Heatmap: Cluster_10 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.03 0.04 0.04 0.03 0.07 0.01
6.33 5.31 4.25 5.05 5.92 4.17
0.71 0.78 0.77 0.99 1.5 1.24
0.3 0.12 0.11 0.2 0.16 0.14
0.08 0.07 0.06 0.07 0.1 0.09
10.65 12.92 9.67 7.76 14.24 9.84
53.44 54.67 28.92 30.05 58.15 39.4
3.94 3.01 2.68 3.43 5.41 4.16
0.54 0.4 0.51 0.57 0.65 0.53
42.5 40.03 34.49 41.36 54.58 45.13
27.96 25.65 21.27 24.94 34.97 28.86
71.88 65.79 70.05 75.3 84.75 71.36
0.26 0.21 0.13 0.27 0.4 0.17
10.93 8.15 6.61 9.31 12.23 7.4
0.27 0.2 0.12 0.22 0.22 0.16
0.27 0.35 0.36 0.31 0.39 0.32
0.61 0.86 0.83 0.7 0.84 0.64
40.56 31.07 24.96 34.37 39.31 33.05
0.85 0.89 0.62 0.9 1.12 0.59
0.05 0.04 0.02 0.05 0.08 0.03
52.78 108.61 91.01 72.99 81.48 89.58
0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.23 0.2 0.24 0.28 0.32 0.21
4.53 4.32 5.23 9.53 10.36 5.94
143.0 157.57 93.81 113.98 178.45 115.09
4.87 5.4 4.51 4.66 6.22 4.93
8.28 6.07 6.38 6.72 8.1 6.09
1.03 0.49 0.34 0.62 0.93 0.5
7.55 11.76 9.11 8.35 9.4 9.23
6.69 6.17 6.09 8.31 8.23 6.36
14.68 13.74 12.3 12.05 15.22 11.02
0.54 0.38 0.19 0.28 0.32 0.29
0.03 0.05 0.03 0.04 0.1 0.03
0.11 0.12 0.05 0.13 0.26 0.08
3.72 4.48 3.48 3.94 5.66 4.02
0.11 0.13 0.07 0.11 0.19 0.06
1.94 1.64 1.54 1.46 1.86 1.69
2.15 1.54 2.15 2.86 4.2 2.17
0.1 0.07 0.08 0.12 0.13 0.1
3.72 4.58 3.67 4.32 5.08 4.98
2.09 1.56 0.86 1.04 2.02 1.3
0.11 0.09 0.05 0.1 0.16 0.08
0.24 0.17 0.16 0.21 0.28 0.2
0.24 0.19 0.06 0.18 0.31 0.12
0.37 0.45 0.44 0.68 0.38 0.76
2.11 1.63 0.89 1.62 1.65 1.46
0.44 0.28 0.19 0.48 0.53 0.26
7.84 8.17 7.88 7.29 8.52 10.46
0.19 0.19 0.18 0.21 0.25 0.2
0.47 0.59 0.48 0.52 0.5 0.57
0.0 0.02 0.04 0.01 0.01 0.0
0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01
0.14 0.11 0.12 0.15 0.17 0.12
0.21 0.06 0.07 0.21 0.04 0.16
0.99 0.74 0.26 0.74 0.82 0.65
0.19 0.2 0.02 0.1 0.17 0.11
1.84 3.14 2.69 2.6 3.55 2.36
0.11 0.12 0.11 0.13 0.15 0.09
1.31 1.28 0.59 1.05 1.43 1.03
0.04 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01
1.1 1.83 1.01 1.06 1.6 0.79
0.06 0.0 0.02 0.04 0.05 0.04
31.17 26.61 19.53 22.5 32.8 21.34
0.07 0.13 0.05 0.15 0.26 0.09
1.64 1.26 0.92 1.11 1.77 1.32
0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0
0.06 0.02 0.02 0.04 0.07 0.02
79.07 92.41 77.16 76.44 102.04 63.35
1.34 1.06 0.15 0.62 1.21 0.55
3.09 2.27 2.94 3.32 3.42 3.53
0.51 0.33 0.31 0.27 0.25 0.34
8.56 9.74 8.19 7.79 8.61 8.55
7.86 9.34 8.88 9.1 8.13 8.49
0.06 0.03 0.02 0.04 0.05 0.04
31.78 30.23 29.01 29.3 30.27 28.97
4.95 4.72 3.48 3.52 5.73 4.47
0.06 0.03 0.01 0.02 0.09 0.01
0.1 0.08 0.04 0.12 0.11 0.12
1.21 1.06 0.62 0.93 1.27 0.75
0.1 0.11 0.03 0.05 0.06 0.0
7.94 7.36 5.84 6.52 9.75 6.23
26.23 24.01 23.75 23.39 33.82 20.1
