.02 0.04 0.03 0.04 0.03 0.0
0.02 0.04 0.0 0.01 0.09 0.02
0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0
0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02
0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01
0.12 0.07 0.01 0.04 0.04 0.08
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02
0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0
0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.04
0.04 0.04 0.07 0.06 0.08 0.04
4.51 5.17 6.12 5.73 4.93 5.38
17.7 21.29 12.22 12.43 14.3 12.3
0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
2.68 2.38 2.42 2.69 2.4 2.4
0.0 0.02 0.05 0.0 0.06 0.01
0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.09
0.23 0.45 0.59 0.4 0.47 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
0.05 0.1 0.15 0.08 0.01 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.04
0.1 0.09 0.14 0.14 0.05 0.05
0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.01
0.03 0.06 0.14 0.21 0.09 0.03
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01
0.67 0.72 0.72 0.94 0.56 0.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.04 0.07 0.05 0.02 0.03
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.13 0.11 0.16 0.14 0.13
2.61 2.14 2.8 2.42 2.3 2.01
0.0 0.22 0.05 0.0 0.03 0.02
0.0 0.15 0.34 0.14 0.0 0.0
0.05 0.05 0.04 0.04 0.02 0.03

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)