1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_12 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.99 1.24 1.53 1.47 1.12 1.1
0.86 1.76 2.29 2.31 1.05 0.74
0.15 0.28 0.37 0.29 0.28 0.22
5.22 4.86 3.84 4.55 4.36 5.22
0.1 0.09 0.04 0.09 0.07 0.15
0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01
6.15 3.48 3.5 3.87 6.78 7.95
0.03 0.01 0.02 0.04 0.0 0.02
1.2 0.86 0.88 1.06 1.65 1.89
0.45 0.41 0.33 0.43 0.19 0.16
1.32 1.52 1.25 1.68 1.21 1.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.74 0.44 0.56 0.8 0.97 1.02
17.35 15.7 20.61 20.1 18.06 16.38
12.6 14.46 12.97 14.11 13.31 12.88
0.98 0.87 0.88 0.64 0.37 0.73
8.91 7.36 8.41 9.44 8.71 8.43
3.65 26.25 32.68 20.93 11.9 6.64
3.54 2.14 2.22 2.64 3.04 2.86
0.41 0.56 0.79 0.72 0.61 0.58
1.89 2.64 2.39 2.69 2.19 1.72
0.05 0.14 0.32 0.16 0.08 0.19
0.86 1.4 1.02 1.06 1.03 1.0
0.07 0.08 0.09 0.08 0.11 0.06
0.3 0.41 0.45 0.24 0.43 0.32
0.89 0.97 0.87 1.38 1.03 1.06
0.03 0.12 0.06 0.01 0.06 0.04
0.03 0.03 0.01 0.02 0.0 0.01
0.03 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02
0.05 0.14 0.07 0.1 0.03 0.03
0.04 0.1 0.03 0.09 0.01 0.03
1.43 1.61 0.91 1.11 0.97 0.73
0.45 0.45 0.57 0.73 0.74 0.98
5.03 2.68 2.73 3.09 5.62 6.47
0.98 1.07 0.6 0.91 0.59 0.62
1.33 0.81 0.87 0.97 1.54 1.32
0.35 0.22 0.26 0.33 0.55 0.6
0.51 0.19 0.33 0.49 0.81 0.86
0.07 0.06 0.11 0.07 0.06 0.07
0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01
0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.85 0.51 1.18 1.89 2.22 2.52
0.1 0.17 0.07 0.17 0.04 0.09
0.94 0.77 0.74 0.74 0.98 0.85
12.93 13.69 12.32 17.37 15.99 11.5
8.69 9.9 8.48 8.89 8.39 8.83
0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01
0.72 1.49 1.88 1.12 0.66 0.64
0.36 1.36 1.69 0.71 0.52 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.55 0.28 0.25 0.28 0.52 0.71
0.07 0.03 0.07 0.08 0.09 0.1
163.85 160.07 152.64 162.84 185.36 194.38
5.51 4.37 5.39 5.73 5.58 5.61
2.0 1.76 1.64 1.93 1.96 1.77
0.2 0.14 0.13 0.19 0.16 0.15
0.44 0.25 0.74 1.18 1.12 1.14
5.15 4.21 4.18 5.94 4.91 4.51
0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0
0.27 0.39 0.32 0.34 0.3 0.23
23.93 16.52 15.68 24.47 12.5 16.62
0.11 0.06 0.04 0.07 0.06 0.06
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.16 0.07 0.05 0.07 0.1 0.14
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.34 0.25 0.27 0.33 0.38 0.38
0.0 0.07 0.04 0.07 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.39 2.17 2.19 1.75 1.56 1.38
0.26 0.21 0.21 0.2 0.19 0.22
6.24 11.76 11.47 16.3 11.24 7.87
0.05 0.03 0.1 0.08 0.05 0.1
0.05 0.0 0.01 0.03 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.22 0.23 0.2 0.14 0.18
