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Heatmap: Cluster_89 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
-1.01 1.52 0.68 -0.98 -0.93 -
-1.44 0.95 0.56 -1.21 0.26 -0.75
0.65 -0.86 -0.83 -2.26 1.18 -0.24
0.11 0.3 -0.69 0.06 0.31 -0.35
-0.01 0.32 -0.15 -0.08 -0.04 -0.09
0.45 0.37 -1.94 0.28 -0.3 0.07
0.3 -0.26 -0.74 0.31 0.11 0.02
0.38 0.49 1.05 0.29 - -
0.16 -0.2 -0.21 -0.04 0.02 0.21
-0.33 0.22 -0.15 -0.26 0.31 0.1
0.95 0.69 -0.71 -0.9 -0.27 -1.08
0.04 -0.43 -0.57 -0.0 0.62 0.04
0.77 1.06 - - 1.14 -
0.58 1.1 0.04 - -1.45 -0.04
-0.82 0.56 -0.35 0.7 0.16 -1.21
- 1.73 - 1.42 - -
- 1.19 0.26 - - 1.33
0.78 -0.0 -0.09 -0.26 0.24 -1.63
-1.56 -0.05 0.41 -0.01 -0.45 0.71
-0.05 - 1.36 - 1.3 -
0.68 -0.22 -0.66 -0.22 -0.52 0.44
1.24 0.27 - 1.28 - -
0.39 0.67 -0.11 -0.15 -0.34 -1.04
0.29 -0.77 -0.46 0.32 0.18 0.11
0.18 - -1.18 -0.59 0.92 0.9
0.17 - -1.67 1.58 - 0.64
-0.95 1.29 - 0.74 -0.67 -0.43
-1.36 -1.14 0.96 -0.44 0.21 0.4
- - - 0.31 - 2.25
0.81 - 0.97 0.13 0.25 -
0.66 -0.22 -1.68 -0.4 -1.74 1.13
0.41 -0.33 -0.09 -0.39 -0.03 0.25
0.08 0.2 0.05 -0.24 -0.08 -0.05
-18.96 1.33 -1.26 -19.46 -0.43 1.21
-0.42 0.46 0.14 0.28 -0.47 -0.25
-0.51 0.17 -0.18 0.2 0.34 -0.18
0.56 0.97 - -0.58 0.08 -0.25
- 1.26 0.46 - - 1.15
-2.32 0.64 -0.95 0.52 -0.37 0.59
1.26 0.47 - 0.07 - 0.23
- 0.77 0.14 - 1.15 -0.04
-0.73 -0.06 0.39 1.17 -1.15 -1.25
- 0.94 0.34 -0.07 0.29 -0.64
0.93 0.88 0.29 -0.87 -1.06 -
-0.41 0.19 0.91 -0.29 -0.46 -0.56
-0.19 0.02 -0.41 0.15 0.37 -0.08
0.25 0.09 -0.51 -0.02 0.21 -0.16
-1.29 0.16 0.72 -0.4 -0.08 0.16
-1.41 1.27 0.12 -1.25 0.33 -1.14
-2.27 0.71 0.58 0.26 0.21 -1.7
-0.82 0.27 0.02 -0.03 0.52 -0.33
-1.04 0.26 0.4 0.1 0.79 -2.36
0.81 -1.84 -0.99 0.13 0.47 -0.02
1.39 0.94 -1.72 -0.49 - -1.15
0.25 0.37 0.1 -0.2 -0.73 -0.04
-2.1 0.47 -1.04 0.37 -0.17 0.78
0.75 0.82 -18.94 0.04 0.21 -1.44
- 1.4 0.76 0.74 - -
-0.86 0.8 0.82 -1.07 0.25 -1.88
0.6 0.02 - -1.91 1.16 -0.06
-2.54 0.5 0.95 -0.52 -0.06 -0.28
