Heatmap: Cluster_52 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
3.77 5.08 4.59 3.58 3.99 3.99
3.41 3.9 2.14 2.53 2.64 4.16
4.09 3.97 4.95 5.46 5.28 5.33
12.27 8.76 6.88 7.42 10.78 14.23
12.68 14.23 10.75 11.02 11.67 12.08
184.1 174.61 181.81 177.73 174.24 184.83
0.14 0.14 0.1 0.18 0.19 0.14
0.4 0.69 0.98 0.7 0.38 0.37
0.08 0.06 0.11 0.08 0.07 0.08
0.12 0.13 0.15 0.13 0.15 0.18
1.07 0.88 0.84 0.94 1.07 1.14
1.32 1.03 1.19 1.43 1.38 1.37
0.05 0.05 0.05 0.07 0.05 0.05
0.15 0.16 0.18 0.17 0.21 0.15
1.39 0.75 1.03 1.46 1.74 1.51
14.42 11.27 13.25 13.06 12.98 13.64
0.77 1.07 0.42 0.29 1.18 0.69
0.94 0.89 0.93 1.04 0.9 1.01
0.35 0.44 0.43 0.44 0.24 0.2
17.79 18.02 16.47 15.71 16.49 15.42
10.13 10.54 8.13 8.85 9.21 9.12
323.32 314.31 340.48 360.43 359.1 318.19
0.63 0.46 0.54 0.73 0.72 0.8
0.06 0.09 0.08 0.1 0.15 0.12
3.26 3.02 1.3 1.68 4.3 4.63
0.43 0.51 0.19 0.13 0.58 0.28
0.04 0.03 0.03 0.03 0.05 0.05
0.39 0.43 0.51 0.65 0.25 0.29
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
0.19 0.29 0.22 0.21 0.3 0.24
0.19 0.3 0.45 0.37 0.33 0.35
0.1 0.0 0.09 0.04 0.2 0.17
0.15 0.12 0.11 0.15 0.15 0.2
0.06 0.1 0.1 0.1 0.04 0.05
0.22 0.28 0.33 0.38 0.43 0.45
0.02 0.03 0.01 0.02 0.03 0.05
0.06 0.1 0.09 0.08 0.14 0.08
0.42 0.16 0.24 0.5 1.16 1.4
214.79 209.56 185.81 201.8 211.96 194.23
1.14 1.5 1.85 1.73 1.07 1.12
0.88 0.66 0.95 0.76 0.93 0.73
6.69 1.92 6.47 6.94 9.87 9.64
1.64 1.41 1.97 2.07 2.38 1.93
0.51 0.91 2.17 1.52 0.86 0.54
0.38 0.39 0.39 0.45 0.34 0.31
1.33 1.44 1.86 2.11 2.33 1.95
0.82 0.87 1.37 1.21 0.83 1.19
0.29 0.31 0.11 0.12 0.33 0.42
1.64 2.12 2.39 1.7 1.67 1.42
0.02 0.02 0.04 0.04 0.02 0.02
17.14 13.33 17.97 14.8 19.44 22.29
0.22 0.65 0.65 0.42 0.32 0.31
0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02
7.4 7.83 7.67 6.54 10.35 8.78
25.73 25.12 22.35 24.05 25.91 28.32
0.33 0.62 0.74 0.56 0.52 0.41
0.24 0.24 0.23 0.37 0.34 0.3
1.38 1.7 1.73 2.29 2.44 1.95
59.96 50.63 40.62 47.6 43.88 41.75
0.26 0.34 0.33 0.44 0.42 0.36
0.82 0.45 0.59 1.14 1.95 2.38
3.42 2.2 2.9 2.55 2.99 3.45
0.95 0.54 0.64 0.59 0.55 0.59
0.11 0.11 0.13 0.13 0.12 0.13
12.82 10.31 8.84 9.02 10.76 9.95
8.11 6.69 7.24 8.36 10.96 13.54
3.95 3.97 3.96 3.91 3.75 4.18
0.26 0.26 0.13 0.15 0.19 0.17
1.0 1.51 1.61 1.54 1.17 0.63
0.09 0.1 0.15 0.11 0.15 0.15
0.75 0.55 0.37 0.47 0.76 0.71
1.31 1.79 1.46 1.18 0.81 0.9
0.66 0.64 0.78 0.85 0.68 0.7
0.32 0.63 0.66 0.48 0.42 0.43
2.53 1.91 1.6 1.92 1.66 1.59
5.67 4.86 5.67 4.1 5.15 7.23
0.32 0.26 0.36 0.33 0.31 0.27
4.98 5.0 6.2 7.04 6.84 8.26
0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02
0.42 0.23 0.15 0.16 0.31 0.24
7.53 6.36 2.68 3.94 6.25 6.08
162.42 152.71 162.33 163.14 159.82 155.25
15.32 14.26 16.66 17.18 22.76 22.25
0.08 0.06 0.1 0.07 0.08 0.06
0.83 0.63 0.78 0.88 0.92 1.02
0.81 1.11 1.0 0.74 0.31 0.48
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
226.55 210.51 196.14 193.66 223.71 213.92
0.07 0.1 0.12 0.24 0.3 0.21
2.29 1.75 2.23 2.73 1.96 1.85
0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
1.38 1.13 0.97 1.22 1.24 1.15
0.13 0.14 0.07 0.08 0.08 0.07
