Heatmap: Cluster_150 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.25 0.32 -0.1 0.08 -0.44 -0.25
0.08 0.45 0.27 0.17 -0.51 -0.88
-0.07 0.25 0.22 0.22 -0.2 -0.59
1.05 0.15 0.21 0.22 -1.94 -2.13
0.8 0.4 -0.55 0.21 -0.67 -1.08
-0.25 0.18 0.37 0.46 -0.62 -0.5
1.2 0.25 -0.17 -0.02 -2.16 -1.28
2.04 - - - 0.92 -
0.47 -0.22 0.13 0.47 -0.35 -1.0
1.11 0.42 0.13 -0.12 -1.46 -3.0
1.14 0.21 -0.13 0.34 -1.66 -2.84
0.19 -0.13 0.21 0.23 -0.5 -0.13
0.17 0.19 0.05 0.11 -0.39 -0.22
1.47 -0.37 -0.97 -0.01 -1.89 -0.55
1.01 0.2 0.32 -0.27 -0.82 -2.37
0.4 0.19 -0.11 -0.03 -0.25 -0.33
0.05 0.37 0.17 0.11 -0.27 -0.65
0.51 0.6 -0.06 0.47 -1.88 -1.18
1.05 -0.48 -0.64 0.6 -0.58 -1.36
1.24 -0.91 -0.96 -0.44 -0.12 -0.09
0.48 0.66 -0.62 0.72 -1.52 -1.4
-0.2 0.23 0.34 0.35 -0.41 -0.58
0.25 -0.35 -0.37 0.1 0.06 0.18
1.2 -0.14 -1.94 0.32 -0.71 -0.57
0.33 0.23 -0.53 0.15 -0.15 -0.21
0.47 -0.24 0.01 0.14 -0.26 -0.28
-0.18 -0.17 -0.18 0.12 0.22 0.13
1.12 -0.71 -1.6 0.73 -1.23 -0.33
0.99 0.02 -1.33 0.81 -1.22 -1.26
0.29 0.02 -0.69 0.05 0.12 0.03
1.6 1.57 -12.54 - - -
0.09 0.16 -0.02 -0.02 -0.06 -0.17
0.38 0.26 -0.2 0.16 -0.37 -0.43
0.45 0.72 0.21 -0.03 -1.16 -1.29
0.38 0.06 0.13 -0.01 -0.51 -0.2
0.73 -0.5 0.08 0.81 -1.25 -1.33
0.54 -0.27 -0.44 0.58 -0.45 -0.41
0.29 -0.19 -0.19 0.49 0.09 -0.83
0.34 0.1 -0.25 0.16 -0.15 -0.31
0.77 -0.23 -0.06 -0.35 -0.2 -0.27
-0.16 0.08 -0.24 0.33 0.08 -0.17
1.72 - - - 1.44 -
0.01 0.22 0.03 0.01 -0.17 -0.14
0.48 0.3 0.23 -0.07 -0.63 -0.72
0.59 -0.15 0.07 0.65 -2.59 -0.31
0.38 0.47 - 0.92 -0.22 -0.83
0.08 -0.11 0.06 0.18 -0.03 -0.22
0.27 0.31 -0.0 0.32 -0.48 -0.75
0.66 0.1 -0.42 -0.19 -0.32 -0.1
1.11 0.6 -2.23 0.28 -1.22 -1.09
0.97 0.57 0.2 -0.32 -2.6 -1.18
0.63 0.1 0.56 0.44 -1.12 -3.41
0.17 0.3 -0.06 -0.27 -0.15 -0.06
0.45 0.07 -0.48 -0.41 0.02 0.14
0.62 -0.1 -0.09 0.11 -0.45 -0.36
0.6 0.29 -0.02 0.04 -0.67 -0.68
1.56 0.53 0.7 - - -
-0.12 0.56 0.19 0.15 -0.17 -1.08
0.08 0.5 -0.44 0.58 -0.59 -0.68
0.53 -0.08 -0.17 0.4 -0.61 -0.41
0.71 -0.05 -0.64 -0.03 -0.29 -0.06
0.2 0.14 -0.26 -0.04 -0.1 0.01
0.17 0.07 -0.27 -0.15 -0.01 0.14
0.18 0.21 -0.24 -0.21 -0.05 0.05
0.61 0.51 -0.42 0.01 -0.64 -0.62
0.71 0.14 -0.72 0.09 -0.25 -0.43
0.81 -0.25 -0.58 -0.14 -0.33 0.06