-0.22 0.71 -0.2 0.17 -1.42 0.19
0.69 -0.12 -0.41 -0.83 0.04 0.17
-0.94 0.24 0.15 0.42 0.21 -0.53
-1.32 -0.13 0.61 0.27 -0.21 0.12
0.32 -0.06 0.13 0.1 -0.22 -0.37
1.65 - - - - 1.52
- - 1.48 -2.09 1.58 -
- 0.61 - - - 2.16
-0.3 0.82 0.21 -0.64 -0.19 -0.41
-1.16 0.74 0.34 0.62 -0.2 -2.3
-0.26 0.93 0.34 -0.99 -0.26 -0.6
- -0.11 0.17 0.89 -0.06 0.18
0.53 0.02 - -0.84 1.12 -0.3
-2.13 0.42 1.41 -2.65 0.15 -0.94
- 0.44 0.56 -0.41 -1.31 1.01
-0.63 0.32 -0.55 -0.43 0.44 0.41
-0.3 0.2 0.52 0.02 0.04 -0.85
-0.21 -0.03 0.34 0.23 -0.43 -0.04
- 1.19 - 0.54 - 1.18
1.6 - 1.57 - - -
-1.1 0.92 0.31 0.11 0.41 -
0.68 -0.36 -0.88 -0.87 0.47 0.19
-1.72 0.56 0.76 -0.03 - 0.64
-0.57 1.22 0.22 -0.41 -0.64 -1.15
0.04 1.27 0.24 - 0.47 -
-20.97 0.44 -0.86 1.13 -1.68 0.67
0.17 0.46 -2.06 -0.23 -0.04 0.52
-1.82 -0.41 -0.19 0.84 -0.58 0.7
-0.29 0.78 -0.05 0.44 -0.1 -2.27
0.53 -0.5 -0.82 -0.47 -0.82 1.0
0.06 0.13 0.16 0.19 -0.08 -0.6
-0.28 0.48 -1.83 0.54 -0.04 0.11
- 1.93 - 1.13 - -
0.21 -0.18 -0.28 -0.86 0.41 0.32
-1.35 0.9 -2.34 -1.46 0.11 1.07
0.0 0.35 0.39 -0.4 0.33 -1.35
1.38 -0.38 -2.05 -1.44 -0.15 0.17
-0.4 0.68 0.38 -0.19 - 0.54
- -0.38 -0.71 0.44 -0.54 1.37
-0.21 0.31 0.65 0.68 -0.74 -2.95
-0.52 0.02 0.3 0.1 0.26 -0.35
0.06 0.42 -0.85 1.32 - -0.83
0.24 1.39 0.33 - -0.08 -
0.64 -0.71 -0.53 -1.09 -0.48 0.97
-0.78 -0.18 0.57 -0.68 0.08 0.45
0.53 0.77 -1.53 -0.06 -0.44 -0.32
0.33 -23.32 0.44 -1.17 0.32 0.76
0.11 -0.15 0.01 0.07 -0.02 -0.04
-0.92 0.32 0.37 0.42 -0.06 -0.64
-0.43 0.94 1.35 - -0.35 -
0.3 0.04 -21.1 1.01 -0.35 -0.09
0.37 0.21 -1.07 0.41 0.14 -0.64
-0.51 0.18 0.6 0.23 -0.5 -0.38
-0.46 0.45 0.19 0.03 -0.88 0.27
-0.02 0.01 -1.58 -0.13 0.51 0.41
- 1.88 - 1.22 - -
0.72 -0.8 -1.88 -0.1 -0.39 0.85
-1.19 0.68 0.36 -0.95 -0.23 0.38
0.45 0.92 -0.57 0.05 0.04 -
0.61 0.35 0.25 -1.21 -1.05 0.12
- - - 1.33 -0.41 1.45
-0.47 0.21 0.23 -0.01 0.37 -0.61
0.29 -0.15 -0.05 -0.16 0.34 -0.42
- 0.52 -0.11 1.09 0.6 -
2.29 - - 0.13 - -
0.17 -0.81 -1.8 -0.04 0.62 0.59
