Heatmap: Cluster_244 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.13 -0.09 -0.31 -0.11 0.04 0.27
0.11 -0.08 -0.34 -0.18 0.12 0.28
-0.75 -0.9 -0.69 0.15 0.63 0.67
0.42 - 0.73 0.38 0.35 -1.24
0.02 -0.23 -0.14 -0.17 0.19 0.26
-0.28 -0.07 -0.05 -0.06 0.31 0.08
0.51 -0.74 -1.21 -0.17 0.22 0.58
0.01 -0.16 -0.02 -0.13 0.03 0.23
0.16 -0.12 -0.23 -0.2 0.1 0.22
0.17 -0.09 -0.53 -0.46 0.17 0.48
0.04 -0.53 -0.09 0.2 0.02 0.23
-0.21 0.07 0.06 -0.2 0.01 0.22
0.24 -0.23 -0.51 -0.27 0.19 0.36
-0.28 -0.7 -0.34 0.19 0.34 0.45
-0.01 -0.09 0.05 0.09 -0.04 -0.02
-0.11 -0.19 -0.09 0.13 -0.05 0.25
0.29 -0.34 -0.67 -0.21 0.22 0.41
-0.31 -1.4 -0.42 0.08 0.35 0.8
0.13 0.02 -0.12 -0.06 -0.05 0.07
0.01 -0.94 -1.17 0.08 0.36 0.76
-0.14 -1.35 -0.9 0.52 0.05 0.76
0.08 0.1 0.05 -0.06 -0.12 -0.07
0.11 0.07 -0.03 -0.1 -0.06 -0.0
0.01 0.09 0.0 -0.09 -0.04 0.02
0.12 0.02 -0.11 -0.04 -0.01 0.02
0.3 -0.62 -0.89 -0.3 0.44 0.49
-0.9 -0.33 0.24 0.76 0.01 -0.33
0.06 0.01 -0.0 -0.08 -0.08 0.08
-0.22 -0.49 0.0 0.23 0.15 0.19
-0.0 -0.53 0.41 0.99 -1.22 -0.82
0.15 -0.24 -0.28 -0.07 0.05 0.3
- 0.9 - 2.05 - -
0.06 -0.34 -0.3 -0.24 0.3 0.35
-0.16 -0.5 -0.61 -0.19 0.36 0.66
0.54 -0.23 -0.55 -0.16 -0.04 0.2
-0.68 -0.37 0.14 0.23 0.28 0.15
-0.17 -0.31 -0.6 -0.13 0.08 0.74
0.1 -0.11 -0.08 -0.05 -0.08 0.19
-0.09 -0.1 -0.33 -0.29 0.22 0.43
-0.26 -0.67 -0.62 -0.04 0.32 0.74
-0.03 -0.05 0.08 -0.02 0.05 -0.03
-0.18 -0.27 -0.2 0.01 0.29 0.24
-0.07 -0.22 -0.06 0.11 0.14 0.06
0.21 -0.44 -0.25 0.05 0.05 0.25
0.1 0.05 -0.11 -0.09 0.1 -0.08
-0.25 -0.07 0.36 0.53 -1.23 0.07
-0.3 -1.27 -1.19 -0.15 0.78 0.78
0.22 0.0 -0.38 -0.09 0.03 0.14
0.25 -1.35 -0.33 0.4 -0.09 0.45
-0.08 -0.47 -0.48 0.3 0.22 0.29
0.15 -0.48 -0.59 -0.13 0.2 0.53
- -0.07 0.44 0.89 -1.05 0.45
- -0.16 0.83 0.68 -0.22 -0.21
0.11 -0.35 -0.43 -0.36 0.29 0.48
0.29 -0.14 -0.49 -0.36 0.02 0.45
- 0.2 -0.58 1.61 0.18 -
- -1.77 0.89 1.16 -0.42 -0.21
0.06 0.02 0.03 -0.01 0.01 -0.12
0.06 -0.26 0.04 -0.08 0.14 0.06
0.18 -0.45 -0.56 0.05 0.2 0.35
0.49 -0.17 -0.87 -0.28 -0.01 0.42
0.12 -0.54 -0.84 0.11 0.22 0.51
0.16 -0.08 -0.47 -0.11 0.27 0.11
0.24 -0.53 -0.87 -0.36 0.16 0.75
-0.35 -0.39 -0.43 0.27 0.26 0.39
-0.17 -0.42 -0.57 -0.07 0.31 0.58
-0.28 -1.28 -0.79 0.12 0.63 0.63
-0.15 -0.37 0.18 0.16 -0.07 0.16
-0.07 -0.61 -0.87 -0.28 0.58 0.61
0.07 -0.53 -0.64 0.01 0.33 0.44
0.05 -0.0 -0.09 0.02 0.02 -0.01
0.04 -0.12 -0.29 0.03 -0.11 0.36
0.09 0.15 -0.1 -0.07 -0.12 0.02
0.11 -0.32 -0.42 -0.02 0.19 0.31
-0.37 -0.31 -0.5 0.19 0.38 0.35
0.35 -0.32 -0.68 0.12 0.18 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.