0.68 0.18 -0.52 -0.14 -0.44 -0.12
0.25 0.05 -0.6 0.44 -0.03 -0.37
0.57 -0.03 -0.19 0.16 -0.45 -0.3
0.39 1.06 -0.15 -0.57 -1.45 -0.6
1.38 -0.01 -0.94 -0.14 -1.01 -1.06
0.15 0.17 0.0 -0.03 -0.17 -0.17
1.84 0.99 - -7.39 -19.91 -1.23
1.28 -0.45 -1.57 0.33 -0.57 -0.8
-0.08 0.15 -0.25 -0.17 0.28 0.0
0.16 0.15 0.03 0.52 -0.25 -1.08
0.97 -0.07 -0.62 -0.27 -0.44 -0.2
0.25 0.47 -0.19 0.1 -0.45 -0.4
0.75 0.29 -0.29 -0.09 -0.42 -0.74
0.23 0.27 -0.77 0.71 0.1 -1.6
1.18 0.14 -0.85 0.13 -1.35 -0.74
0.1 0.29 0.25 0.04 -0.24 -0.62
0.32 0.27 0.22 0.1 -0.37 -0.88
0.44 -0.03 -0.44 0.05 -0.13 -0.03
0.82 0.15 -0.93 -0.2 -0.26 -0.16
1.83 -0.02 -1.58 -0.99 -1.84 -1.52
0.55 -0.7 -0.62 -0.07 0.12 0.31
0.37 -0.2 -0.45 0.42 -0.25 -0.11
0.4 -0.18 -0.46 0.24 -0.43 0.2
0.01 -0.04 0.03 0.14 0.23 -0.45
0.41 -0.61 -0.56 -0.0 0.16 0.29
-0.35 -1.7 -0.19 0.32 0.67 0.25
0.79 -0.01 -0.23 0.16 -0.59 -0.65
0.62 -0.24 -0.37 0.17 -0.22 -0.21
0.05 -0.02 -0.36 0.13 0.17 -0.04
1.48 -1.11 -0.62 -0.22 -0.73 -0.67
0.35 -0.26 -0.09 -0.06 -0.02 0.01
-0.02 0.39 0.06 0.06 -0.35 -0.26
0.42 -0.6 -0.63 0.11 0.76 -0.8
0.53 -0.15 -0.01 -0.02 -0.46 -0.08
0.21 1.04 -0.33 0.03 -0.98 -1.09
0.33 0.22 -0.27 0.69 -0.78 -0.87
1.71 - - - 1.44 -
0.5 0.57 -0.87 0.32 -0.31 -0.99
0.65 0.1 -0.35 -0.27 -0.19 -0.21
1.51 -0.43 -0.55 0.24 -1.39 -2.71
1.33 -1.62 -0.93 0.38 -0.71 -0.47
0.43 0.64 -2.3 0.3 -0.67 0.04
0.67 0.12 -1.32 1.03 -1.14 -1.21
0.26 0.3 0.05 0.22 -0.2 -0.96
2.02 - -2.86 0.47 -1.28 -
0.45 -0.05 -0.38 -0.33 0.23 -0.11
0.35 0.45 0.12 -0.29 -0.37 -0.54
0.38 0.23 0.23 -0.04 -0.46 -0.63
0.98 -0.26 -0.71 0.31 -0.89 -0.3
1.16 0.17 -1.42 -0.42 -0.68 -0.17
-0.2 0.16 0.52 -0.24 -0.02 -0.42
0.36 1.09 1.21 -1.89 - -
-0.27 0.39 -0.21 0.36 -0.08 -0.38
-0.15 -0.7 -0.47 0.07 0.58 0.29
0.6 0.71 -0.42 0.15 -0.7 -1.43
0.46 0.66 -0.12 -0.11 -0.6 -0.88
0.52 -0.2 -0.29 0.11 -0.17 -0.13
0.38 -0.09 0.27 0.39 -0.78 -0.6
0.38 0.76 0.57 -0.79 -1.07 -1.1
0.06 0.24 0.23 0.13 -0.5 -0.32
0.56 -0.1 -0.05 0.23 -0.13 -0.87
0.77 0.82 0.27 -0.18 -1.27 -5.36
0.55 -0.17 0.05 0.33 -0.4 -0.74
0.4 -0.49 -0.29 0.23 0.04 -0.07
0.52 0.74 -0.8 0.48 -1.24 -1.0
0.61 0.64 -1.19 0.69 -0.99 -1.45
0.53 -0.69 -0.58 0.17 0.06 0.14
0.13 -1.09 0.46 0.33 -0.13 -0.17
0.16 -0.63 0.07 0.38 0.32 -0.65
