Heatmap: Cluster_17 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.03 0.01 0.01 0.02 -0.02 -0.04
-0.04 -0.06 0.05 0.05 -0.0 -0.0
-0.25 -0.2 0.13 0.19 -0.01 0.09
0.01 -0.18 0.03 0.12 0.03 -0.03
-0.2 -0.27 0.1 0.29 -0.01 0.02
-0.32 0.2 0.17 0.04 0.03 -0.19
-0.02 -0.14 0.02 0.1 -0.04 0.07
-0.04 -0.06 0.1 0.08 0.0 -0.09
-0.06 -0.01 0.12 0.04 -0.23 0.11
0.12 -0.01 -0.02 0.1 -0.01 -0.2
0.03 -0.06 0.05 0.19 -0.01 -0.23
0.08 -0.02 0.0 0.02 -0.03 -0.05
-0.04 -0.04 0.05 0.09 0.01 -0.08
0.05 -0.09 0.07 0.2 -0.02 -0.23
-0.08 -0.2 0.02 0.12 0.06 0.06
-0.11 -0.08 0.13 0.14 -0.03 -0.06
0.13 -0.14 -0.06 0.04 0.02 -0.0
-0.0 -0.13 0.08 0.11 -0.1 0.02
-0.09 -0.2 0.13 0.16 0.03 -0.07
-0.01 -0.09 0.01 0.05 -0.0 0.03
-0.14 -0.0 0.16 0.23 -0.13 -0.17
-0.0 -0.17 0.08 0.12 0.02 -0.07
0.06 0.06 0.06 0.07 -0.04 -0.23
0.1 -0.1 -0.02 0.09 0.01 -0.1
-0.13 0.08 -0.03 0.16 -0.35 0.2
-0.12 -0.31 0.05 0.15 0.07 0.11
-0.05 -0.16 0.01 0.02 0.08 0.09
-0.14 -0.23 -0.06 0.07 0.09 0.21
-0.08 -0.12 0.0 0.19 0.01 -0.02
-0.04 -0.2 0.04 0.19 -0.02 0.0
-0.05 -0.14 0.07 0.1 0.03 -0.03
-0.15 -0.3 0.14 0.33 -0.07 -0.05
0.12 -0.17 -0.02 0.15 -0.02 -0.09
-0.03 -0.07 0.02 0.12 -0.01 -0.03
-0.02 -0.07 0.1 0.07 0.0 -0.08
0.13 -0.13 -0.07 -0.03 0.0 0.08
-0.16 -0.65 -0.06 0.42 0.17 0.07
-0.09 -0.03 0.09 0.08 -0.08 0.02
0.03 -0.12 -0.01 0.11 0.04 -0.06
0.05 -0.13 -0.05 0.02 0.08 0.02
-0.08 -0.14 -0.01 0.19 -0.03 0.05
0.02 -0.06 -0.09 0.1 -0.03 0.05
-0.24 -0.21 0.17 0.22 -0.06 0.06
0.07 -0.06 0.01 0.08 -0.0 -0.1
0.02 -0.06 -0.02 0.11 0.02 -0.07
-0.09 -0.15 0.09 0.25 -0.02 -0.12
-0.0 -0.15 -0.06 0.07 0.05 0.08
0.02 -0.14 0.01 0.09 -0.02 0.03
-0.15 -0.19 0.29 0.17 -0.19 0.0
-0.02 -0.17 0.01 0.11 0.04 0.02
0.1 -0.06 -0.03 0.06 0.04 -0.11
-0.19 -0.08 0.17 0.19 -0.05 -0.08
-0.07 -0.27 -0.06 0.3 -0.13 0.15
-0.02 -0.14 0.06 -0.01 0.05 0.05
-0.27 -0.32 0.21 0.35 0.06 -0.15
-0.0 -0.08 0.02 0.05 -0.0 0.01
0.01 -0.13 -0.03 0.07 0.06 0.0
-0.03 -0.05 0.11 0.15 0.0 -0.22
-0.04 -0.01 0.08 0.18 -0.05 -0.18
0.02 -0.1 -0.05 0.01 0.03 0.09
-0.05 -0.07 0.11 0.09 -0.06 -0.03
0.02 -0.22 -0.02 0.18 0.1 -0.1
0.01 -0.06 0.09 0.08 -0.1 -0.02