2.43 1.73 0.5 1.32 3.23 1.33
0.05 0.05 0.01 0.02 0.04 0.02
0.84 0.84 0.67 0.73 0.78 0.74
17.89 19.68 17.63 18.0 23.64 17.16
0.49 0.38 0.12 0.09 0.2 0.23
5.07 3.04 0.47 3.09 4.82 1.49
0.37 0.43 0.3 0.36 0.56 0.28
0.06 0.0 0.02 0.01 0.05 0.07
0.41 1.4 0.92 1.0 1.11 1.28
0.04 0.02 0.0 0.04 0.03 0.02
7.78 7.0 8.94 11.88 10.86 7.45
0.05 0.05 0.06 0.04 0.04 0.0
0.17 0.13 0.07 0.14 0.23 0.08
0.14 0.1 0.06 0.11 0.19 0.07
5.71 4.63 3.87 4.53 7.52 5.87
0.57 0.37 0.13 0.52 0.84 0.62
5.32 6.6 4.58 5.34 7.91 5.01
1.99 2.36 2.15 2.1 2.32 1.87
0.1 0.1 0.08 0.11 0.15 0.08
0.4 0.62 0.45 0.43 0.63 0.36
0.19 0.07 0.08 0.16 0.24 0.04
10.28 10.26 7.64 10.06 12.63 8.95
10.16 7.83 9.02 12.59 14.63 6.9
8.06 9.04 9.84 9.7 13.02 7.61
0.27 0.24 0.16 0.2 0.22 0.19
0.19 0.19 0.16 0.24 0.34 0.21
3.85 4.3 4.17 5.77 5.35 4.19
3.35 3.01 2.32 2.81 3.73 3.09
6.61 6.72 4.48 5.07 8.03 6.65
1.52 1.42 1.15 1.21 2.23 1.31
0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02
1.72 1.94 1.6 1.62 2.67 1.54
0.14 0.14 0.14 0.18 0.21 0.15
0.94 0.51 0.56 0.44 0.9 0.68
6.76 6.84 5.97 6.46 8.31 4.88
0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0
1.42 1.23 1.41 1.67 1.66 1.49
0.01 0.02 0.06 0.05 0.08 0.04
0.1 0.1 0.09 0.09 0.15 0.08
1.8 1.94 1.82 1.71 2.17 1.75
16.01 22.15 24.91 21.72 23.79 19.87
8.72 9.04 7.75 7.63 10.15 7.46
2.51 2.27 2.49 2.22 2.45 2.62
7.41 6.28 4.04 5.32 7.49 5.04
1.89 2.55 2.56 3.84 4.23 2.68
0.41 0.3 0.23 0.28 0.39 0.2
0.25 0.18 0.12 0.23 0.28 0.17
1.79 1.73 1.22 0.94 1.68 1.17
0.94 1.84 1.17 1.84 1.93 0.49
4.74 4.71 5.16 4.55 5.66 4.03
27.87 33.65 32.08 30.07 40.51 30.19
4.44 4.15 3.94 4.32 5.74 3.49
2.22 2.89 2.23 2.75 2.47 1.76
0.93 0.6 0.58 1.25 1.79 0.57
1.3 1.17 1.15 1.11 1.47 1.21
0.76 0.55 0.54 0.68 1.11 0.73
0.03 0.08 0.05 0.05 0.04 0.07
0.05 0.09 0.05 0.1 0.11 0.08
2.48 2.28 2.13 2.37 2.94 2.31
0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01
0.6 0.32 0.21 0.41 0.42 0.37
0.84 0.81 0.8 0.96 0.96 0.75
29.87 25.22 16.67 21.42 28.83 23.04
0.04 0.03 0.05 0.05 0.03 0.02
14.21 10.28 7.95 13.65 20.13 11.04
4.46 3.73 2.94 2.83 5.63 3.52
12.67 13.35 6.19 7.82 15.24 8.4
0.25 0.11 0.1 0.12 0.14 0.15
0.13 0.13 0.04 0.03 0.1 0.03
0.08 0.0 0.07 0.22 0.0 0.04
0.53 0.27 0.24 0.46 0.28 0.25
0.48 0.48 0.25 0.3 0.6 0.2
2.38 2.12 1.25 2.33 3.35 1.96
0.07 0.05 0.01 0.02 0.05 0.02
0.74 1.28 1.35 1.42 1.64 0.95
0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0
0.28 0.29 0.19 0.31 0.28 0.23
0.07 0.03 0.0 0.04 0.07 0.05
2.81 1.63 1.58 2.48 3.37 2.58
0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02
0.17 0.17 0.15 0.2 0.25 0.15
0.06 0.03 0.03 0.05 0.03 0.0
0.18 0.12 0.06 0.13 0.21 0.07
0.19 0.31 0.25 0.19 0.24 0.12
0.92 0.96 0.64 0.85 0.93 0.71