0.38 -0.6 -0.39 0.21 -0.14 0.28
0.31 0.35 0.58 -0.04 -0.44 -1.88
-0.08 -2.98 - -1.67 0.65 1.61
0.71 -1.61 -1.72 -0.02 0.26 0.63
0.66 -1.39 0.95 -1.01 - 0.68
0.37 0.29 0.29 0.22 -1.01 -0.72
- 0.7 - 0.57 1.13 -0.51
1.08 -0.41 - - 0.03 1.08
- 0.57 -0.86 0.36 1.06 -0.75
1.41 - - 0.93 - 0.52
0.64 -0.41 0.55 -0.34 -1.21 -0.01
0.88 0.94 - - 1.16 -
0.67 -0.51 0.24 0.55 -0.79 -1.03
-0.38 -0.2 0.3 0.09 -0.01 0.09
0.23 0.28 -0.39 -1.6 0.52 0.13
- -0.27 0.28 0.65 0.01 0.47
- -0.13 1.07 0.03 0.66 -1.37
0.1 0.22 0.21 0.37 -0.11 -1.37
- 1.01 - - 1.09 0.9
0.06 -0.26 -0.26 0.27 0.2 -0.1
1.16 -0.69 -0.2 -0.46 -2.11 0.39
-0.03 -0.76 -0.02 -0.39 0.41 0.44
-0.45 -0.37 0.2 -0.66 0.43 0.45
0.63 -1.13 -0.4 -0.65 0.15 0.58
0.26 1.32 -1.02 -1.97 -1.49 0.26
0.12 0.53 0.93 0.16 -1.15 -
-0.84 -0.36 0.45 0.19 0.33 -0.16
-0.88 0.25 0.55 0.25 0.04 -0.77
0.94 0.13 -0.96 -0.71 -0.48 0.2
0.42 0.86 -0.26 -1.35 -1.14 0.22
0.72 1.24 0.5 -0.82 - -
-0.43 -0.0 0.45 -0.43 -0.5 0.53
-0.23 0.43 -0.14 0.25 0.03 -0.56
0.01 0.16 -0.13 0.07 -0.04 -0.08
- 0.87 -0.03 0.04 1.12 -
0.2 0.29 -0.08 0.09 -0.43 -0.18
-0.64 0.84 0.72 -1.42 -0.02 -0.85
0.63 1.08 0.03 -0.93 -0.33 -
-2.56 -0.8 0.34 -0.02 -0.31 1.14
- 1.88 - 1.22 - -
- - - 0.3 0.48 1.75
0.44 0.77 0.13 -2.18 -0.34 -0.26
0.72 0.95 -1.12 -0.42 -1.52 -0.2
-0.48 0.44 -0.76 0.19 -1.08 0.78
-0.78 0.79 -1.76 -0.06 0.79 -0.5
- 0.6 -0.2 1.14 - 0.49
0.54 0.02 -0.04 -0.88 0.52 -0.8
0.25 -0.35 -0.42 0.8 -0.03 -0.85
0.74 -1.42 -0.85 -1.32 -0.8 1.28
0.01 -0.6 0.76 -1.79 -0.08 0.49
-0.69 0.77 0.58 -1.19 0.2 -0.73
0.22 -0.63 0.44 -0.2 -1.13 0.58
- 0.9 1.19 - 0.89 -
1.58 - - - 0.5 0.66
-0.4 -0.53 0.26 0.23 0.24 0.0
0.77 -0.99 0.08 -0.38 -0.57 0.37
- - -0.36 0.98 - 1.7
-0.13 1.09 -1.35 -0.77 - 0.99
-0.39 -0.75 - 0.15 0.05 1.32
0.49 1.14 -0.62 -1.29 -1.75 0.04
0.79 0.44 0.75 0.3 - -
0.8 0.7 -0.17 -0.93 -0.46 -1.0
1.15 0.46 -0.99 -0.53 -1.26 -0.34
-0.01 0.94 0.86 -0.31 -1.07 -
- - 0.96 -0.5 1.15 0.16
1.15 1.5 -0.08 - - -
