Heatmap: Cluster_137 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.01 0.03 0.01 0.02 0.06 0.02
0.13 0.21 0.21 0.19 0.13 0.16
0.05 0.08 0.18 0.56 0.51 0.42
0.66 0.92 0.96 1.09 0.71 0.56
0.45 0.52 0.47 0.32 0.58 0.25
0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
1.89 2.61 2.15 3.3 1.85 2.02
70.48 62.86 69.29 67.01 67.18 66.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.17 0.21 0.22 0.18 0.27 0.29
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.02 0.04 0.01 0.01
0.14 0.02 0.11 0.18 0.13 0.19
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
1.54 2.25 2.35 3.0 3.06 3.4
22.43 18.66 20.14 21.92 21.22 23.26
0.18 0.37 0.08 0.12 0.15 0.22
0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01
1.88 1.5 1.75 2.1 1.56 1.16
10.47 11.54 10.76 12.59 12.29 13.23
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.02 0.16 0.12 0.24 0.14 0.14
0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0
0.09 0.19 0.23 0.18 0.15 0.14
2.41 1.9 1.69 2.47 2.61 3.26
0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.01 0.02 0.05 0.07 0.12 0.04
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.4 0.28 0.64 1.65 1.22 0.56
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.3 0.24 0.27 0.32 0.33 0.27
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.19 0.09 0.14 0.21 0.05 0.04
134.46 112.63 116.96 123.81 135.46 132.39
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.17 0.54 0.93 0.53 0.88 0.15
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.05
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02
0.06 0.1 0.1 0.09 0.09 0.07
0.24 0.18 0.29 0.39 0.32 0.26
0.1 0.06 0.07 0.15 0.17 0.15
1.19 0.93 1.26 1.61 1.63 1.47
2.41 2.5 2.49 2.35 2.16 2.38
0.01 0.01 0.03 0.02 0.03 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.08 0.06 0.04 0.04 0.04
0.11 0.14 0.08 0.09 0.19 0.11
0.02 0.01 0.06 0.01 0.03 0.01
0.01 0.05 0.04 0.04 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.28 0.18 0.11 0.28 0.23 0.16
0.05 0.01 0.06 0.06 0.1 0.04
4.04 2.67 2.79 3.19 4.22 4.62
0.01 0.02 0.11 0.04 0.09 0.06
3.18 4.09 5.9 8.08 6.34 6.59
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.06 0.05 0.12 0.07 0.09 0.15
7.46 6.91 7.22 7.25 6.67 7.36
0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.02 0.03 0.02 0.0 0.01 0.04
17.72 25.56 35.02 47.52 35.81 31.55
0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0
0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.0 0.02 0.04 0.05 0.04 0.05
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
1.16 0.52 0.66 1.06 1.49 1.35
0.44 0.46 0.62 0.47 0.4 0.7
21.95 67.22 75.86 55.69 34.15 21.44
1.59 1.4 2.02 3.36 2.02 1.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.3 0.34 0.19 0.21 0.47
0.14 0.06 0.09 0.13 0.14 0.11
0.6 0.43 1.05 0.99 0.92 0.71
0.01 0.03 0.06 0.01 0.03 0.01
1.39 1.33 1.5 1.56 1.53 1.55
0.92 0.62 0.55 0.99 0.91 0.84
8.93 7.67 10.08 17.0 14.08 14.07
0.02 0.06 0.06 0.04 0.01 0.05
3.27 2.98 2.74 2.35 3.83 3.3
2.24 2.36 2.41 1.86 3.35 2.34
0.79 0.76 0.93 0.89 0.89 0.65
0.03 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01
0.06 0.06 0.07 0.0 0.03 0.0
9.36 7.13 5.42 8.91 6.78 5.66
0.09 0.1 0.08 0.03 0.12 0.05
0.28 0.34 0.41 0.42 0.49 0.35
0.06 0.02 0.04 0.05 0.07 0.05
0.72 0.71 0.89 1.46 1.4 0.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.03 0.04 0.01 0.02 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
394.39 350.17 346.78 361.9 353.34 370.74
0.01 0.02 0.04 0.05 0.02 0.05
0.05 0.05 0.03 0.0 0.06 0.07
0.37 0.46 0.44 0.32 0.29 0.38
5.29 7.93 7.97 8.61 12.78 11.49
0.18 0.14 0.23 0.13 0.32 0.31
1.87 1.9 1.53 1.87 2.14 1.86
0.62 0.52 0.53 0.7 0.93 0.97
0.06 0.15 0.25 0.16 0.2 0.13
0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.87 6.75 6.61 6.36 4.01 2.74
0.02 0.05 0.0 0.0 0.06 0.07
0.15 0.06 0.06 0.08 0.14 0.23
0.0 0.14 0.21 0.28 0.31 0.21
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
2.78 1.91 1.86 3.47 1.47 1.61
4.46 2.62 2.45 3.79 3.32 3.23
0.03 0.01 0.01 0.06 0.02 0.06
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
16.59 25.9 38.76 45.41 32.98 26.36
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01
0.22 0.21 0.1 0.11 0.3 0.22
0.05 0.05 0.06 0.04 0.14 0.11
0.18 0.12 0.15 0.18 0.19 0.26
0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0
0.46 0.77 0.2 0.24 0.5 0.22
0.05 0.03 0.0 0.15 0.1 0.07
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.03 0.21 0.15 0.11 0.19 0.06
0.13 0.07 0.07 0.11 0.14 0.21
0.72 0.49 0.66 0.94 1.06 0.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
175.84 146.79 138.34 153.12 159.82 186.99
21.62 25.65 25.15 26.92 25.23 27.86
0.51 0.78 0.91 0.84 1.13 0.88
0.09 0.22 0.3 0.28 0.18 0.18
1.63 1.46 1.53 1.15 1.85 1.79
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 0.36 0.5 0.57 0.63 0.59
0.89 1.03 1.02 1.03 1.23 1.14
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.03 0.04 0.02 0.03 0.05 0.06
1.2 0.88 0.84 1.4 1.47 0.88
0.06 0.15 0.18 0.09 0.1 0.09
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
6.68 12.91 18.28 15.4 13.81 10.87
0.26 0.41 0.59 0.66 0.3 0.37
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.04 0.08 0.1 0.05 0.12 0.09
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
9.15 10.27 13.73 14.27 11.86 10.8
3.8 4.17 3.53 3.47 3.86 4.1
0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03
5406.35 4841.44 5376.5 6001.34 4833.98 5074.96
0.32 0.22 0.44 0.35 0.52 0.25
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.02 0.05 0.3 0.1 0.0 0.02
0.12 0.07 0.26 0.15 0.17 0.07
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
3.52 3.05 3.44 4.41 3.85 5.01
0.44 0.21 0.21 0.33 0.28 0.24
0.16 0.12 0.11 0.14 0.19 0.14
0.14 0.06 0.11 0.08 0.07 0.07
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
2.38 2.46 1.9 2.77 3.46 2.37
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
6.42 11.76 11.66 10.1 8.75 8.83
0.97 1.38 0.8 0.68 1.08 0.98
0.09 0.08 0.1 0.0 0.08 0.21
0.07 0.02 3.76 0.05 0.15 0.0
0.65 0.27 0.31 0.49 0.69 0.48
6.57 7.93 9.74 10.14 6.38 6.14
7.54 8.68 9.8 9.75 10.3 9.69
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.01 0.05 0.06 0.05 0.06 0.04
0.25 0.47 0.36 0.31 0.38 0.67

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)