0.24 0.19 0.07 0.09 0.1 0.1
1.13 0.71 0.65 0.7 1.28 1.39
0.09 0.15 0.05 0.11 0.07 0.07
0.14 0.23 0.31 0.26 0.13 0.12
1.0 0.93 1.18 1.01 0.85 0.8
0.33 0.22 0.25 0.3 0.36 0.31
0.05 0.07 0.11 0.09 0.07 0.09
0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0
1.68 1.66 1.71 1.74 1.35 1.68
10.97 11.37 12.22 12.02 10.8 9.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.22 1.3 1.7 1.7 1.69 1.03
0.38 0.17 0.28 0.44 0.12 0.2
0.04 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01
7.17 4.63 5.37 9.73 10.09 8.17
0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02
0.97 1.4 1.27 1.04 0.85 0.87
0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.88 0.95 1.07 0.79 0.85 0.66
14.48 12.93 13.92 14.48 16.35 18.32
5.51 5.53 4.13 4.37 4.0 4.35
138.86 134.62 136.83 138.65 131.17 120.81
6.49 6.59 7.13 7.45 8.45 7.46
0.38 0.37 0.38 0.35 0.4 0.42
0.58 0.74 0.62 0.7 0.74 0.61
2.94 1.53 1.97 2.69 4.95 4.57
0.05 0.1 0.13 0.16 0.2 0.06
0.99 1.11 1.66 1.67 1.35 1.01
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.02 0.01 0.04 0.04 0.01 0.02
3.61 2.5 2.92 5.15 2.68 4.99
6.22 4.22 4.59 8.79 4.83 7.48
6.7 5.95 8.33 7.5 7.73 6.74
31.58 34.79 34.97 28.83 39.98 37.83
1.5 1.52 1.62 2.22 1.53 1.94
0.18 0.13 0.08 0.15 0.19 0.13
302.23 261.79 271.14 269.87 315.39 304.58
0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.02
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.16 0.11 0.12 0.09 0.11
2.59 1.42 2.02 1.9 2.54 3.57
0.01 0.04 0.0 0.03 0.01 0.0
19.8 14.55 18.95 24.5 25.5 24.52
0.01 0.03 0.07 0.02 0.02 0.03
1.17 1.68 1.65 1.48 1.28 1.16
0.14 0.3 0.23 0.25 0.12 0.05
0.11 0.09 0.14 0.17 0.2 0.25
0.54 0.53 0.55 0.7 0.57 0.47
0.3 0.31 0.4 0.43 0.5 0.38
1.47 1.19 1.48 1.2 1.55 1.41
0.09 0.08 0.26 0.4 0.56 0.23
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06
2.62 2.91 3.31 3.56 2.86 2.91
0.37 0.41 0.38 0.9 0.46 0.34
0.6 3.2 1.58 0.97 0.61 0.28
29.79 30.3 26.94 25.83 26.42 28.15
0.01 0.05 0.05 0.04 0.0 0.01
1.11 1.83 1.37 1.32 1.05 1.34
2.51 4.55 4.54 3.14 2.98 1.66
1.83 1.66 1.52 1.57 1.48 1.56
0.81 0.66 0.78 0.79 0.61 0.7
0.36 0.28 0.37 0.35 0.47 0.35
0.31 0.31 0.2 0.51 0.51 0.7
3.93 3.31 3.15 6.31 3.0 5.11
0.09 0.14 0.21 0.17 0.21 0.2
0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01
0.52 0.45 0.58 0.72 0.57 0.69
0.23 0.14 0.11 0.13 0.07 0.09
13.59 10.8 11.28 11.03 14.75 13.85
0.08 0.09 0.14 0.07 0.22 0.22
0.36 0.29 0.26 0.27 0.3 0.3
69.01 57.63 73.81 82.39 87.94 83.98
0.11 0.27 0.49 0.45 0.31 0.27
5.37 7.21 7.48 5.9 5.68 5.05
11.85 10.61 12.4 12.07 10.76 8.49
2.54 2.52 2.48 2.92 3.0 3.18
0.32 0.19 0.36 0.62 0.66 0.38