9.92 10.6 7.01 6.89 13.16 6.23
4.57 4.11 4.41 7.03 6.05 3.68
0.15 0.28 0.06 0.28 0.03 0.05
0.19 0.33 0.25 0.44 0.33 0.09
9.66 7.72 6.66 8.78 12.82 8.81
4.24 5.36 6.64 6.85 8.04 4.2
0.33 0.44 0.5 0.33 0.42 0.38
55.04 60.01 48.84 44.68 53.41 47.17
0.07 0.08 0.08 0.09 0.07 0.04
0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0
0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.05 0.03 0.03 0.05 0.05 0.02
9.76 8.65 9.97 10.14 9.79 8.9
2.07 4.38 4.47 4.23 4.08 2.71
0.07 0.01 0.02 0.03 0.04 0.02
0.33 0.24 0.11 0.16 0.23 0.13
0.11 0.12 0.02 0.07 0.09 0.03
0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.11 1.94 1.91 1.71 2.14 1.64
34.95 34.16 21.15 28.55 46.84 26.43
0.09 0.13 0.21 0.11 0.26 0.21
31.38 37.49 38.92 36.05 46.58 29.33
0.04 0.02 0.0 0.04 0.03 0.05
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.12 0.1 0.08 0.15 0.06
0.08 0.03 0.03 0.04 0.12 0.03
0.46 0.26 0.21 0.26 0.36 0.26
0.18 0.2 0.2 0.15 0.22 0.16
0.15 0.1 0.07 0.11 0.13 0.12
1.09 1.93 1.41 1.13 1.88 1.38
6.19 4.74 3.13 4.73 6.41 4.43
0.31 0.16 0.05 0.15 0.22 0.05
8.59 8.74 6.44 6.94 8.3 6.68
0.03 0.04 0.05 0.02 0.11 0.09
1.46 1.31 1.43 1.89 2.18 1.86
0.07 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0
0.08 0.04 0.01 0.08 0.08 0.08
0.21 0.09 0.05 0.14 0.11 0.08
26.54 22.45 27.74 30.06 29.6 28.34
3.38 3.51 3.32 3.2 4.43 3.76
14.65 18.83 18.35 16.35 18.97 12.37
5.12 4.59 3.78 4.1 7.17 4.43
0.13 0.1 0.21 0.07 0.11 0.08
41.47 47.69 55.63 46.88 67.15 41.45
4.53 3.18 2.27 2.2 4.57 2.0
0.44 0.39 0.14 0.23 0.82 0.26
0.55 0.56 0.36 0.42 0.59 0.38
0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0
0.07 0.01 0.01 0.1 0.05 0.03
0.19 0.18 0.13 0.1 0.23 0.08
1.33 1.55 1.57 2.01 2.14 1.09
0.42 0.27 0.26 0.5 0.76 0.4
0.64 0.58 0.68 1.13 1.13 1.07
0.09 0.03 0.0 0.06 0.07 0.03
8.02 41.53 34.29 22.57 22.93 7.94
3.15 14.72 11.74 7.43 8.24 3.18
0.57 0.35 0.56 0.5 1.11 0.63
0.46 0.76 0.76 1.01 1.38 0.92
366.41 357.45 403.05 421.98 400.1 358.54
1.3 1.07 0.24 0.73 0.99 0.57
0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02
0.04 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0
0.44 0.21 0.15 0.41 0.45 0.42
0.73 0.34 0.31 0.57 1.1 0.65
0.11 0.06 0.03 0.09 0.02 0.01
0.21 0.18 0.13 0.21 0.2 0.12
0.12 0.08 0.07 0.09 0.21 0.08
1.42 1.54 1.37 1.33 1.32 1.52
0.15 0.07 0.04 0.18 0.14 0.08
0.1 0.06 0.06 0.05 0.04 0.01
6.95 5.78 5.37 6.79 6.65 6.01
2.56 2.1 1.69 2.15 3.07 2.38
0.07 0.06 0.1 0.11 0.09 0.1
0.18 0.1 0.09 0.07 0.08 0.14
0.1 0.03 0.01 0.1 0.15 0.09
0.18 0.25 0.05 0.16 0.33 0.12
0.08 0.07 0.02 0.07 0.08 0.06
0.35 0.23 0.09 0.31 0.4 0.16
0.13 0.13 0.16 0.16 0.16 0.09
0.29 0.36 0.44 0.48 0.53 0.36
27.75 27.51 21.27 22.67 28.93 23.64
75.05 77.06 30.77 39.7 77.14 43.41