0.47 -1.37 -0.51 1.18 -0.17 -1.42
0.53 0.9 -1.02 0.57 -1.51 -1.45
0.53 0.22 -0.09 0.15 -0.57 -0.58
0.09 0.38 0.91 -0.31 -1.1 -1.06
1.16 -0.97 -1.61 -0.39 0.22 0.01
0.14 0.22 0.02 0.02 -0.04 -0.43
-0.15 -0.56 -0.19 0.18 0.62 -0.2
0.53 -0.42 -0.34 0.41 -0.25 -0.24
0.92 -0.27 -0.97 0.29 -0.65 -0.12
0.18 0.67 0.19 -0.02 -0.86 -0.74
0.54 0.12 -0.17 -0.11 -0.29 -0.28
1.25 -0.6 -1.22 0.64 -1.15 -0.91
0.53 0.76 -0.08 0.27 -1.28 -1.71
0.53 -0.1 -0.43 0.8 -0.69 -0.94
0.28 0.42 0.01 -0.29 -0.31 -0.29
1.2 0.28 -0.01 -0.18 -2.48 -1.22
0.42 0.83 0.59 -0.49 -1.74 -1.4
0.08 0.58 0.13 -0.11 -0.28 -0.73
2.58 - - - - -
0.85 0.6 -0.44 -0.12 -1.12 -0.82
0.15 0.11 0.33 0.36 -0.05 -1.73
0.72 0.49 -0.14 -0.28 -0.84 -0.61
1.04 0.11 -1.79 0.16 -0.84 -0.15
0.71 -0.15 -0.89 -0.09 -0.29 0.21
-0.17 0.54 0.25 0.23 -0.6 -0.64
0.54 -0.18 -0.17 0.14 -0.03 -0.54
0.28 -0.37 -0.58 -0.04 0.46 -0.0
0.06 0.27 -0.57 0.44 -0.18 -0.25
0.59 -0.28 -0.57 -0.13 0.08 0.05
0.86 0.67 -0.66 -0.13 -1.01 -0.89
0.35 0.37 -0.71 0.47 -0.2 -0.82
- 1.51 1.66 - - -
0.2 0.01 0.3 0.14 -0.41 -0.41
0.26 -0.19 -0.47 -0.13 0.21 0.19
0.59 0.23 -1.25 0.28 -0.29 -0.2
1.25 -0.33 -1.68 -0.59 -0.48 0.18
0.04 0.11 0.27 0.26 -0.23 -0.66
0.6 -0.65 -1.35 0.45 0.43 -0.43
-0.08 0.56 0.09 0.17 -0.28 -0.81
0.53 0.33 - 0.43 0.96 -
1.72 - - - 1.44 -
0.33 0.53 -1.93 -0.95 1.03 -1.05
0.81 -0.32 0.05 0.2 -0.71 -0.62
1.58 -0.61 -2.46 -0.62 -0.97 0.03
0.35 0.78 -0.46 -0.27 -0.15 -0.86
0.46 -0.64 -0.33 0.36 0.12 -0.29
0.28 0.35 -0.79 0.31 0.1 -0.7
0.73 -1.08 -0.46 0.53 0.05 -0.58
0.69 0.14 -0.13 0.38 -0.86 -0.95
0.71 0.43 -0.45 -0.2 -0.53 -0.47
0.34 -0.19 -0.02 0.22 -0.17 -0.29
-0.17 -1.36 -0.77 0.57 0.61 0.17
0.12 0.06 0.01 0.03 -0.11 -0.13
0.52 0.04 -0.54 1.09 -1.18 -1.79
0.61 -0.09 -0.52 -0.41 0.0 0.11
0.86 -0.12 -0.67 0.12 -0.34 -0.38
0.88 0.23 0.05 0.28 -1.44 -1.46
0.38 0.43 -0.06 0.29 -0.59 -0.99
0.39 0.12 -0.03 -0.12 -0.08 -0.4
0.22 0.25 -0.13 -0.25 -0.21 0.04
0.13 0.46 0.54 0.08 -0.78 -1.2
0.53 0.22 0.21 -0.06 -0.55 -0.75
-0.15 0.28 0.38 0.1 -0.21 -0.6
1.46 -1.77 -1.19 1.33 - -
0.77 0.33 -0.18 -0.07 -0.66 -0.82
0.3 -0.19 0.33 0.09 -0.45 -0.26
-0.15 0.04 -0.72 0.32 0.22 0.06
0.26 0.21 0.63 0.24 -0.44 -2.44

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.