Heatmap: Cluster_94 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.03 0.04 0.02 0.0 0.0 0.02
0.02 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01
1.42 1.5 1.63 1.16 0.93 0.87
0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01
0.0 0.05 0.02 0.04 0.0 0.0
0.16 0.1 0.05 0.15 0.01 0.03
0.48 0.65 0.43 0.35 0.4 0.49
6.94 8.86 4.39 3.96 4.23 4.2
1.08 1.63 0.53 0.39 0.25 0.96
4.61 4.95 1.87 1.42 0.66 2.01
31.79 39.25 9.34 6.69 4.9 9.69
0.45 0.43 0.02 0.04 0.16 0.26
0.55 0.47 0.04 0.38 0.05 0.01
23.68 13.67 4.72 4.08 6.62 12.43
0.07 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0
1.76 2.84 2.86 2.42 2.75 2.69
0.04 0.04 0.02 0.05 0.02 0.04
1.91 2.53 1.42 1.21 1.48 1.81
0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0
0.1 0.06 0.04 0.08 0.04 0.04
0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0
54.43 66.25 61.01 57.89 60.17 52.69
0.29 0.62 0.46 0.39 0.38 0.24
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.91 1.72 1.34 1.01 0.88 0.88
0.0 0.05 0.01 0.05 0.04 0.03
3.62 3.18 1.9 2.64 2.43 2.69
1.81 2.57 2.04 1.53 1.81 1.6
0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.22 0.27 0.16 0.59 0.2 0.33
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
115.04 181.45 155.3 112.97 138.75 138.23
3.6 3.79 1.71 0.9 0.73 1.13
0.15 0.03 0.01 0.06 0.03 0.06
1.14 1.59 0.45 0.25 0.0 1.01
0.06 0.06 0.06 0.04 0.04 0.05
0.11 0.06 0.04 0.04 0.0 0.05
0.37 0.4 0.32 0.54 0.54 0.37
0.03 0.03 0.02 0.03 0.01 0.0
0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0
0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01
5.08 5.78 3.33 4.05 4.52 4.47
0.03 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0
0.05 0.09 0.09 0.08 0.06 0.07
0.07 0.11 0.01 0.08 0.01 0.02
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02
2.52 2.4 2.2 1.97 1.74 2.19
0.02 0.1 0.03 0.04 0.04 0.07
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.1 0.3 0.2 0.29 0.21 0.15
0.33 0.25 0.14 0.12 0.07 0.1
0.61 0.35 0.32 0.51 0.49 0.45
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.32 6.8 4.22 3.91 2.6 3.03
0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
1.14 1.44 1.27 1.11 0.99 1.14
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0
5.07 5.47 4.55 5.2 3.93 3.73
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.06 0.03 0.05 0.06 0.02
0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0
0.87 0.36 0.07 0.25 0.19 0.16
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.12 0.09 0.17 0.14 0.1
0.04 0.02 0.01 0.02 0.02 0.0
6.84 9.71 2.94 2.22 1.22 6.05
20.82 23.93 8.93 14.16 4.1 8.45
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.07 0.04 0.04 0.04 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.03 0.09 0.0 0.0
0.05 0.02 0.01 0.04 0.02 0.01
0.64 0.8 0.5 0.14 0.21 0.22
0.2 0.13 0.2 0.22 0.15 0.13
1.6 1.41 0.74 1.19 0.83 1.89
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
28.33 28.53 17.04 32.46 17.3 21.12
0.05 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0
0.02 0.09 0.12 0.14 0.11 0.04
0.87 0.7 0.97 0.62 0.81 0.64
0.0 0.04 0.03 0.03 0.03 0.01
0.26 0.27 0.26 0.2 0.19 0.21
0.12 0.07 0.08 0.09 0.05 0.02
0.22 0.1 0.11 0.14 0.04 0.04
0.92 0.78 0.63 0.41 0.76 0.43
0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0
0.23 0.5 0.29 0.35 0.37 0.31
0.07 0.03 0.03 0.09 0.03 0.04
0.27 0.2 0.28 0.16 0.26 0.11
0.09 0.02 0.0 0.04 0.01 0.02
2.33 3.08 1.82 3.33 0.87 0.86
0.04 0.04 0.06 0.01 0.0 0.05
0.03 0.05 0.03 0.03 0.0 0.03
4.07 5.36 3.41 2.89 2.54 2.78
0.02 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0
0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0
1.35 2.22 1.26 0.9 1.21 1.62
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01
0.13 0.02 0.1 0.05 0.07 0.03
0.51 0.5 0.48 0.57 0.51 0.39
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.78 0.42 0.32 0.39 0.54 0.56
0.26 0.26 0.23 0.24 0.1 0.21
0.04 0.01 0.04 0.13 0.02 0.02
0.21 0.11 0.06 0.15 0.19 0.12
0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
4.06 3.38 2.9 3.73 2.2 3.25
0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.02 0.04 0.05 0.01 0.01 0.01
0.01 0.06 0.0 0.02 0.05 0.03
1.38 2.05 0.66 0.33 0.29 1.36
0.03 0.02 0.05 0.04 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
117.08 82.47 28.75 21.72 24.24 35.06
0.04 0.01 0.02 0.04 0.01 0.01
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 0.77 0.3 0.39 0.06 0.32
0.09 0.24 0.1 0.1 0.11 0.08
0.04 0.17 0.11 0.1 0.09 0.09
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0
12.54 13.04 4.35 5.96 3.95 6.19
14.63 14.5 10.0 11.9 9.3 10.97
0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0
0.42 0.23 0.08 0.25 0.14 0.19
0.42 0.47 0.22 0.2 0.13 0.17
1.2 1.32 0.81 0.7 0.32 0.31
0.0 0.01 0.01 0.06 0.0 0.0
0.07 0.09 0.03 0.03 0.08 0.04
1.73 1.44 1.13 1.08 1.32 1.18
0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0
0.02 0.08 0.04 0.02 0.02 0.01
0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0
0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0
0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)