Heatmap: Cluster_40 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.09 -0.09 -0.07 -0.05 -0.02 0.11
-0.27 0.17 0.33 0.1 -0.1 -0.35
-0.42 0.16 0.35 0.05 0.04 -0.31
-0.07 -0.5 0.38 -0.03 0.17 -0.09
-0.06 0.0 -0.05 0.25 0.18 -0.41
0.04 -0.02 -0.04 0.1 -0.03 -0.05
- - - 1.3 - 1.82
-0.16 -0.06 -0.01 -0.04 -0.06 0.29
-0.39 -0.76 0.28 0.37 0.28 -0.11
0.16 -0.2 -0.12 -0.11 0.18 0.05
0.49 -0.56 -0.09 0.08 -0.41 0.23
0.19 0.03 0.06 0.31 -0.34 -0.37
0.15 -0.18 -0.38 -0.2 0.13 0.35
0.04 -0.08 0.09 0.19 -0.21 -0.06
0.14 -0.04 -0.23 -0.19 0.02 0.24
0.13 -0.0 -0.08 0.04 0.18 -0.33
0.12 0.08 -0.09 0.1 0.15 -0.42
-1.07 0.36 0.49 0.59 -0.18 -1.19
-0.29 -0.17 0.64 -0.14 0.0 -0.27
-0.33 -0.2 0.11 0.05 0.13 0.16
-0.06 0.08 -0.1 0.11 0.02 -0.07
0.12 -0.06 -0.05 0.06 -0.02 -0.07
-0.03 -0.06 0.37 0.14 -0.12 -0.43
-0.32 -0.26 0.31 0.2 -0.11 0.06
-0.54 -0.4 -0.2 0.21 -0.15 0.7
0.17 -0.24 -0.33 0.06 0.0 0.24
0.09 -0.17 0.0 0.42 -0.0 -0.49
-0.48 -1.22 -1.19 0.29 0.64 0.7
0.47 0.05 -0.21 -0.16 -0.08 -0.2
0.44 -0.33 -0.23 0.47 -0.04 -0.65
-0.1 -0.23 -0.24 0.24 0.24 0.0
- - 1.06 0.72 - 1.19
0.01 -0.56 -0.27 0.23 0.18 0.23
-0.02 -0.56 -0.27 0.02 0.21 0.41
0.07 -0.05 -0.05 -0.11 0.04 0.08
0.37 0.12 0.01 0.18 -0.16 -0.79
0.84 0.02 -0.65 -0.83 0.39 -0.54
-0.12 -0.5 0.61 -0.49 0.15 0.04
0.23 0.15 0.1 0.16 -0.34 -0.43
-0.01 0.06 0.02 0.17 0.16 -0.49
0.1 0.04 -0.37 -0.26 0.13 0.26
0.64 0.29 -0.55 0.44 -0.69 -0.85
-0.36 -0.7 -0.6 -1.45 0.05 1.34
0.12 -0.0 -0.07 0.06 0.01 -0.13
-0.1 -0.07 0.07 0.19 0.11 -0.24
0.15 0.21 -0.17 -0.2 0.13 -0.19
-0.52 0.05 0.47 0.51 -0.23 -0.73
0.07 0.17 0.23 0.15 -0.3 -0.45
0.33 -0.17 -0.22 0.52 -0.02 -0.81
0.61 -0.33 -0.01 -0.05 -0.38 -0.08
-0.15 -0.09 0.12 -0.01 0.04 0.07
-0.11 -0.01 -0.21 0.28 0.21 -0.24
0.61 -0.25 -0.39 0.38 -0.24 -0.47
0.43 -0.21 -0.41 0.51 -0.13 -0.53
-0.33 -1.07 0.4 -2.54 0.02 1.15
-0.01 0.05 -0.12 0.21 0.01 -0.18
0.46 -0.01 -0.59 0.13 -0.08 -0.12
0.05 -0.08 0.0 0.0 -0.01 0.04
-0.19 -0.51 -0.08 0.24 0.14 0.25
-0.01 -0.04 -0.06 0.11 -0.1 0.08
0.18 0.34 -0.08 -0.0 -0.28 -0.26
-0.69 0.46 0.69 0.23 -0.66 -0.77
-0.21 -0.48 0.06 0.56 0.27 -0.53
0.06 -0.42 0.06 -0.05 0.6 -0.54
-0.41 -1.02 0.11 0.22 0.4 0.26
0.08 0.0 -0.61 0.92 -0.09 -1.12
-0.39 -1.34 0.91 -1.41 - 1.37
-0.39 -0.43 0.35 0.23 0.2 -0.15
-0.04 -0.12 -0.26 -0.0 0.23 0.13
0.13 -0.26 0.07 0.41 0.03 -0.57
-0.75 0.3 0.42 -0.22 0.2 -0.27
- 0.77 0.64 -0.93 - 1.15
0.12 -0.29 -0.43 0.14 0.05 0.28