2.83 2.6 2.87 2.98 3.39 3.33
0.03 0.07 0.07 0.06 0.06 0.04
6.53 7.5 3.68 5.77 7.62 8.52
0.15 0.08 0.12 0.0 0.0 0.0
1.45 1.31 1.15 1.06 1.25 1.29
28.27 24.98 26.14 25.89 27.51 28.7
0.08 0.04 0.03 0.21 0.26 0.17
0.04 0.06 0.08 0.08 0.06 0.06
7.69 2.14 4.9 7.29 10.43 11.9
0.14 0.17 0.15 0.16 0.13 0.14
5.56 6.24 6.15 6.27 5.94 4.77
0.25 0.16 0.15 0.21 0.12 0.22
0.38 0.28 0.28 0.34 0.49 0.54
11.6 7.26 12.01 15.36 15.58 18.8
11.24 10.28 11.46 11.49 12.29 13.17
0.69 0.26 0.59 0.81 0.92 1.23
4.92 4.29 4.26 3.65 4.19 5.98
56.91 54.12 52.85 55.55 59.38 59.04
0.11 0.1 0.18 0.09 0.07 0.08
2.06 1.62 2.5 2.04 2.1 1.7
4.7 4.32 5.07 5.74 5.34 6.08
0.15 0.25 0.25 0.21 0.28 0.49
0.14 0.1 0.15 0.22 0.15 0.22
0.34 0.3 0.36 0.42 0.31 0.21
0.95 0.86 1.13 1.09 1.37 1.48
0.2 0.2 0.25 0.37 0.3 0.35
0.32 0.26 0.28 0.25 0.14 0.12
0.03 0.02 0.03 0.01 0.04 0.04
0.27 0.35 0.33 0.26 0.24 0.34
3.2 2.78 2.05 1.88 2.81 3.29
0.04 0.04 0.05 0.03 0.08 0.06
3.26 2.08 1.82 2.58 3.28 3.48
2.88 3.76 2.76 3.01 2.97 2.71
0.16 0.2 0.26 0.24 0.2 0.17
0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
1.16 0.87 0.51 0.45 1.03 1.35
0.13 0.08 0.03 0.04 0.1 0.09
0.6 0.75 1.1 0.83 0.91 0.93
1.73 1.84 1.54 1.69 2.26 2.36
0.08 0.08 0.03 0.07 0.08 0.12
0.27 0.22 0.26 0.3 0.41 0.31
0.21 0.11 0.13 0.14 0.23 0.29
5.06 4.4 4.76 4.94 7.57 8.07
0.65 0.51 0.64 0.68 0.74 0.72
0.2 0.42 0.29 0.24 0.33 0.43
0.48 1.33 0.97 1.06 0.91 0.54
0.19 0.27 0.22 0.16 0.12 0.33
1.2 1.34 1.25 1.3 1.13 1.54
16.76 12.72 12.97 19.69 19.76 16.74
0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01
0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02
1.51 1.17 1.37 2.03 1.88 1.74
0.24 0.15 0.26 0.29 0.14 0.26
0.02 0.03 0.03 0.01 0.02 0.03
1.75 2.16 2.43 2.55 2.02 1.83
4.08 4.09 4.26 4.33 4.0 3.89
0.32 0.49 0.34 0.17 0.59 0.58
1.02 0.77 0.91 0.97 1.26 1.11
0.11 0.15 0.21 0.17 0.08 0.1
0.06 0.01 0.06 0.06 0.01 0.09
5.18 6.47 5.38 5.95 7.49 5.65
49.26 45.59 48.22 47.25 51.72 56.62
2.67 1.93 2.6 3.11 4.26 4.49
0.17 0.16 0.1 0.07 0.16 0.15
18.53 22.99 23.27 21.81 18.56 15.87
0.1 0.15 0.16 0.29 0.29 0.28
38.9 35.69 35.64 37.9 36.61 36.11
0.02 0.02 0.05 0.03 0.07 0.08
2.24 1.37 1.87 2.57 2.92 3.49
0.09 0.12 0.1 0.1 0.06 0.17
14.99 12.52 11.07 13.01 13.88 12.61
0.65 0.91 0.81 1.03 1.33 1.44
0.38 0.88 1.04 0.92 0.62 0.6
1.74 2.47 2.56 3.51 3.64 2.75
0.09 0.03 0.05 0.02 0.09 0.13
5.65 5.95 6.36 6.18 6.22 5.3
0.47 0.52 0.61 0.41 0.36 0.2
0.86 0.89 0.71 0.76 0.77 0.98
0.41 0.46 0.17 0.18 0.48 0.24
0.12 0.15 0.03 0.02 0.2 0.27
0.46 0.51 0.59 0.51 0.49 0.38
0.05 0.07 0.1 0.07 0.07 0.09
0.98 1.28 0.58 0.56 1.41 0.88
6.86 6.79 8.44 12.37 12.93 11.89
2.86 4.02 1.57 1.0 5.4 5.64
0.7 0.94 1.13 0.8 0.76 0.83
5.84 3.59 3.61 4.75 6.62 8.2
0.21 0.26 0.15 0.22 0.37 0.29
0.35 0.38 0.34 0.18 0.26 0.19
0.28 0.27 0.11 0.29 0.29 0.32
0.27 0.1 0.18 0.23 0.17 0.15
0.3 0.33 0.24 0.27 0.34 0.29
0.97 1.33 1.26 0.96 0.7 0.57
1.99 1.75 1.92 2.38 2.48 2.56
2.07 1.88 2.06 3.34 3.75 3.56
0.05 0.05 0.0 0.02 0.03 0.07
0.03 0.02 0.01 0.01 0.05 0.06

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)