Heatmap: Cluster_14 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
-0.01 0.26 -0.33 -0.43 0.27 0.09
0.03 -0.05 -0.03 0.08 -0.0 -0.03
0.55 - 0.27 0.65 - 0.82
-0.17 0.95 0.84 -0.37 -1.32 -2.23
0.02 -0.07 -0.31 -0.13 0.21 0.2
-0.35 0.33 0.46 0.45 -0.21 -1.49
-0.02 0.29 -0.12 -0.16 0.02 -0.06
1.24 -0.39 0.01 -0.0 -1.26 -1.14
- -0.39 0.69 - 0.17 1.32
0.12 -0.04 -0.17 0.29 -0.09 -0.17
-0.78 -0.42 0.51 -0.11 0.04 0.36
0.05 0.01 -0.14 0.13 -0.01 -0.05
-0.12 0.06 -0.03 0.11 0.41 -0.64
-0.82 -0.9 0.43 0.25 0.44 0.0
0.16 -0.73 0.07 -0.49 0.32 0.34
-0.26 0.12 0.44 0.26 -0.34 -0.45
0.98 -1.32 -1.62 1.03 -0.42 -0.96
1.63 - - 1.54 - -
0.45 -0.73 -0.91 0.64 0.22 -0.37
0.89 - - 0.95 - 1.15
0.49 -0.09 -0.43 0.13 -0.0 -0.29
0.36 0.42 0.1 0.27 -1.81 -0.31
-0.01 0.06 0.05 -0.02 -0.0 -0.08
-0.09 0.32 -0.43 0.14 -0.15 0.1
-0.62 0.36 0.43 0.07 -0.03 -0.54
0.55 -0.29 -0.4 0.84 -1.35 -0.37
1.3 -0.42 -1.42 -0.67 0.09 -0.48
-0.51 0.27 0.2 0.16 -0.04 -0.23
0.15 0.14 0.09 -0.14 -0.44 0.11
0.09 0.02 -0.05 0.1 0.02 -0.21
0.09 -0.15 -0.29 -0.11 0.14 0.25
1.46 -0.12 -0.09 -0.06 -1.18 -
0.11 -0.95 0.6 -0.08 0.71 -1.72
0.28 -0.9 -2.01 0.17 0.9 0.01
-0.49 -0.31 -0.02 -0.33 0.64 0.18
-0.57 -0.23 0.2 0.44 0.26 -0.38
1.46 - 0.07 0.49 -0.33 -
-0.79 0.29 0.17 0.38 - 0.82
2.05 - 0.89 - - -
-0.23 0.38 0.11 -0.05 -0.15 -0.16
2.05 - 0.9 - - -
-0.27 0.34 0.14 0.32 -0.25 -0.48
-0.1 0.28 0.16 -0.51 -0.19 0.22
0.08 -0.05 0.0 0.02 -0.03 -0.03
0.85 0.41 -0.38 -1.0 0.06 -0.85
0.03 0.16 -0.05 -0.18 -0.14 0.15
-0.35 0.59 0.13 -0.11 -0.19 -0.3
2.1 - 0.77 - - -
-1.11 0.25 0.77 -0.08 0.04 -0.58
1.07 0.08 -0.23 -0.72 -0.68 -0.39
0.13 -0.17 -0.49 -0.31 0.09 0.52
0.53 -1.34 0.05 0.32 0.14 -0.37
1.27 -0.52 -1.48 -0.05 0.11 -1.04
0.12 -0.87 -1.23 1.04 -0.07 -0.11
-0.2 0.38 0.61 -1.04 -1.28 0.49
-0.04 -0.16 -0.33 0.35 0.08 0.01
0.08 0.53 0.17 -0.15 -0.27 -0.64
-0.7 0.48 1.13 -0.1 -0.42 -3.11
1.09 -2.2 -2.07 0.51 0.61 -1.13
1.67 -0.8 - -0.12 -0.82 -0.42
0.55 -1.45 -1.24 0.48 0.37 0.08
-0.11 -0.16 -0.11 0.16 -0.02 0.21
- 0.76 0.17 0.39 0.3 -0.64
0.34 -0.24 0.06 0.03 -0.15 -0.12
-1.09 0.97 0.67 0.01 -0.72 -1.44
-0.08 0.05 -0.27 0.03 0.11 0.13
-0.15 0.35 0.36 -0.01 0.03 -0.92
1.58 - - 0.53 -0.28 -0.45
0.33 -0.02 -0.14 -0.88 0.36 0.02
1.49 0.67 - - 0.69 -
-0.62 -1.55 1.09 0.81 -0.25 -1.86
-0.06 -0.01 0.1 0.02 -0.0 -0.06
