Heatmap: Cluster_229 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.1 -0.14 -0.13 -0.04 0.13 0.06
-0.27 -0.41 -0.05 0.09 0.22 0.3
-0.22 -0.28 0.1 0.16 0.1 0.08
-0.12 -0.58 0.08 0.11 0.15 0.22
0.13 -0.16 -0.14 -0.13 0.06 0.2
-0.07 -0.5 -0.08 0.2 0.17 0.16
-0.19 -0.52 0.08 0.21 0.08 0.22
-0.04 -0.54 -0.24 0.02 0.17 0.43
0.01 0.0 0.07 -0.05 -0.0 -0.02
0.02 -0.09 0.0 -0.14 0.08 0.11
-0.15 -0.12 0.08 0.14 0.04 -0.02
-0.02 -0.24 0.05 0.12 -0.03 0.09
0.01 -0.47 -0.37 0.05 0.21 0.39
-0.1 -0.36 -0.2 -0.01 0.18 0.37
-0.24 -0.02 0.04 0.1 0.1 0.0
0.07 -0.01 -0.1 -0.09 0.15 -0.03
-0.04 -0.22 0.09 -0.03 0.12 0.06
0.03 -0.15 -0.1 0.01 0.06 0.13
0.02 -0.02 -0.15 -0.03 0.01 0.16
-0.24 -0.26 0.16 0.23 -0.04 0.08
-0.05 -0.02 0.08 0.03 0.02 -0.06
0.05 -0.19 0.08 0.13 -0.07 -0.01
0.16 0.29 0.0 -0.32 -0.18 -0.04
0.12 0.07 -0.09 -0.12 0.01 -0.01
0.04 -0.14 -0.1 -0.07 0.12 0.13
-0.29 -0.22 0.16 0.2 0.01 0.07
0.15 -0.1 -0.09 -0.18 0.1 0.09
0.01 0.06 0.01 -0.05 0.03 -0.07
-0.11 -0.17 -0.02 0.05 0.06 0.16
-0.01 -0.04 0.11 0.09 -0.15 -0.02
0.1 0.01 -0.1 -0.09 0.05 0.02
-0.15 -0.34 0.03 0.2 0.06 0.14
-0.06 -0.18 -0.19 0.15 0.03 0.2
-0.08 0.05 -0.08 0.06 -0.03 0.07
-0.07 -0.05 -0.15 -0.0 0.07 0.17
0.0 -0.13 -0.12 0.05 0.09 0.08
-0.11 -0.12 -0.07 -0.04 0.06 0.24
0.02 -0.06 -0.08 -0.06 0.07 0.09
-0.03 0.0 0.01 -0.15 0.17 -0.02
0.18 -0.08 -0.25 -0.14 0.14 0.11
-0.09 -0.16 -0.08 0.04 0.07 0.19
-0.08 -0.1 -0.01 0.05 0.05 0.08
-0.41 -0.7 0.21 0.3 0.09 0.24
-0.16 -0.21 -0.01 0.19 0.08 0.07
0.04 -0.06 0.02 0.16 -0.14 -0.04
-0.18 -0.13 0.08 0.07 0.05 0.09
-0.3 0.14 0.07 0.39 0.09 -0.6
0.02 -0.13 -0.09 0.1 -0.0 0.1
-0.07 -0.19 -0.3 0.1 0.22 0.17
-0.14 -0.2 -0.18 0.1 0.1 0.26
0.16 0.06 -0.08 -0.08 -0.08 0.01
0.09 -0.26 -0.08 0.07 0.14 0.01
0.01 -0.06 -0.08 -0.02 0.07 0.07
0.11 0.01 -0.07 -0.06 -0.02 0.03
0.04 -0.13 -0.03 0.05 0.08 -0.02
0.16 -0.03 -0.1 -0.17 0.06 0.06
0.13 0.3 -0.03 -0.65 -0.1 0.17
0.03 -0.21 -0.16 -0.05 0.11 0.23
-0.15 0.06 0.04 0.02 0.08 -0.07
0.03 -0.1 0.03 0.1 -0.07 0.01
0.2 0.08 -0.1 -0.25 -0.04 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.