Heatmap: Cluster_28 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
0.02 -0.4 -0.42 0.28 0.09 0.26
0.1 -0.49 -0.25 0.18 0.17 0.16
0.02 -0.24 -0.15 0.25 0.07 -0.0
0.05 -0.17 -0.1 -0.01 0.19 0.01
0.13 -0.27 -0.09 -0.03 0.03 0.18
0.09 -0.16 0.0 0.06 -0.03 0.03
-0.01 -0.34 -0.15 0.13 0.08 0.23
0.05 -0.12 -0.51 0.35 -0.01 0.1
-0.1 -0.02 -0.09 0.08 0.06 0.06
0.24 -0.45 -0.17 0.14 0.06 0.09
-0.01 -0.27 -0.11 0.2 0.12 0.02
0.09 -0.06 0.0 -0.02 0.02 -0.05
0.02 -0.05 -0.04 -0.02 0.05 0.05
0.19 -0.08 -0.12 -0.06 0.05 -0.0
0.21 -0.33 -0.27 0.21 0.02 0.07
-0.12 0.09 -0.3 0.15 0.13 -0.0
-0.1 -0.03 -0.25 0.19 0.18 -0.04
0.03 -0.01 0.05 -0.09 0.03 -0.02
-0.04 -0.28 -0.03 0.2 0.06 0.04
0.03 0.16 -0.22 0.15 0.13 -0.31
0.0 -0.36 -0.28 0.17 0.15 0.22
-0.19 -0.28 0.05 0.25 0.08 0.03
0.04 -0.11 -0.12 0.07 0.02 0.08
-0.01 -0.34 -0.13 0.18 0.07 0.17
-0.02 -0.44 -0.05 0.16 0.15 0.13
0.03 -0.49 -0.08 0.2 0.05 0.18
0.11 -0.05 -0.07 0.03 -0.02 -0.0
0.01 -0.17 -0.07 -0.02 -0.0 0.22
0.25 -0.24 -0.15 0.02 0.09 -0.02
0.2 -0.12 -0.23 0.07 0.15 -0.12
0.11 0.05 -0.13 0.07 -0.07 -0.05
0.15 -0.04 -0.01 -0.02 -0.06 -0.03
-0.03 -0.12 0.02 0.02 0.03 0.07
-0.0 0.1 -0.34 0.16 0.08 -0.04
0.11 -0.07 -0.02 -0.13 -0.02 0.11
0.01 -0.13 0.13 -0.02 0.09 -0.1
0.12 -0.22 -0.09 0.1 0.05 0.02
0.02 -0.05 -0.22 0.18 -0.04 0.09
0.06 -0.16 0.08 -0.05 -0.01 0.06
-0.01 -0.03 0.07 -0.01 0.01 -0.03
-0.02 0.05 -0.1 0.05 -0.01 0.03
0.19 0.01 -0.1 -0.07 0.01 -0.06
0.02 -0.04 -0.13 -0.03 0.28 -0.14
-0.07 -0.21 -0.27 0.01 0.19 0.27
0.11 -0.16 -0.35 -0.02 0.04 0.3
0.08 -0.21 -0.07 0.11 0.05 0.0
0.12 -0.55 -0.21 0.28 0.01 0.19
0.06 0.04 0.02 0.09 -0.03 -0.2
-0.16 0.0 -0.05 -0.05 0.05 0.19
0.09 -0.07 -0.01 -0.02 0.02 -0.01
0.01 -0.21 -0.14 0.14 0.04 0.13
-0.02 -0.09 -0.19 0.1 0.04 0.14
0.03 -0.01 -0.16 0.09 -0.02 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.