0.13 -0.25 -0.11 -0.05 0.06 0.17
1.14 -1.8 - -0.4 0.47 0.44
-1.13 -0.25 -0.73 0.3 0.76 0.23
1.11 - - - 0.2 1.43
-0.7 -0.38 -0.34 -0.16 0.87 0.15
0.84 -0.89 -0.68 0.43 -0.3 -0.18
0.17 -0.26 -0.02 -0.3 0.24 0.1
-1.51 0.87 0.1 0.51 -0.37 -0.85
0.97 -0.59 -2.88 0.26 0.19 -0.13
0.05 0.0 -0.07 0.17 -0.04 -0.13
0.15 -0.28 -0.34 0.01 0.21 0.15
0.14 0.02 -0.36 0.05 0.03 0.07
-0.62 -0.2 0.25 0.15 0.13 0.11
1.32 -3.49 -0.57 0.52 0.38 -
0.01 0.01 -0.02 0.01 0.02 -0.03
1.04 - - -0.65 1.32 -0.29
0.26 0.1 0.18 -0.28 -0.12 -0.23
1.13 -0.42 -1.11 -0.43 0.31 -0.68
0.25 0.31 0.04 0.48 -0.33 -1.53
0.12 -0.06 -0.18 -0.55 0.54 -0.1
-0.51 -0.12 0.26 -1.03 0.6 0.23
1.7 -1.69 -2.07 0.92 - -1.65
-0.06 -0.5 -0.49 0.27 0.4 0.13
0.05 -0.18 -0.15 -0.0 -0.03 0.26
-0.12 0.05 -0.23 0.14 -0.06 0.17
-0.08 0.55 -0.19 0.58 -0.06 -1.95
- 0.8 0.1 - 0.33 0.95
0.03 -0.11 -0.22 -0.08 0.05 0.27
-0.31 -1.21 0.09 0.48 0.39 -0.02
-0.16 -0.02 0.04 0.06 0.03 0.04
-0.43 0.27 0.12 0.06 -0.04 -0.08
0.26 -0.23 -0.1 -0.12 0.05 0.09
-0.78 -0.18 0.16 0.36 -0.06 0.24
0.03 0.25 -0.31 -0.38 0.3 -0.02
0.01 -0.34 0.45 -0.53 -0.53 0.53
-0.6 - -0.5 1.59 -0.27 -0.34
-0.24 0.69 -0.21 0.07 0.11 -0.85
2.0 - - 1.01 - -
0.3 -0.55 -0.54 0.16 0.62 -0.42
-0.93 -2.53 0.72 0.39 -0.75 0.81
-0.03 -0.36 -0.19 0.04 0.16 0.29
-0.44 0.13 -0.28 0.09 0.34 0.01
-1.09 1.25 0.66 -0.4 -1.11 -1.47
-0.75 -1.64 0.28 -0.61 0.95 0.36
0.07 0.12 -0.15 0.31 -0.03 -0.42
-0.17 0.51 0.32 -0.04 -0.26 -0.65
1.44 -0.66 0.53 - -0.72 -0.72
-0.32 -0.37 1.1 -1.6 -0.65 0.39
0.37 -0.39 -0.39 -1.08 0.19 0.65
0.59 0.3 -0.51 -0.76 0.16 -0.23
-0.6 0.26 0.88 0.63 -0.39 -
0.39 -0.9 -0.34 0.2 0.33 -0.07
0.89 -0.23 -1.74 0.49 -0.04 -0.68
0.15 -0.04 0.06 -0.04 0.01 -0.15
0.08 -0.69 -0.29 0.07 0.43 0.15
0.17 0.3 0.23 -0.15 -0.4 -0.31
-0.11 -1.2 -1.26 1.81 -1.23 -1.78
-0.88 -1.04 0.14 1.22 -1.07 0.08
-0.13 0.01 0.57 -0.08 -0.14 -0.42
1.19 -2.54 -1.65 1.03 -1.66 -0.2
-2.48 -0.61 1.02 0.77 0.11 -1.5
-0.12 -0.04 0.0 -0.15 0.09 0.19
0.03 -0.82 -0.53 0.76 -0.09 0.12
-1.28 1.11 0.09 0.53 -0.65 -1.79
-0.02 -1.06 0.45 -0.61 0.09 0.53
-0.84 0.08 -1.24 -0.12 0.9 0.23
0.83 0.74 -1.64 -0.18 -1.49 -0.01
-1.22 0.34 0.86 0.09 -0.18 -0.91
1.08 - -0.95 1.2 0.09 -
0.29 -0.69 -0.82 0.09 0.5 0.15
0.7 -3.07 -1.13 0.17 0.75 -0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.