129.57 224.57 207.07 163.82 126.23 125.35
0.56 0.3 0.16 0.28 0.46 0.38
0.3 0.31 0.38 0.38 0.27 0.31
0.01 0.04 0.01 0.07 0.0 0.0
0.17 0.26 0.33 0.38 0.22 0.18
2.97 2.37 4.01 2.71 5.02 4.67
0.36 1.14 1.15 0.93 0.29 0.26
14.47 8.73 10.26 12.93 17.99 17.19
1.28 1.09 1.1 1.01 1.15 1.68
1.43 1.63 2.53 3.28 2.09 1.75
1.02 0.45 1.15 2.43 1.15 1.56
0.18 0.21 0.38 0.33 0.23 0.31
0.13 0.2 0.13 0.18 0.19 0.17
0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
3.75 4.27 4.13 4.14 4.63 5.16
0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.02
0.82 1.09 1.28 1.08 0.88 0.87
0.11 0.18 0.14 0.21 0.1 0.13
0.23 0.12 0.12 0.13 0.2 0.22
0.09 0.08 0.1 0.16 0.2 0.17
29.02 33.75 25.65 31.42 34.97 30.64
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.01 0.06 0.07 0.04 0.01 0.01
0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02
0.1 0.11 0.11 0.12 0.13 0.13
0.05 0.01 0.04 0.03 0.05 0.05
1.1 1.4 1.58 1.38 1.84 1.39
0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
6.96 5.35 10.3 7.28 13.28 12.07
0.02 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0
0.27 0.32 0.44 0.46 0.45 0.5
0.06 0.1 0.1 0.12 0.12 0.11
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.14 0.28 0.12 0.18 0.02 0.03
0.12 0.16 0.07 0.06 0.11 0.03
0.01 0.08 0.04 0.07 0.05 0.02
0.09 0.12 0.08 0.13 0.05 0.09
1.97 2.96 1.95 1.84 2.45 3.03
0.61 0.58 0.34 0.5 0.21 0.17
0.04 0.07 0.07 0.07 0.04 0.06
0.61 0.83 0.77 1.0 1.11 1.13
4.44 4.44 4.94 6.89 6.82 7.19
0.02 0.04 0.03 0.06 0.03 0.07
1.5 1.33 1.81 2.33 2.56 2.26
0.23 0.35 0.49 0.47 0.31 0.38
2.87 3.22 3.76 3.57 3.04 2.71
1.38 1.95 1.76 1.7 1.95 1.95
0.1 0.21 0.06 0.08 0.05 0.02
2.81 2.76 3.23 3.07 3.88 3.74
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0
2.15 2.5 2.57 2.44 2.36 2.35
0.08 0.04 0.03 0.02 0.05 0.01
0.25 0.15 0.11 0.07 0.25 0.24
2.71 2.01 1.9 3.21 1.83 2.78
9.86 13.21 15.29 17.38 11.34 12.11
0.28 0.42 0.5 0.49 0.47 0.37
0.02 0.2 0.05 0.14 0.0 0.0
0.58 0.74 0.94 0.78 0.53 0.42
14.25 22.99 17.85 17.75 13.72 15.47
12.69 13.2 13.47 13.36 12.89 12.09
41.88 50.23 50.62 48.27 45.49 46.23
2.21 3.17 3.94 3.44 2.92 2.89
177.5 137.74 191.46 223.48 214.47 217.04
140.9 126.21 93.63 110.04 90.66 84.22
0.45 0.74 0.89 0.83 0.43 0.22
5.18 4.22 6.73 4.82 7.89 8.87
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.68 5.15 6.31 5.08 3.34 2.14
0.29 0.32 0.22 0.29 0.12 0.26
0.07 0.03 0.06 0.06 0.01 0.06
0.63 0.53 0.45 0.68 0.5 0.52
0.39 1.05 1.15 1.7 0.93 0.54
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02
0.28 0.76 0.85 0.71 0.31 0.19
0.27 0.31 0.32 0.32 0.28 0.25
0.07 0.12 0.09 0.16 0.05 0.08

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)