0.3 0.25 0.12 0.24 0.45 0.17
0.04 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0
1.79 1.23 0.91 2.59 2.42 2.26
0.15 0.11 0.06 0.13 0.21 0.07
0.56 0.68 0.5 0.47 0.91 0.61
5.42 3.77 3.33 5.48 6.49 5.27
0.1 0.02 0.06 0.07 0.05 0.04
0.03 0.01 0.01 0.04 0.04 0.04
18.8 18.03 16.31 18.92 25.98 17.5
0.65 0.64 0.63 0.8 0.86 0.53
0.74 0.68 0.57 0.72 0.99 0.57
0.4 0.43 0.29 0.5 0.63 0.21
3.41 4.18 2.49 5.25 7.9 2.46
5.93 6.23 6.71 6.96 6.99 7.0
0.06 0.05 0.05 0.04 0.06 0.04
0.01 0.06 0.09 0.07 0.09 0.06
0.09 0.07 0.06 0.1 0.15 0.07
0.21 0.22 0.09 0.18 0.34 0.14
0.06 0.09 0.01 0.05 0.05 0.0
4.82 5.16 4.58 5.33 6.7 4.44
2.2 1.38 1.96 2.62 2.5 2.46
0.04 0.02 0.0 0.04 0.0 0.01
28.18 26.85 21.88 26.09 38.57 26.27
0.08 0.03 0.0 0.04 0.12 0.0
14.49 13.09 10.03 11.92 17.56 13.87
15.45 18.29 18.81 20.88 22.19 15.74
3.66 3.11 2.26 2.94 3.39 2.81
0.44 0.53 0.56 0.67 0.78 0.41
6.01 3.98 4.79 6.72 5.69 3.84
1.92 1.3 1.26 2.26 2.2 1.66
0.12 0.08 0.0 0.07 0.1 0.0
0.16 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0
0.02 0.05 0.01 0.01 0.03 0.0
11.73 9.99 13.39 16.8 18.47 14.86
0.6 0.55 0.57 1.23 1.28 0.84
1.1 0.91 0.38 0.79 1.17 0.58
0.5 1.06 0.93 0.67 1.12 1.16
5.97 5.12 4.71 8.18 9.24 7.04
15.74 15.27 12.44 14.11 19.34 16.75
3.5 2.59 1.7 3.21 4.22 2.4
0.35 0.4 0.38 0.29 0.67 0.13
0.56 0.39 0.2 0.42 0.71 0.43
0.06 0.04 0.01 0.04 0.06 0.02
2.19 2.43 2.32 2.99 3.58 1.87
12.68 10.39 10.27 11.56 15.89 12.45
6.14 4.28 3.64 4.65 7.89 4.58
16.93 21.28 19.14 20.49 24.37 14.82
0.99 0.77 0.93 1.22 0.9 0.61
1.54 0.82 0.84 1.6 1.44 1.01
0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
11.85 10.49 10.87 13.22 14.64 9.0
0.09 0.09 0.02 0.08 0.11 0.08
0.01 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0
0.02 0.1 0.03 0.12 0.03 0.08
1.09 0.91 0.98 1.03 1.38 0.93
0.09 0.05 0.02 0.04 0.07 0.03
15.42 14.55 12.87 13.18 20.11 10.32
4.15 3.89 3.25 3.2 5.94 3.9
1.34 1.0 0.76 1.17 1.9 1.27
50.61 47.6 41.83 44.95 75.13 50.23
0.06 0.06 0.02 0.05 0.02 0.01
7.27 7.11 4.95 6.79 7.59 5.01
6.06 6.07 5.26 6.58 8.16 4.95
1.27 1.4 1.38 1.47 2.16 1.36
6.18 7.81 5.05 5.59 9.37 7.29
125.04 122.07 101.38 122.62 172.78 115.12
0.34 0.2 0.12 0.26 0.31 0.02
0.11 0.28 0.29 0.22 0.37 0.29
0.1 0.13 0.05 0.1 0.05 0.12
27.05 31.89 30.6 33.43 40.86 30.65
0.07 0.12 0.0 0.0 0.03 0.0
0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01
0.39 0.01 0.05 0.0 0.09 0.09
18.14 17.61 15.06 19.3 27.18 17.77
3.43 2.4 4.32 4.83 4.45 4.1
53.32 39.09 31.57 44.94 73.44 47.82
0.13 0.09 0.06 0.09 0.14 0.07
1.29 1.37 1.39 1.54 2.1 1.53
42.81 26.09 16.84 30.5 54.86 36.41
11.32 8.04 5.08 6.02 7.3 7.56
0.98 0.46 0.68 1.29 1.62 1.12

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)