-0.76 -0.52 0.73 0.29 -0.04 -0.22
-1.1 0.78 0.75 0.32 -0.83 -1.64
0.25 -0.43 -1.01 0.52 -0.22 0.36
0.4 -0.17 -0.19 0.46 -0.11 -0.69
-0.12 -0.1 0.13 0.33 0.12 -0.5
0.03 - 0.65 - - 1.77
-0.39 0.15 0.08 0.05 -0.13 0.17
0.18 -0.4 -1.83 0.87 -0.16 0.14
-0.13 0.06 0.39 0.29 -0.2 -0.65
0.01 0.09 -0.23 0.37 -0.3 -0.04
-0.52 -0.46 -0.51 0.61 -0.4 0.67
0.16 -0.32 0.11 0.21 0.53 -1.33
-0.67 -0.8 -0.16 -0.12 0.51 0.64
-0.63 0.39 0.34 -0.05 -0.24 -0.05
0.07 -0.38 0.39 0.63 -0.17 -1.22
-0.16 -0.23 0.11 0.41 0.06 -0.33
0.15 0.4 -0.29 -0.21 -0.01 -0.16
-0.02 -0.16 -0.49 0.47 0.42 -0.56
-0.27 -0.12 -0.18 0.39 -0.17 0.23
-0.7 -0.45 0.67 0.25 0.09 -0.3
0.26 0.21 -0.27 -0.28 0.07 -0.07
- - - 1.45 -1.41 1.53
0.19 0.05 0.0 0.47 -0.14 -0.93
-0.31 -0.73 -0.14 0.53 0.24 0.07
-0.31 -1.77 -0.05 0.46 0.44 0.27
-0.1 -0.18 0.13 0.19 0.09 -0.18
-1.16 -0.12 0.12 -0.34 0.25 0.65
-1.09 0.71 0.12 0.55 -0.33 -0.86
0.32 -0.25 -0.0 -0.11 -0.07 0.05
-0.2 0.09 0.14 0.19 -0.16 -0.12
0.61 -0.12 -1.51 0.88 -0.35 -0.79
0.23 -0.32 -0.24 0.18 0.12 -0.06
-0.39 -0.47 0.12 0.42 0.17 -0.05
-0.05 0.01 1.09 0.07 -0.24 -
0.55 -0.74 0.22 0.23 -0.05 -0.64
0.27 -0.03 -0.26 0.38 -0.02 -0.54
-0.42 -0.07 0.08 0.64 -0.15 -0.34
-0.06 -0.96 -1.2 0.72 0.31 0.27
0.15 -0.01 -0.15 -0.02 0.13 -0.13
-0.02 -0.32 -0.84 0.07 0.66 0.04
0.31 -0.45 -0.29 0.43 0.13 -0.38
-0.36 -0.31 0.44 0.63 -0.76 -0.1
0.15 0.4 0.07 0.31 -0.55 -0.75
0.49 -1.59 -0.97 0.52 0.18 0.25
-1.28 0.17 0.71 0.23 0.11 -0.78
0.06 -0.16 -0.0 1.13 -0.86 -1.65
0.07 0.1 -0.2 0.2 0.05 -0.27
0.23 -0.01 0.02 0.74 -0.58 -1.07
0.7 -0.01 -0.38 0.44 -0.43 -0.93
0.45 0.02 -0.42 -0.16 0.16 -0.22
0.21 -0.11 0.18 0.34 -0.31 -0.49
-0.3 -0.19 -0.14 0.29 0.13 0.12
-0.25 0.93 0.1 0.62 -1.59 -1.71
0.27 -0.06 -0.36 0.41 0.02 -0.49
-0.59 - 1.22 0.62 - 0.55
0.77 -0.62 0.3 0.09 -0.19 -1.1
0.04 0.03 -0.04 -0.28 0.03 0.18
0.28 -0.01 0.12 -0.03 -0.05 -0.39
0.75 -0.12 -0.04 0.72 -1.18 -1.55
0.32 -0.21 -0.1 0.45 -0.1 -0.62
0.32 -0.29 -0.05 0.52 -0.15 -0.67
- -0.13 1.1 0.54 -0.89 -0.08
-1.78 -1.62 0.73 -0.14 0.84 0.03
0.03 -0.2 0.37 0.52 0.0 -1.41
-0.44 -0.66 0.06 0.67 0.12 -0.12
-0.1 -0.97 - 0.56 -0.46 1.23
-0.27 - 0.34 0.26 -0.05 0.8
0.22 -0.38 0.07 0.02 0.6 -1.03
0.37 -0.21 -0.04 0.51 -0.32 -0.61
-0.3 -0.05 0.03 0.3 -0.25 0.17
0.3 -0.46 0.52 -0.39 0.28 -0.66
0.02 0.41 0.13 0.6 -0.54 -1.47
0.0 0.22 0.22 0.33 -0.46 -0.54
0.25 -0.03 -0.25 -0.28 -0.02 0.23
0.07 0.4 -0.39 0.55 -0.44 -0.57