0.4 0.89 0.62 -1.51 -1.1 -1.07
1.1 0.75 -0.43 -0.21 -1.56 -2.11
-0.0 0.0 -0.04 -0.28 0.03 0.24
1.53 -0.68 -1.4 0.63 - -0.83
-0.46 0.77 0.52 -0.25 -2.83 0.21
0.17 -0.18 -0.05 0.17 -0.01 -0.14
- - - - - 2.58
0.39 -0.71 -0.63 -0.33 -0.41 0.91
-7.07 - 0.69 -7.91 -0.65 1.9
0.36 0.16 -0.04 0.15 -0.24 -0.58
0.01 0.08 - -0.33 - 1.65
0.56 0.09 -2.08 -0.29 0.13 0.39
0.16 -0.25 0.21 -0.41 0.33 -0.21
-1.2 1.31 -0.87 0.97 -0.76 -
0.25 1.04 - 1.46 - -
-0.42 -0.05 0.43 -0.14 0.12 -0.09
0.88 -1.58 0.5 - -0.77 0.87
0.07 -0.11 -0.19 0.15 0.04 0.0
- 1.93 - - 1.13 -
-0.22 0.45 0.22 -0.62 -0.38 0.25
-0.53 -0.16 0.31 0.2 -0.38 0.33
- 1.3 -0.34 0.03 - 0.79
0.5 0.86 -0.29 -2.54 0.83 -
0.68 1.22 - -0.87 -0.31 -0.48
-0.03 0.56 0.18 0.24 -0.68 -0.72
0.64 0.53 -0.21 -0.15 -0.6 -0.81
- 1.02 - - 1.99 -
0.01 -0.09 -0.09 0.16 0.21 -0.25
1.5 0.25 - - 0.99 -
0.09 -0.08 0.16 -2.65 0.31 0.56
-0.28 -1.8 1.06 0.07 -1.54 0.5
-0.12 -0.02 -0.04 -0.99 1.2 -1.64
- 0.5 - - 0.5 1.67
- 0.44 - - - 2.22
- 0.9 - - 1.55 0.28
0.64 -2.48 -0.71 0.16 0.57 0.07
- -0.52 -0.54 0.93 -0.07 0.81
0.49 -0.02 -0.27 0.9 -1.19 -1.07
0.51 -0.35 -0.16 -0.02 0.29 -0.56
0.18 0.21 0.12 -0.2 - 0.81
0.13 0.18 -0.02 0.35 0.6 -
-1.26 0.58 -0.61 -0.11 0.03 0.57
-1.12 -1.12 -0.33 0.23 0.63 0.65
0.11 -0.48 -0.3 -0.29 0.5 0.21
- - - 0.88 -12.1 2.06
- - 2.15 - - 0.65
-0.18 0.28 0.25 0.14 -0.1 -0.56
-0.71 - -0.2 0.73 - 1.52
0.8 0.97 -0.3 -1.28 -1.04 -0.78
- - 1.57 - 1.6 -
-0.48 0.45 -0.31 -0.43 0.33 0.14
0.6 -0.8 - -0.42 0.23 0.99
- 1.53 - 0.65 0.63 -
0.98 -1.25 -1.83 1.0 -1.93 0.1
-0.21 -0.05 -1.47 -1.28 -1.79 1.64
0.27 -1.42 -0.97 -0.33 0.4 0.84
- -0.1 0.39 0.52 - 1.22
-0.27 - -0.09 1.15 1.01 -
-0.08 0.3 0.07 -0.32 0.16 -0.23
-0.15 -0.13 0.64 0.03 0.28 -1.38
0.13 -0.36 -0.94 -0.53 -0.18 1.02
1.41 - 0.53 0.93 - -
1.21 - -0.95 -0.33 0.1 0.39
-0.51 -0.55 0.63 -0.02 0.23 -0.14
-0.98 0.51 0.03 0.71 -1.25 -0.02
0.86 0.47 -0.11 -0.04 -0.84 -1.52

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.