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Heatmap: Cluster_90 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.38 -0.37 -1.37 -0.67 0.29 0.75
0.2 -0.92 -0.34 -0.03 0.25 0.45
0.19 0.36 -0.3 -0.31 -0.08 0.02
0.04 -0.58 -0.62 -1.07 0.81 0.5
0.02 0.23 -0.18 -0.13 0.03 -0.0
0.22 0.32 -0.03 -0.27 -0.27 -0.08
-0.16 -0.37 0.06 -0.48 0.4 0.32
0.1 0.1 -0.19 -0.14 0.02 0.09
0.07 -0.05 -0.1 -0.02 0.08 0.02
-0.09 -0.34 -0.63 -0.04 0.38 0.42
-0.54 -0.16 -0.19 -0.16 0.46 0.35
-0.0 -0.17 -0.43 -0.15 0.27 0.34
0.05 0.18 -0.18 -0.23 0.03 0.11
-0.12 -1.16 -1.23 -0.46 0.76 0.83
0.07 -0.18 -0.51 -0.07 0.3 0.23
-1.41 -0.25 0.02 0.44 0.73 -0.41
-0.66 - - -0.7 0.93 1.51
0.09 -0.89 0.15 0.63 -0.42 -0.02
-0.11 0.11 -0.3 -0.3 0.21 0.27
-0.41 -0.11 -0.27 -0.06 0.37 0.31
0.26 0.11 -0.2 -0.53 -0.04 0.25
0.1 0.37 -0.64 -1.09 0.27 0.41
0.04 0.42 -0.58 -1.02 0.27 0.34
0.4 -0.24 -1.63 -1.11 0.46 0.75
0.16 0.31 -0.24 -0.79 0.06 0.23
0.11 -0.04 -0.09 -0.15 0.01 0.14
0.16 0.19 -0.18 -0.18 -0.01 -0.04
0.52 -1.16 -1.75 -0.84 0.54 0.86
0.56 0.17 -1.76 -2.25 -0.01 0.93
0.38 -0.09 -0.55 -0.33 0.11 0.27
-0.35 0.34 -0.97 0.48 0.59 -0.9
-0.22 -0.31 -0.21 -0.04 0.41 0.22
-0.25 -0.35 0.03 -0.25 0.51 0.12
0.01 0.15 -0.27 -0.14 0.07 0.13
-0.29 -0.12 0.27 0.38 -0.11 -0.26
0.66 -0.13 -1.09 -0.56 0.16 0.31
-0.05 -0.16 -0.17 0.22 0.09 0.02
0.15 -0.06 0.12 -0.56 0.08 0.15
0.04 -0.25 -0.09 -0.11 0.19 0.17
0.17 -0.08 -0.7 -0.44 0.27 0.46
0.3 0.16 -0.84 -0.52 0.2 0.32
0.11 0.15 -0.28 -0.12 -0.05 0.13
-0.46 0.36 -0.85 0.85 -0.24 -0.34
-0.0 -0.07 -0.46 -0.45 0.23 0.51
0.21 -0.63 -0.71 0.03 0.25 0.47
0.21 0.18 -1.72 0.21 0.71 -0.68
-0.14 -0.39 -0.46 -0.43 0.54 0.49
0.09 0.34 -0.47 -0.65 0.15 0.26
0.06 0.28 -0.28 -0.27 0.08 0.05
0.79 -1.58 -1.91 -0.7 0.21 0.92
-0.2 -0.17 0.02 0.25 0.1 -0.04
0.13 0.17 -0.11 -0.15 0.05 -0.12
0.4 0.13 -0.44 -0.46 0.05 0.12
-0.09 -0.5 -0.5 -0.15 0.48 0.43
0.48 0.21 -1.22 -0.96 -0.09 0.65
-0.12 -0.32 -0.02 -0.88 0.5 0.41
0.09 0.48 -0.48 -0.32 0.22 -0.24
-0.01 0.35 -0.33 -0.68 0.12 0.3
0.56 0.07 -0.92 -0.77 -0.02 0.47
-0.13 -0.6 -0.11 0.02 0.26 0.37
0.06 -0.6 -0.79 -0.74 0.61 0.67
0.13 0.3 0.32 0.58 -0.1 -
-0.43 -0.28 -0.36 -0.32 0.49 0.54
-0.15 -0.06 -0.76 -0.14 0.38 0.42
0.22 -0.96 -1.21 -0.38 0.6 0.68
-0.14 0.35 -0.22 -0.39 0.16 0.11
-0.15 -0.37 -0.92 -0.08 0.65 0.36
0.06 -0.52 -0.63 -0.72 0.6 0.58
0.11 0.11 -0.12 -0.26 0.02 0.1
0.51 -0.16 -0.88 -0.92 0.29 0.47
0.33 -0.02 -0.48 -0.05 -0.13 0.21
-0.27 -0.14 -0.33 -0.4 0.51 0.36
-0.01 -1.89 -0.74 0.36 0.51 0.52
-0.4 -0.8 -0.21 0.55 0.1 0.34
-0.26 -0.21 -0.63 0.07 0.12 0.6
0.23 0.16 -0.27 -0.5 0.03 0.21
-0.44 -0.45 -0.3 0.08 0.46 0.36
0.06 -0.18 -0.16 0.1 -0.03 0.18
0.12 -0.25 -0.66 0.03 0.3 0.24
-0.83 0.54 -1.64 -0.09 0.62 0.25
0.08 0.13 -0.07 -0.12 -0.01 -0.03
-0.02 -1.14 -1.06 -0.12 0.65 0.66
0.05 0.35 -0.43 -0.65 0.28 0.14
-0.13 -0.25 -0.33 0.13 0.29 0.18
-0.26 -0.68 0.17 -0.04 0.49 0.05
0.02 -0.02 -0.06 -0.02 0.08 0.01
0.22 -0.37 -0.85 0.1 0.5 0.03
0.16 0.09 -0.17 -0.17 0.01 0.04
-0.78 0.14 -0.41 1.27 -0.4 -1.36
-0.23 -0.22 -0.59 -1.01 0.68 0.61
0.21 0.08 -0.55 -0.48 0.55 -0.12
0.38 0.14 -0.78 -0.76 0.16 0.39
0.08 -0.06 -0.11 -0.01 0.06 0.02
0.08 0.01 -0.16 -0.35 0.17 0.19
0.02 0.19 -0.2 -0.21 0.08 0.07
-0.01 0.06 -0.54 -0.33 0.21 0.41
0.12 -0.64 -0.86 -0.03 0.47 0.45
-0.18 -0.12 0.44 -0.2 0.12 -0.19
-0.57 0.29 -0.02 0.12 0.36 -0.42
-1.35 0.34 0.67 0.14 -0.13 -0.45
0.05 -0.28 -0.01 -0.01 0.26 -0.06
-1.09 -1.33 -1.75 0.37 0.77 0.88
0.07 0.33 -0.2 -0.4 0.08 0.02
0.34 0.02 -0.75 -0.31 0.27 0.15
-0.06 -0.58 -1.99 -1.5 0.59 1.17
0.05 0.14 -0.11 -0.13 0.06 -0.03
-0.12 -0.19 -0.43 -0.36 0.45 0.4
0.09 -0.03 -0.78 -0.64 0.46 0.44
-0.02 -1.18 -1.42 0.08 0.6 0.7
0.08 0.12 -0.77 -0.18 0.21 0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.