-0.09 -0.28 -0.08 0.17 0.11 0.12
-0.59 0.52 0.28 0.7 -0.41 -1.66
0.31 0.09 -0.58 -0.13 0.3 -0.19
-0.41 -0.21 0.09 0.13 -0.0 0.3
0.2 0.29 0.09 0.16 -0.35 -0.58
0.25 -0.74 0.15 -0.04 -0.23 0.36
0.1 -0.42 -0.68 -0.34 0.51 0.43
0.73 -0.31 -0.71 0.14 -0.23 -0.05
0.27 -0.25 -0.29 -0.02 0.34 -0.19
0.65 -0.25 0.18 -0.09 -0.45 -0.35
0.14 -0.92 -1.16 0.83 0.04 0.16
- - 1.54 - - 1.63
-0.22 0.46 0.69 0.11 -0.51 -1.38
0.3 -0.17 -0.53 0.07 0.17 0.02
0.24 -0.51 -0.57 -0.25 0.13 0.59
0.03 0.11 0.18 -0.25 0.09 -0.21
-0.13 0.06 0.16 0.23 -0.01 -0.39
- - -0.02 -0.84 - 2.16
0.25 -0.13 -0.51 -0.13 -0.3 0.55
-0.68 0.36 0.44 -0.18 0.04 -0.29
0.11 -0.45 -0.32 0.24 0.26 0.01
-0.05 -0.15 0.16 0.6 -0.19 -0.69
0.05 -0.03 -0.01 -0.01 -0.01 0.01
-0.86 -0.03 0.92 0.06 -0.09 -0.75
0.25 -1.88 -0.99 0.93 0.5 -0.46
0.2 -0.29 0.1 -0.04 0.46 -0.71
-0.24 0.17 -0.08 0.05 -0.1 0.15
-0.12 0.34 -0.3 0.79 -0.34 -1.08
0.2 0.05 0.32 0.14 -0.21 -0.76
-0.01 -0.63 0.06 1.12 -0.53 -1.16
-0.43 0.48 -0.74 -0.19 0.84 -0.74
0.16 -0.06 -0.12 0.23 -0.01 -0.25
-0.07 -0.02 0.17 -0.12 0.13 -0.13
-1.14 -0.94 0.21 -0.09 0.77 0.29
0.23 -0.18 0.13 0.55 -0.2 -0.95
0.12 -0.14 0.14 -0.72 0.33 0.04
0.04 0.17 -0.6 -0.89 0.42 0.39
-0.05 0.11 -0.21 -0.06 0.01 0.17
-1.49 -1.91 0.13 0.59 -0.81 1.14
-0.25 0.17 -0.2 0.29 0.0 -0.08
0.11 0.08 -0.04 0.29 -0.3 -0.22
0.36 -0.51 -0.16 0.42 -0.42 0.05
- 0.06 -0.0 1.0 - 0.97
-0.46 -0.78 0.13 0.65 0.11 -0.08
-1.03 0.07 0.73 0.48 -0.39 -0.63
0.19 -0.27 0.02 0.18 -0.46 0.21
0.03 0.41 0.06 -0.18 0.04 -0.52
-0.43 0.45 -0.11 0.79 -0.34 -1.17
-0.09 -0.56 -0.22 0.53 -0.42 0.41
-0.15 0.6 0.27 0.3 -1.91 -0.19
0.25 -0.38 -0.07 0.15 0.41 -0.62
-0.14 0.03 0.23 -0.01 -0.02 -0.12
-0.11 -0.39 0.03 -0.25 0.4 0.17
-0.29 0.22 0.41 -0.44 -1.8 0.73
-0.01 -0.37 0.27 0.33 0.05 -0.45
-1.17 -1.09 0.17 0.32 -2.24 1.32
0.13 0.12 0.17 0.7 -0.67 -1.2
0.46 -0.44 -0.12 0.05 0.2 -0.34
-0.19 -0.39 -1.08 0.05 -0.95 1.22
0.38 -0.83 -1.07 0.17 0.21 0.46
0.32 -0.86 -0.64 0.27 0.3 0.17
-0.17 -0.4 -0.23 0.16 0.26 0.25
-0.12 -0.21 0.19 0.26 -0.08 -0.1
0.42 0.11 -0.37 0.09 -0.32 -0.08
0.2 -0.16 0.12 0.5 -0.15 -0.85
-0.36 -1.57 0.48 0.39 0.19 0.05
0.11 -0.31 -0.22 0.09 0.08 0.17
0.18 -22.54 -1.32 0.52 -1.53 1.43
0.22 -0.15 -0.08 0.33 0.07 -0.55
0.05 0.06 -0.06 0.37 0.02 -0.6
-0.56 0.68 0.12 0.25 -0.41 -0.54
0.45 -0.15 0.07 0.57 -0.16 -1.74
0.05 -1.19 -1.29 0.57 -0.06 0.75
-0.55 -0.02 -0.63 0.26 0.52 0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.