0.03 -0.17 0.0 0.14 0.09 -0.11
0.05 -0.03 -0.03 -0.01 0.01 0.01
-0.06 -0.13 0.09 0.1 0.01 -0.02
0.01 0.08 -0.05 -0.11 -0.06 0.12
0.03 -0.08 0.05 0.09 -0.04 -0.06
-0.33 -0.02 -0.13 0.34 -0.15 0.19
0.13 -0.26 0.06 0.14 0.07 -0.19
-0.04 -0.11 0.1 0.07 0.04 -0.07
-0.0 -0.19 -0.06 0.07 0.07 0.1
0.02 -0.08 -0.07 0.08 0.02 0.03
-0.08 -0.09 0.15 0.08 -0.03 -0.04
-0.11 -0.0 -0.04 0.19 -0.05 -0.01
0.08 -0.16 -0.07 0.13 0.06 -0.06
-0.2 -0.16 0.16 0.19 0.09 -0.13
0.07 -0.13 0.02 0.09 -0.03 -0.03
-0.1 0.02 0.15 0.09 -0.13 -0.07
0.1 -0.21 0.06 0.12 0.04 -0.15
0.02 -0.2 0.1 0.25 -0.07 -0.16
-0.14 -0.24 0.04 0.3 0.06 -0.09
-0.11 -0.22 0.14 0.25 -0.01 -0.1
0.03 0.05 0.07 0.02 -0.12 -0.06
-0.0 -0.12 0.04 0.15 -0.04 -0.04
0.03 -0.07 0.01 0.13 -0.03 -0.07
0.02 -0.02 -0.07 0.02 0.04 0.01
-0.09 -0.13 0.16 -0.08 0.07 0.03
0.05 -0.26 0.21 0.15 -0.06 -0.14
-0.02 -0.05 0.1 0.04 -0.04 -0.03
0.05 -0.25 -0.05 0.12 -0.03 0.13
0.26 -0.02 -0.06 -0.33 -0.05 0.12
-0.28 0.0 -0.02 0.15 -0.07 0.17
-0.07 -0.36 0.03 0.33 0.16 -0.19
-0.15 -0.35 0.06 0.19 0.01 0.16
-0.07 -0.07 0.1 0.12 0.0 -0.1
0.05 -0.1 0.06 0.09 0.02 -0.14
-0.22 0.1 0.19 0.1 -0.13 -0.1
0.01 -0.1 -0.01 0.1 -0.0 0.0
-0.27 -0.14 0.17 0.25 -0.01 -0.05
0.03 -0.18 -0.13 0.05 0.09 0.11
-0.07 -0.13 0.13 0.16 -0.07 -0.05
-0.36 -0.06 0.21 0.27 -0.06 -0.09
-0.14 -0.07 0.14 0.15 -0.05 -0.06
-0.35 -0.35 -0.14 0.49 0.14 0.01
-0.09 -0.05 0.05 0.06 0.05 -0.03
-0.21 -0.02 0.18 0.18 0.0 -0.19
-0.15 -0.31 0.3 0.21 -0.07 -0.08
-0.06 -0.05 0.14 0.07 -0.05 -0.07
0.01 0.07 0.01 0.07 -0.01 -0.15
-0.16 0.16 0.06 0.15 -0.02 -0.24
-0.04 0.01 0.0 -0.06 0.08 0.01
-0.17 -0.32 0.27 0.17 -0.03 0.01
-0.15 -0.12 0.1 0.19 -0.07 0.01
-0.01 -0.11 0.11 0.18 -0.08 -0.13
0.03 0.01 0.09 0.01 -0.05 -0.1
0.06 -0.04 -0.06 0.09 -0.06 0.0
-0.06 -0.35 -0.26 0.33 0.24 -0.03
0.0 -0.27 0.02 0.2 0.02 -0.01
-0.26 -0.21 0.1 0.12 -0.01 0.2
-0.07 -0.27 0.12 0.22 0.14 -0.19
0.04 -0.01 -0.02 0.03 0.02 -0.06
-0.0 -0.16 0.01 0.2 0.08 -0.16
-0.27 -0.27 0.11 0.19 -0.0 0.17
0.02 -0.05 -0.06 0.07 0.01 0.02
-0.04 -0.12 -0.19 0.16 -0.03 0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.