Heatmap: Cluster_33 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.05 0.04 0.07 0.07 0.06 0.02
0.08 0.1 0.15 0.15 0.1 0.11
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.75 1.43 1.09 1.01 0.95 0.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.03 0.06 0.03 0.01 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.04 0.05 0.02 0.07 0.02 0.06
0.01 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0
0.62 0.47 0.38 0.52 0.4 0.67
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 0.72 1.36 0.91 0.8 0.71
0.0 0.01 0.12 0.01 0.0 0.02
0.0 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01
0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.03 0.01 0.0 0.03 0.02 0.0
0.0 0.02 0.03 0.01 0.04 0.04
0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0
0.03 0.0 0.08 0.07 0.04 0.0
0.18 0.23 0.17 0.16 0.26 0.18
0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0
0.05 0.02 0.05 0.02 0.02 0.0
11.95 14.87 15.2 12.11 11.8 11.26
0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.04 0.04 0.06 0.01 0.03 0.03
0.47 0.35 0.37 0.53 0.35 0.6
0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.12 0.21 0.25 0.18 0.13 0.16
0.08 0.16 0.17 0.22 0.15 0.22
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.01
0.03 0.01 0.04 0.01 0.02 0.02
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.01 0.02 0.04 0.02 0.02 0.0
0.08 0.26 0.15 0.06 0.16 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
1.2 1.29 1.19 1.57 1.3 1.5
0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01
0.13 0.21 0.21 0.11 0.16 0.13
1.8 1.45 1.41 1.53 1.75 2.28
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.05 0.01 0.0 0.01
0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0
1.03 0.89 0.72 0.58 0.62 0.8
0.71 0.73 1.51 1.22 1.19 0.73
0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0
0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.06 0.04 0.01 0.0 0.01 0.01
0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.08 0.17 0.13 0.15 0.3 0.14
0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01
0.01 0.01 0.05 0.0 0.0 0.01
0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.02 0.05 0.01 0.06 0.02
0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.14 0.18 0.12 0.24 0.18 0.21
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01
0.37 0.36 0.32 0.53 0.24 0.28
0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02
0.11 0.07 0.13 0.09 0.05 0.04
1.26 0.79 0.78 1.01 1.31 1.16
0.06 0.11 0.08 0.1 0.09 0.08
0.03 0.07 0.08 0.14 0.07 0.07
0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0
0.7 0.49 0.72 0.67 0.45 0.69
0.0 0.02 0.06 0.0 0.02 0.0
0.12 0.12 0.15 0.1 0.1 0.04
0.24 0.29 0.25 0.13 0.27 0.14
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0
1.14 0.71 0.6 0.61 0.67 0.88
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.02
0.02 0.05 0.14 0.03 0.07 0.06
0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.05
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.76 0.69 1.03 1.05 0.81 0.96
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.66 0.85 0.86 0.8 0.63 0.29
0.6 0.75 0.84 0.31 0.37 0.39
0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.02
0.05 0.0 0.05 0.08 0.02 0.01
0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0
0.24 0.57 0.52 0.45 0.54 0.42
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.28 0.07 0.22 0.07 0.0 0.0
0.56 0.0 0.3 0.36 0.34 0.0
0.24 0.24 0.23 0.26 0.25 0.16
0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.02 0.0 0.06 0.01 0.02 0.03
0.22 0.15 0.27 0.23 0.17 0.14
0.19 0.29 0.08 0.14 0.21 0.1
0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.2 0.18 0.65 0.27 0.13 0.11
0.04 0.07 0.07 0.04 0.06 0.05
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02
0.13 0.07 0.06 0.03 0.09 0.07
0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.55 0.49 0.36 0.24 0.34 0.49
0.0 0.02 0.05 0.01 0.06 0.01
0.13 0.02 0.12 0.05 0.07 0.07
0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.88 0.78 0.79 0.87 0.86 0.85
2.68 2.94 2.37 2.36 2.44 2.94
0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.44 0.47 0.53 0.36 0.4 0.38
0.0 0.05 0.06 0.05 0.02 0.01
0.07 0.1 0.08 0.13 0.2 0.24
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.02 0.01 0.05 0.0 0.01 0.0
2.11 1.8 1.2 1.31 1.23 1.94
0.68 0.64 0.95 1.07 0.75 0.85
0.01 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.15 0.23 0.25 0.3 0.17 0.38
0.07 0.18 0.2 0.14 0.24 0.32
0.33 0.2 0.35 0.28 0.39 0.16
5.07 6.7 7.82 8.3 5.19 4.49
0.01 0.09 0.06 0.07 0.07 0.04
0.04 0.01 0.04 0.0 0.02 0.01
0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.35 0.23 0.27 0.31 0.37 0.36
0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
3.45 2.55 1.93 2.31 2.98 3.97
0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0
7.12 6.91 7.18 6.79 7.0 7.49
0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0
0.04 0.03 0.09 0.03 0.04 0.05
0.44 0.62 0.59 0.18 0.45 0.34
0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02
0.01 0.0 0.03 0.02 0.01 0.02
0.06 0.05 0.24 0.05 0.18 0.26
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0
0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.27 0.74 0.63 0.46 0.61 0.49
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.02 0.03 0.15 0.09 0.03 0.03
0.59 0.0 0.55 0.39 0.4 0.3
0.04 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)