Heatmap: Cluster_23 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	3 h after light	7 h after light	11 h after light	2 h after dark	6 h after dark	10 h after dark
PSME_00000854-RA	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01
PSME_00001093-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00004162-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04
PSME_00004276-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00005108-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00005619-RA	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02
PSME_00005773-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00005852-RA	0.0	0.0	0.04	0.05	0.05	0.02
PSME_00006335-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00006474-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00006824-RA	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01
PSME_00007149-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00008857-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00009651-RA	0.03	0.0	0.08	0.0	0.01	0.04
PSME_00010015-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00010296-RA	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
PSME_00010554-RA	0.02	0.01	0.03	0.03	0.08	0.04
PSME_00010965-RA	0.04	0.08	0.05	0.06	0.12	0.08
PSME_00011327-RA	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.03
PSME_00011807-RA	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.02
PSME_00011869-RA	0.01	0.01	0.04	0.02	0.0	0.03
PSME_00012083-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00012163-RA	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02
PSME_00012980-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00013381-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00013647-RA	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03
PSME_00013889-RA	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01
PSME_00014319-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00014473-RA	0.04	0.01	0.07	0.05	0.03	0.04
PSME_00015833-RA	0.04	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03
PSME_00016958-RA	0.04	0.03	0.04	0.06	0.08	0.03
PSME_00018902-RA	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.05
PSME_00019676-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00020121-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
PSME_00020545-RA	0.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01
PSME_00020586-RA	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01
PSME_00020681-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00020944-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00021054-RA	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01
PSME_00021267-RA	0.0	0.02	0.02	0.01	0.09	0.04
PSME_00022027-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00022510-RA	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01
PSME_00024557-RA	0.06	0.02	0.1	0.03	0.05	0.07
PSME_00024622-RA	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01
PSME_00025137-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00025482-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00025548-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00025809-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
PSME_00025833-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00026719-RA	0.07	0.04	0.05	0.0	0.06	0.0
PSME_00027202-RA	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01
PSME_00027604-RA	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
PSME_00029441-RA	0.02	0.0	0.02	0.01	0.02	0.01
PSME_00029649-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00029987-RA	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
PSME_00030418-RA	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.05
PSME_00030924-RA	0.0	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02
PSME_00031072-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00031475-RA	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
PSME_00031488-RA	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.03
PSME_00031843-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00031848-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
PSME_00032216-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00032273-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00032780-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00032869-RA	0.04	0.04	0.02	0.06	0.03	0.03
PSME_00032980-RA	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
PSME_00033324-RA	0.01	0.0	0.05	0.01	0.04	0.03
PSME_00033797-RA	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0
PSME_00033970-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00034030-RA	0.01	0.0	0.02	0.05	0.0	0.0
PSME_00035733-RA	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
PSME_00036570-RA	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
PSME_00036698-RA	0.0	0.0	0.21	0.41	0.0	0.41
PSME_00037001-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00037225-RA	0.05	0.03	0.08	0.0	0.03	0.14
PSME_00037760-RA	0.0	0.0	0.03	0.04	0.0	0.02
PSME_00038107-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00038790-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
PSME_00038993-RA	1.17	1.67	1.33	1.24	1.77	1.52
PSME_00039755-RA	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.03
PSME_00039817-RA	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
PSME_00039836-RA	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05
PSME_00040801-RA	0.24	0.24	0.26	0.21	0.13	0.23
PSME_00041148-RA	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0
PSME_00041716-RA	0.12	0.1	0.09	0.13	0.2	0.15
PSME_00041822-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03
PSME_00041861-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00043458-RA	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
PSME_00043758-RA	0.0	0.02	0.0	0.0	0.04	0.04
PSME_00044317-RA	0.02	0.01	0.03	0.0	0.0	0.03
PSME_00045238-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00045314-RA	0.0	0.05	0.05	0.13	0.1	0.03
PSME_00045801-RA	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.11
PSME_00045803-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00046249-RA	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01
PSME_00048481-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
PSME_00048652-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03
PSME_00048752-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03
PSME_00049533-RA	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03
PSME_00049900-RA	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.04
PSME_00049912-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00050077-RA	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.03
PSME_00050098-RA	0.0	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04
PSME_00050374-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01
PSME_00052135-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00052576-RA	0.03	0.07	0.03	0.02	0.12	0.08
PSME_00052687-RA	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00052754-RA	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
PSME_00052870-RA	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02
PSME_00052963-RA	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00053014-RA	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01
PSME_00053946-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00054202-RA	0.0	0.01	0.02	0.06	0.04	0.03
PSME_00054280-RA	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.04
PSME_00054493-RA	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00054767-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00054864-RA	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01
PSME_00055123-RA	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02
PSME_00055298-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00055304-RA	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00055747-RA	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0
PSME_00055839-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00055974-RA	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)