Heatmap: Cluster_44 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	3 h after light	7 h after light	11 h after light	2 h after dark	6 h after dark	10 h after dark
PSME_00001733-RA	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00001738-RA	0.0	0.16	0.07	0.0	0.0	0.0
PSME_00002198-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00002802-RA	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00003362-RA	0.01	0.02	0.0	0.0	0.03	0.0
PSME_00003423-RA	0.0	0.03	0.02	0.01	0.03	0.0
PSME_00004123-RA	0.0	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00004799-RA	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00004971-RA	0.01	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0
PSME_00005166-RA	0.11	0.31	0.06	0.13	0.02	0.02
PSME_00005566-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00006189-RA	0.01	0.03	0.0	0.0	0.01	0.01
PSME_00006521-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00007154-RA	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00007334-RA	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00008284-RA	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00008569-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00008772-RA	0.02	0.03	0.04	0.01	0.0	0.0
PSME_00010458-RA	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00010551-RA	0.01	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0
PSME_00010610-RA	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0
PSME_00010962-RA	0.12	0.27	0.03	0.1	0.07	0.18
PSME_00011171-RA	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00012744-RA	0.02	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0
PSME_00012850-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00013425-RA	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01
PSME_00014544-RA	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00014616-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00014700-RA	0.0	0.03	0.01	0.01	0.02	0.0
PSME_00015135-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00017052-RA	0.03	0.36	0.13	0.08	0.08	0.0
PSME_00017444-RA	0.0	0.07	0.0	0.0	0.02	0.0
PSME_00017788-RA	0.0	0.03	0.0	0.01	0.01	0.0
PSME_00017956-RA	0.01	0.06	0.02	0.0	0.0	0.01
PSME_00018702-RA	0.0	0.03	0.01	0.0	0.01	0.03
PSME_00019232-RA	0.02	0.04	0.0	0.02	0.0	0.0
PSME_00019400-RA	0.08	0.12	0.05	0.03	0.03	0.0
PSME_00019456-RA	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0
PSME_00020195-RA	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00020772-RA	0.01	0.04	0.0	0.0	0.01	0.01
PSME_00020974-RA	0.0	0.19	0.05	0.05	0.03	0.0
PSME_00021804-RA	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
PSME_00022159-RA	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00022253-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00022266-RA	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00022336-RA	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00022594-RA	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01
PSME_00022878-RA	0.0	0.04	0.0	0.0	0.02	0.0
PSME_00023184-RA	0.02	0.04	0.01	0.01	0.0	0.01
PSME_00025269-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00025584-RA	0.02	0.07	0.01	0.01	0.0	0.0
PSME_00025765-RA	0.28	0.19	0.12	0.14	0.07	0.09
PSME_00026164-RA	0.05	0.11	0.04	0.04	0.02	0.05
PSME_00026236-RA	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00026357-RA	0.01	0.03	0.01	0.01	0.0	0.0
PSME_00027146-RA	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00027152-RA	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02
PSME_00027772-RA	0.01	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0
PSME_00027845-RA	0.06	0.13	0.03	0.03	0.07	0.03
PSME_00028241-RA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00028344-RA	0.0	0.03	0.0	0.0	0.02	0.0
PSME_00028974-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00029593-RA	0.01	0.06	0.0	0.02	0.08	0.0
PSME_00030184-RA	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.01
PSME_00030619-RA	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00030640-RA	0.57	1.07	0.57	0.31	0.08	0.05
PSME_00031231-RA	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00031679-RA	0.05	0.06	0.02	0.0	0.02	0.0
PSME_00031975-RA	0.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0
PSME_00032732-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00032752-RA	0.12	0.33	0.15	0.14	0.04	0.03
PSME_00033086-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00033640-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00033986-RA	0.01	0.04	0.01	0.0	0.02	0.0
PSME_00034740-RA	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00035786-RA	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00036889-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00038309-RA	0.02	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0
PSME_00038807-RA	0.08	0.09	0.03	0.04	0.05	0.02
PSME_00039261-RA	0.0	0.03	0.0	0.04	0.0	0.01
PSME_00039311-RA	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02
PSME_00040020-RA	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0
PSME_00040465-RA	0.06	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03
PSME_00041103-RA	0.01	0.02	0.0	0.03	0.01	0.0
PSME_00042097-RA	0.06	0.19	0.05	0.06	0.04	0.03
PSME_00043394-RA	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00043614-RA	0.03	0.07	0.03	0.0	0.05	0.02
PSME_00043860-RA	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00044109-RA	0.01	0.02	0.01	0.0	0.03	0.0
PSME_00044926-RA	0.01	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0
PSME_00045014-RA	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01
PSME_00045554-RA	0.02	0.04	0.02	0.0	0.0	0.0
PSME_00046615-RA	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0
PSME_00046665-RA	1.9	1.57	0.93	0.96	0.54	0.57
PSME_00046729-RA	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.02
PSME_00047464-RA	0.03	0.03	0.0	0.01	0.0	0.02
PSME_00048062-RA	0.01	0.06	0.04	0.03	0.03	0.07
PSME_00048184-RA	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00048910-RA	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00049479-RA	0.0	0.03	0.01	0.0	0.01	0.0
PSME_00049882-RA	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0
PSME_00050090-RA	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.05
PSME_00050452-RA	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0
PSME_00050605-RA	0.0	0.02	0.01	0.01	0.02	0.0
PSME_00050705-RA	0.0	0.04	0.02	0.0	0.03	0.0
PSME_00050941-RA	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0
PSME_00052417-RA	0.0	0.03	0.01	0.01	0.0	0.0
PSME_00052782-RA	0.18	1.44	0.17	0.37	0.66	0.33
PSME_00055563-RA	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.01
PSME_00056051-RA	0.0	0.07	0.01	0.03	0.03	0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)