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Heatmap: Cluster_173 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
2 h after light
6 h after light
10 h after light
14 h after light
18 h after light
2 h after dark
0.14 -0.17 0.09 -0.08 -0.08 0.08
0.24 -0.08 -0.05 - 0.73 0.33
0.13 -0.17 0.02 -0.16 0.1 0.06
0.54 -0.07 -0.62 0.3 -0.26 -0.18
- - - 1.52 - 1.65
-0.03 0.01 -0.41 -0.23 0.11 0.42
-0.45 -0.11 -0.26 -0.08 0.01 0.63
0.78 0.29 -0.82 -0.95 -0.08 0.04
-0.3 0.54 -0.85 -0.01 -0.77 0.68
0.08 0.02 - 1.01 -0.31 0.14
0.22 0.14 -0.29 -0.53 0.15 0.16
0.32 -0.0 -0.22 -0.29 0.14 -0.04
-0.15 -0.38 -0.3 0.07 0.23 0.37
-0.31 -0.26 -0.28 -0.02 0.33 0.38
- -1.36 -1.33 0.78 0.43 1.1
-0.05 0.28 -0.14 -0.57 -0.68 0.7
-0.07 - -0.3 -0.06 1.15 0.07
0.26 -0.08 -0.06 -0.13 -0.04 0.0
0.2 0.11 -0.13 -0.4 0.22 -0.09
0.55 0.12 -0.59 -0.77 0.21 0.05
-0.27 -0.1 -0.47 0.59 0.1 -0.09
- - - 1.56 - 1.61
0.15 -0.14 -0.43 0.07 0.08 0.18
0.1 -0.74 -0.39 0.76 -0.45 0.19
0.3 - - 1.34 0.79 -0.98
0.01 -0.05 0.1 -0.06 -0.08 0.07
0.24 -0.08 -0.22 -0.21 0.22 -0.02
- - - 1.52 - 1.64
0.12 0.25 -0.25 -0.27 0.06 0.01
0.59 - - 0.66 0.24 0.79
0.3 0.11 -0.39 -0.01 0.19 -0.34
0.01 - -0.98 1.16 0.31 0.02
- 0.17 0.25 1.24 -0.2 -1.13
-0.34 -0.01 -0.54 0.61 0.25 -0.3
- - - 1.56 - 1.61
0.39 -0.1 -0.0 0.52 -0.83 -0.39
-0.26 -1.2 0.2 0.26 0.46 0.02
0.21 -0.04 -0.04 -0.16 0.14 -0.16
0.33 0.04 -0.15 -0.17 -0.14 0.02
0.94 -0.67 -0.74 0.42 -0.25 -0.55
0.47 -0.11 -0.02 -0.08 -0.37 -0.03
-1.58 -0.73 -1.31 1.07 -0.72 0.97
0.45 0.12 -0.24 -0.53 0.08 -0.07
1.29 0.12 - 1.31 - -
0.12 0.02 -0.01 0.29 -0.21 -0.29
0.68 -0.79 0.09 -0.5 0.25 -0.22
0.55 0.39 - 1.69 - -
-0.2 0.34 -0.07 0.75 -0.47 -0.98
0.08 -0.13 -0.04 0.01 0.07 0.0
-0.66 -0.15 -0.34 0.75 -0.49 0.35
0.3 -0.38 -0.47 -0.06 0.56 -0.24
-0.27 -0.0 -0.11 0.06 -0.01 0.27
0.27 -0.01 -2.21 1.29 -2.25 -0.1
- 0.42 - 0.72 0.37 0.78
0.07 -0.02 -0.02 -0.12 0.03 0.05
0.12 -0.19 -0.25 -0.13 0.18 0.19
0.0 -0.12 0.01 -0.04 -0.08 0.21
0.28 0.04 -0.38 0.04 0.08 -0.14
0.3 -0.62 0.1 -0.08 0.19 -0.06
-0.05 -0.24 -0.12 -0.09 0.03 0.38
-0.69 -0.51 -0.14 0.17 0.39 0.41
0.2 0.12 -0.22 -0.25 0.08 0.02
0.08 -0.6 -0.3 0.08 0.0 0.5
1.46 - 0.15 -0.44 -1.64 0.13
- 0.72 0.43 0.58 -2.27 0.38
0.01 -0.52 0.02 0.54 -0.18 -0.09
0.98 - 0.81 - - 1.18
0.46 0.18 -0.22 -0.18 0.07 -0.53
-0.13 -0.18 -0.46 0.69 0.26 -0.6
- - 0.44 1.72 - 0.44
0.3 -0.06 0.02 -0.12 -0.17 -0.02
-0.31 0.09 -0.35 0.19 0.07 0.21
-0.05 -0.18 0.19 0.19 0.1 -0.32
0.25 -0.49 -0.07 0.02 0.17 0.02
-0.0 -0.33 -0.56 -0.23 0.5 0.34
0.2 0.51 -0.37 -0.39 -0.44 0.21
0.16 -0.12 -0.26 0.07 0.12 -0.01
0.88 -0.66 0.06 -0.59 -1.12 0.44
0.07 0.97 1.06 - -0.14 -
0.05 -0.05 -0.02 -0.24 0.16 0.07
0.23 -0.21 -0.39 0.35 0.03 -0.15
-0.25 0.08 0.13 -0.0 -0.04 0.06
-0.93 -0.03 0.59 0.09 0.4 -0.73
0.96 -0.24 - -0.0 - 1.14
-0.19 0.06 -0.03 -0.22 0.02 0.3
1.51 - - 1.65 - -
0.28 0.07 -0.25 -0.16 -0.03 0.03
0.43 -0.57 -0.55 0.09 0.12 0.2
0.01 -1.13 -0.26 -0.26 0.38 0.65
0.17 -0.02 0.08 -0.29 0.06 -0.05
0.12 -0.06 -0.21 0.05 -0.05 0.13
0.31 -0.08 -0.17 -0.14 0.04 -0.01
-0.07 0.44 0.32 0.17 -0.06 -1.48
1.98 - - 0.0 - 0.06
0.16 -0.15 -0.07 -0.03 -0.07 0.14
0.87 - - 1.56 - 0.29
- - 0.15 0.47 1.04 0.53
-0.11 -0.04 0.02 -0.31 0.05 0.31
1.53 -0.76 - 0.51 0.12 -
-0.15 - - 1.78 - 0.72
-0.2 0.22 -0.0 -0.13 -0.22 0.27
-0.26 -0.27 -0.21 -0.06 0.03 0.58
0.5 -1.25 0.07 0.18 -0.89 0.54
-0.11 -1.09 0.11 0.94 0.3 -1.43
0.27 -0.12 -0.0 -0.12 0.09 -0.17
0.12 -0.07 -0.13 0.08 -0.05 0.02
- - - 2.58 - -
0.48 - - 1.59 - 0.68
0.05 0.03 0.07 -0.17 0.15 -0.15
0.61 - - 1.72 0.25 -
0.42 0.08 - 0.39 -0.11 0.45
0.31 0.28 -0.19 -0.42 -0.04 -0.08
0.3 0.06 -0.1 -0.26 0.12 -0.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.