Heatmap: Cluster_16 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.11 0.03 -0.04 0.0 -0.04 -0.07
1.36 0.23 -0.9 -2.06 - 0.57
0.03 -0.11 0.05 0.02 0.03 -0.02
0.06 0.03 0.02 -0.04 -0.0 -0.07
0.11 -0.09 -0.1 0.06 0.05 -0.04
-0.11 -0.05 -0.11 0.14 0.08 0.03
0.34 -0.15 -0.14 -0.03 -0.0 -0.08
0.12 -0.14 -0.12 0.05 0.11 -0.03
0.04 -0.08 -0.05 0.06 0.04 -0.0
0.1 -0.14 0.02 0.04 0.02 -0.05
0.12 0.12 -0.04 -0.07 -0.01 -0.14
0.14 -0.17 -0.04 0.07 0.01 -0.03
-0.02 -0.06 -0.0 -0.01 -0.01 0.1
-0.15 -0.03 0.19 0.17 -0.17 -0.05
-0.09 -0.06 0.14 0.29 -0.08 -0.26
0.09 -0.03 -0.14 -0.01 0.04 0.04
0.03 -0.14 0.14 0.01 -0.02 -0.04
0.11 -0.01 -0.04 -0.02 0.01 -0.05
0.01 0.0 0.07 0.07 -0.06 -0.1
0.16 0.09 -0.24 -0.28 0.17 0.03
0.1 -0.01 -0.07 0.04 -0.08 0.01
0.27 -0.04 -0.16 0.06 -0.02 -0.14
0.07 -0.34 -0.06 -0.01 0.1 0.19
-0.02 0.03 0.1 0.09 -0.07 -0.15
0.08 -0.03 -0.04 -0.02 0.01 -0.0
0.06 -0.07 -0.0 0.02 0.02 -0.04
0.05 0.03 -0.04 -0.06 0.06 -0.04
0.04 0.02 -0.03 0.05 -0.02 -0.07
-0.14 0.03 0.2 0.27 -0.19 -0.24
0.07 -0.17 0.06 0.08 -0.01 -0.04
0.1 -0.03 -0.01 -0.02 -0.01 -0.04
0.12 -0.1 0.08 0.19 -0.06 -0.28
0.15 -0.05 -0.21 -0.06 0.11 0.03
0.11 -0.08 0.0 0.0 0.02 -0.06
0.03 0.09 -0.01 -0.08 -0.03 -0.01
0.08 0.1 -0.1 -0.12 -0.01 0.03
0.19 0.07 -0.12 -0.19 0.0 0.01
0.38 0.26 -0.09 -0.12 -0.24 -0.34
0.04 0.07 0.08 0.03 0.01 -0.25
0.18 0.14 -0.05 -0.01 -0.07 -0.23
0.23 0.06 -0.17 -0.04 -0.09 -0.02
-0.23 0.18 0.43 -0.21 -0.05 -0.24
0.08 0.03 0.05 -0.1 -0.02 -0.04
0.08 0.02 -0.07 -0.05 0.04 -0.02
0.12 0.02 0.03 0.1 -0.28 -0.03
0.0 0.15 0.05 -0.08 0.01 -0.16
-0.01 -0.05 -0.0 0.04 0.04 -0.02
0.1 0.1 -0.02 -0.06 -0.08 -0.06
0.09 -0.01 0.03 -0.13 0.02 -0.01
-0.15 -0.16 -0.17 0.1 0.24 0.1
0.08 0.09 -0.09 -0.07 0.0 -0.02
0.09 0.03 -0.12 -0.05 0.04 0.0
0.21 0.18 -0.16 -0.23 0.01 -0.06
-0.01 0.08 0.17 0.2 -0.12 -0.4
0.11 0.01 -0.05 0.01 -0.06 -0.02
0.15 -0.11 -0.15 -0.1 0.17 0.0
0.1 0.08 -0.01 0.04 -0.06 -0.16
-0.0 -0.17 -0.0 0.11 0.03 0.02
0.04 -0.0 0.08 -0.06 0.03 -0.09
0.05 -0.06 0.03 0.12 -0.05 -0.11
0.1 0.08 -0.01 -0.04 -0.06 -0.09
0.15 0.02 0.16 0.41 -0.33 -0.69
0.06 -0.07 -0.05 0.12 0.04 -0.13
0.12 0.02 -0.02 0.12 -0.11 -0.14
0.08 -0.01 0.01 -0.07 -0.01 -0.01
0.33 0.09 0.45 -0.12 -0.31 -0.78
-0.13 0.05 0.12 -0.16 0.11 -0.02
0.05 0.01 0.06 0.11 -0.07 -0.18
0.05 0.18 -0.03 -0.1 -0.03 -0.09
0.26 -0.03 -0.16 0.09 -0.1 -0.11
0.1 -0.08 -0.01 -0.07 0.01 0.05
0.33 -0.12 0.05 0.46 -0.29 -0.76

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.