Heatmap: Cluster_87 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.28 0.25 0.13 0.17 0.3 0.18
0.01 0.01 0.01 0.05 0.02 0.0
0.04 0.02 0.02 0.03 0.08 0.04
0.18 0.26 0.12 0.12 0.24 0.16
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.8 1.16 0.43 0.49 1.34 0.74
1.58 1.56 0.56 0.73 1.34 1.26
0.18 0.28 0.1 0.08 0.17 0.2
0.03 0.07 0.07 0.05 0.09 0.04
0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0
0.1 0.13 0.09 0.16 0.09 0.09
0.11 0.17 0.07 0.1 0.08 0.13
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.15 0.08 0.08 0.19 0.12
35.74 47.1 30.69 32.52 33.05 38.42
0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0
0.2 0.08 0.04 0.07 0.17 0.11
0.07 0.04 0.04 0.06 0.1 0.04
0.88 0.42 0.27 0.61 1.17 0.41
0.34 0.32 0.31 0.3 0.44 0.34
0.04 0.02 0.02 0.03 0.06 0.03
2.14 1.55 1.73 1.91 2.18 1.97
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01
0.04 0.0 0.01 0.01 0.1 0.01
0.16 0.23 0.14 0.09 0.23 0.09
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.01 0.02 0.05 0.03
49.99 104.44 72.81 66.12 93.88 80.35
13.69 16.75 16.53 14.57 20.57 18.59
5.8 7.84 7.25 6.02 9.5 8.83
0.01 0.01 0.03 0.02 0.04 0.02
0.03 0.23 0.13 0.12 0.37 0.29
0.09 0.07 0.01 0.07 0.21 0.08
0.24 0.24 0.12 0.16 0.27 0.1
0.02 0.03 0.02 0.04 0.02 0.02
0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
1.11 1.18 1.17 1.38 1.49 1.63
0.09 0.17 0.05 0.13 0.15 0.09
0.21 0.14 0.09 0.09 0.24 0.1
0.03 0.03 0.04 0.06 0.07 0.04
0.02 0.01 0.0 0.05 0.03 0.02
0.08 0.06 0.09 0.13 0.18 0.16
0.15 0.13 0.11 0.16 0.29 0.17
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01
0.07 0.08 0.05 0.05 0.08 0.07
0.02 0.12 0.06 0.03 0.07 0.03
0.37 0.49 0.58 0.56 0.69 0.59
0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.01 0.1 0.04 0.05 0.09 0.03
0.45 0.68 0.28 0.31 0.7 0.44
0.7 0.88 0.48 0.63 1.14 0.65
0.01 0.04 0.0 0.01 0.05 0.01
1.04 1.14 0.48 0.85 0.94 0.71
0.19 0.07 0.07 0.04 0.17 0.14
1.62 1.61 1.29 1.19 2.05 1.83
0.28 0.34 0.14 0.21 0.34 0.23
0.15 0.05 0.02 0.03 0.18 0.13
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.27 0.1 0.1 0.27 0.15
0.15 0.17 0.07 0.11 0.21 0.07
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0
1.99 2.42 1.31 1.65 1.62 1.59
0.0 0.0 0.16 0.0 1.93 0.36
0.08 0.08 0.01 0.02 0.13 0.01
0.02 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01
0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01
0.03 0.05 0.03 0.03 0.06 0.06
1.22 1.17 0.52 0.8 1.73 1.04
0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01
0.12 0.04 0.12 0.13 0.14 0.15
0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02
0.16 0.17 0.2 0.26 0.29 0.13
0.03 0.07 0.04 0.07 0.1 0.04
0.05 0.1 0.03 0.08 0.09 0.05
0.35 0.55 0.34 0.45 0.9 0.68
1.78 2.53 0.87 1.13 2.14 2.28
0.06 0.15 0.08 0.03 0.1 0.07
0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0
0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01
0.8 1.0 0.89 1.17 1.59 0.95
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02
7.14 11.94 6.47 6.2 9.06 9.45
0.03 0.03 0.01 0.0 0.02 0.01
0.43 0.36 0.49 0.5 0.76 0.52
0.02 0.04 0.0 0.02 0.06 0.02
3.36 4.07 2.96 2.77 3.09 2.66
0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
0.52 0.59 0.34 0.49 0.72 0.47
0.58 0.55 0.26 0.43 0.6 0.5
0.19 0.27 0.1 0.12 0.32 0.25
0.18 0.21 0.15 0.2 0.18 0.17
0.46 0.36 0.32 0.58 0.35 0.35
0.98 0.72 0.95 0.97 1.25 1.24
0.28 0.12 0.06 0.17 0.34 0.12
0.05 0.1 0.11 0.06 0.06 0.02
0.0 0.06 0.0 0.04 0.04 0.02
0.51 0.72 0.21 0.35 1.02 0.6
0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0
0.02 0.02 0.02 0.07 0.04 0.04
0.03 0.08 0.09 0.14 0.17 0.02
0.16 0.12 0.12 0.09 0.14 0.14
0.06 0.08 0.1 0.06 0.16 0.11
0.03 0.04 0.03 0.09 0.14 0.02
0.16 0.18 0.06 0.09 0.1 0.15
0.77 0.79 0.73 0.63 0.61 0.61
23.34 34.66 22.18 23.17 20.92 27.58
0.54 0.6 0.3 0.36 0.69 0.49
5.2 5.04 3.96 4.23 8.31 5.13
0.02 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02
0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0
0.1 0.1 0.1 0.07 0.12 0.11
0.02 0.03 0.05 0.04 0.05 0.06
6.3 6.21 2.87 2.75 8.2 6.7
0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0
0.58 0.74 0.25 0.4 0.85 0.53
0.81 1.12 0.82 0.75 0.91 0.86
0.27 0.21 0.29 0.17 0.69 0.25
0.03 0.02 0.01 0.01 0.06 0.01
0.16 0.11 0.04 0.16 0.28 0.09
0.62 0.49 0.54 0.55 0.79 0.8
0.12 0.09 0.1 0.12 0.13 0.06
0.0 0.26 0.0 0.0 1.02 0.0
0.1 0.06 0.17 0.17 0.16 0.17
2.88 3.03 2.15 2.76 3.76 3.72
0.11 0.06 0.03 0.01 0.21 0.17
0.16 0.19 0.07 0.14 0.09 0.11
0.23 0.27 0.25 0.22 0.25 0.22
2.63 3.74 1.85 2.42 3.2 2.52
0.26 0.26 0.18 0.11 0.17 0.07
0.22 0.16 0.38 0.31 0.28 0.25
0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 0.0
0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02
0.01 0.0 0.04 0.08 0.04 0.03
0.01 0.06 0.01 0.05 0.04 0.03
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01
1.01 1.07 0.47 0.77 1.21 0.8
0.8 1.88 1.1 0.78 1.25 0.87
0.28 0.21 0.07 0.12 0.48 0.16
0.05 0.03 0.07 0.1 0.1 0.08
0.3 0.32 0.15 0.21 0.41 0.18
1.45 1.35 0.37 0.5 1.76 1.25
0.17 0.06 0.11 0.24 0.28 0.2
0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0
0.07 0.08 0.06 0.08 0.07 0.04
0.46 0.43 0.18 0.29 0.94 0.42

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)